人源性IGFBP3的生物信息学分析

目的采用生物信息学方法预测人源性胰岛素样生长因子结合蛋白3(IGFBP3)的分子结构和生物学功能。方法从美国生物信息中心获取人源性IGFBP3基因mRNA和蛋白氨基酸序列,利用ORF Finder在线工具分析IGFBP3蛋白开放阅读框,ProtParam预测IGFBP3蛋白的理化性质,Predict-Protein和SOPMA工具预测IGFBP3蛋白的二级结构,SWISS-MODEL预测IGFBP3蛋白的三级结构,Signal P4.1 Server和NLStradamus工具预测IGFBP3蛋白的信号肽和核定位信号,TMHMM软件包分析IGFBP3蛋白的跨膜区,BLAST工具预测IGFBP3蛋白的结构域,String软件预测与IGFBP3蛋白相互作用的蛋白,Gene Ontology Consortium预测IGFBP3蛋白的生物学功能。结果IGFBP3属于不稳定亲水性分泌蛋白,二级结构主要为环状结构和螺旋结构,无跨膜区,包含5个保守结构域,能在细胞核中发挥生物学效应,与MMP2等多种蛋白作用紧密。IGFBP3可参与细胞凋亡、细胞增殖负调控、蛋白质磷酸化负调控、信号转导负调控、胰岛素样生长因子受体信号通路调控等生物学功能。结论人源性IGFBP3是肿瘤发生的负性调控因子,可介导MMP2及其下游信号通路,参与调控肿瘤的发生、发展。

2型糖尿病患者血清三叶因子3、磷酸酪氨酸衔接蛋白1水平与肾功能及炎症反应的关系研究

目的:探讨2型糖尿病(T2DM)患者血清三叶因子3(TFF3)、磷酸酪氨酸衔接蛋白1(APPL1)水平,并分析其与肾功能及炎症反应之间的关系。方法:选择2017年1月至2019年1月期间我院收治的T2DM患者168例,根据尿白蛋白/肌酐比率(UACR)将患者分为正常白蛋白尿组(UACR<30 mg/g,n=79)、微量白蛋白尿组(30 mg/g≤UACR≤300 mg/g,n=65)和大量白蛋白尿组(UACR>300 mg/g,n=24),另选择同期行体检的健康志愿者57例作为对照组。对比四组受试者血清TFF3、APPL1水平、肾功能指标[血尿素(UREA)、血肌酐(Scr)、胱抑素C(Cys C)和肾小球滤过率(GFR)]及炎症指标[肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-10(IL-10)及单核细胞趋化因子1(MCP-1)]变化,Pearson相关分析血清TFF3、APPL1水平与肾功能指标及炎症因子的相关性。结果:四组受试者血清TFF3、APPL1、肾功能指标、TNF-α、IL-6及MCP-1之间的差异具有统计学意义(P<0.05);与对照组相比,T2DM患者血清TFF3、APPL1、UREA、Scr、Cys C、TNF-α、IL-6及MCP-1水平均明显升高,而GFR显著下降,且差异均具有统计学意义(PP0.05);不同UACR水平的T2DM患者血清TFF3、APPL1、肾功能指标、TNF-α、IL-6及MCP-1之间的差异具有统计学意义(P<0.05);Pearson相关分析结果显示,T2DM患者血清TFF3、APPL1分别与UREA、Scr、Cys C、TNF-α、IL-6、MCP-1呈正相关(P<0.05),与GFR呈负相关(P<0.05),但是与IL-10无相关性(P>0.05)。结论:血清TFF3和APPL1可能通过影响肾功能及炎症反应而影响T2DM的发生及发展,可能作为T2DM临床诊断的生物学指标,为T2DM的治疗提供新靶点。