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不结球白菜抗病基因同源序列的克隆及分析 被引量:14
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作者 王彦华 侯喜林 +2 位作者 申书兴 陈雪平 王梅 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第12期2621-2626,共6页
目的利用同源序列法分离不结球白菜抗病基因同源序列。方法根据植物抗病基因TIR-NBS-LRR保守区设计简并引物,对不结球白菜基因组DNA及cDNA进行PCR扩增。结果获得了10个具有通读氨基酸序列的片段。同源性比较发现,该10个片段均属于TIR-NB... 目的利用同源序列法分离不结球白菜抗病基因同源序列。方法根据植物抗病基因TIR-NBS-LRR保守区设计简并引物,对不结球白菜基因组DNA及cDNA进行PCR扩增。结果获得了10个具有通读氨基酸序列的片段。同源性比较发现,该10个片段均属于TIR-NBS-LRR类抗病基因同源序列(RGA),与已知R基因相应区段的氨基酸序列一致性为50%~66%。与已知抗病基因聚类分析结果显示,该10个RGA序列可以分为5大类。利用RGA950作为探针进行Southern杂交,结果表明,其在基因组中存在多拷贝。结论本研究成功获得了不结球白菜RGA序列,为进一步克隆不结球白菜的R基因奠定了基础。 展开更多
关键词 不结球白菜 抗病基因同源序列 TIR—NBS—LRR SOUTHERN杂交
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毛白杨TIR-NBS-LRR基因转化烟草的研究 被引量:10
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作者 李海霞 张志毅 +3 位作者 张谦 安新民 李琰 刘婷婷 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期73-78,共6页
该文采用农杆菌介导法将从毛白杨中克隆得到的TIR-NBS-LRR抗病基因(PtDRG01)导入烟草中,经抗生素筛选和PCR分子检测,获得了一批阳性转化植株。进而对这些阳性转化植株进行烟草花叶病毒接种实验,从表型观察结果发现,在接种病毒1周和6周后... 该文采用农杆菌介导法将从毛白杨中克隆得到的TIR-NBS-LRR抗病基因(PtDRG01)导入烟草中,经抗生素筛选和PCR分子检测,获得了一批阳性转化植株。进而对这些阳性转化植株进行烟草花叶病毒接种实验,从表型观察结果发现,在接种病毒1周和6周后,转基因烟草株系TG-11的发病程度明显低于非转基因烟草。荧光定量分析结果显示,转基因烟草株系TG-11叶片中的烟草花叶病毒(TMV)数量显著低于非转基因植株,且该转基因株系中的PtDRG01基因转录水平显著高于非转基因植株。这些结果表明,毛白杨PtDRG01基因具有明显的抗病功能,其高效表达能够显著提高烟草的抗TMV能力。该文通过对烟草的遗传转化与病毒接种实验,鉴定了PtDRG01基因的功能,可为其他TIR-NBS-LRR基因的功能鉴定提供参考。 展开更多
关键词 毛白杨 TIR-NBS-LRR基因 转基因烟草 烟草花叶病毒 抗病性
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瑟伯氏棉TIR-NBS-LRR类蛋白质编码基因的克隆与分析 被引量:1
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作者 杨晓杰 赵付安 +4 位作者 唐中杰 李武 赵元明 谢德意 房卫平 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2013年第6期1228-1235,共8页
以对抗黄萎病种质瑟伯氏棉接菌前后高调表达的3个TIR-NBS-LRR类蛋白质点为出发点,根据其对应同源蛋白质B3V7R2(烟草)、B9INW6(棉白杨)和Q19EF1(拟南芥),利用BLAST在线搜索棉花中对应的表达序列标签(EST),分别设计引物,对接菌后的瑟伯氏... 以对抗黄萎病种质瑟伯氏棉接菌前后高调表达的3个TIR-NBS-LRR类蛋白质点为出发点,根据其对应同源蛋白质B3V7R2(烟草)、B9INW6(棉白杨)和Q19EF1(拟南芥),利用BLAST在线搜索棉花中对应的表达序列标签(EST),分别设计引物,对接菌后的瑟伯氏棉进行RT-PCR扩增,进而以获得的EST序列为母序列,通过电子克隆及RACE技术,克隆了3个编码TIR-NBS-LRR类蛋白质的候选基因。生物信息学分析结果表明,3个候选TIR-NBS-LRR类蛋白质编码基因均具有典型的TIR、NBS及LRR功能域;系统进化分析结果显示,3个候选基因在瑟伯氏棉抗黄萎病机制中可能起重要作用。 展开更多
关键词 瑟伯氏棉 黄萎病 TIR-NBR-LRR蛋白质编码基因 克隆与分析
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中间锦鸡儿CiDR1的克隆及干旱胁迫下的表达分析 被引量:2
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作者 武苾菲 李万峰 +3 位作者 徐海燕 张立峰 齐力旺 韩素英 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2017年第2期238-244,共7页
