TMEM67基因突变所致的Joubert综合征一家系及临床遗传学分析

目的利用二代测序技术结合Sanger测序验证对一临床诊断为Joubert综合征的家系进行致病基因检测。方法以2015年广东省妇幼保健院产前诊断科诊断为Joubert综合征的一家系为研究对象,采集先证者胎儿病史、影像学检查结果及家族史,采用全外显子高通量测序方法,对先证者胎儿及其父母进行基因检测,后对发现的致病位点进行Sanger测序验证。结果检测到先证者在TMEM67基因第12个外显子上发生了错义突变,c.1175C>G(来源于父亲),以及在TMEM67基因第12个外显子上发生了另外一个错义突变,c.1250A>G(来源于母亲)的双重杂合改变,符合孟德尔隐性遗传。结论本研究成功利用二代测序技术鉴定了一种导致Joubert综合征的新发突变类型,此位点为国内外首次报道,丰富了Joubert综合征的病因信息。二代测序技术为产前确诊罕见疾病提供一套可行的新方法,建立基因水平上的堡垒。

新TMEM67基因突变致眼-脑-肝-肾综合征的诊断及家系研究

目的探讨眼-脑-肝-肾综合征(COACH综合征)的临床及家系特点。方法以1例COACH综合征患者(先证者)及其3代内家系成员作为研究对象,收集先证者的临床资料[包括病史、体格检查、肝功能、肝脏弹力纤维检测、眼部学相干断层成像(OCT)检查、颅脑磁共振成像(MRI)检查等]及其3代内家系成员的病史及体格检查,分别取先证者及其3代内家系成员外周血各2 mL,采用全外显子组捕获测序技术进行基因测序。结果先证者有智力发育落后、并趾畸形、先天性肝纤维化(CHF)、眼部视网膜外层结构缺损,MRI呈现典型的“磨牙征”和“蝙蝠征”;先证者大舅幼年发热后出现智力发育落后,余家属无类似症状;基因测序检测出先证者8号染色体跨膜蛋白67基因(TMEM67)c.725A>G(p.N242S)和c.1288+1G>A(splicing)双重杂合突变,其中c.725A>G(p.N242S)突变为父系遗传、为已有报道的突变,c.1288+1G>A(splicing)突变为母系遗传、为新发现的致病突变。结论确诊患儿为COACH综合征,并诊断其家系遗传特点为常染色体隐性遗传,同时检测出COACH综合征新TMEM67突变位点。

TMEM67基因变异所致Meckel综合征1例胎儿的遗传学分析

目的对1例Meckel综合征(MKS)胎儿进行产前诊断,明确其致病原因。方法选取2018年2月就诊于苏州市立医院的1例孕妇作为研究对象,收集其临床信息。采集引产胎儿肌肉组织标本以及孕妇夫妇的外周血样,进行染色体微阵列分析(CMA)和全外显子组测序,并用Sanger测序对候选变异进行验证。结果孕18周超声提示胎儿存在小头畸形、小脑香蕉征、多囊肾和羊水过少。引产后观察到胎儿脑膨出、多指和肾脏囊形结构。胎儿CMA检测未见异常。基因测序提示引产胎儿TMEM67基因存在母源c.296delA(p.Lys99SerfsTer6)和父源c.1243G>A(p.Val415Met)变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会变异相关指南,c.296del被评级为致病性变异(PVS1+PM2Supporting+PP4),c.1243G>A被评级为可能致病性变异(PM2Supporting+PM3+PP3Moderate+PP4)。结论TMEM67基因c.296delA和c.1243G>A变异可能是该MKS胎儿的遗传学病因。

