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泛癌组织中T-box转录因子19基因水平与患者预后和肿瘤免疫微环境的相关性
1
作者
何梦婷
刘宏劲
任宏生
《山东医药》
CAS
2023年第27期47-53,共7页
目的基于数据库数据分析泛癌组织中T-box转录因子19(TBX19)表达水平与患者预后和肿瘤免疫微环境(免疫细胞浸润、免疫检查点基因、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性)之间的关系。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取泛癌组织及相应正常...
目的基于数据库数据分析泛癌组织中T-box转录因子19(TBX19)表达水平与患者预后和肿瘤免疫微环境(免疫细胞浸润、免疫检查点基因、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性)之间的关系。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取泛癌组织及相应正常组织中TBX19表达水平,比较不同WHO分级和TNM分期泛癌组织中TBX19表达水平,使用Cox回归分析TBX19表达水平与肿瘤患者预后的关系。基于肿瘤免疫估算数据库(TIMER2)数据,采用Pearson法分析TBX19表达水平与免疫细胞浸润丰度的相关性;在Sanger Box网站中利用TCGA数据库采用Pearson方法分析TBX19表达水平与免疫评分、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性的相关性;基于临床生信之家数据库数据,采用Spearman法分析TBX19表达水平与免疫检查点基因的相关性。结果在膀胱尿路上皮癌、胆管癌、结肠癌(COAD)、结直肠癌(COADREAD)、食管癌、头颈鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌、混合肾癌、肝细胞癌(LIHC)、肺腺癌、肺鳞癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、直肠腺癌、胃癌、胃和食管癌癌组织中TBX19高表达(P均<0.05),在乳腺浸润癌、肾嫌色细胞癌、前列腺癌、子宫内膜癌癌组织中TBX19低表达(P均<0.05)。不同WHO分级以及TNM分期的COAD、COADREAD癌组织中TBX19表达差异有统计学意义(P均<0.05)。与TBX19低表达者比较,LIHC癌组织TBX19高表达者的总体生存期、疾病特异性生存期、无疾病间隔期和无进展间隔期短(P均<0.05)。在COAD、KIRC、LIHC等多种癌组织中,TBX19的表达与免疫细胞浸润、免疫检查点基因、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性密切相关(P均<0.05)。结论泛癌组织中TBX19表达水平以升高为主,TBX19高表达者预后差;癌组织中TBX19高表达与肿瘤免疫微环境有关,在多种肿瘤中免疫浸润水平升高、肿瘤突变负荷增大、微卫星不稳定性增加。
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关键词
t盒转录因子19
泛癌分析
肿瘤免疫微环境
免疫浸润细胞
肿瘤突变负荷
微卫星不稳定性
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题名
泛癌组织中T-box转录因子19基因水平与患者预后和肿瘤免疫微环境的相关性
1
作者
何梦婷
刘宏劲
任宏生
机构
山东中医药大学第二临床医学院
山东第一医科大学附属省立医院东院重症医学科
出处
《山东医药》
CAS
2023年第27期47-53,共7页
基金
齐鲁卫生与健康领军人才资助项目(2021.01.01-2025.12.31)。
文摘
目的基于数据库数据分析泛癌组织中T-box转录因子19(TBX19)表达水平与患者预后和肿瘤免疫微环境(免疫细胞浸润、免疫检查点基因、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性)之间的关系。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取泛癌组织及相应正常组织中TBX19表达水平,比较不同WHO分级和TNM分期泛癌组织中TBX19表达水平,使用Cox回归分析TBX19表达水平与肿瘤患者预后的关系。基于肿瘤免疫估算数据库(TIMER2)数据,采用Pearson法分析TBX19表达水平与免疫细胞浸润丰度的相关性;在Sanger Box网站中利用TCGA数据库采用Pearson方法分析TBX19表达水平与免疫评分、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性的相关性;基于临床生信之家数据库数据,采用Spearman法分析TBX19表达水平与免疫检查点基因的相关性。结果在膀胱尿路上皮癌、胆管癌、结肠癌(COAD)、结直肠癌(COADREAD)、食管癌、头颈鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌、混合肾癌、肝细胞癌(LIHC)、肺腺癌、肺鳞癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、直肠腺癌、胃癌、胃和食管癌癌组织中TBX19高表达(P均<0.05),在乳腺浸润癌、肾嫌色细胞癌、前列腺癌、子宫内膜癌癌组织中TBX19低表达(P均<0.05)。不同WHO分级以及TNM分期的COAD、COADREAD癌组织中TBX19表达差异有统计学意义(P均<0.05)。与TBX19低表达者比较,LIHC癌组织TBX19高表达者的总体生存期、疾病特异性生存期、无疾病间隔期和无进展间隔期短(P均<0.05)。在COAD、KIRC、LIHC等多种癌组织中,TBX19的表达与免疫细胞浸润、免疫检查点基因、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性密切相关(P均<0.05)。结论泛癌组织中TBX19表达水平以升高为主,TBX19高表达者预后差;癌组织中TBX19高表达与肿瘤免疫微环境有关,在多种肿瘤中免疫浸润水平升高、肿瘤突变负荷增大、微卫星不稳定性增加。
关键词
t盒转录因子19
泛癌分析
肿瘤免疫微环境
免疫浸润细胞
肿瘤突变负荷
微卫星不稳定性
Keywords
t
-box
t
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t
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t
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19
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t
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分类号
R730.2 [医药卫生—肿瘤]
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1
泛癌组织中T-box转录因子19基因水平与患者预后和肿瘤免疫微环境的相关性
何梦婷
刘宏劲
任宏生
《山东医药》
CAS
2023
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