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过表达TLR4基因绵羊瘤胃与肠道宏基因组分析
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作者 卢畅 逯钧 +5 位作者 宋旭婷 王福明 亓美玉 刘玉峰 陆明海 姚玉昌 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期206-214,共9页
胃肠道微生物生态系统参与机体物质代谢、生物屏障、免疫调控等生理过程,对维持宿主健康具有重要作用。Toll样受体4(Toll-like Receptor 4,TLR4)除在机体天然免疫过程中扮演关键角色之外,胃肠道中TLR4基因的表达可能参与微生物区系结构... 胃肠道微生物生态系统参与机体物质代谢、生物屏障、免疫调控等生理过程,对维持宿主健康具有重要作用。Toll样受体4(Toll-like Receptor 4,TLR4)除在机体天然免疫过程中扮演关键角色之外,胃肠道中TLR4基因的表达可能参与微生物区系结构的塑造。本研究利用前期获得的过表达TLR4基因绵羊,基于宏基因组测序技术探讨TLR4基因高水平表达对绵羊胃肠道微生物群体多样性、丰度及生物学功能的影响。结果表明:TLR4基因过表达后对绵羊瘤胃(P=0.35)和肠道(P=0.56)中微生物Alpha多样性无显著影响;胃肠道中微生物优势菌群(相对丰度>1%)在门、属、种不同分类水平上的区系结构无显著变化。进一步分析TLR4基因过表达对胃肠道中革兰氏阴性菌群(相对丰度<1%)组成的影响,在瘤胃和肠道中分别鉴定出8个和13个差异菌属(P<0.05),33个和32个差异菌种(P<0.05);其中,Helicobactersp.MIT05-5293(P=0.03)和Yersinia pseudotuberculosis(P=0.048)在瘤胃中存在显著差异,Campylobacter hominis(P=0.048)和Escherichia coli(P=0.04)在肠道中存在显著差异。同时,TLR4基因过表达对胃肠道中KEGG level 1和level 2途径的主要通路无明显影响,仅在肠道中KEGG level 2途径的神经变性疾病通路存在差异(P=0.04);而在KEGG level 3途径,瘤胃和肠道中分别有11条和6条非关键通路存在差异。综上,TLR4基因高水平表达对绵羊胃肠道微生物群体多样性、丰度及生物学功能未造成广泛影响,胃肠道微生物生态系统整体上仍处于稳定状态。 展开更多
关键词 绵羊 tlr4基因 胃肠道微生物 KEGG
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疣鼻天鹅TLR4基因克隆及生物信息学分析
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作者 于鑫 胡玉苗 +4 位作者 李芳兵 杨亚东 赵金 冯亚莉 张莹 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期3469-3479,共11页
【目的】克隆疣鼻天鹅Toll样受体4(Toll-like receptor 4,TLR4)基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析,为进一步探索疣鼻天鹅TLR4蛋白抗病原微生物免疫机制提供重要参考依据。【方法】利用PCR扩增并克隆疣鼻天鹅TLR4基因CDS序列,应用NC... 【目的】克隆疣鼻天鹅Toll样受体4(Toll-like receptor 4,TLR4)基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析,为进一步探索疣鼻天鹅TLR4蛋白抗病原微生物免疫机制提供重要参考依据。【方法】利用PCR扩增并克隆疣鼻天鹅TLR4基因CDS序列,应用NCBI-BLAST、Mega-X软件进行序列比对并构建系统进化树;利用ProtParam、SWISS-MODEL等软件预测TLR4基因编码蛋白的结构、功能及与宿主蛋白的相互作用关系,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。【结果】试验成功克隆疣鼻天鹅TLR4基因CDS区序列,全长2550 bp,已提交至NCBI,登录号为:OP908241。疣鼻天鹅TLR4基因CDS区序列中存在79个稀有密码子,其中含6段连续稀有密码子,编码849个氨基酸,与灰雁和鸿雁相似度较高,亲缘关系最近。TLR4蛋白的跨膜结构域位于第647―667位氨基酸处,N-端包含由36个氨基酸组成的信号肽,信号肽切割位点在第36―37位氨基酸之间,置信度为67.85%,含有10个N-糖基化位点和85个磷酸化位点,是亲水性蛋白,主要存在于细胞质中,与人TLR4蛋白有相似的三级结构,相似率为45.48%。TLR4蛋白共存在10个主要互作蛋白,富集得到96个GO功能条目和7条KEGG通路,其中GO功能条目包括物种间相互作用、免疫反应、应激反应、信号转导等;KEGG通路包括甲型流感、单纯疱疹病毒Ⅰ型感染及沙门氏菌感染等。【结论】疣鼻天鹅TLR4基因与灰雁和鸿雁亲缘关系最近,有明显的密码子种属选择性,含有6段连续稀有密码子,其蛋白存在跨膜结构域和信号肽,并与天然免疫应答、信号转导和应激反应密切相关。 展开更多
