小鼠凋亡相关新基因TFAR15的克隆和序列分析

目的克隆人白血病细胞凋亡相关新基因TFAR15的小鼠同源序列 ,并比较其在不同种属间的序列同源性。方法利用EST(expressedsequencetag)拼排、RT PCR、DNA序列测定和计算机分析技术 ,对小鼠TFAR15进行研究。结果首次成功地进行了小鼠TFAR15全长cDNA的克隆和序列分析 ,发现小鼠TFAR15与小鼠其它cDNA没有明显的同源性 ,因此提交GenBank并被收录 ,登录号为AF159368。小鼠TFAR15和人TFAR15在核苷酸水平上有92.3 %的同源性 ,在氨基酸水平上有高达98.6 %的同源性 ;同时发现小鼠TFAR15在氨基酸水平上与线虫C14A4.11蛋白质有38 %的同源性。功能区分析发现 ,小鼠TFAR15cDNA序列含编码212个氨基酸的开放读码框架 ,有2个可能的N 糖基化位点 ,3个可能的caseinkinaseII磷酸化位点 ,4个可能的PKC磷酸化位点 ,并且可能是一种胞浆蛋白(cytoplasmicprotein)。结论小鼠TFAR15是进化上高度保守的新基因 ,可能具有重要的功能。

一个人类凋亡相关新基因TFAR15的cDNA克隆化与表达

运用cDNA RDA(cDNA Representationaldifferencesanalysis)的方法 ,已获得了在细胞因子依赖性红白血病细胞系TF 1中撤除GM CSF(Granulocytemacrophage colonystimulatingfactor)后表达增高的多个基因片段 ,其中一个经GenBank检索为新基因 .利用RACE (rapidamplificationofcDNAends)和EST (expressedsequencetags)重叠片段拼接的方法克隆了该基因的cDNA全长序列 ,命名该基因为TFAR1 5 (TF 1cellapoptosisrelatedgene 1 5 ) .TFAR1 5全长cDNA由 1 2 1 8个碱基组成 ,其分布十分广泛 .随着GM CSF的去除 ,TF 1细胞中TFAR1 5的mRNA和蛋白表达水平均有不同程度的增高 .体外活性研究发现 ,重组TFAR1 5蛋白片段可抑制人胚肾细胞 2 93的自然凋亡 .