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题名杂色鲍幼虫变态及TR干扰下内参基因的筛选
被引量:2
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作者
张丽莉
徐建波
王国栋
王艺磊
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机构
集美大学水产学院
农业部东海海水健康养殖重点实验室
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出处
《集美大学学报(自然科学版)》
CAS
2018年第2期91-98,共8页
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基金
国家自然科学基金项目(41006105
41176152
+4 种基金
3170130721)
福建省自然科学基金项目(2015J01142
2016J01163)
福建省高校新世纪优秀人才支持计划项目(B15138)
青岛海洋科学与技术国家实验室开放基金项目(OF2015NO11)
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文摘
内参基因的稳定性对实时定量PCR的结果影响巨大。采用Ge Norm、norm Finder和Ref Finder三款软件比较了鲍变态和干扰幼虫甲状腺激素受体(TR)两种情况下内参基因的稳定性。软件分析了EIF5A、OAZ1、YB1、RPL3、RPS9和ACT等6个候选内参基因的C_t值,据此获得各基因的稳定值。在杂色鲍幼虫的变态过程中,EIF5A稳定性最高,排名平均数为1,表明该基因可以作为这一阶段实时定量PCR的内参基因,但是在干扰TR情况下,EIF5A的稳定性下降,排名平均数为3.91。RPS9则与之相反,在变态过程该基因表达稳定性最差,而在干扰TR时表达稳定性最好。ACT在两种情况下稳定性较好,排名平均数均位列第二位,可以作为这两种情况下的通用内参基因。其他基因的稳定性在这两种情况下也发生剧烈变换。这表明内参基因的稳定与样品具体处理情况关系密切。为了保证定量PCR结果的准确性,需要针对具体处理情况相应地进行内参基因的稳定性评估。
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关键词
杂色鲍
内参基因
稳定性
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Keywords
Haliotis diversicolor
reference gene
stability metamorphosis
tr rnai
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分类号
S917
[农业科学—水产科学]
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