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徐淮白山羊DGAT2基因内含子3多态性与生长性状关联分析 被引量:6
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作者 房兴堂 徐海霞 +3 位作者 陈宏 张春雷 杜毓 石秀英 《生物技术通讯》 CAS 2009年第6期814-817,共4页
目的:探讨DGAT2基因内含子3的遗传多态性及其与山羊生长性状的关联。方法:采用PCR-SSCP、DNA序列分析及生物信息学技术研究徐淮白山羊DGAT2基因内含子3的多态性及其与山羊生长性状的关联情况。结果:徐淮白山羊DGAT2基因内含子3存在A、B... 目的:探讨DGAT2基因内含子3的遗传多态性及其与山羊生长性状的关联。方法:采用PCR-SSCP、DNA序列分析及生物信息学技术研究徐淮白山羊DGAT2基因内含子3的多态性及其与山羊生长性状的关联情况。结果:徐淮白山羊DGAT2基因内含子3存在A、B2个等位基因,其基因频率依次为0.9550、0.0450,并且处于Hardy-Weinberg平衡状态;徐淮白山羊DGAT2基因不同基因型对徐淮白山羊体高有显著影响(P<0.05),而对其他体尺指标在统计学上无显著影响(P>0.05)。结论:DGAT2基因内含子3的遗传多态性与徐淮白山羊生长性状存在相关。 展开更多
关键词 徐淮白山羊 DGAt2基因 多态性 生长性状 关联分析
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DNA依赖蛋白激酶催化亚基与细胞周期蛋白T2相互结合的鉴定 被引量:1
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作者 孙敬芬 隋建丽 +1 位作者 周平坤 吴德昌 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期373-377,共5页
目的鉴定与DNA依赖蛋白激酶催化亚基(DNAPKcs)相互结合的蛋白,以深入探讨其生理功能。方法通过免疫共沉淀获得DNAPKcs的相互结合蛋白复合物,SDSPAGE电泳分离蛋白,肽质指纹分析和Western印迹鉴定蛋白。结果以DNAPKcs抗体进行免疫共沉淀从... 目的鉴定与DNA依赖蛋白激酶催化亚基(DNAPKcs)相互结合的蛋白,以深入探讨其生理功能。方法通过免疫共沉淀获得DNAPKcs的相互结合蛋白复合物,SDSPAGE电泳分离蛋白,肽质指纹分析和Western印迹鉴定蛋白。结果以DNAPKcs抗体进行免疫共沉淀从HeLa细胞中获得DNAPKcs的相互结合蛋白,对部分结合蛋白进行质谱分析和蛋白数据库检索,发现转录延伸因子PTEFb的亚基细胞周期蛋白(cyclin)T2是其中之一。其后,通过Western印迹检测,进一步证实DNAPKcs与cyclinT2相互结合作用。结论首次发现DNAPKcs与cyclinT2的相互结合,提示DNAPKcs参与基因转录调控或转录偶联修复反应的生物学功能。 展开更多
关键词 DNA依赖蛋白激酶催化亚基 细胞周期蛋白t2 免疫共沉淀 DNA修复 基因 转录
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T2基因突变致3-酮硫解酶缺乏症 被引量:2
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作者 李莉 朱岷 +2 位作者 毛会英 朱丹丹 熊丰 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期683-686,共4页
目的:在非糖尿病性酮症酸中毒病例中寻找3-酮硫解酶(3-ketothiolase,3KT)(以下简称T2)基因异常情况,进一步为3KT缺乏症(3-ketothiolase deficiency,3KTD)的诊断提供依据,揭示T2在异亮氨酸代谢过程中的作用,并探讨基因突变导致该疾病的... 目的:在非糖尿病性酮症酸中毒病例中寻找3-酮硫解酶(3-ketothiolase,3KT)(以下简称T2)基因异常情况,进一步为3KT缺乏症(3-ketothiolase deficiency,3KTD)的诊断提供依据,揭示T2在异亮氨酸代谢过程中的作用,并探讨基因突变导致该疾病的潜在机制。方法:采集先证者及家属外周血,同时采集50例正常儿童外周血为正常对照,提取外周血DNA,用PCR法扩增T2基因全部外显子及其侧翼,对扩增产物进行直接测序,检测突变位点。结果:先证者外显子5第46位C突变为T,该突变导致T2蛋白第127位氨基酸由丙氨酸突变为缬氨酸,先证者父母、哥哥及正常对照组该位点均未见突变;先证者外显子1、内含子5、内含子8发现多个单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)。结论:T2基因外显子5 A127V,可能是3KTD的潜在病因。 展开更多
