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分子对接技术预测丹酚酸B对TGF-β/Smads信号通路的潜在作用靶点 被引量:1
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作者 曾煦欣 郭嘉亮 +3 位作者 刘妙玲 王芳 尹雅祺 赵志雄 《广东药科大学学报》 CAS 2019年第1期92-96,共5页
目的利用分子反向对接方法,探索丹酚酸B在TGF-β/Smads通路中的潜在作用靶点,为研究丹酚酸B干预上皮-间充质转化与纤维化机制提供参考依据。方法通过查阅文献寻找与TGF-β/Smads信号通路有关的药物靶点,构建TGF-β/Smads信号通路蛋白靶... 目的利用分子反向对接方法,探索丹酚酸B在TGF-β/Smads通路中的潜在作用靶点,为研究丹酚酸B干预上皮-间充质转化与纤维化机制提供参考依据。方法通过查阅文献寻找与TGF-β/Smads信号通路有关的药物靶点,构建TGF-β/Smads信号通路蛋白靶点结构数据集,通过分子对接软件AutoDockVina,对丹酚酸B和结构数据集中的蛋白分子进行反向分子模拟对接,根据丹酚酸B和各个靶点蛋白亲和力分数高低和对接构象相互作用的大小,筛选出潜在的靶点蛋白。结果根据AutoDockVina构象结合打分结果进行分析,分数最佳的是Snail(2y48)和Axin(2x39),均为-10.9分。Chimera构象检视显示Snail的结构优于Axin,从得分总体情况分析,Axin优于Snail。结论推测Snail、Axin可能为丹酚酸B潜在的药物作用靶点蛋白。 展开更多
关键词 丹酚酸B tgf-Β/smads 信号通路 靶点 分子对接
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胰腺上皮内瘤变和胰腺癌中TGF-β/Smads信号通路相关基因的突变分析
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作者 郑建明 朱明华 +4 位作者 王炜 刘晓红 陈颖 龚志锦 林万和 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期1088-1091,共4页
目的:探讨TGF-β/Smads信号通路相关基因在胰腺上皮内瘤变和胰腺癌中的变化规律。方法:采用组织芯片、激光显微切割、PCRSSCP和直接测序技术,检测各级别胰腺上皮内瘤变和胰腺癌组织中TGF-β/Smads信号通路相关基因突变。结果:23例胰腺... 目的:探讨TGF-β/Smads信号通路相关基因在胰腺上皮内瘤变和胰腺癌中的变化规律。方法:采用组织芯片、激光显微切割、PCRSSCP和直接测序技术,检测各级别胰腺上皮内瘤变和胰腺癌组织中TGF-β/Smads信号通路相关基因突变。结果:23例胰腺癌中有2例分别存在Smad4基因(DPC4)第8和第11外显子的纯合性缺失;2例PanIN3病灶和5例胰腺癌中分别存在Smad4基因第8外显子、第11外显子,TβRⅡ基因第3外显子和Smad2基因第1外显子的突变。突变类型包括错义突变、移码突变和多聚腺苷酸A的缺失,且基因改变者的免疫组化结果与之完全一致。结论:TGF-β/Smads信号通路中Smad4基因(DPC4)改变在胰腺癌形成和发展过程中起主导作用。 展开更多
关键词 胰腺上皮内瘤变 胰腺癌 tgf-β/smads信号通路相关基因 基因突变
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Smads基因功能的研究进展 被引量:25
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作者 杨晓 黄培堂 黄翠芬 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 2000年第2期145-150,共6页