关键词 疣鼻天鹅 tlr4基因 克隆 蛋白相互作用网络 GO功能 KEGG通路
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TLR2和TLR4基因在独龙牛不同组织器官中的表达分布
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作者 亐开兴 黄梅芬 +3 位作者 和占星 王蕾 胡柠檬 胡映开 《特种经济动植物》 2023年第12期4-9,共6页
以4头独龙牛公牛为研究对象,采用qPCR技术检测,以GAPDH基因为内参,建立TLR2、TLR4基因qPCR标准曲线,测定独龙牛各组织器官的TLR2、TLR4基因及基因相对表达量。结果表明,TLR2基因在独龙牛的心、肺、背部脂肪表达较高,TLR4在独龙牛心、背... 以4头独龙牛公牛为研究对象,采用qPCR技术检测,以GAPDH基因为内参,建立TLR2、TLR4基因qPCR标准曲线,测定独龙牛各组织器官的TLR2、TLR4基因及基因相对表达量。结果表明,TLR2基因在独龙牛的心、肺、背部脂肪表达较高,TLR4在独龙牛心、背部脂肪表达较高,而在免疫器官和胃肠道中的表达量相对较低,可能与独龙牛的健康和营养水平有关,动物健康则TLRs低水平表达。 展开更多
关键词 独龙牛 tlr2基因 tlr4基因 基因表达
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牛TLR4基因的遗传多态性与乳房炎的关联分析 被引量:36
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作者 王兴平 许尚忠 +3 位作者 马腾壑 高雪 任红艳 陈金宝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期120-124,共5页
TLR4通过识别病原体而激活免疫细胞,在先天免疫和适应性免疫防御中起着重要作用。以中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛共397头为研究对象,利用创造酶切位点PCR法扩增243 bp的目的片段,通过限制性内切酶HinfⅠ酶切来检测TLR4第3外... TLR4通过识别病原体而激活免疫细胞,在先天免疫和适应性免疫防御中起着重要作用。以中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛共397头为研究对象,利用创造酶切位点PCR法扩增243 bp的目的片段,通过限制性内切酶HinfⅠ酶切来检测TLR4第3外显子的多态性,结果发现扩增产物的27 bp处C到T的突变使得多态位点产生,编码的氨基酸由苏氨酸变为异亮氨酸。A、B 2个等位基因在3个群体中均有分布,A等位基因占优势(大于78%),经χ2适合性检验,三河牛在该位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。运用SAS 8.2软件采用最小二乘法拟合线性模型,将该基因座不同基因型与奶牛乳房炎进行了关联分析,结果表明:AA基因型为乳房炎抗性基因型(P<0.05),A等位基因为乳房炎抗性的有利基因。 展开更多
关键词 tlr4基因 CRS-PCR PCR-RFLP 乳房炎 体细胞数 体细胞评分
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牛TLR4基因5′侧翼区的遗传变异与乳房炎的关联 被引量:12
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作者 王兴平 许尚忠 +3 位作者 马腾壑 高雪 任红艳 陈金宝 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第12期1520-1524,共5页
TLR4基因通过识别病原体激活免疫细胞,在天然免疫和适应性免疫防御中起着重要的作用。以中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛为研究对象,扩增477bp的目的片断,测序后发现扩增片段的245bp处G→C的转换使得MspⅠ酶切位点产生,形成新... TLR4基因通过识别病原体激活免疫细胞,在天然免疫和适应性免疫防御中起着重要的作用。以中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛为研究对象,扩增477bp的目的片断,测序后发现扩增片段的245bp处G→C的转换使得MspⅠ酶切位点产生,形成新的等位基因。因此采用RFLP-MspⅠ方法检测该等位基因的多态性,结果表明,在3个群体中A、B两个等位基因均有分布,处于中度多态。经χ2适合性检验,三河牛在该位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。利用SAS8.2软件采用最小二乘法拟合线性模型将该基因座不同基因型与奶牛乳房炎进行了关联分析,结果表明品种和泌乳月效应对乳房炎的影响较大,各基因型效应差异均不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 tlr4基因 PCR—RFLP 乳房炎 SCC 体细胞评分
