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草莓miR390靶基因TAS3的克隆及表达分析
被引量:
4
1
作者
李贺
毛健鑫
+2 位作者
戚华彩
张志宏
纪明山
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期2153-2158,共6页
以栽培草莓品种‘全明星’为试材,通过3′-和5′-RACE技术克隆出miR390靶基因TAS3的cDNA全长,命名为FaTAS3。序列分析发现:草莓TAS3基因的cDNA全长为742bp,含有16个碱基的Poly A尾巴及2个高度保守的ta-siRNA产生位点和1个miR390靶位点;...
以栽培草莓品种‘全明星’为试材,通过3′-和5′-RACE技术克隆出miR390靶基因TAS3的cDNA全长,命名为FaTAS3。序列分析发现:草莓TAS3基因的cDNA全长为742bp,含有16个碱基的Poly A尾巴及2个高度保守的ta-siRNA产生位点和1个miR390靶位点;该基因DNA全长为824bp,5′端130bp处有一个98bp的内含子序列。生物信息学软件预测显示,草莓TAS3基因的启动子除具有TATA/CAAT-box外,还含有G-box、Cbox等特异作用元件。实时定量RT-PCR结果表明,草莓miR390与靶基因TAS3间的表达模式与拟南芥中的表达模式相同,推测草莓TAS3基因的生物合成也受miR390的指导。
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关键词
草莓
tas3
基因
miR390
实时定量RT—PCR
下载PDF
职称材料
菊花TAS3 tasi-RNA靶基因CmARF4的鉴定及表达分析
被引量:
1
2
作者
时春美
朱文静
+4 位作者
田畅
蒋甲福
宋爱萍
陈发棣
陈素梅
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期1006-1014,共9页
[目的]本文旨在鉴定菊花TAS3 tasi-RNA的靶基因生长素响应因子CmARF4,并探讨该基因的表达特性。[方法]以菊花品种‘神马’为材料,利用高保真PCR方法克隆CmARF4基因全长,采用5′RLM-RACE技术验证CmARF4基因是否含有TAS3剪切位点,通过qPC...
[目的]本文旨在鉴定菊花TAS3 tasi-RNA的靶基因生长素响应因子CmARF4,并探讨该基因的表达特性。[方法]以菊花品种‘神马’为材料,利用高保真PCR方法克隆CmARF4基因全长,采用5′RLM-RACE技术验证CmARF4基因是否含有TAS3剪切位点,通过qPCR分析CmARF4基因在不同组织器官中和生长素处理及盐处理条件下的表达水平。[结果]CmARF4为TAS3 tasi-RNA的靶基因,其剪切位点位于TAS35′端的第10与第11位碱基之间。CmARF4基因包含开放阅读框(ORF)2322 bp,编码773个氨基酸,预测其蛋白质相对分子质量为85.7×103,理论pI为6.44,且与刺菜蓟的同源性最高(78.63%)。在营养生长期,芽中CmARF4的表达量最高,茎中次之;在盛花期舌状花中CmARF4的表达量最高,其次是茎。亚细胞定位与转录激活活性分析结果显示:CmARF4蛋白定位在细胞核上,且无转录激活活性。CmARF4响应生长素处理,当萘乙酸(NAA)浓度为5μmol·L^-1时,CmARF4基因的相对表达量在12 h时明显升高;当NAA浓度为15μmol·L^-1时,CmARF4的相对表达量呈上升趋势。200 mmol·L^-1 NaCl处理下,CmARF4的相对表达量在盐胁迫1 h时升至最高,之后逐渐下降。[结论]CmARF4基因为TAS3 tasi-RNA的靶基因,CmARF4的转录水平受生长素及盐处理的诱导。
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关键词
菊花
tas3
tasi-RNA
CmARF4基因
生长素
盐胁迫
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职称材料
番茄LemiR390及其预测靶基因LeTAS3的鉴定与表达分析
被引量:
3
3
作者
于丽丽
刘伟伟
+4 位作者
方媛
周莹
王如意
李洋
周波
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期271-279,共9页
以番茄(Lycopersicon esculentum)紫色花青素积累品系Aft基因型‘LA1996’为试验材料,以番茄总RNA反转录的c DNA文库为模板,根据mirbase数据库中MIR390基因和番茄unigene数据库预测到的靶基因序列,克隆番茄Lemi R390前体基因及其预测靶...