关键词 3-酮硫解酶 非糖尿病性酮症酸中毒 异亮氨酸代谢 3-羟基丁酸 t2基因
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柔嫩艾美耳球虫多肽:N-乙酰氨基半乳糖转移酶2的基因表达及转录动态分析 被引量:1
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作者 刘晓丽 龚振兴 +6 位作者 马雪婷 曲自刚 韩政岚 刘保红 袁如意 杨孝朴 蔡建平 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期2173-2180,共8页
蛋白质翻译后O-糖基化修饰普遍存在于真核生物、细菌和古细菌,多肽:N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(polypeptide:N-acetylgalactosaminyltransferase 2,ppGalNAc-T2)是O-糖基化反应的限速酶。基因组数据分析揭示艾美耳球虫具有O-糖基化反应途... 蛋白质翻译后O-糖基化修饰普遍存在于真核生物、细菌和古细菌,多肽:N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(polypeptide:N-acetylgalactosaminyltransferase 2,ppGalNAc-T2)是O-糖基化反应的限速酶。基因组数据分析揭示艾美耳球虫具有O-糖基化反应途径。为研究柔嫩艾美耳球虫(Eimeria tenella)蛋白质翻译后糖基化修饰及其关键酶的药靶效用,对Et ppGalNAc-T2基因进行了克隆,并检测其在E.tenella不同发育阶段的表达动态。根据EuPathDB中所预测Et ppGalNAc-T2基因序列设计引物,以RT-PCR方法扩增获得Et ppGalNAc-T2的ORF,插入酶切位点后连接到原核表达载体pGEX-6p-1进行诱导表达。提取E.tenella广东株未孢子化卵囊、孢子化7h卵囊、孢子化卵囊、子孢子和第二代裂殖子5个发育阶段的总RNA,以qRT-PCR法检测Et ppGalNAc-T2转录水平的动态变化。结果表明,Et ppGalNAc-T2的全长ORF为1 983bp,编码660个氨基酸,在E.coli Transetta(DE3)可溶性表达。qRT-PCR结果显示,Et ppGalNAc-T2转录水平随发育阶段不同而有显著差异,子孢子阶段表达水平最高、而在孢子化卵囊则几近不能检出。结果为进一步研究EtppGalNAc-T2的功能提供了试验基础。 展开更多
关键词 柔嫩艾美耳球虫 ppGalNAc-t2 基因克隆 表达差异 QRT-PCR
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一例Ah-分泌型个体的分子生物学背景的分析 被引量:1
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作者 苏宇清 喻琼 +2 位作者 梁延连 刘旭 魏天莉 《实验与检验医学》 CAS 2008年第4期369-371,共3页
目的研究Ah-分泌型个体的分子基础。方法经血型血清学方法鉴定红细胞上H抗原缺失、但存在弱A抗原的Ah-分泌型个体,用PCR-SSP法鉴定ABO基因型,对FU-T1和FU-T2编码区域进行扩增,并对扩增产物直接测序,FU-T1进一步做克隆测序分析。结果血... 目的研究Ah-分泌型个体的分子基础。方法经血型血清学方法鉴定红细胞上H抗原缺失、但存在弱A抗原的Ah-分泌型个体,用PCR-SSP法鉴定ABO基因型,对FU-T1和FU-T2编码区域进行扩增,并对扩增产物直接测序,FU-T1进一步做克隆测序分析。结果血清学结果显示该个体红细胞不凝集抗H血清,但与抗A定型血清呈弱凝集,Lewis血型表现型为Le(a-b+),唾液中有A、H物质,ABO基因型为A102B02;FU-T1基因型为h35h328,h35等位基因(nt35C>T),使12位(Ala)丙氨酸被(Val)缬氨酸置换;h328等位基因(nt328G>A),导致110位Ala(丙氨酸)被Thr(苏氨酸)置换;FU-T2基因为正常野生型Se357Se357。结论两个错义突变C35T、G328A可能是引起该例Ah-分泌型H抗原缺失、但存在A抗原的弱表达的原因。 展开更多
关键词 Ah-分泌型 H抗原缺失 FUT1基因 FUt2基因 错义突变
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枣ZjRNase1基因的克隆及功能分析
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作者 张玉 程壮 +2 位作者 甄曼 王玖瑞 刘孟军 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期49-54,共6页