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猪TLR4基因在F18大肠杆菌抗性型和敏感型资源群体间的差异表达分析 被引量:7
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作者 包文斌 潘章源 +6 位作者 朱璟 叶兰 杜子栋 蔡家嘉 黄小国 朱国强 吴圣龙 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期278-283,共6页
本研究旨在检测TLR4基因mRNA在猪各个组织的分布以及在F18大肠杆菌抗性型和敏感型群体间差异表达水平,为探讨该基因在免疫识别和F18大肠杆菌抗性中发挥的作用提供理论依据。本试验运用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR技术进行定量测定。首... 本研究旨在检测TLR4基因mRNA在猪各个组织的分布以及在F18大肠杆菌抗性型和敏感型群体间差异表达水平,为探讨该基因在免疫识别和F18大肠杆菌抗性中发挥的作用提供理论依据。本试验运用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR技术进行定量测定。首先,各取8头35日龄F18大肠杆菌抗性型和敏感型苏太仔猪组织样,包括心脏、肝脏、脾脏等11个组织,提取总RNA,以GAPDH基因为内参基因,进行实时荧光定量PCR。对TLR4基因mR-NA进行均一化处理,利用荧光阈值(Ct值)计算TLR4基因mRNA在各个组织以及F18大肠杆菌抗性型和敏感型群体间表达量。结果显示,TLR4 mRNA在猪各种组织中广泛表达,在肺、淋巴结、肾脏和脾脏等免疫器官中表达量较高,F18大肠杆菌敏感型的TLR4基因表达量普遍高于抗性型个体的表达量,在各个组织中(除胃外)TLR4表达量差异倍数从1.083到2.980不等;在肺、淋巴结、肾脏和胸腺组织中,F18大肠杆菌敏感型的TLR4基因表达量显著高于抗性型个体的表达量(P<0.05)。本研究结果表明,TLR4基因通过天然免疫识别机制对猪F18大肠杆菌病等革兰氏阴性疾病有一定的影响,TLR4基因表达量的下调与F18大肠杆菌的抗性具有一定程度的关系。 展开更多
关键词 tlr4基因 F18大肠杆菌 REAL-TIME PCR 表达谱
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猪TLR4基因外显子1新等位基因的分离及遗传变异分析 被引量:7
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作者 潘章源 叶兰 +5 位作者 朱璟 杜子栋 黄小国 朱国强 包文斌 吴圣龙 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期163-167,共5页
文章采用PCR-SSCP方法对亚洲野猪、3个引进的商业化品种和10个中国地方猪品种共893个个体TLR4基因外显子1的遗传变异进行了检测,旨在系统分析国内外猪种TLR4基因的多态性,为探讨该基因在免疫和防御系统中发挥的作用提供依据。结果,在猪T... 文章采用PCR-SSCP方法对亚洲野猪、3个引进的商业化品种和10个中国地方猪品种共893个个体TLR4基因外显子1的遗传变异进行了检测,旨在系统分析国内外猪种TLR4基因的多态性,为探讨该基因在免疫和防御系统中发挥的作用提供依据。结果,在猪TLR4基因外显子1中分离到新的等位基因,共检测到3个等位基因,6种基因型。其中杜洛克检测到AA、BB、CC、AB、AC、BC基因型,有杜洛克血统的苏太猪中检测到BB、CC、BC基因型,长白猪、约克夏中检测到CC、BC基因型,野猪及所有10个中国地方猪品种TLR4基因外显子1高度保守,只检测到CC基因型,中国地方猪品种和引进品种TLR4基因外显子1多态性存在极显著的差异。3种基因型中CC型与GenBank中的序列一致,BB和AA基因型分别存在G93C同义突变位点和G194A无义突变位点,这2个变异位点与抗逆性和一般抗病力的关系值得进一步深入研究。 展开更多
关键词 tlr4基因 多态性 野猪 地方猪种 引进猪种
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奶牛TLR4基因的多态性与乳房炎的相关性研究(英文) 被引量:5
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作者 王兴平 许尚忠 +2 位作者 高雪 任红艳 陈金宝 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第5期406-412,共7页
