TNFSF13B在实验性自身免疫性心肌炎小鼠心肌组织中的表达及意义

目的:探讨肿瘤坏死因子超家簇成员TN-FSF13B在实验性自身免疫性心肌炎小鼠心肌组织中的表达及其意义。方法:用包含心肌肌球蛋白致病性抗原表位的人工合成多肽在d 1d、8免疫遗传易感BALB/c小鼠,建立实验性自身免疫性心肌炎动物模型。在初次免疫后d 14、d 21,取实验组小鼠和对照组小鼠的心肌组织作病理学检查,用免疫组化技术检测TNFSF13B在心肌组织中的表达情况,用ELISA法测血清中抗心肌肌球蛋白自身抗体滴度。结果:初次免疫后d 14,实验组15只(15/18)小鼠出现心肌炎症,至d 21,实验组17只(17/18)小鼠出现心肌炎症,且程度进一步加重,而对照组小鼠未出现心肌炎症;TNFSF13B在炎症小鼠心肌中的表达明显,而在对照组小鼠心肌中未发现TNFSF13B的表达;与对照组小鼠相比,出现心肌炎症的小鼠血清中有较高滴度的抗心肌肌球蛋白自身抗体。结论:TNFSF13B参与了自身免疫性心肌炎的发生发展过程。

马立克病病毒对鸡NRAMP1和TNFSF13B基因转录水平的影响

旨在探究马立克病毒(MDV)感染后,不同鸡体内NRAMP1和TNFSF13B基因的转录差异;比较不同鸡种对MDV的抗病性差异。选取山东省优良地方鸡种济宁百日鸡、汶上芦花鸡、寿光鸡作为研究对象,以SPF白来航鸡为对照。随机抽取100枚受精卵,在同一孵化箱内同时进行孵化、育雏和马立克病毒的人工攻毒,攻毒后7~90d,选取染病且存活的鸡,采集肝、脾等组织,进行荧光定量PCR检测。结果表明:在7日龄攻毒后90d的脾组织中,汶上芦花鸡与寿光鸡和SPF鸡NRAMP1基因的mRNA转录量差异显著(P<0.05);在7日龄攻毒的肝组织中,济宁百日鸡的TNFSF13B基因mRNA的转录量显著高于其余3个鸡种(P<0.05)。结果提示:NRAMP1作为家禽抗马立克病的候选基因,在感染了马立克病毒90d后,转录量显著上调,可能是其增强鸡对MDV的抵抗力的重要因素;TNFSF13B作为肿瘤相关抑制基因,在济宁百日鸡中的转录量最高,济宁百日鸡作为肿瘤发生率最高的鸡种,在最后存活的抗性鸡中转录量高。

细胞因子TNFSF13B的结构与功能及其在相关疾病发生中的作用

TNFSF13B是于 1999年发现并克隆的一种重要的细胞因子 ,它广泛参与了T、B淋巴细胞的增殖及功能调节。该文介绍TNFSF13B的结构及功能特点、TNFSF13B在相关疾病 (如免疫功能低下、某些自身免疫性疾病及某些肿瘤等 )

TNFSF13B通过影响肿瘤微环境免疫细胞不利于肾透明细胞癌的预后

目的:通过生物信息学的方法对肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma, KIRC)的肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)进行分析,确定与其关键基因相关的肿瘤浸润免疫细胞(tumor-infiltrating immune cells, TICs)的组成,揭示关键基因的独立预后价值。方法:应用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法,从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库中计算了611例KIRC患者免疫和基质成分的数量和TICs的比例。通过对差异表达基因进行分析并进行Cox回归分析和构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein protein interaction network, PPI),再通过单因素Cox与PPI的交集分析,确定肿瘤坏死因子超家族13b(TNFSF13B)为预测因子。进一步对TNFSF13B的表达进行差异分析、生存分析、临床相关性分析、基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)、TICs组成比例及相关性分析。结果:TNFSF13B的表达与KIRC患者的生存期呈负相关。GSEA表明,高表达TNFSF13B组的基因主要富集在免疫活性细胞中。对TICs比例的CIBERSORT分析表明,调节性T细胞(Treg)和T细胞滤泡辅助因子(Tfh)与TNFSF13B表达呈正相关,但幼稚B细胞和静息肥大细胞与TNFSF13B表达呈负相关,提示TNFSF13B可能负责调控TME的免疫细胞成分。结论:TNFSF13B的表达水平可能不利于KIRC患者的预后,特别可能通过影响TME的免疫成分发挥作用,同时也揭示了TNFSF13B作为免疫治疗发展的潜在靶点和生物标志物。

