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题名TNF-α基因多态性及其与奶牛乳房炎的相关性分析
被引量:4
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作者
徐阿娟
刘小林
郭家中
夏志
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机构
西北农林科技大学动物科技学院
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出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第9期929-934,共6页
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基金
国家十一五"863"项目(编号:2008AA10Z144)
陕西省"13115"科技创新项目(编号:2008ZDKG-11)
西安市科技计划项目(编号:NC09049-2)
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文摘
以417头中国荷斯坦奶牛为研究对象,根据体细胞评分(Somatic cell score,SCS)的大小将该奶牛群体划分为感染牛群(100头)和健康牛群(317头)。通过PCR-RFLP和CRS-RFLP方法检测了肿瘤坏死因子α(Tumor necrosis factor-alpha,TNF-α)基因在荷斯坦奶牛群体中的多态性,并分析这些多态位点和奶牛乳房炎的相关性。研究发现了3个单核苷酸多态位点(Single-nucleotide polymorphism,SNP):第2外显子39bp处G→A的突变;第4外显子293bp处C→T的突变;5′侧翼区(5′-flanking region,5′UTR)C→G的突变。这3个突变位点分别是DraⅠ、AfaⅠ和DdeⅠ限制性内切酶的酶切多态位点,其中DraⅠ为创造酶切位点。经过基因型分析与χ2检验表明:3个酶切多态位点在荷斯坦奶牛群中均未达到Hardy-Weinberg平衡状态。运用SPSS13.0软件,采用最小二乘拟合线性模型分析3个酶切多态位点与SCS的关系,结果表明:AA基因型个体在DraⅠ酶切位点中的SCS显著大于BB及AB基因型个体(P<0.05),BB基因型表现出乳房炎抗性。AfaⅠ酶切位点中BB基因型个体的SCS显著大于AA及AB基因型个体(P<0.05),AA基因型表现出乳房炎抗性。DdeⅠ酶切位点中,AB基因型个体的SCS显著低于AA基因型个体(P<0.05),AB基因型为优良基因型。因此BB、AA、AB基因型分别为DraⅠ、AfaⅠ、DdeⅠ酶切位点中的优良基因型,可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性筛选。
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关键词
tnf-Α基因
pcr-rflp
多态性
乳房炎
相关性
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Keywords
tnf-α gene pcr-rflp polymorphism mastitis relativity
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分类号
S858.23
[农业科学—临床兽医学]
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