TLR4通过识别病原体而激活免疫细胞,在先天免疫和适应性免疫防御中起着重要作用。以中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛为研究对象,以TLR4为乳房炎抗性的候选基因,分别扩增316bp和382bp2个片段,分别采用SSCP和RFLP-AluⅠ方法来检测... TLR4通过识别病原体而激活免疫细胞,在先天免疫和适应性免疫防御中起着重要作用。以中国荷斯坦奶牛、三河牛和中国西门塔尔牛为研究对象,以TLR4为乳房炎抗性的候选基因,分别扩增316bp和382bp2个片段,分别采用SSCP和RFLP-AluⅠ方法来检测TLR4基因的多态性。结合测序发现:在intron1的第4,525bp处的A→G的突变,和exon3的第1,397bp处的T→C突变,使得产生多态。2个位点的A、B等位基因在3个群体中都有分布,且处于中度多态。χ2适合性检验表明,3个群体在这2个位点的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。运用SAS8.0软件采用最小二乘法拟合线性模型,将基因座不同基因型与奶牛乳房炎进行了关联分析,结果表明:T4CRBR1的AA基因型为乳房炎抗性基因型(P<0.05),A等位基因为乳房炎抗性的有利基因,T4CRBR2的各基因型个体间的体细胞评分差异不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 tlr4基因 SSCP RFLP 乳房炎 体细胞数 体细胞评分
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pri-miR-21重组腺病毒载体构建及其对TLR4基因调控的研究 被引量:8
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作者 赵婧 徐广贤 +4 位作者 贾伟 董辉 张一琳 赵志军 魏军 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期153-155,159,共4页
目的:构建能高效表达成熟miR-21小分子的腺病毒载体,探讨其对TLR4基因的靶向调控关系。方法:以正常小鼠基因组DNA为模板,PCR扩增pri-miR-21基因,克隆至穿梭载体pAdTrack-CMV中经PCR、酶切及基因测序分析正确无误后,与pAdEasy-1腺病毒骨... 目的:构建能高效表达成熟miR-21小分子的腺病毒载体,探讨其对TLR4基因的靶向调控关系。方法:以正常小鼠基因组DNA为模板,PCR扩增pri-miR-21基因,克隆至穿梭载体pAdTrack-CMV中经PCR、酶切及基因测序分析正确无误后,与pAdEasy-1腺病毒骨架质粒进行同源重组,并利用293A细胞,包装成pri-miR-21重组腺病毒感染HeLa细胞,通过Western blot检测TLR4的蛋白表达水平,验证miR-21与TLR4靶向调控的关系。结果:经PCR、酶切、测序及GFP表达证实,成功构建携带pri-miR-21基因的重组腺病毒载体并制备出高滴度重组病毒。Western blot证实,miR-21可抑制TLR4蛋白的表达。结论:所制备的小鼠pri-miR-21重组腺病毒,可以高效表达成熟miR-21小分子,能够抑制靶基因TLR4的表达。 展开更多
关键词 pri-miR-21 重组腺病毒载体 tlr4基因 靶向调控
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鸡TLR4基因表达水平与沙门氏菌感染关系的研究 被引量:10
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作者 李鹏 夏平安 +1 位作者 宋咏梅 赵桂苹 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2009年第5期72-74,共3页
为了研究鸡TLR4(toll like receptor 4)基因表达在调控鸡沙门氏菌感染中的作用,80只3日龄SPF鸡按随机分为2组,处理组经口注射鸡白痢沙门氏菌悬液108CFU/mL 0.50 mL,对照组注射同剂量生理盐水。每个处理组分别在感染后1、3、7和14 d随机... 为了研究鸡TLR4(toll like receptor 4)基因表达在调控鸡沙门氏菌感染中的作用,80只3日龄SPF鸡按随机分为2组,处理组经口注射鸡白痢沙门氏菌悬液108CFU/mL 0.50 mL,对照组注射同剂量生理盐水。每个处理组分别在感染后1、3、7和14 d随机取8只鸡处死,迅速取脾脏样品用于RNA提取。采用SYBR GreenⅠ染料实时荧光定量PCR(QPCR),比较处理组和对照组TLR4基因mRNA相对表达量的变化。结果显示,在4个时间点,与对照组相比,处理组TLR4基因高表达,差异显著(P<0.05);尤其在感染后3和7 d,差异达到极显著水平(P<0.01)。结果表明,鸡沙门氏菌感染后,TLR4基因mRNA表达上调,TLR4基因在沙门氏菌感染中发挥重要作用。 展开更多
关键词 tlr4基因 沙门氏菌 荧光定量PCR
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猪TLR4基因可变剪接体的鉴定 被引量:6
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作者 杨秀芹 翟春媛 +1 位作者 李海涛 刘娣 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1051-1056,共6页