以番茄(Lycopersicon esculentum)紫色花青素积累品系Aft基因型‘LA1996’为试验材料,以番茄总RNA反转录的c DNA文库为模板,根据mirbase数据库中MIR390基因和番茄unigene数据库预测到的靶基因序列,克隆番茄Lemi R390前体基因及其预测靶基因Le TAS3;采用定量PCR技术检测Lemi R390及其预测靶基因Le TAS3在番茄果实不同发育阶段的表达情况,利用RLM 5′RACE技术验证Lemi R390对靶基因m RNA的剪切作用。结果表明,克隆到两个Lemi R390的前体,分别与MIR390a和MIR390b一致,含有完整的茎环结构。Lemi R390与其靶基因Le TAS3在番茄果实不同发育时期表达量不同,果实发育前期特别是花后1~2周幼果期表达量高,发育后期均下降为微量表达,并且在幼果期Lemi R390与Le TAS3表达呈负调控关系。Lemi R390能够靶作用于Le TAS3的转录本调控其降解,其剪切位点为Lemi R390序列5′端的第10位碱基。
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关键词
番茄
Lemi
R390
LE
tas3
基因表达
MI
RNA
原文传递
题名
草莓miR390靶基因TAS3的克隆及表达分析
被引量:
4
1
作者
李贺
毛健鑫
戚华彩
张志宏
纪明山
机构
沈阳农业大学植物保护学院
沈阳农业大学园艺学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期2153-2158,共6页
基金
国家自然科学基金(31101524)
中国博士后科学基金(20100481212
+1 种基金
2012T50270)
辽宁省创新团队项目(LT2010094)
文摘
以栽培草莓品种‘全明星’为试材,通过3′-和5′-RACE技术克隆出miR390靶基因TAS3的cDNA全长,命名为FaTAS3。序列分析发现:草莓TAS3基因的cDNA全长为742bp,含有16个碱基的Poly A尾巴及2个高度保守的ta-siRNA产生位点和1个miR390靶位点;该基因DNA全长为824bp,5′端130bp处有一个98bp的内含子序列。生物信息学软件预测显示,草莓TAS3基因的启动子除具有TATA/CAAT-box外,还含有G-box、Cbox等特异作用元件。实时定量RT-PCR结果表明,草莓miR390与靶基因TAS3间的表达模式与拟南芥中的表达模式相同,推测草莓TAS3基因的生物合成也受miR390的指导。
关键词
草莓
tas3
基因
miR390
实时定量RT—PCR
Keywords
strawberry
tas3 gene
miR390
real time RT-PCR
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
菊花TAS3 tasi-RNA靶基因CmARF4的鉴定及表达分析
被引量:
1
2
作者
时春美
朱文静
田畅
蒋甲福
宋爱萍
陈发棣
陈素梅
机构
南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业农村部景观设计重点实验室/园艺学院
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期1006-1014,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31972451)
国家重点研发计划项目(2018YFD1000402)
江苏省农业科技自主创新资金项目[CX(18)2020]。
文摘
