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草莓miR390靶基因TAS3的克隆及表达分析
被引量:
4
1
作者
李贺
毛健鑫
+2 位作者
戚华彩
张志宏
纪明山
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期2153-2158,共6页
以栽培草莓品种‘全明星’为试材,通过3′-和5′-RACE技术克隆出miR390靶基因TAS3的cDNA全长,命名为FaTAS3。序列分析发现:草莓TAS3基因的cDNA全长为742bp,含有16个碱基的Poly A尾巴及2个高度保守的ta-siRNA产生位点和1个miR390靶位点;...
以栽培草莓品种‘全明星’为试材,通过3′-和5′-RACE技术克隆出miR390靶基因TAS3的cDNA全长,命名为FaTAS3。序列分析发现:草莓TAS3基因的cDNA全长为742bp,含有16个碱基的Poly A尾巴及2个高度保守的ta-siRNA产生位点和1个miR390靶位点;该基因DNA全长为824bp,5′端130bp处有一个98bp的内含子序列。生物信息学软件预测显示,草莓TAS3基因的启动子除具有TATA/CAAT-box外,还含有G-box、Cbox等特异作用元件。实时定量RT-PCR结果表明,草莓miR390与靶基因TAS3间的表达模式与拟南芥中的表达模式相同,推测草莓TAS3基因的生物合成也受miR390的指导。
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关键词
草莓
tas3基因
miR
3
90
实时定量RT—PCR
下载PDF
职称材料
转小麦冷胁迫蛋白截短基因烟草及其抗病性分析
被引量:
2
2
作者
李娜
杜秀贞
+2 位作者
潘小玫
王金生
宋从凤
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期520-526,共7页
TA3-13是克隆于小麦冷胁迫蛋白基因的截短片段。原核表达的TA3-13蛋白能够诱导烟草产生显著的抗烟草花叶病毒(TMV)的作用。文章将TA3-13基因片段克隆到植物表达载体pBI121上,构建成转基因重组体pB-3-13,通过冻融法转化农杆菌EHA105,构...
TA3-13是克隆于小麦冷胁迫蛋白基因的截短片段。原核表达的TA3-13蛋白能够诱导烟草产生显著的抗烟草花叶病毒(TMV)的作用。文章将TA3-13基因片段克隆到植物表达载体pBI121上,构建成转基因重组体pB-3-13,通过冻融法转化农杆菌EHA105,构建成转基因侵染菌株。采用叶盘法将pB-3-13转化三生烟草,经卡那霉素抗性筛选,获得48株T0代再生植株。通过PCR检测,鉴定出33株转基因单株,收获了20株种子作为T1代株系。PCR-Southern杂交结果显示,PCR阳性条带与TA3-13探针有特异性杂交,说明外源基因被转化到烟草的基因组中。选取两个T1代株系的烟草植株用于各项测定。GUS组织化学活性鉴定和RT-PCR检测结果显示,外源基因可以成功地表达。接种TMV病毒后,转基因烟草抗TMV的能力较转空载体烟草提高3~5倍。转基因烟草具有抗TMV侵入和抗病毒病害发展的作用,同时转基因烟草可以抗细菌软腐病菌的扩展。
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关键词
ta
3
-1
3
基因
转
基因
烟草
抗病性
冷胁迫蛋白
下载PDF
职称材料
羚牛苦味受体3(Tas2R3)基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
1
3
作者
周明
余姣姣
+2 位作者
李彪
欧阳菠
杨建东
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期1957-1968,共12页
Tas2R3是苦味受体基因家族中一个重要的成员,为了进一步了解和研究羚牛(Budorcas taxicolor)苦味受体基因的结构和功能,本研究对羚牛苦味受体3 (Tas2R3)基因进行了克隆和生物信息学分析(GenBank登录号:MG650195)。结果显示,羚牛Tas2R3...