为合理、有效地利用民猪资源进行抗病育种,本研究利用重叠延伸RT-PCR结合巢式PCR法扩增民猪TLR4基因,寻找可变剪接体;利用竞争性RT-PCR方法研究各可变剪接体的组织表达情况。获得了猪TLR4基因3个可变剪接体(其中2个是未见报道的),并且... 为合理、有效地利用民猪资源进行抗病育种,本研究利用重叠延伸RT-PCR结合巢式PCR法扩增民猪TLR4基因,寻找可变剪接体;利用竞争性RT-PCR方法研究各可变剪接体的组织表达情况。获得了猪TLR4基因3个可变剪接体(其中2个是未见报道的),并且鉴定出一类特殊的剪接模式——外显子内部的部分片段被单独剪除,该类型在动物中尚属首次发现;组织表达分析表明3个可变剪接体普遍表达。TLR4基因存在着复杂的剪接机制,也暗示着其功能的复杂性。 展开更多
关键词 民猪 tlr4基因 可变剪接 组织表达
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TLR4基因敲除小鼠对噪声性耳蜗损伤的反应 被引量:9
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作者 杨卫平 许阳 +1 位作者 胡博华 杨仕明 《中华耳科学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第6期947-952,共6页
目的揭示Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)基因缺失对噪声性耳蜗感觉细胞损伤,听觉功能障碍和耳蜗免疫活力的影响作用,探讨噪声性耳蜗损伤的免疫炎性机制。方法将TLR4基因敲除(TLR4 KO)小鼠接触持续噪声暴露(1-7kHz,120dB SPL)1小时... 目的揭示Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)基因缺失对噪声性耳蜗感觉细胞损伤,听觉功能障碍和耳蜗免疫活力的影响作用,探讨噪声性耳蜗损伤的免疫炎性机制。方法将TLR4基因敲除(TLR4 KO)小鼠接触持续噪声暴露(1-7kHz,120dB SPL)1小时,以噪声暴露的野生型(WT)小鼠为对照,检测噪声暴露前和噪声暴露后25天四个频率短纯音(4 kHz、8 kHz、16 kHz和32 kHz)诱发的小鼠双耳ABR阈值。噪声暴露后1天,25天处死动物,解剖取双侧耳蜗。采用白细胞共同抗原(CD45)荧光免疫抗体标记噪声暴露前和噪声暴露后1天耳蜗基底膜免疫细胞,鬼笔环肽(phalloidin)染色噪声暴露前和噪声暴露后25天耳蜗基底膜毛细胞纤毛、表皮板的丝状肌动蛋白。荧光显微镜下观察噪声暴露后TLR4 KO小鼠和WT小鼠耳蜗基底膜组织的巨噬细胞、单核细胞和毛细胞形态变化,计数耳蜗基底膜外毛细胞的缺失数目。结果噪声暴露后1天,WT和TLR4 KO小鼠耳蜗基底膜均呈现单核细胞渗入。噪声暴露后25天,不同频率短纯音诱发的TLR4 KO小鼠ABR阈移和耳蜗基底膜外毛细胞缺失数目均低于WT小鼠(F=71.590, df=1,90, P<0.001;Tukey test, P<0.001),(F=8.996, df=1,17, P=0.008;Tukey test, P=0.008)。结论噪声暴露后TLR4基因缺失没有阻止单核细胞渗入耳蜗基底膜,但减轻噪声暴露后耳蜗感觉细胞和听功能损伤的程度。 展开更多
关键词 tlr4基因敲除小鼠 噪声 耳蜗 毛细胞 单核细胞
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霍寿黑猪和长白猪TLR4基因第3外显子的SNP检测及其遗传差异分析 被引量:3
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作者 朱卫华 杜恒 +6 位作者 杨勇 薛玮玮 孟云 黄龙 张晓东 丁月云 殷宗俊 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期808-812,共5页
为了对安徽地方猪霍寿黑猪和引进猪种长白猪TLR4基因进行多态性分析,采用PCR-SSCP结合PCR产物双向测序的方法研究了86头霍寿黑猪及44头长白猪2个群体共130个样本TLR4基因外显子3部分片段的单核苷核多态性,并对检测到的突变位点进行群体... 为了对安徽地方猪霍寿黑猪和引进猪种长白猪TLR4基因进行多态性分析,采用PCR-SSCP结合PCR产物双向测序的方法研究了86头霍寿黑猪及44头长白猪2个群体共130个样本TLR4基因外显子3部分片段的单核苷核多态性,并对检测到的突变位点进行群体遗传学分析。结果检测到1个突变C1027A,C1027A突变为错义突变。群体遗传学分析表明,该多态位点基因型的分布在霍寿黑猪和长白猪2个中外猪种间存在极显著差异(P<0.01)。C1027A位点多态性在地方猪品种和引进品种间的差异,是否与品种抗病性有关,值得进一步研究。 展开更多
关键词 霍寿黑猪 长白猪 tlr4基因 SNP 群体遗传学分析
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TLR4基因外显子ⅢBbv12 I酶切位点多态性与奶牛乳房炎的相关分析 被引量:7