TNFSF13B基因与肾透明细胞癌预后及肿瘤微环境的关系

目的基于TCGA数据库发掘与肾透明细胞癌(RCCC)预后和肿瘤微环境(TME)相关的关键基因。方法从TCGA数据库中筛选出605例RCCC患者,通过ESTIMATE算法计算出这些患者的免疫评分和基质评分,分析其与RCCC患者预后及临床病理特征的关系。基于免疫评分和基质评分,筛选出差异表达基因(DEGs),通过构建PPI网络和单因素Cox回归分析,确定关键基因TNFSF13B。进一步分析TNFSF13B在RCCC中的表达水平及其与RCCC患者预后及临床病理特征的关系。最后,探讨TNFSF13B与RCCC肿瘤微环境的关系。结果TNFSF13B被确定为与RCCC预后和TME相关的关键基因。TNFSF13B在RCCC肿瘤组织中的表达显著升高,并与患者的淋巴结转移和不良预后显著相关。TME中共11种肿瘤浸润性免疫细胞的浸润水平与TNFSF13B的表达相关。结论TNFSF13B基因高表达与RCCC患者不良预后显著相关,并对RCCC肿瘤微环境产生一定影响。TNFSF13B有望成为RCCC新的潜在治疗靶点和预后相关的生物学标志物。

小鼠自身免疫性心肌炎心肌TNFSF13B的表达及三七总皂甙对其的影响

目的探讨自身免疫性心肌炎(AMC)小鼠心肌肿瘤坏死因子SF13B(TNFSF13B)的表达变化及三七总皂甙对其的影响。方法BALB/C雄性小鼠72只,随机分为自身免疫性心肌炎组(A组)、三七总皂甙组(P组)、对照组(C组)。采用猪心肌球蛋白制备小鼠AMC动物模型,电镜观察心肌组织超微结构改变,免疫组化法检测心肌TNFSF13B蛋白表达。结果A组心肌组织的超微结构损伤严重,P组较A组损伤程度明显减轻;C组心肌TNFSF13B蛋白表达量极少,A组心肌TNFSF13B蛋白表达增加,呈现动态变化,P组心肌TNFSF13B蛋白表达显著低于A组(P<0.05或P<0.01)。结论自身免疫性心肌炎可诱导心肌TNFSF13B蛋白的表达,三七总皂甙可能通过下调心肌TNFSF13B蛋白的表达而减轻心肌损伤。

马立克氏病病毒对鸡肿瘤相关基因TNFSF13B和ST18表达水平的影响

将150只1日龄雏鸡随机分成2组,100只作为攻毒组,50只作为对照组。攻毒组腹腔注射2 000PFU的马立克氏病病毒(MDV)-GA细胞毒0.2mL;对照组注射同等剂量的病毒稀释液。2组鸡严格隔离,在相同条件的负压隔离器中饲养。攻毒后60d,屠宰所有存活鸡。在对照组中取4个正常鸡的脾脏(HS);在攻毒组中取4个感染MDV后产生肿瘤鸡的脾脏(TS)及4个感染MDV后未产生肿瘤并表现为健康鸡的脾脏(ANS),并对TNFSF13B和ST18基因在这些脾脏组织中的表达水平进行荧光定量分析。结果表明,肿瘤相关基因TNFSF13B和ST18的表达在产生肿瘤鸡的脾脏中都是显著性下调的。MDV通过抑制宿主TNFSF13B基因的表达来抑制B细胞分化、成熟进而对宿主免疫系统进行抑制;同时MDV通过下调肿瘤抑制基因ST18的表达,促使机体肿瘤发生。在对MDV有明显抵抗能力的鸡(ANS组)中,TNFSF13B和ST18的表达水平与对照组健康鸡基本一致,表明这2个基因在MDV抗病过程中起着重要作用。

基于WGCNA探索与卵巢癌预后和免疫浸润相关的生物标志物

目的利用生物信息学方法研究卵巢癌(ovarian cancer,OC)中相关基因表达情况,并分析其与预后和肿瘤免疫浸润的相关性,探索OC诊断和预后的新生物标志物和免疫治疗靶点。方法从高通量基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载OC基因表达数据集,筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析和基因百科全书数据库(Kyoto Encyclopedia of Gene and Genomes,KEGG)富集分析,通过加权基因共表达网络(weighted correlation network analysis,WGCNA)鉴定关键基因,通过基因表达谱数据动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA2)数据库进行生存分析和肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库及CIBERSORT算法进行免疫浸润分析,GSEA筛选信号通路。结果筛选出283个上调基因和401个下调基因,GO富集结果显示DEGs主要富集于细胞外基质、染色体分离等,KEGG富集结果显示DEGs主要富集于细胞周期,WGCNA显示黄绿色和淡绿松石色模块和OC关联显著。TNFSF13B、LOC653486、LRRN4等25个基因为关键基因,其中TNFSF13B与生存期和免疫浸润显著相关。结论TNFSF13B可能成为OC诊断和预后的新生物标志物和免疫治疗靶点。