转化生长因子 -β( TGF-β)超家族通过调节细胞的增殖、分化、移行和凋亡而在脊椎动物发育过程中起重要的作用 . SMAD家族是一类新发现的 TGF-β信号的细胞质内介导者 ,它们可将TGF- β信号直接从细胞膜转导入细胞核内 .受体激活的 SMAD... 转化生长因子 -β( TGF-β)超家族通过调节细胞的增殖、分化、移行和凋亡而在脊椎动物发育过程中起重要的作用 . SMAD家族是一类新发现的 TGF-β信号的细胞质内介导者 ,它们可将TGF- β信号直接从细胞膜转导入细胞核内 .受体激活的 SMADs被特导性的细胞表面受体磷酸化后 ,与通用介导分子 SMAD4相互作用形成异源三聚体 ,转移至细胞核内并激活靶基因的转录 .抑制型 SMADs通过负反馈途径阻断或减弱 TGF- β信号 .SMADs通过与 TGF- β配体应答的启动子序列及其它转录因子和辅助活化因子相互作用而调节转录 .通过同源重组在小鼠中定位敲除Smads基因的研究已经开始揭示 SMADs分子在脊椎动物发育过程中的功能 . 展开更多
关键词 tgf 信号转导 smads 体内转导 脊椎动物 发育
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Smad及其结合蛋白在TGFβ信号传导中的功能 被引量:5
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作者 王海霞 朱大海 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期479-483,共5页
转化生长因子β超家族的细胞因子在细胞生长发育和分化、物质代谢等方面都有极其重要的作用,这种多功效性决定在细胞内必然存在复杂的TGF β信号传导通路。Smad是TGF β超家族信号传导的下游因子,介导TGF β信号从胞质中传入细胞核,特... 转化生长因子β超家族的细胞因子在细胞生长发育和分化、物质代谢等方面都有极其重要的作用,这种多功效性决定在细胞内必然存在复杂的TGF β信号传导通路。Smad是TGF β超家族信号传导的下游因子,介导TGF β信号从胞质中传入细胞核,特异性调节TGF β靶基因的表达。最近的研究发现与Smad结合的蛋白因子,包括转录因子、活化因子和抑制因子等在Smad特异性识别和调控TGF β靶基因表达的过程中起着十分重要的作用。同时,Smad通过与不同蛋白因子相结合形成复合体调控TGF β靶基因的表达可能是TGF β具有多种生物学功能的分子基础。 展开更多
关键词 smad 结合蛋白 信号传导 转化生长因子Β 细胞
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比较不同方法肝脏靶向性导入抗TGF-β_1 siRNA对肝细胞TGF-β/Smad信号传导通路的影响 被引量:1
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作者 张涛 黄顺玲 +1 位作者 孙克伟 谭德明 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2011年第2期132-137,共6页
目的比较抗TGF-β1 siRNA靶向性进入肝细胞的4种转染方式在抗肝损伤与纤维化及对TGF-β/Smad信号传导通路影响中的效果差异,并探讨各自的优劣。方法已启动肝组织中的TGF-β/Smad信号传导通路的50只模型鼠,随机分为模型对照组、尾静脉直... 目的比较抗TGF-β1 siRNA靶向性进入肝细胞的4种转染方式在抗肝损伤与纤维化及对TGF-β/Smad信号传导通路影响中的效果差异,并探讨各自的优劣。方法已启动肝组织中的TGF-β/Smad信号传导通路的50只模型鼠,随机分为模型对照组、尾静脉直接注射组、脂质体包裹组、流体动力学法组和肝动脉插管组,每组10只;将构建的TGF-β1 siRNA质粒分别通过尾静脉直接注射、脂质体包裹、流体动力学法、肝动脉插管等方式导入肝脏靶细胞;分别检测血清指标ALT、AST、HA;取肝组织,HE染色病理检测;RT-PCR技术检测Ⅰ、Ⅲ型胶原、TGF-β1和Smad3 mRNA表达;免疫组化技术检测Ⅰ、Ⅲ型胶原、TGF-β和Smad3蛋白表达。结果抗TGF-β1siRNA质粒经过以上4种导入方法转染入靶细胞,均能有效地阻断大鼠肝组织中的TGF-β/Smad信号传导通路的传导(P<0.05);4种导入方法比较,肝动脉插管组与脂质体包裹组效果相当(P>0.05),优于尾静脉直接注射组及流体动力学法组(P<0.05),尾静脉直接注射组效果最差(P<0.05)。结论抗TGF-β1siRNA质粒经肝动脉插管途径转染,是一种安全、高效的外源基因肝脏靶向导入转染方法。 展开更多
关键词 肝脏靶向性给药 小干扰RNA tgf-β/smad信号传导通路 基因转染