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作者 刘文娇 孙少华 李雪梅 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2008年第2期114-118,共5页
采用PCR-RFLP技术,对奶牛TLR4基因外显子Ⅲ321bp的部分序列进行多态性分析,结果发现扩增产物C到T突变处存在限制性内切酶Bbv12 I酶切位点,并且导致编码氨基酸由苏氨酸变为异亮氨酸。C、T等位基因在牛群中均有分布并且属于中度多态,C等... 采用PCR-RFLP技术,对奶牛TLR4基因外显子Ⅲ321bp的部分序列进行多态性分析,结果发现扩增产物C到T突变处存在限制性内切酶Bbv12 I酶切位点,并且导致编码氨基酸由苏氨酸变为异亮氨酸。C、T等位基因在牛群中均有分布并且属于中度多态,C等位基因占优势。利用最小二乘拟合线性模型将基因型效应与奶牛乳房炎易感性进行关联分析,结果表明不同基因型奶牛的体细胞评分(SCS)表现出CC基因型>CT基因型>TT基因型的趋势,但运用SAS 9.0软件统计不同基因型对体细胞评分的最小二乘均值没有显著性差异(P>0.05)。 展开更多
关键词 tlr4基因 PCR-RFLP 体细胞评分 乳房炎
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胃幽门螺杆菌感染与TLR4基因G11367C、NADPH氧化酶基因His72Tyr多态性的交互作用和特发性成年骨质疏松症的关系 被引量:7
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作者 张超贤 郭李柯 +1 位作者 侯文根 秦咏梅 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期515-523,共9页
目的探讨胃幽门螺杆菌(H.Pylori)感染与TLR4基因G11367C、NADPH氧化酶基因His72Tyr多态性的交互作用和特发性成年骨质疏松症(IOIA)的关系。方法选择我院2011年5月至2015年7月收治的IOIA患者160例,以160例健康体检者作为对照组,两组在年... 目的探讨胃幽门螺杆菌(H.Pylori)感染与TLR4基因G11367C、NADPH氧化酶基因His72Tyr多态性的交互作用和特发性成年骨质疏松症(IOIA)的关系。方法选择我院2011年5月至2015年7月收治的IOIA患者160例,以160例健康体检者作为对照组,两组在年龄、性别、民族、籍贯和生活习惯方面无显著性差异,以上述各组患者的外周血白细胞为样本,利用PCR-RFLP技术检测了TLR4基因G11367C和NADPH氧化酶基因His72Tyr多态性。采用^(14)C-尿素呼气试验法(^(14)C-UBT)检测受检者,H.Pylori与^(14)C结合的每分钟衰变数(DPM)以判断H.Pylori感染情况。每位研究对象进行问卷调查,采用非条件Logistic分析,估算G11367C、His72Tyr多态性和H.Pylori感染与LSCC发病风险的调整比值比(OR)及95%可信区间(95%CI),并分析G11367C、His72Tyr多态性与H.Pylori感染的交互作用。结果G11367C(GC)、His72Tyr(HT)和His72Tyr(TT)基因型频率分布在IOIA组分别为70.62%、35.00%和36.25%,在对照组分别为28.12%、13.12%和13.75%,两组之间有显著差异(P均<0.01)。G11367C(GC)基因型者患IOIA的风险均显著增加(OR=6.1442),His72Tyr(HT)和His72Tyr(TT)基因型者患IOIA的风险也显著增加(OR=6.7773,OR=6.4737)。基因突变的协同分析发现G11367C(GC)/His72Tyr(TT)基因型者频率在IOIA组和对照组的分布频率分别为25.63%和3.75%,经χ~2检验在两组之间有显著性差异(P<0.01)。G11367C(GC)/His72Tyr(TT)基因型者患IOIA的风险显著增加(OR=39.5731),G11367C(GC)和His72Tyr(TT)基因型在IOIA发生、发展存在正向的交互作用(γ_2=2.0887,γ_3=1.9856),另外G11367C(GC)和His72Tyr(HT)之间也存在正向交互作用(γ>1)。100≤DPM<500和DPM≥500的H.Pylori感染者频率分布在IOIA组分别为28.75%和40.63%,在对照组分别为15.63%和11.87%,上述H.Pylori感染状况频率在IOIA组与对照组之间均有显著差异(P均<0.01)。100≤DPM<500和DPM≥500的H.Pylori感染者患IOIA的风险性均明显增高(OR=4.4463;OR=8.0238),而DPM≥500的H.Pylori感染者患LSCC的风险性则又明显高于100≤DPM<500的H.Pylori感染者(P<0.01)。H.Pylori感染与G11367C(GC)、His72Tyr(HT)和His72Tyr(TT)基因型与均有正向交互作用(γ均大于1)。结论携带G11367C(GC)、His72Tyr(HT)和His72Tyr(TT)基因型的个体属IOIA高危险人群,这些基因型和H.Pylori感染的交互作用促进了IOIA的发生、发展,应当采取根除H.Pylor或调控基因表达的措施以达到有效预防IOIA的目的。 展开更多
