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Sporothriolide电子圆二色谱的理论计算及其绝对构型的确定
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作者 施震宇 蒋南 +1 位作者 史皓明 李飞 《科学技术与工程》 北大核心 2018年第16期26-32,共7页
Sporothriolide(6-己基-3-亚甲基四氢呋喃[3,4-b]呋喃-2,4-酮)最早是从Sporothrix sp.(孢子丝菌)中发现的一种抗真菌化合物。经核磁共振谱图解析,发现它是一个聚酮化合物;其化学结构中含有3个手性碳中心;并具有两种相对构型,即(3a S,6R,... Sporothriolide(6-己基-3-亚甲基四氢呋喃[3,4-b]呋喃-2,4-酮)最早是从Sporothrix sp.(孢子丝菌)中发现的一种抗真菌化合物。经核磁共振谱图解析,发现它是一个聚酮化合物;其化学结构中含有3个手性碳中心;并具有两种相对构型,即(3a S,6R,6aR)和(3aR,6S,6a S)。为了确定绝对构型,采用含时密度泛函方法,在MPW1LYP/6-31G(d,p)水平上计算了电子圆二色谱。通过与实测谱图的比对,其绝对构型被确定为(3a S,6R,6aR)。五元环的左手构象和右手构象产生了镜像对称的电子圆二色谱,表明五元环的构象翻转对其圆二色谱具有重要影响。此外,溶剂甲醇与sporothriolide之间的分子间氢键导致了低于14.1 nm的Cotton效应偏移,及低于75 cgs的峰强度的增强,说明溶剂化效应对sporothriolide的圆二色谱影响不大。 展开更多
关键词 手性天然产物 电子圆二色谱 tddft计算 手性光谱学性质
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含轴向咪唑配体的手性SalenCo(川)配合物ECD谱的理论解析 被引量:7
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作者 苏晓玲 王越奎 +2 位作者 王炎 贾杰 高小丽 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第7期1633-1639,共7页
用密度泛函理论(DFT)方法,在B3LYP和混合基组(C,H原子用6-31 G*;Co,N,O用6-31 1+G(2d,p))水平上,对含轴向配体的三种Co(Ⅲ)席夫碱配合物[Co(MeO-salen)(国m)_2]^+、[Co(MeO-salen)(2-Melm)_2]^+和[Co(MeO-salen)(Melm)_2]^+(lm=咪唑,Mel... 用密度泛函理论(DFT)方法,在B3LYP和混合基组(C,H原子用6-31 G*;Co,N,O用6-31 1+G(2d,p))水平上,对含轴向配体的三种Co(Ⅲ)席夫碱配合物[Co(MeO-salen)(国m)_2]^+、[Co(MeO-salen)(2-Melm)_2]^+和[Co(MeO-salen)(Melm)_2]^+(lm=咪唑,Melm=1-甲基咪唑,2-Melm=2-甲基咪唑,MeO-salenH2=salen型席夫碱,即(R,R)-N,N'-双(5-甲氧基亚水杨基)-1,2-二亚胺基环己烷)在二氯甲烷溶液中的基态结构进行了优化,并用含时密度泛函理论(TDDFT)方法,在相同泛函和基组水平上计算了其激发能、振子强度和旋转强度.这些计算中均用极化连续介质模型(PCM)考虑了溶剂效应.计算的电子圆二色(ECD)谱与实验谱吻合较好.通过对有关跃迁性质的分析,对实验电子圆二色光谱进行了解析与指认.结果表明,长波区的第一个园二色(CD)吸收带主要是由π→d荷移跃迁(LMCT)引起的,而不是通常认为的d→d跃迁.轴向配体的加入对配合物前两个CD吸收带的符号没有影响,但会影响带形和强度.手性salen配合物的绝对构型为λ(RR)时,第一个CD吸收带为正,第二个为负.这些结论对于深入理解该类配合物的电子结构和手征光学性质具有重要的科学意义. 展开更多
关键词 钴席夫碱配合物 轴向咪唑配体 圆二色谱 tddft计算 手征光学性质
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手性络合物[M(bpy)_2(phen)]^(2+)和[M(phen)_2(bpy)]^(2+)(M=Ru,Os)圆二色谱的理论解析 被引量:1
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作者 高小丽 王越奎 +2 位作者 王炎 贾杰 苏晓玲 《中国科学:化学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期1145-1155,共11页
应用密度泛函理论,在B3LYP/LanL2DZ水平上对C2对称性的混配络合物[M(bpy)2(phen)]2+和[M(phen)2(bpy)]2+(M=Ru、Os;bpy=2,2'-bipyridine;phen=1,10-phenanthroline)在水溶液中的几何构型进行了优化,并用TDDFT/B3LYP方法和相同的基... 应用密度泛函理论,在B3LYP/LanL2DZ水平上对C2对称性的混配络合物[M(bpy)2(phen)]2+和[M(phen)2(bpy)]2+(M=Ru、Os;bpy=2,2'-bipyridine;phen=1,10-phenanthroline)在水溶液中的几何构型进行了优化,并用TDDFT/B3LYP方法和相同的基组计算了其激发能、旋转强度和振子强度,绘制了相应的圆二色谱(CD).在分析有关跃迁性质的基础上,对实验圆二色谱的谱带进行了明确的解析和指认,同时讨论了短波区激子裂分的规律性.结果表明:四种络合物在长波区(λ>320nm)的CD吸收带主要是由d-π*跃迁产生的荷移谱带;短波区(λ<320nm)则是配体上平行于长轴的π-π*跃迁产生的激子耦合带,且对于Λ构型表现为正的手性激子裂分.其中,[M(bpy)2(phen)]2+只显示出正负两个激子带,分属于联吡啶和邻菲咯啉配体;而[M(phen)2(bpy)]2+则有三个激子带,其中左侧的两个(一负一正)属于邻菲咯啉配体,右侧的正带则属于联吡啶配体.此外,尽管激子耦合属于远程相互作用,但用TDDFT计算的激子裂分样式仍是正确的.这些结论对于深入理解有关混配络合物的电子结构、关联络合物的绝对构型和探讨手性识别机理等具有重要的科学意义. 展开更多
关键词 钌、锇的混配络合物 ECD谱理论解析 tddft计算 手征光学性质
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手性配合物[M(bipy)_3]^(2+)(M=Fe,Ru,Os)圆二色谱的理论解析 被引量:4
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作者 杨翊韬 王越奎 +3 位作者 王炎 贾杰 苏晓玲 高小丽 《中国科学:化学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期1091-1098,共8页
应用密度泛函理论,在DFT/B3LYP/LanL2DZ水平上优化了铁族配合物[M(bipy)3]2+(M=Fe,Ru,Os;bipy=2,2′-联吡啶)在溶液中的基态几何结构,并用TDDFT/B3LYP方法和相同的基组计算了该类配合物的激发能、旋转强度和振子强度,绘制了相应的圆二色... 应用密度泛函理论,在DFT/B3LYP/LanL2DZ水平上优化了铁族配合物[M(bipy)3]2+(M=Fe,Ru,Os;bipy=2,2′-联吡啶)在溶液中的基态几何结构,并用TDDFT/B3LYP方法和相同的基组计算了该类配合物的激发能、旋转强度和振子强度,绘制了相应的圆二色谱.计算的谱带位置虽有一定的红移或蓝移,但各谱带的带形和符号均与实验谱吻合.对跃迁性质的分析表明,三个配合物在长波区,除[Fe(bipy)3]2+的第一个谱带是以d-d跃迁为主外,其他谱带均是荷移跃迁为主.短波区的两个强带则是以π-π*跃迁为主的激子耦合带:对于铁配合物,TDDFT可以正确预言其正负带的强度比,但对钌和锇配合物而言,由于对激子跃迁中荷移成份的贡献估计不足,计算的比值偏小.这一结论为进一步改进有关的计算模型指明了方向. 展开更多