RNase T2家族中Class I基因在植物生长发育和逆境胁迫中发挥着重要作用。通过查找拟南芥RNS1在枣上的同源蛋白,设计引物克隆获取了枣ZjRNase1基因。该基因包含3个外显子和2个内含子,cDNA全长为681 bp,其编码蛋白包含226个氨基酸,与番茄... RNase T2家族中Class I基因在植物生长发育和逆境胁迫中发挥着重要作用。通过查找拟南芥RNS1在枣上的同源蛋白,设计引物克隆获取了枣ZjRNase1基因。该基因包含3个外显子和2个内含子,cDNA全长为681 bp,其编码蛋白包含226个氨基酸,与番茄、拟南芥和水稻中的Class I蛋白具有高度相似的保守域。该蛋白含有信号肽,属于分泌蛋白。通过ZjRNase1基因实时定量PCR分析发现,该基因表达具有组织特异性,在茎、叶、花中的表达量远远高于果实和根。将枣ZjRNase1基因转入拟南芥,转基因植株叶片发生明显卷曲现象,初步明确了该基因参与叶片发育过程。本研究可为后续枣RNase T2家族中Class I基因研究提供参考。 展开更多
关键词 RNase t2家族 ZjRNase1基因 叶片发育
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菠萝RNase T2家族基因克隆及表达分析
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作者 井敏敏 雍成文 +2 位作者 李小针 李栋梁 陈晶晶 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期2107-2118,共12页
核糖核酸酶T2(ribonuclease T2,RNase T2)家族基因中的S-RNase基因,是部分双子叶植物中自交不亲和的雌蕊决定因子。为了解菠萝(Ananas comosus var.comosus)中的RNase T2家族基因中是否存在S-RNase基因,是否在菠萝自交/异交的过程中起作... 核糖核酸酶T2(ribonuclease T2,RNase T2)家族基因中的S-RNase基因,是部分双子叶植物中自交不亲和的雌蕊决定因子。为了解菠萝(Ananas comosus var.comosus)中的RNase T2家族基因中是否存在S-RNase基因,是否在菠萝自交/异交的过程中起作用,对菠萝RNase T2家族基因进行克隆和表达分析。本研究查找并克隆了菠萝基因组中RNase T2家族基因,分析了基因结构、系统进化关系,重点分析了在不同品种菠萝雌雄蕊及授粉花柱中的基因表达情况。菠萝基因组中仅存在3个RNase T2家族基因,其中一个存在可变剪切。基因结构和进化分析表明S-like RNase1和S-like RNase2均含有3个内含子,被归于第Ⅰ类;S-like RNase3有7个内含子,被归于第Ⅱ类。3个S-like RNase基因均不存在明显的组织特异性表达,其中S-like RNase2整体表达水平低于S-like RNase1和S-like RNase3;S-like RNase1和S-like RNase3在花粉和花柱中的表达水平因品种而异,整体上在花粉中的表达水平高于花柱;转录组、蛋白组及实时荧光定量PCR分析结果均表明自交/异交柱头中S-like RNase1和S-like RNase3表达量显著高于未授粉柱头,且异交高于自交。S-like RNase1和S-like RNase3虽然不属于第Ⅲ类S-RNase,但极有可能在菠萝授粉过程中起重要作用。 展开更多
关键词 菠萝 RNase t2家族基因 自交不亲和 S-like RNase
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Single-cell RNA Sequencing Reveals Sexually Dimorphic Transcriptome and Type 2 Diabetes Genes in Mouse Islet β Cells 被引量:1
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作者 Gang Liu Yana Li +9 位作者 Tengjiao Zhang Mushan Li Sheng Li Qing He Shuxin Liu Minglu Xu Tinghui Xiao Zhen Shao Weiyang Shi Weida Li 《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》 SCIE CAS CSCD 2021年第3期408-422,共15页