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恶性肿瘤中TGF-β_1信号传递分子DPC4/Smad4的研究进展 被引量:1
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作者 潘元青 孙少华 马岚 《肿瘤防治杂志》 2004年第4期414-417,共4页
DPC4/Smad4基因是新近被鉴定的一个肿瘤抑制基因 ,其编码的DPC4/Smad4蛋白是TGF β信号传导通路中的重要传导蛋白 ,是TGF β配体、受体结合后后续信号传导的胞质递质 ,参与TGF β受体激活后的信号传导。DPC4/Smad4调控的下游目的基因有p... DPC4/Smad4基因是新近被鉴定的一个肿瘤抑制基因 ,其编码的DPC4/Smad4蛋白是TGF β信号传导通路中的重要传导蛋白 ,是TGF β配体、受体结合后后续信号传导的胞质递质 ,参与TGF β受体激活后的信号传导。DPC4/Smad4调控的下游目的基因有p2 1WAF1、uPA、PAI 1、VEGF、TSP 1。转化生长因子 -β(transforminggrowthfactorbeta ,TGF β)信号传导通路的配体、受体、胞内信号传导分子Smad蛋白及其调控的下游目的基因等组成一个肿瘤生长的负性调节 ,通路中任何一个元件的异常都可引起信号传导紊乱 。 展开更多
关键词 tgf-Β1 DPC4/smad4 信号传导 下游目的基因 恶性肿瘤
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TGFβ1/smad7信号通路在大鼠肝纤维化发生中的活化及意义 被引量:4
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作者 余晓红 郑颖娟 +2 位作者 吕宏迪 杨旸 杨廷桐 《实用医药杂志》 2015年第3期261-263,共3页
目的探讨肝纤维化组织中TGFβ1/smad7信号传导通路的活化及意义。方法将Wistar大鼠随机分为对照组、模型组(腹腔注射10%的CCl4),8周后检测血清ALT、HA和TGFβ1水平,HE染色观察肝组织炎性反应及纤维化程度,Western blot与RT-PCR法检测肝... 目的探讨肝纤维化组织中TGFβ1/smad7信号传导通路的活化及意义。方法将Wistar大鼠随机分为对照组、模型组(腹腔注射10%的CCl4),8周后检测血清ALT、HA和TGFβ1水平,HE染色观察肝组织炎性反应及纤维化程度,Western blot与RT-PCR法检测肝组织TGFβ1、Smad3、Smad7、蛋白和m RNA水平。结果模型组血清ALT、HA和TGFβ1水平明显高于对照组;肝组织TGFβ1、Smad3和Smad7蛋白表达量分别是3.87±0.87,2.64±0.95,1.21±0.54,TGFβ1、Smad3高于对照组(1.08±0.61,0.82±0.05);Smad7低于对照组(2.84±1.16),蛋白和m RNA表达较对照组(6.32±1.18)显著降低(P<0.01)。结论 TGFβ1/smad信号传导通路过度活化与血清中ALT、HA和TGFβ1水平升高可能与肝纤维化的发生和发展密切相关。 展开更多
关键词 肝纤维化 信号传导通路 转化生长因子 β1 smad基因
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目标基因测序技术检测与下颌前突相关的BMP-Smad信号通路基因突变
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作者 李偲 陈凤山 《口腔颌面外科杂志》 CAS 2016年第6期399-405,共7页
目的:采用目标基因捕获联合二代测序技术探索BMP-Smad信号通路基因与下颌前突(mandibular prognathism)相关的变异。方法 :从同济大学附属口腔医院收集176例下颌前突患者及155例正常对照,分别采集5 m L静脉血并提取基因组DNA。采用Nimbl... 目的:采用目标基因捕获联合二代测序技术探索BMP-Smad信号通路基因与下颌前突(mandibular prognathism)相关的变异。方法 :从同济大学附属口腔医院收集176例下颌前突患者及155例正常对照,分别采集5 m L静脉血并提取基因组DNA。采用Nimble Gen捕获富集系统对病例对照组的23个目标基因的编码区和侧翼区进行捕获富集,通过Illumina Hiseq 2000测序平台进行测序。