[目的]本文旨在鉴定菊花TAS3 tasi-RNA的靶基因生长素响应因子CmARF4,并探讨该基因的表达特性。[方法]以菊花品种‘神马’为材料,利用高保真PCR方法克隆CmARF4基因全长,采用5′RLM-RACE技术验证CmARF4基因是否含有TAS3剪切位点,通过qPCR分析CmARF4基因在不同组织器官中和生长素处理及盐处理条件下的表达水平。[结果]CmARF4为TAS3 tasi-RNA的靶基因,其剪切位点位于TAS35′端的第10与第11位碱基之间。CmARF4基因包含开放阅读框(ORF)2322 bp,编码773个氨基酸,预测其蛋白质相对分子质量为85.7×103,理论pI为6.44,且与刺菜蓟的同源性最高(78.63%)。在营养生长期,芽中CmARF4的表达量最高,茎中次之;在盛花期舌状花中CmARF4的表达量最高,其次是茎。亚细胞定位与转录激活活性分析结果显示:CmARF4蛋白定位在细胞核上,且无转录激活活性。CmARF4响应生长素处理,当萘乙酸(NAA)浓度为5μmol·L^-1时,CmARF4基因的相对表达量在12 h时明显升高;当NAA浓度为15μmol·L^-1时,CmARF4的相对表达量呈上升趋势。200 mmol·L^-1 NaCl处理下,CmARF4的相对表达量在盐胁迫1 h时升至最高,之后逐渐下降。[结论]CmARF4基因为TAS3 tasi-RNA的靶基因,CmARF4的转录水平受生长素及盐处理的诱导。
关键词
菊花
tas3
tasi-RNA
CmARF4基因
生长素
盐胁迫
Keywords
Chrysanthemum morifolium
tas3
tasi-RNA
CmARF4
gene
auxin
salinity stress
分类号
S682.1 [农业科学—观赏园艺]
下载PDF
职称材料
题名
番茄LemiR390及其预测靶基因LeTAS3的鉴定与表达分析
被引量:
3
3
作者
于丽丽
刘伟伟
方媛
周莹
王如意
李洋
周波
机构
东北林业大学生命科学学院
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期271-279,共9页
基金
东北林业大学国家基础科学人才培养基金项目(201220A5)
国家自然科学基金项目(30800082
+2 种基金
31272200)
中央高校基本科研业务费专项资金项目(DL11CA03
2572014EA03-02)
文摘
以番茄(Lycopersicon esculentum)紫色花青素积累品系Aft基因型‘LA1996’为试验材料,以番茄总RNA反转录的c DNA文库为模板,根据mirbase数据库中MIR390基因和番茄unigene数据库预测到的靶基因序列,克隆番茄Lemi R390前体基因及其预测靶基因Le TAS3;采用定量PCR技术检测Lemi R390及其预测靶基因Le TAS3在番茄果实不同发育阶段的表达情况,利用RLM 5′RACE技术验证Lemi R390对靶基因m RNA的剪切作用。结果表明,克隆到两个Lemi R390的前体,分别与MIR390a和MIR390b一致,含有完整的茎环结构。Lemi R390与其靶基因Le TAS3在番茄果实不同发育时期表达量不同,果实发育前期特别是花后1~2周幼果期表达量高,发育后期均下降为微量表达,并且在幼果期Lemi R390与Le TAS3表达呈负调控关系。Lemi R390能够靶作用于Le TAS3的转录本调控其降解,其剪切位点为Lemi R390序列5′端的第10位碱基。
关键词
番茄
Lemi
R390
LE
tas3
基因表达
MI
RNA
Keywords
tomato
Lemi R390
Le
tas3
gene
expression
mi RNA
分类号
S641.2 [农业科学—蔬菜学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草莓miR390靶基因TAS3的克隆及表达分析
李贺
毛健鑫
戚华彩
张志宏
纪明山
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
4
下载PDF
职称材料
2
菊花TAS3 tasi-RNA靶基因CmARF4的鉴定及表达分析
时春美
朱文静
田畅
蒋甲福
宋爱萍
陈发棣
陈素梅
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
下载PDF
职称材料
3
番茄LemiR390及其预测靶基因LeTAS3的鉴定与表达分析
于丽丽
刘伟伟
方媛
周莹
王如意
李洋
周波
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
3
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