[目的]研究并了解中间锦鸡儿CiDR1基因功能及其对干旱胁迫的响应,为抗性育种提供候选基因。[方法]通过RACE技术从中间锦鸡儿中克隆CiDR1基因的c DNA全长,利用生物信息学分析软件对其基因结构及功能进行分析和预测。再通过qRT-PCR技术对... [目的]研究并了解中间锦鸡儿CiDR1基因功能及其对干旱胁迫的响应,为抗性育种提供候选基因。[方法]通过RACE技术从中间锦鸡儿中克隆CiDR1基因的c DNA全长,利用生物信息学分析软件对其基因结构及功能进行分析和预测。再通过qRT-PCR技术对干旱胁迫后的幼苗中的CiDR1表达模式进行研究。[结果]从中间锦鸡儿中克隆到CiDR1基因的c DNA全长共计4 297 bp,Gen Bank登录号为KP277100。生物信息学分析表明,预测的CiDR1蛋白序列中含有1 243个氨基酸残基,具有抗病基因特征结构域TIR、NB-ARC、LRR等,其等电点为6.35,不稳定指数为42.91,不具备信号肽,为非分泌蛋白,定位于细胞质中。定量PCR检测发现,CiDR1基因在幼年期的茎中表达量较低,在成年期的叶片中表达量较高;在干旱胁迫处理后的幼苗中,CiDR1表达水平有明显下降,表明该基因的表达受干旱抑制,可能与中间锦鸡儿适应干旱相关。[结论]中间锦鸡儿在干旱胁迫后其根、茎和叶中CiDR1的表达均明显下降,表明CiDR1的表达受干旱抑制,可能与中间锦鸡儿适应干旱相关,进一步研究发现CiDR1在根、茎、叶中的表达水平可能受发育阶段调控。 展开更多
关键词 中间锦鸡儿 CI DR1 TIR-NBS-LRR 干旱
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The BZR1-EDS1 module regulates plant growth-defense coordination 被引量:5
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作者 Guang Qi Huan Chen +10 位作者 Dian Wang Hongyuan Zheng Xianfeng Tang Zhengzheng Guo Jiayu Cheng Jian Chen Yiping Wang Ming-yi Bai Fengquan Liu Daowen Wang Zheng Qing Fu 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2021年第12期2072-2087,共16页
Plants have developed sophisticated strategies to coordinate growth and immunity,but our understanding of the underlying mechanism remains limited.In this study,we identified a novel molecular module that reg-ulates p... Plants have developed sophisticated strategies to coordinate growth and immunity,but our understanding of the underlying mechanism remains limited.In this study,we identified a novel molecular module that reg-ulates plant growth and defense in both compatible and incompatible infections.This module consisted of BZR1,a key transcription factor in brassinosteroid(BR)signaling,and EDS1,an essential positive regulator of plant innate immunity.We found that EDS1 interacts with BZR1 and suppresses its transcriptional activ-ities.Consistently,upregulation of EDS1 function by a virulent Pseudomonas syringae strain or salicylic acid treatment inhibited BZR1-regulated expression of BR-responsive genes and BR-promoted growth.Furthermore,we showed that the cytoplasmic fraction of BZR1 positively regulates effector-triggered im-munity(ETI)controlled by the TIR-NB-LRR protein RPS4,which is attenuated by BZR1's nuclear transloca-tion.Mechanistically,cytoplasmic BZR1 facilitated AvrRps4-triggered dissociation of EDS1 and RPS4 by binding to EDS1,thus leading to efficient activation of RPS4-controlled ETI.Notably,transgenic expression of a mutant BZR1 that accumulates exclusively in the cytoplasm improved pathogen resistance without compromising plant growth.Collectively,these results shed new light on plant growth-defense coordina-tion and reveal a previously unknown function for the cytoplasmic fraction of BZR1.The BZR1-EDS1 mod-ule may be harnessed for the simultaneous improvement of crop productivity and pathogen resistance. 展开更多
关键词 BRASSINOSTEROID BZR1 salicylic acid EDS1 basal resistance effector-triggered immunity tir-nb-lrr resistance protein RPS4
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