Type 2 diabetes(T2D)is characterized by the malfunction of pancreaticβcells.Susceptibility and pathogenesis of T2D can be affected by multiple factors,including sex differences.However,the mechanisms underlying sex d... Type 2 diabetes(T2D)is characterized by the malfunction of pancreaticβcells.Susceptibility and pathogenesis of T2D can be affected by multiple factors,including sex differences.However,the mechanisms underlying sex differences in T2D susceptibility and pathogenesis remain unclear.Using single-cell RNA sequencing(scRNA-seq),we demonstrate the presence of sexually dimorphic transcriptomes in mouseβcells.Using a high-fat diet-induced T2D mouse model,we identified sex-dependent T2D altered genes,suggesting sex-based differences in the pathological mechanisms of T2D.Furthermore,based on islet transplantation experiments,we found that compared to mice with sexmatched islet transplants,sex-mismatched islet transplants in healthy mice showed down-regulation of genes involved in the longevity regulating pathway ofβcells.Moreover,the diabetic mice with sex-mismatched islet transplants showed impaired glucose tolerance.These data suggest sexual dimorphism in T2D pathogenicity,indicating that sex should be considered when treating T2D.We hope that our findings could provide new insights for the development of precision medicine in T2D. 展开更多
关键词 Type 2 diabetes mellitus Pancreaticβcell Sex-biased gene expression Sex-dependent t2D altered genes Precision medicine
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Th1和Th2相关白介素基因多态性与Graves病的相关性研究
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作者 朱巍 郭婷 +4 位作者 刘楠 崔斌 王曙 宁光 王卫庆 《内科理论与实践》 2013年第4期229-233,共5页
目的:探讨辅助性T细胞(Th)1和Th2相关白介素(IL)基因单核苷酸多态性(SNP)与Graves病的遗传相关性。方法:选取Th1相关IL-1α、IL-1β、IL-10、IL-12A基因和Th2相关IL-3、IL-4、IL-5、IL-9、IL-13基因的共18个SNP,采用高通量SNPstream芯... 目的:探讨辅助性T细胞(Th)1和Th2相关白介素(IL)基因单核苷酸多态性(SNP)与Graves病的遗传相关性。方法:选取Th1相关IL-1α、IL-1β、IL-10、IL-12A基因和Th2相关IL-3、IL-4、IL-5、IL-9、IL-13基因的共18个SNP,采用高通量SNPstream芯片技术检测,在751例来自上海的Graves病患者和748名正常对照者中进行病例对照研究。结果:Th1相关IL基因中,位于IL-1α的rs1800587、位于IL-10的rs1800896和rs3021094、位于IL-12A的rs568408均是Graves病的易感位点。IL-10基因的单倍型AACAT和IL-12A基因的单倍型TTAAG都可导致Graves病患病风险增加。Th2相关IL基因中,IL-3基因的rs40401位点和IL-5基因的rs2069812位点是Graves病的易感位点,且此两者存在风险叠加效应。结论:Th1和Th2相关IL基因多态性与Graves病有遗传相关性。 展开更多
关键词 辅助性T细胞1 辅助性T细胞2 单核苷酸多态性 GRAVES病 白介素基因
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