关键词 特发性成年骨质疏松症(IOIA) tlr4基因G11367C NADPH氧化酶基因His72Tyr 胃幽门螺杆菌(H.Pylori)感染 多态现象
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安徽地方猪TLR4基因第3外显子的SNP分析 被引量:2
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作者 丁月云 朱卫华 +4 位作者 薛玮纬 孟云 黄龙 张晓东 殷宗俊 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1767-1774,共8页
本试验采用PCR-SSCP方法对皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪及长白猪5个群体共354个样本TLR4基因外显子3部分片段的遗传变异进行了检测,旨在系统分析安徽地方品种猪TLR4基因的多态性,为探讨该基因在免疫和防御系统中发挥的作用提... 本试验采用PCR-SSCP方法对皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪及长白猪5个群体共354个样本TLR4基因外显子3部分片段的遗传变异进行了检测,旨在系统分析安徽地方品种猪TLR4基因的多态性,为探讨该基因在免疫和防御系统中发挥的作用提供依据。结果检测到2个突变:G417A、C1027A,其中,G417A为非错义突变,仅在皖南黑猪、圩猪和安庆六白猪群体中检测到,且只检测到GG、GA两种基因型,在该3群体均为低度多态,且均处于哈迪-温伯格平衡状态(P>0.05);C1027A为错义突变,且引起了编码氨基酸性质的改变,在皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪及长白猪群体中均检测到CC、CA、AA 3种基因型,在该5群体均为中度多态,且均处于哈迪-温伯格平衡状态(P>0.05);χ2独立性检验结果表明,G417A、C1027A各基因型的分布在皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪及长白猪5个中外猪种间存在极显著差异(P<0.01)。结果提示,安徽地方猪TLR4基因外显子3区序列相对保守、多态含量较低,群体遗传变异程度较小;C1027A位点多态性在猪种间分布的差异是否与品种抗病性有关,值得进一步研究。 展开更多
关键词 安徽地方猪 tlr4基因 单核苷酸多态性 群体遗传学分析
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绵羊TLR4基因的遗传多态性分析 被引量:2
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作者 吕伟丽 马小军 +1 位作者 张小丽 张国华 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第4期790-795,共6页
为了研究永昌羊、小尾寒羊、白萨福克羊和特克塞尔羊4个品种的舍饲绵羊TLR4基因的遗传多态性及变异特征,采用PCR-SSCP方法,检测这4种绵羊(共404只)TLR4基因第3外显子部分基因片段的多态性以及产生变异的各等位基因序列。结果显示,4种绵... 为了研究永昌羊、小尾寒羊、白萨福克羊和特克塞尔羊4个品种的舍饲绵羊TLR4基因的遗传多态性及变异特征,采用PCR-SSCP方法,检测这4种绵羊(共404只)TLR4基因第3外显子部分基因片段的多态性以及产生变异的各等位基因序列。结果显示,4种绵羊中共发现6种等位基因控制的7种基因型,永昌羊、白萨福克羊和特克塞尔羊均未检测到E和F等位基因,小尾寒羊未检测到D等位基因;与GenBank中羊TLR4基因序列比对发现,扩增片段中有19个核苷酸多态位点,编码的氨基酸序列中有9个氨基酸多态位点;经χ2适应性检验,4个绵羊品种均位于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),其中白萨福克羊、特克塞尔羊和小尾寒羊处于高度多态(PIC>0.50),而永昌羊处于中度多态(0.25<PIC<0.50)。 展开更多
关键词 绵羊 tlr4基因 遗传多态性 聚合酶链式反应-单链构象多态( PCR-SSCP)
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中国汉族人群前列腺癌易感性与TLR4基因单核苷酸多态性的研究 被引量:4
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作者 李忠海 王英磊 +2 位作者 孟琳 范成娟 吴现海 《癌症进展》 2017年第5期537-539,543,共4页
