TNFSF13B在实验性自身免疫性心肌炎小鼠心肌组织中的表达及意义

目的:探讨肿瘤坏死因子超家簇成员TN-FSF13B在实验性自身免疫性心肌炎小鼠心肌组织中的表达及其意义。方法:用包含心肌肌球蛋白致病性抗原表位的人工合成多肽在d 1d、8免疫遗传易感BALB/c小鼠,建立实验性自身免疫性心肌炎动物模型。在初次免疫后d 14、d 21,取实验组小鼠和对照组小鼠的心肌组织作病理学检查,用免疫组化技术检测TNFSF13B在心肌组织中的表达情况,用ELISA法测血清中抗心肌肌球蛋白自身抗体滴度。结果:初次免疫后d 14,实验组15只(15/18)小鼠出现心肌炎症,至d 21,实验组17只(17/18)小鼠出现心肌炎症,且程度进一步加重,而对照组小鼠未出现心肌炎症;TNFSF13B在炎症小鼠心肌中的表达明显,而在对照组小鼠心肌中未发现TNFSF13B的表达;与对照组小鼠相比,出现心肌炎症的小鼠血清中有较高滴度的抗心肌肌球蛋白自身抗体。结论:TNFSF13B参与了自身免疫性心肌炎的发生发展过程。

马立克病病毒对鸡NRAMP1和TNFSF13B基因转录水平的影响

旨在探究马立克病毒(MDV)感染后,不同鸡体内NRAMP1和TNFSF13B基因的转录差异;比较不同鸡种对MDV的抗病性差异。选取山东省优良地方鸡种济宁百日鸡、汶上芦花鸡、寿光鸡作为研究对象,以SPF白来航鸡为对照。随机抽取100枚受精卵,在同一孵化箱内同时进行孵化、育雏和马立克病毒的人工攻毒,攻毒后7~90d,选取染病且存活的鸡,采集肝、脾等组织,进行荧光定量PCR检测。结果表明:在7日龄攻毒后90d的脾组织中,汶上芦花鸡与寿光鸡和SPF鸡NRAMP1基因的mRNA转录量差异显著(P<0.05);在7日龄攻毒的肝组织中,济宁百日鸡的TNFSF13B基因mRNA的转录量显著高于其余3个鸡种(P<0.05)。结果提示:NRAMP1作为家禽抗马立克病的候选基因,在感染了马立克病毒90d后,转录量显著上调,可能是其增强鸡对MDV的抵抗力的重要因素;TNFSF13B作为肿瘤相关抑制基因,在济宁百日鸡中的转录量最高,济宁百日鸡作为肿瘤发生率最高的鸡种,在最后存活的抗性鸡中转录量高。

细胞因子TNFSF13B的结构与功能及其在相关疾病发生中的作用

TNFSF13B是于 1999年发现并克隆的一种重要的细胞因子 ,它广泛参与了T、B淋巴细胞的增殖及功能调节。该文介绍TNFSF13B的结构及功能特点、TNFSF13B在相关疾病 (如免疫功能低下、某些自身免疫性疾病及某些肿瘤等 )

TNFSF13B通过影响肿瘤微环境免疫细胞不利于肾透明细胞癌的预后

目的:通过生物信息学的方法对肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma, KIRC)的肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)进行分析,确定与其关键基因相关的肿瘤浸润免疫细胞(tumor-infiltrating immune cells, TICs)的组成,揭示关键基因的独立预后价值。方法:应用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法,从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库中计算了611例KIRC患者免疫和基质成分的数量和TICs的比例。通过对差异表达基因进行分析并进行Cox回归分析和构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein protein interaction network, PPI),再通过单因素Cox与PPI的交集分析,确定肿瘤坏死因子超家族13b(TNFSF13B)为预测因子。进一步对TNFSF13B的表达进行差异分析、生存分析、临床相关性分析、基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)、TICs组成比例及相关性分析。结果:TNFSF13B的表达与KIRC患者的生存期呈负相关。GSEA表明,高表达TNFSF13B组的基因主要富集在免疫活性细胞中。对TICs比例的CIBERSORT分析表明,调节性T细胞(Treg)和T细胞滤泡辅助因子(Tfh)与TNFSF13B表达呈正相关,但幼稚B细胞和静息肥大细胞与TNFSF13B表达呈负相关,提示TNFSF13B可能负责调控TME的免疫细胞成分。结论:TNFSF13B的表达水平可能不利于KIRC患者的预后,特别可能通过影响TME的免疫成分发挥作用,同时也揭示了TNFSF13B作为免疫治疗发展的潜在靶点和生物标志物。