Tas2R3是苦味受体基因家族中一个重要的成员,为了进一步了解和研究羚牛(Budorcas taxicolor)苦味受体基因的结构和功能,本研究对羚牛苦味受体3 (Tas2R3)基因进行了克隆和生物信息学分析(GenBank登录号:MG650195)。结果显示,羚牛Tas2R3基因编码区(coding sequence, CDS)序列全长951 bp,共编码316个氨基酸,以亮氨酸含量最高,谷氨酰胺含量最低。其蛋白质等电点为9.68,分子量为51.96 kD。高级结构功能预测显示,二级结构以α-螺旋为主,蛋白质为碱性、稳定的亲水性蛋白,由4个胞外区、7个跨膜区和4个胞内区组成。预测到2种类型共8个糖基化功能位点和4种类型共15个磷酸化功能位点。通过比较Tas2R3基因种间相似性发现,在偶蹄目中具有很高的同源性,羚牛与绵羊(Ovis aries)的相似性最高(0.98),与褐家鼠(Rattus norvegicus)最低(0.52)。用羚牛、绵羊等12个物种的Tas2R3基因CDS序列构建的NJ树与ME树结构一致,表明Tas2R3基因适合用于构建不同物种间的系统进化树。
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关键词
羚牛
苦味受体
tas
2R
3
基因
克隆
生物信息学分析
原文传递
题名
草莓miR390靶基因TAS3的克隆及表达分析
被引量:
4
1
作者
李贺
毛健鑫
戚华彩
张志宏
纪明山
机构
沈阳农业大学植物保护学院
沈阳农业大学园艺学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期2153-2158,共6页
基金
国家自然科学基金(31101524)
中国博士后科学基金(20100481212
+1 种基金
2012T50270)
辽宁省创新团队项目(LT2010094)
文摘
以栽培草莓品种‘全明星’为试材,通过3′-和5′-RACE技术克隆出miR390靶基因TAS3的cDNA全长,命名为FaTAS3。序列分析发现:草莓TAS3基因的cDNA全长为742bp,含有16个碱基的Poly A尾巴及2个高度保守的ta-siRNA产生位点和1个miR390靶位点;该基因DNA全长为824bp,5′端130bp处有一个98bp的内含子序列。生物信息学软件预测显示,草莓TAS3基因的启动子除具有TATA/CAAT-box外,还含有G-box、Cbox等特异作用元件。实时定量RT-PCR结果表明,草莓miR390与靶基因TAS3间的表达模式与拟南芥中的表达模式相同,推测草莓TAS3基因的生物合成也受miR390的指导。
关键词
草莓
tas3基因
miR
3
90
实时定量RT—PCR
Keywords
strawberry
tas
3
gene
miR
3
90
real time RT-PCR
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
转小麦冷胁迫蛋白截短基因烟草及其抗病性分析
被引量:
2
2
作者
李娜
杜秀贞
潘小玫
王金生
宋从凤
机构
南京农业大学植物保护学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期520-526,共7页
基金
国家自然科学基金项目(编号:30671355)
江苏高校优势学科建设工程项目资助
文摘
TA3-13是克隆于小麦冷胁迫蛋白基因的截短片段。原核表达的TA3-13蛋白能够诱导烟草产生显著的抗烟草花叶病毒(TMV)的作用。文章将TA3-13基因片段克隆到植物表达载体pBI121上,构建成转基因重组体pB-3-13,通过冻融法转化农杆菌EHA105,构建成转基因侵染菌株。采用叶盘法将pB-3-13转化三生烟草,经卡那霉素抗性筛选,获得48株T0代再生植株。通过PCR检测,鉴定出33株转基因单株,收获了20株种子作为T1代株系。PCR-Southern杂交结果显示,PCR阳性条带与TA3-13探针有特异性杂交,说明外源基因被转化到烟草的基因组中。选取两个T1代株系的烟草植株用于各项测定。GUS组织化学活性鉴定和RT-PCR检测结果显示,外源基因可以成功地表达。接种TMV病毒后,转基因烟草抗TMV的能力较转空载体烟草提高3~5倍。转基因烟草具有抗TMV侵入和抗病毒病害发展的作用,同时转基因烟草可以抗细菌软腐病菌的扩展。
关键词
ta
3
-1
3
基因
转
基因
烟草
抗病性
冷胁迫蛋白
Keywords
ta
3
-1
3
gene
transgenic tobacco
disease resis
ta
nce
cold shock protein
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
下载PDF
职称材料
题名
羚牛苦味受体3(Tas2R3)基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
1
3
作者
周明
余姣姣
李彪
欧阳菠
杨建东
机构
四川农业大学动物科技学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期1957-1968,共12页
基金
四川省教育局创新研究小组计划项目(No.14TD0002)资助
文摘
Tas2R3是苦味受体基因家族中一个重要的成员,为了进一步了解和研究羚牛(Budorcas taxicolor)苦味受体基因的结构和功能,本研究对羚牛苦味受体3 (Tas2R3)基因进行了克隆和生物信息学分析(GenBank登录号:MG650195)。结果显示,羚牛Tas2R3基因编码区(coding sequence, CDS)序列全长951 bp,共编码316个氨基酸,以亮氨酸含量最高,谷氨酰胺含量最低。其蛋白质等电点为9.68,分子量为51.96 kD。高级结构功能预测显示,二级结构以α-螺旋为主,蛋白质为碱性、稳定的亲水性蛋白,由4个胞外区、7个跨膜区和4个胞内区组成。预测到2种类型共8个糖基化功能位点和4种类型共15个磷酸化功能位点。通过比较Tas2R3基因种间相似性发现,在偶蹄目中具有很高的同源性,羚牛与绵羊(Ovis aries)的相似性最高(0.98),与褐家鼠(Rattus norvegicus)最低(0.52)。用羚牛、绵羊等12个物种的Tas2R3基因CDS序列构建的NJ树与ME树结构一致,表明Tas2R3基因适合用于构建不同物种间的系统进化树。
关键词
羚牛
苦味受体
tas
2R
3
基因
克隆
生物信息学分析
Keywords
ta
kin(Budorcas
ta
xicolor)
Bitter
tas
te receptor
tas
2R
3
gene
Cloning
Bioinformatics
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草莓miR390靶基因TAS3的克隆及表达分析
李贺
毛健鑫
戚华彩
张志宏
纪明山
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
4
下载PDF
职称材料
2
转小麦冷胁迫蛋白截短基因烟草及其抗病性分析
李娜
杜秀贞
潘小玫
王金生
宋从凤
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011
2
下载PDF
职称材料
3
羚牛苦味受体3(Tas2R3)基因的克隆及生物信息学分析
周明
余姣姣
李彪
欧阳菠
杨建东
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
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