目的探讨Asp299Gly(rs4986790)、Thr399Ile(rs4986791)、rs11536889单核苷酸多态性(SNP)与前列腺癌(PCa)易感性和严重程度的关系。方法采用病例对照研究方法,选取组织学证据确诊的PCa患者96例为PCa组,良性前列腺增生(BPH)患者87例为BPH... 目的探讨Asp299Gly(rs4986790)、Thr399Ile(rs4986791)、rs11536889单核苷酸多态性(SNP)与前列腺癌(PCa)易感性和严重程度的关系。方法采用病例对照研究方法,选取组织学证据确诊的PCa患者96例为PCa组,良性前列腺增生(BPH)患者87例为BPH组,健康者92例为健康对照组。记录研究对象的临床资料并计算Gleason评分,PCR-RFLP法分析各组的基因型。结果 PCa组、BPH组及健康对照组的年龄、前列腺癌家族史所占比例、前列腺特异抗原(PSA)水平比较,差异均有统计学意义(P=0.000);PCa组、BPH组及健康对照组的Asp299Gly和Thr399Ile基因型频率分布比较,差异无统计学意义(P﹥0.05),但3组间rs11536889基因型频率分布比较,差异有统计学意义[PCa组/(BPH组+健康对照组),CC/GC vs GG,OR=2.152,95%CI:1.280~3.618,P﹤0.05];Gleason评分≥7分组GC+CC分布比例高于Gleason评分﹤7分组(OR=2.378,95%CI:1.042~4.427,P﹤0.05)。结论 TLR4基因rs11536889 SNP可能与PCa发病和病情严重程度相关。 展开更多
关键词 tlr4基因 单核苷酸多态性 前列腺癌
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牛血液组胺浓度、TLR4基因多态性与抗蜱能力的关联分析 被引量:3
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作者 赵刚 余梅 +6 位作者 崔群维 周璇 开兴 李惠侠 张继才 王根林 黄必志 《中国奶牛》 2015年第6期1-5,共5页
为研究牛TLR4基因多态性与抗蜱能力的关系,以正在杂交育种的BMY牛和其亲本婆罗门牛、红安格斯牛共103头牛为研究对象,在人工草场全放牧条件下测定微小牛蜱的感染量和静脉血组胺浓度,并以64头中国荷斯坦牛和加系西门塔尔牛(Simmental)为... 为研究牛TLR4基因多态性与抗蜱能力的关系,以正在杂交育种的BMY牛和其亲本婆罗门牛、红安格斯牛共103头牛为研究对象,在人工草场全放牧条件下测定微小牛蜱的感染量和静脉血组胺浓度,并以64头中国荷斯坦牛和加系西门塔尔牛(Simmental)为对比,利用PCR-SSCP扩增228bp的目的片段,检测TLR4的多态性,结果发现了535(A/C)、546(T/C)、605(T/A)、618(G/C)4个SNPS;中国荷斯坦牛和加系西门塔尔牛有A等位基因,红安格斯牛有A、B两个等位基因和AA、AB两种基因型,BMY牛和婆罗门牛有A、B、C三个等位基因和AA、AB、BB、BC四种基因型。牛血液组胺浓度与微小牛蜱的感染量呈负相关,其中BMY牛的相关性极显著(P<0.01);BB基因型的牛感染蜱的量显著低于AA基因型,静脉血组胺浓度显著高于BB型(P<0.05);TLR4基因突变可影响牛血液组胺浓度和微小牛蜱感染而引起的全身免疫反应水平,B等位基因可作为婆罗门杂交牛抗蜱选育的分子标记。BMY牛的抗蜱选育已经获得进展。 展开更多
关键词 tlr4基因 微小牛蜱 婆罗门牛 杂种 BMY牛
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小分子RNA干扰TLR4基因表达对宫颈癌细胞体外增殖的影响 被引量:2
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作者 宋晓霞 刘玉玲 +1 位作者 胡颜霞 寿纪霞 《国际医药卫生导报》 2021年第1期39-41,共3页
目的RNA干扰技术靶向敲除TLR4基因对子宫颈癌Siha细胞生物学行为影响。方法试验分为重组载体组、空载体组与空白组3组,利用RT-PCR技术对3组细胞中的TLR4 mRNA表达情况进行检测,分别在MMT实验以及细胞划痕实验中对细胞的增殖情况进行观... 目的RNA干扰技术靶向敲除TLR4基因对子宫颈癌Siha细胞生物学行为影响。方法试验分为重组载体组、空载体组与空白组3组,利用RT-PCR技术对3组细胞中的TLR4 mRNA表达情况进行检测,分别在MMT实验以及细胞划痕实验中对细胞的增殖情况进行观察并绘制其增长曲线。结果(1)重组载体组细胞中TLR4 mRNA转染前的表达水平为(81.6±2.1)%,显著高于转染后的表达水平(23.6±1.8)%,差异有统计学意义(P<0.05);空载体组与空白组中的TLR4 mRNA增殖情况在转染前后对比,差异无统计学意义(P>0.05)。(2)转染72 h时,重组载体组吸光度A值为(0.12±0.02),空载体组吸光度A值为(0.15±0.01),空白组吸光度A值为(0.16±0.02),空载体组与空白组的细胞增殖速度在转染72 h时均快于重组载体组,差异均统计学意义(均P<0.05)。(3)重组载体组细胞在划痕后培养细胞的48 h与72 h时的迁移率均慢于未转染组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论小分子RNA靶向敲除TLR4基因可有效抑制子宫颈癌Siha细胞的生长速度。 展开更多
关键词 宫颈癌 RNA 小分子干扰 tlr4基因 转染
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