TNFSF13B基因与肾透明细胞癌预后及肿瘤微环境的关系

目的基于TCGA数据库发掘与肾透明细胞癌(RCCC)预后和肿瘤微环境(TME)相关的关键基因。方法从TCGA数据库中筛选出605例RCCC患者,通过ESTIMATE算法计算出这些患者的免疫评分和基质评分,分析其与RCCC患者预后及临床病理特征的关系。基于免疫评分和基质评分,筛选出差异表达基因(DEGs),通过构建PPI网络和单因素Cox回归分析,确定关键基因TNFSF13B。进一步分析TNFSF13B在RCCC中的表达水平及其与RCCC患者预后及临床病理特征的关系。最后,探讨TNFSF13B与RCCC肿瘤微环境的关系。结果TNFSF13B被确定为与RCCC预后和TME相关的关键基因。TNFSF13B在RCCC肿瘤组织中的表达显著升高,并与患者的淋巴结转移和不良预后显著相关。TME中共11种肿瘤浸润性免疫细胞的浸润水平与TNFSF13B的表达相关。结论TNFSF13B基因高表达与RCCC患者不良预后显著相关,并对RCCC肿瘤微环境产生一定影响。TNFSF13B有望成为RCCC新的潜在治疗靶点和预后相关的生物学标志物。

M2巨噬细胞来源的TNFSF13通过激活IRF8对胶质母瘤细胞替莫唑胺耐药的影响

目的探讨M2巨噬细胞来源的肿瘤坏死因子配体超家族成员13(TNFSF13)通过调控干扰素调节因子8(IRF8)对胶质母瘤(GBM)细胞替莫唑胺(TMZ)耐药的影响。方法免疫组织化学法(IHC)检测正常脑组织和GBM组织中TNFSF13的表达,ELISA检测M0型巨噬细胞和M2型巨噬细胞条件培养基(CM)中TNFSF13的表达。M0-CM和M2-CM用于培养U251敏感(U251/S)细胞和U251耐药(U251/R)细胞。TMZ处理组同时加入800μmol/L的TMZ。U251/R细胞分为如下组:con组、M2^(vector)-CM组、M2^(vector)-CM+TMZ组、M2^(TNFSF13)-CM组、M2^(TNFSF13)-CM+TMZ组、si-IRF8组、si-IRF8+M2^(TNFSF13)-CM组。CCK-8检测细胞活力并计算IC_(50)值,Transwell实验检测细胞侵袭,流式细胞术检测凋亡,Western blot检测IRF8的表达。构建裸鼠移植瘤模型并且将裸鼠分为如下组:U251+M2^(si-NC)组、U251+M2^(si-TNFSF13)组、U251+M2^(si-NC+TMZ)组、U251+M2^(si-TNFSF13)+TMZ组。检测各组成瘤体积和质量,免疫组化检测各组肿瘤组织中TNFSF13和CD206的表达。结果与癌旁组织以及M0-CM比较,癌组织以及M2-CM中TNFSF13的表达上调。与M0-CM组相比,M2-CM组中U251/S和U251/R细胞TMZ的IC 50值和细胞侵袭数目均显著上调(均P<0.05)。在M2巨噬细胞中过表达TNFSF13能够促进U251/R细胞TMZ的IC_(50)值,促进细胞侵袭、抑制细胞凋亡(均P<0.05)。过表达TNFSF13促进IRF8的表达,敲低IRF8能够减弱过表达TNFSF13介导的U251/R对TMZ耐药。体内研究显示,敲低TNFSF13与TMZ单独或联合处理显著抑制肿瘤生长、降低TNFSF13和CD206的表达。结论M2巨噬细胞来源的TNFSF13通过激活IRF8促进GBM细胞TMZ耐药。

