家猫TM6SF2蛋白的生物信息学分析

为了初步探索家猫(Felis catus)跨膜蛋白6超家族成员2(transmembrane 6 superfamily member 2,TM6SF2)蛋白的结构与功能,试验采用生物信息学方法对家猫TM6SF2蛋白的理化性质和亲/疏水性、同源性、信号肽和跨膜区、二级结构、结构域、三级结构、磷酸化修饰、相互作用蛋白质及GO功能注释进行了研究。结果表明:家猫TM6SF2蛋白是一种不稳定碱性疏水蛋白质,与犬(Canis lupus familiaris)的亲缘关系较近,没有信号肽,具有7个跨膜区。家猫TM6SF2蛋白的二级结构由α-螺旋(41.88%)、延伸链(14.82%)、β-转角(4.94%)和无规则卷曲(38.35%)构成,含有2个EXPERA结构域;三级结构以人(Homo sapiens)TM6SF2蛋白为模板构建且质量较高。家猫TM6SF2蛋白含有25个磷酸化位点,相互作用蛋白质包括Patatin样磷脂酶结构域蛋白3、透明质酸和蛋白多糖连接蛋白4、溶血磷脂酰基转移酶7、葡萄糖激酶调节蛋白等,并参与脂质代谢的调控。说明家猫TM6SF2蛋白可能参与猫肝脏脂肪沉积症(feline hepatic lipidosis,FHL)的发生机制,可作为研发相关药物的潜在靶标。