鸡T细胞受体γ链基因位点重新测序和组装

动物T细胞受体(T cell receptor,TCR)基因由多个不同的高度同源的基因家族组成,通过全基因组测序很难获得准确的基因序列和排列位置。文章通过在NCBI中发布的鸡TCR的γ链(TCRγ或TRG)基因片段序列定位了鸡TRG基因所在区域,并确定了与鸡TRG基因位点对应的细菌人工染色体(BAC)克隆(CH261-174P24)。对该克隆进行高通量的重新测序和组装后,得到含有10个scaffolds的基因组草图,较完整地覆盖了鸡TRG基因位点及两侧区域。通过PCR扩增和测序证明了scaffold内部结构的正确性,校正了鸡参考基因组TRG基因位点一个可变基因和一个缺口序列(gap)附近各一处错误序列,以及可变基因区多处序列错误。文章通过校正鸡参考基因组TRG基因位点的序列,为鸡TRA/D和TRB基因位点的基因组序列分析提供了新方法。

北京鸭含有VHδ基因的TCRδ位点结构、表达及其进化特点

为分析北京鸭含有VHδ基因的TCRδ位点的结构、表达及进化特点,本研究通过筛选北京鸭基因组DNA的细菌人工染色体(Bacterial artificial chromosome,BAC)文库,并对筛选到的BAC克隆进行全长测序,获得包含北京鸭第二个TCRδ位点的约136 Kb的基因组序列;深入分析北京鸭第二个TCRδ位点基因序列,发现北京鸭第二个TCRδ位点上的VHδ、Dδ和Jδ之间没有内含子序列,已在基因组水平已经完成了VDJ的重组;同线性分析显示该基因位点结构为SPPL2A-VHδ-Dδ-Jδ-Cδ-OR-OR,与鸡的第二个TCRδ位点5’端具有同线性关系;通过Q-PCR得到了北京鸭二个TCR位点上基因的组织特异表达特点;全面分析鸟类第二个TCRδ位点上各基因的进化关系,结果显示所有鸟类的祖先中已出现了第二个TCRδ位点;但在进化过程中不同鸟类Cδ基因经历了基因的丢失或者基因的复制。

T细胞急性淋巴细胞白血病中的染色体易位及其受累基因的研究进展

染色体易位在T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）中是非常普遍的现象。易位涉及的癌基因在T-ALL的发病机制中起重要作用。T-ALL染色体易位主要包括涉及T细胞受体（TCR）基因位点的染色体易位和形成融合基因的染色体易位。通过对染色体易位导致相关癌基因表达改变的研究来探讨T-ALL的发病机制，为发展临床上有效的相关特异性治疗提供可能。本文就T-ALL中染色体易位和涉及基因的研究进展作一综述。