关键词 铁族联吡啶配合物 圆二色谱 tddft计算 手征光学性质
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利用共振拉曼光谱鉴别茶多酚类分子的可行性研究 被引量:1
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作者 赵欣怡 何少贵 +1 位作者 冯施施 梁万珍 《分子科学学报》 CAS 北大核心 2022年第2期145-153,共9页
本文从理论上探究是否可以利用共振拉曼光谱(RRS)来鉴别儿茶素类物质中的4种主要成分:EC,EGC,ECG和EGCG,并研究这些物质的微观结构信息和指纹特征谱.首先通过比较计算和实验测得的常规拉曼光谱确认了分子的构型;然后利用含时密度泛函理... 本文从理论上探究是否可以利用共振拉曼光谱(RRS)来鉴别儿茶素类物质中的4种主要成分:EC,EGC,ECG和EGCG,并研究这些物质的微观结构信息和指纹特征谱.首先通过比较计算和实验测得的常规拉曼光谱确认了分子的构型;然后利用含时密度泛函理论(TD-DFT)计算了分子的紫外-可见(UV-Vis)吸收光谱,进而利用含时相关函数方法计算了与主要吸收峰对应的RRS,后者计算中其所需的几何和电子结构信息由(TD-)DFT提供.结果显示:虽然EC和EGC、ECG和EGCG二者在结构上仅仅只存在1个酚羟基的差别,但它们的RRS存在明显不同的指纹特征;现实中人们可以用不同频率的激光选择性地激发儿茶素类物质来获得RRS,以期鉴别儿茶素类物质. 展开更多
关键词 儿茶素类分子 常规和共振Raman光谱 UV-Vis吸收光谱 电子结构 DFT/tddft计算
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Theory and algorithms for the excited states of large molecules and molecular aggregates 被引量:2
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作者 LIANG WanZhen WU Wei State 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 2013年第9期1267-1270,共4页
This project aims to attack the frontiers of electronic structure calculations on the excited states of large molecules and molecular aggregates by developing novel theoretical and computational methods. The methodolo... This project aims to attack the frontiers of electronic structure calculations on the excited states of large molecules and molecular aggregates by developing novel theoretical and computational methods. The methodology development is especially based on the time-dependent density functional theory (TDDFT) and valence bond (VB) theory, and is expected to be computationally effective and accurate as well. Research works on the following related subjects will be performed: (1) The analytical energy-derivative approaches for electronically excited state within TDDFT will be developed to reduce bypass the computational costs in the calculation of molecular excited-state properties. (2) The ab initio methods for electronically excited state based on VB theory and hybrid TDDFT-VB method will be developed to overcome the limitations of current TDDFT in simulating photophysics and photochemistry. (3) For larger aggregates, neither ab initio methods nor TDDFT is applicable. We intend to build the effective model Hamiltonian by developing novel theoretical and computational methods to calculate the involved microscopic physical parameters from the first-principles methods. The constructed effective Hamiltonian is then used to describe the excitonic states and excitonic dynamics of the natural or artificial photosynthesized systems, organic or inorganic photovoltaic cell. (4) The condensed phase environment is taken into account by combining the developed theories and algorithms based on TDDFT and VB with the polarizable continuum solvent models (PCM), molecular mechanism (MM), classical electrodynamics (ED) or molecular dynamics (MD) theory. (5) Highly efficient software packages will be designed and developed. 展开更多
关键词 molecular aggregates excited state effective model Hamiltonian time-dependent density functional theory tddft valence bond (VB) theory multiscale models
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