TOMM7遗传变异及基因-环境交互作用与我国侗族人群2型糖尿病的关联研究

目的:探讨全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)中识别的7个遗传位点与我国侗族人群2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的相关性。方法:在我国侗族人群中采用病例对照研究方法,利用多重PCR-SNa Pshot法对PARD3B(rs849230),LOC729993(rs149228),EPHA4(rs16862811),HNT(rs3099797),PTPRD(rs17584499与rs649891),TOMM7(rs2240727)6个基因的7个位点进行基因分型。采用非条件二分类logistic回归方法分析每个多态位点与T2DM的相关性,利用边缘结构线性优势比模型进行基因与环境因素的交互作用分析。结果:本研究共包括209例T2DM患者与209例健康对照。TOMM7基因的rs2240727位点多态性与T2DM相关(对于每个拷贝的风险等位基因T,OR=1.50,P=0.004),且CT和TT基因型是T2DM的风险基因型,OR分别为2.07(95%CI:1.14~3.76)和2.75(95%CI:1.46~5.17),经Bonferroni多重比较校正后,上述结果仍然有意义(均P<0.05)。经调整年龄、性别、体质量指数(body mass index,BMI)后,rs2240727位点与T2DM仍有相关性(P<0.01)。交互作用分析结果表明:rs2240727位点与BMI、腰臀比(waist-hip ratio,WHR)、高血压、糖尿病家族史之间存在正交互作用,调整性别、年龄后,交互作用超额相对危险度(relative excess risk of interaction,RERI)分别为1.5430(95%CI:0.5797~2.5062),2.6520(95%CI:1.7516~3.5524),2.9131(95%CI:1.7959~4.0303),4.2062(95%CI:1.1686~8.2439),差异有统计学意义(均P<0.05)。结论:TOMM7基因的rs2240727位点遗传变异与我国侗族人群的T2DM相关,且与BMI、WHR、高血压和糖尿病家族史之间存在正交互作用。

主观性耳鸣患者外周血非编码RNA高通量测序初析

目的:探寻主观性耳鸣患者的差异表达非编码RNA(ncRNA)及相应调控的信使RNA(mRNA)。方法:对37例主观性耳鸣患者(耳鸣组)和20例健康志愿者(健康对照组)外周血样本进行高通量测序分析,以识别差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)和mRNA,并通过公共数据库匹配ncRNA-miRNA-mRNA的调控路径。通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)对另外10例耳鸣组和10例健康对照组外周血样本进行检测,以验证筛选出的ncRNA和mRNA的差异表达是否具有普遍性。结果:在耳鸣组外周血中发现了13个lncRNA、596个circRNA和38个mRNA存在显著差异表达。13个差异表达的lncRNA均未能匹配到相应的miRNA,未行后续的mRNA匹配分析。596个差异表达的circRNA成功匹配到58个miRNA和595个mRNA,其中有1个mRNA(TOMM7)显示出差异表达,其对应的circRNA和miRNA分别为circ_0051120和miR-615。qPCR结果显示,circ_0051120的表达量在两组间存在显著差异(P<0.05),而TOMM7表达无统计学差异(P>0.05)。结论:circ_0051120可能通过调节TOMM7的表达水平,进而影响线粒体自噬过程,并过度激活NF-κB信号通路以及影响神经网络稳定性,从而在主观性耳鸣的发生和维持过程中发挥重要作用。