通过比较变异位点基因型及等位基因分布频率的差异,探索与下颌前突相关的突变位点。结果:共发现7个与下颌前突相关的常见变异,分别位于5个基因上:chr4:81975103(BMP3)、rs7078571(BMPR1A)、chr2:148686946(ACVR2A)、rs1128919(ACVR2A)、rs2070489(ACVR2B)、chr18:48610378(SMAD4)、chr18:48610376(SMAD4)。未发现罕见变异的分布差异有显著性。结论 :通过目标基因测序的方法检测到了病例对照组中的常见变异和罕见变异,并发现了与下颌前突相关的可能致病基因BMP3、BMPR1A、ACVR2A、ACVR2B、Smad4。未检测到下颌前突的罕见致病位点。 展开更多
关键词 下颌前突 目标基因捕获 新一代测序 BMP-smad信号通路 突变
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敲低NIPBL基因调控小鼠骨髓间充质干细胞向软骨的分化 被引量:1
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作者 马雯晴 张惠荣 +2 位作者 刘辉 董丽丽 杨眷娣 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2023年第10期1477-1483,共7页
背景:目前已将NIPBL基因突变作为诊断Cornelia de Lange综合征的首选指标,但由于该病的遗传异质性,显著增加了临床诊疗难度,尤其患儿骨骼发育畸形的发生率高,其发病机制尚不明确,目前无有效治疗方案,患儿平均寿命较一般人群显著缩短。目... 背景:目前已将NIPBL基因突变作为诊断Cornelia de Lange综合征的首选指标,但由于该病的遗传异质性,显著增加了临床诊疗难度,尤其患儿骨骼发育畸形的发生率高,其发病机制尚不明确,目前无有效治疗方案,患儿平均寿命较一般人群显著缩短。目的:探究敲低NIPBL基因对小鼠骨髓间充质干细胞成软骨分化能力的影响及其可能的分子调控机制。方法:将慢病毒转染NIPBL sh RNA的小鼠骨髓间充质干细胞作为sh-NIPBL组,慢病毒空载体转染的骨髓间充质干细胞作为sh-NC组,无慢病毒干扰的骨髓间充质干细胞作为空白对照组,对上述3组细胞进行成软骨诱导培养,诱导21 d后测量软骨微球最大横截面的周长,行阿利辛蓝染色鉴定其诱导分化结果,免疫荧光法检测软骨细胞Ⅱ型胶原的表达水平,应用实时荧光定量PCR法检测软骨细胞Sox-9、TGF-β1、Smad2、Smad4 m RNA表达水平。结果与结论:(1)成软骨诱导第21天,sh-NIPBL组的软骨微球最大横截面的周长明显小于对照组(P <0.05),阿利辛蓝染色后在倒置显微镜下观察sh-NC组较sh-NIPBL组可见更多的蓝色软骨内酸性黏多糖;(2)诱导成软骨分化后,sh-NIPBL组骨髓间充质干细胞中Ⅱ型胶原、Sox-9的表达低于sh-NC组和空白对照组(P <0.05);(3)成软骨诱导过程中,sh-NIPBL组TGF-β1、Smad2、Smad4基因的表达水平低于sh-NC组和空白对照组(P <0.05);(4)结果表明,慢病毒敲低NIPBL基因表达降低了骨髓间充质干细胞的成软骨分化能力,且该过程可能由TGF-β1/Smad信号通路参与介导。 展开更多
关键词 NIPBL基因 骨骼发育缺陷 慢病毒转染 成软骨分化 tgf-Β1/smad信号通路 Cornelia de Lange综合征
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miR-637靶向SCUBE3对结肠癌细胞增殖及凋亡的影响 被引量:1
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作者 黄洋峰 赵海明 +2 位作者 罗玉明 汪英 唐鹏 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2022年第9期930-937,共8页