TMEM67基因变异致麦克尔综合征一个家系的遗传学分析

目的探讨1个疑似麦克尔综合征家系的遗传学病因。方法选取2017年8月31日因"连续3次不良妊娠史"就诊于郑州大学第一附属医院的1个家系作为研究对象,收集家系相关临床资料。对该家系第3个引产胎儿组织通过高通量测序进行纤毛病相关致病基因变异筛选并用Sanger测序进行家系验证。结果该家系第1个胎儿妊娠过程中出现胚胎停育,第2个胎儿临床疑诊为纤毛病,后引产但未行进一步的病因检测,第3个胎儿疑诊为纤毛病且经高通量测序及Sanger测序检测,结果提示胎儿TMEM67基因存在父源的c.978+1G>A和母源的c.1288G>C(p.D430H)复合杂合变异。依据美国医学遗传学与基因组学学会相关变异指南与标准,c.978+1G>A评级为致病性变异(PVS1+PM2_Supporting+PP5),c.1288G>C(p.D430H)评级为可能致病性变异(PM2_Supporting+PM3+PM5+PP3)。结论TMEM67基因c.978+1G>A和c.1288G>C(p.D430H)复合杂合变异应为该家系3次疑似纤毛病不良妊娠的遗传学病因。TMEM67基因c.1288G>C(p.D430H)变异的发现拓宽了TMEM67基因致病变异谱。

2例Meckel-Gruber综合征胎儿遗传学分析

目的分析2例疑似Meckel-Gruber综合征(MKS)胎儿及其父母的临床资料,探讨其基因突变特点。方法2021年3月河南省人民医院进行遗传咨询的2次孕育疑似MKS胎儿的夫妇,收集胎儿母亲孕育史及孕期2个胎儿的超声声像资料,记录胎儿肾囊肿、颅脑结构异常、颜面部结构异常、羊水量等情况。采集父母外周血及2个胎儿皮肤组织,提取基因组DNA,采用染色体微阵列分析法检测100 kb以上的微重复/微缺失,与人类基因组结构变异数据库、DECIPHER等数据库进行比对;采用高通量测序法对胎儿2进行全外显子组测序,确定基因突变位点,采用PCR-Sanger测序法对胎儿1及其父母进行验证。应用生物信息学软件预测突变位点的致病性,并对突变位点的保守性进行分析。依据ACMG指南对突变位点进行分级。结果胎儿母亲孕4产0,2次孕育MKS胎儿,2次胎儿停止发育。胎儿1、2均有颅脑结构异常、双侧多囊肾的MKS典型特征,胎儿1伴颜面部结构异常、羊水过少。胎儿1、2及其父母均未检出100 kb以上的染色体微重复/微缺失。胎儿1、2均存在TMEM67基因(NM_153704)c.978+1G>A及c.1175C>G(p.Pro392Arg)杂合突变,其中c.978+1G>A均来源于胎儿父亲,为剪接位点突变,ACMG分级为致病;c.1175C>G均来源于胎儿母亲,为错义突变,ACMG分级为可能致病。Unipro UGENE软件分析结果显示TMEM67基因c.1175位点在6个物种中均高度保守,SIFT、Polyphen、Mutationtaster软件分析结果显示c.1175C>G突变有致病性。结论TMEM67基因(NM_153704)c.978+1G>A及c.1175C>G(p.Pro392Arg)复合杂合突变是该夫妇反复孕育MKS胎儿的遗传学病因。

一例Bardet-Biedl综合征患者MKKS基因新变异的遗传学分析

目的对一例Bardet-Biedl综合征(Bardet-Biedl syndrome,BBS)患者进行遗传学分析。方法收集患者的临床资料,对患者进行纤毛病相关基因的高通量测序,并对候选变异进行生物信息学分析。结果在先证者中检出MKKS基因c.635C>T(p.Ser212Phe)和c.1664C>G(p.Thr555Arg)杂合变异及TMEM67基因c.2498T>C(p.Ile833Thr)杂合变异。其母亲携带MKKS基因c.635C>T(p.Ser212Phe)杂合变异,而未携带MKKS基因c.1664C>G(p.Thr555Arg)及TMEM67基因c.2498T>C(p.Ile833Thr)变异。上述3个变异位点所对应的氨基酸序列在不同物种中高度保守。结论MKKS基因c.635C>T(p.Ser212Phe)和c.1664C>G(p.Thr555Arg)复合杂合变异可能为患者的遗传学病因。TMEM67基因c.2498T>C(p.Ile833Thr)杂合变异对其疾病表型是否具有修饰作用还有待进一步的研究。