马立克氏病病毒对鸡肿瘤相关基因TNFSF13B和ST18表达水平的影响

将150只1日龄雏鸡随机分成2组,100只作为攻毒组,50只作为对照组。攻毒组腹腔注射2 000PFU的马立克氏病病毒(MDV)-GA细胞毒0.2mL;对照组注射同等剂量的病毒稀释液。2组鸡严格隔离,在相同条件的负压隔离器中饲养。攻毒后60d,屠宰所有存活鸡。在对照组中取4个正常鸡的脾脏(HS);在攻毒组中取4个感染MDV后产生肿瘤鸡的脾脏(TS)及4个感染MDV后未产生肿瘤并表现为健康鸡的脾脏(ANS),并对TNFSF13B和ST18基因在这些脾脏组织中的表达水平进行荧光定量分析。结果表明,肿瘤相关基因TNFSF13B和ST18的表达在产生肿瘤鸡的脾脏中都是显著性下调的。MDV通过抑制宿主TNFSF13B基因的表达来抑制B细胞分化、成熟进而对宿主免疫系统进行抑制;同时MDV通过下调肿瘤抑制基因ST18的表达,促使机体肿瘤发生。在对MDV有明显抵抗能力的鸡(ANS组)中,TNFSF13B和ST18的表达水平与对照组健康鸡基本一致,表明这2个基因在MDV抗病过程中起着重要作用。

APRIL／BlyS表达与原发性胆汁性肝硬化的关联性研究

目的探讨APRIL／BlyS在原发性胆汁性肝硬化患者外周血单个核细胞中的mRNA表达水平以及与体液免疫水平的关联性。方法设计特异性的引物和探针，以人基因GAPDH为内参照，用实时定量PCR的方法检测42例健康人和56例原发性胆汁性肝硬化患者外周血单个核细胞中APRIL，BlyS的mRNA表达水平，采用ELISA方法在全自动酶标仪上检测血清中IgG，IgA，IgM的浓度。结果与健康人比较，原发性胆汁性肝硬化患者外周血中APRIL，BlySmRNA的表达升高（P〈0．01），患者血清中IgM显著增高（P〈0．01），患者中BlySmRNA表达与IgM成显著正相关（r=0．763，P〈0．01），而APRIL mRNA的表达与IgM的水平无相关性。结论ARPIL，BlyS系统及其受体可能参与原发性胆汁性肝硬化的疾病进程，为监控原发性胆汁性肝硬化的病情和有效治疗提供了新的依据。

TNFSFl3在乳腺癌组织中的表达与临床意义

目的检测人肿瘤坏死因子配体超家族成员13（TNFSFl3）在乳腺癌组织中的表达，并评估其作为乳腺癌患者潜在的预后生物标志物的可能性。方法采用Westernblot和qRT-PCR两种方法检测TNFSF13在乳腺癌组织中的表达情况。结果TNFSFl3在乳腺癌组织中高表达，并且TNFSFl3mRNA的高表达与肿瘤分化程度和pN分期密切相关（P=0．003，P=0．022）。此外，Kaplan-Meier分析显示TNFSFl3高表达的患者，生存时间显著较短（P=0．04，log-rank检验）。Cox风险比例模型多因素分析结果表明，TNFSFl3的高表达是乳腺癌患者一个独立的预后因素（P=0．03）。结论TNFSFl3有望成为乳腺癌患者预后判断及强化治疗的一个重要的新靶标。

基于WGCNA探索与卵巢癌预后和免疫浸润相关的生物标志物

目的利用生物信息学方法研究卵巢癌(ovarian cancer,OC)中相关基因表达情况,并分析其与预后和肿瘤免疫浸润的相关性,探索OC诊断和预后的新生物标志物和免疫治疗靶点。方法从高通量基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载OC基因表达数据集,筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析和基因百科全书数据库(Kyoto Encyclopedia of Gene and Genomes,KEGG)富集分析,通过加权基因共表达网络(weighted correlation network analysis,WGCNA)鉴定关键基因,通过基因表达谱数据动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA2)数据库进行生存分析和肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库及CIBERSORT算法进行免疫浸润分析,GSEA筛选信号通路。结果筛选出283个上调基因和401个下调基因,GO富集结果显示DEGs主要富集于细胞外基质、染色体分离等,KEGG富集结果显示DEGs主要富集于细胞周期,WGCNA显示黄绿色和淡绿松石色模块和OC关联显著。TNFSF13B、LOC653486、LRRN4等25个基因为关键基因,其中TNFSF13B与生存期和免疫浸润显著相关。结论TNFSF13B可能成为OC诊断和预后的新生物标志物和免疫治疗靶点。