目的miR-637靶向SCUBE3调控结肠癌的作用仍未完全清晰,文章旨在探讨miR-637在结肠癌的表达及其是否靶向SCUBE3影响结肠癌的生长。方法选取20份结肠癌组织和癌旁组织样本及结肠癌细胞系HCT116细胞为研究对象,细胞转染miR-637-mimic、miR-... 目的miR-637靶向SCUBE3调控结肠癌的作用仍未完全清晰,文章旨在探讨miR-637在结肠癌的表达及其是否靶向SCUBE3影响结肠癌的生长。方法选取20份结肠癌组织和癌旁组织样本及结肠癌细胞系HCT116细胞为研究对象,细胞转染miR-637-mimic、miR-637-inhibitor或/和pcDNA3.1-SCUBE3。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)或免疫组织化学法检测组织miR-637或信号肽-CUB-EGF样结构域蛋白3(SCUBE3)表达;qRT-PCR和CCK-8检测miR-637表达及其对细胞增殖的影响;流式细胞凋亡和蛋白质印迹法(Western blot)分析miR-637对细胞凋亡的影响;荧光素酶实验、qRT-PCR和Western blot检测miR-637与SCUBE3的靶向关系;Western blot检测miR-637对TGFβ/Smad信号通路的调节作用。结果与癌旁组织相比,结肠癌组织miR-637的表达水平(0.61±0.03)显著下调,SCUBE3的表达(1.81±0.09)显著上调(P<0.01);与阴性对照组相比,miR-637 mimic转染后HCT-116细胞中的miR-637表达(1.53±0.08)显著增强(P<0.05),细胞增殖被显著抑制(P<0.01),细胞凋亡显著增加(P<0.01),且Bax蛋白表达显著升高,Bcl-2、p-smad2、p-smad3、TGF-βR2蛋白表达显著降低(P<0.01);SCUBE3是miR-637的靶基因;与miR-637 mimic组相比,pcDNA3.1-SCUBE3明显抑制了miR-637 mimic的促凋亡作用(P<0.01),miR-637 mimic+pcDNA3.1-SCUBE3组Bax蛋白表达显著降低,Bcl-2、p-smad2、p-smad3、TGF-βR2蛋白表达显著升高(P<0.01)。结论miR-637对结肠癌细胞具有抑制增殖及促凋亡作用,并可能通过靶向SCUBE3和抑制TGF-β/Smad信号通路来抑制结肠癌。 展开更多
关键词 结肠癌 miR-637 信号肽-CUB-EGF样结构域蛋白3 tgfβ/smad信号通路 凋亡 治疗靶点
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Smad信号转导通路在不同证候H22荷瘤小鼠肾上腺的基因表达 被引量:3
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作者 潘志强 方肇勤 +3 位作者 卢文丽 梁超 吴中华 刘小美 《北京中医药大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期336-340,共5页
目的研究TGF-β、Bmp/Smad信号通路基因在不同证候H22肝癌荷瘤小鼠肾上腺的表达特征。方法采用小鼠标准化四诊及辨证方法,以及GeneChip Mouse Exon1.0STArray等技术,检测H22荷瘤小鼠接种第8天(早期)邪毒壅盛证和气虚证、接种第21天(中期... 目的研究TGF-β、Bmp/Smad信号通路基因在不同证候H22肝癌荷瘤小鼠肾上腺的表达特征。方法采用小鼠标准化四诊及辨证方法,以及GeneChip Mouse Exon1.0STArray等技术,检测H22荷瘤小鼠接种第8天(早期)邪毒壅盛证和气虚证、接种第21天(中期)阳气虚证、接种第29天(中晚期)气阴阳虚证共4个证候肾上腺基因表达的差异。通过系统聚类法分析不同证候肾上腺Smad信号通路基因表达模式的相似性及其差异特征。结果就证候而言,邪毒壅盛证与气虚证的基因表达模式相似,而阳气虚证和气阴阳虚证的基因表达模式类似。就基因而言,TGF-βr1、2、3等基因具有相似的表达模式;Smad2与Smad4,Bmp1与Bmp4也具有相似的表达模式。Smad信号通路中,TGF-β受体及Bmp受体表达量分别高于TGF-β与Bmp基因。结论芯片数据提示,H22荷瘤小鼠肿瘤发生后,不同证候的肾上腺Smad通路基因多数被激活,且基因表达模式可能与不同证候有关。 展开更多
关键词 信号转导通路 tgf—β Bmp smad 证候 肾上腺 肿瘤 基因表达 小鼠
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