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基于ISSR和TRAP分子标记的东北地区栽培黑木耳遗传多样性研究
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作者 焦枥禾 张丕奇 +3 位作者 王凤利 张秀丰 岳欣 戴肖东 《种子》 北大核心 2024年第5期112-118,共7页
为探究东北地区黑木耳栽培菌株的遗传多样性及亲缘关系,采用ISSR和TRAP分子标记对50株栽培黑木耳菌株进行遗传多样性分析。利用22条高多态性、高分辨率的ISSR和TRAP分子标记引物,对栽培黑木耳进行了DNA扩增。结果表明,黑木耳ISSR和TRAP... 为探究东北地区黑木耳栽培菌株的遗传多样性及亲缘关系,采用ISSR和TRAP分子标记对50株栽培黑木耳菌株进行遗传多样性分析。利用22条高多态性、高分辨率的ISSR和TRAP分子标记引物,对栽培黑木耳进行了DNA扩增。结果表明,黑木耳ISSR和TRAP标记谱带多态性较高,分别占89.58%和84.71%,遗传相似系数为0.53~1.00;在ISSR标记的聚类图中相似系数大于0.96的菌株占44.0%,TRAP标记的聚类图中相似系数大于0.96的菌株占54.0%;STRUCTURE聚类结果显示,50株菌株可分为四大类;遗传多样性分析结果表明,东北地区黑木耳栽培菌株的遗传多样性主要来源于群体间,黑木耳栽培菌株的遗传多样性欠丰富,生产菌种资源的同质化较为突出。 展开更多
关键词 黑木耳 遗传多样性 分子标记 ISSR trap
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QTL Mapping for Fiber Quality Traits Based on a Dense Genetic Linkage Map with SSR,TRAP,SRAP and AFLP Markers in Cultivated Tetraploid Cotton 被引量:1
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作者 YU Ji-wen1,YU Shu-xun1,ZHANG Jin-fa2,ZHAI Hong-hong1(1.Cotton Research Institute of CAAS Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement,Ministry of Agriculture,Anyang,Henan 455000,China 2.Department of Plant and Environmental Sciences,New Mexico State University,Las Cruces,NM 88003) 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期34-,共1页
Cotton is one of the most important economic crops in the world,and it provides natural fiber for the textile industry.With the advancement of the textile technology and increased consumption demands on cotton fiber,b... Cotton is one of the most important economic crops in the world,and it provides natural fiber for the textile industry.With the advancement of the textile technology and increased consumption demands on cotton fiber,both cotton yield and quality should be enhanced.However,cotton yield 展开更多
关键词 QTLs AFLP QTL Mapping for Fiber Quality Traits Based on a Dense Genetic Linkage Map with SSR trap SRAP and AFLP markers in Cultivated Tetraploid Cotton SSR Map
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鲤改良品系与体质量、体长性状相关的TRAP标记筛选 被引量:8
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作者 董在杰 曲疆奇 +2 位作者 袁新华 苏胜彦 谢庄 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期801-808,共8页
应用TRAP标记对一个鲤(Cyprinus carpio)改良品系72个个体进行扩增,采用其中25个多态性较好引物组合用于该群体遗传多样性分析。运用卡方检验分析25对引物在体质量差异显著的2组鱼中频率差异显著的位点,初步筛选出与体质量和体长性状相... 应用TRAP标记对一个鲤(Cyprinus carpio)改良品系72个个体进行扩增,采用其中25个多态性较好引物组合用于该群体遗传多样性分析。运用卡方检验分析25对引物在体质量差异显著的2组鱼中频率差异显著的位点,初步筛选出与体质量和体长性状相关的TRAP标记。将初步筛选的TRAP标记用于随机群体132个个体进行位点性状间的关联分析。结果表明,25个TRAP分子标记共扩增出353个位点,其中多态性位点230个,平均多态性比率65%,平均多态性信息含量为0.28,Nei’s遗传多样性指数平均值为0.219,Shannon信息指数平均值为0.329,表明该群体遗传多样性较为丰富。在初步筛选出的3个TRAP位点(gh1Trap04–140、4rTrap04–308、igf4Ga5–135)中,4rTrap04–308与体质量、体长呈极显著相关(P<0.01)。本研究利用TRAP这一新型分子标记对1个鲤改良群体进行遗传分析,并寻找出1个可能与鲤体质量,体长性状相关的功能基因位点,旨在为鲤体质量、体长性状的QTL定位和分子标记辅助育种奠定基础。 展开更多
关键词 trap标记 遗传多样性 体质量 体长 关联分析
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9份烟草品种(系)及其航天诱变后代的TRAP分析 被引量:4
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作者 冯俊彦 蒲志刚 +5 位作者 李明 张聪 阎文昭 王勇 邢小军 刘东阳 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期273-279,共7页
为了研究烟草航天诱变育种规律,充分利用该技术创制烟草育种材料、培育新品种,利用航天诱变技术处理9份我国主要烟草品种(系)种子,繁育多代待其性状稳定后,在每个品种(系)中随机选择20份诱变单株,利用42对目标序列多态性引物对其进行遗... 为了研究烟草航天诱变育种规律,充分利用该技术创制烟草育种材料、培育新品种,利用航天诱变技术处理9份我国主要烟草品种(系)种子,繁育多代待其性状稳定后,在每个品种(系)中随机选择20份诱变单株,利用42对目标序列多态性引物对其进行遗传多样性分析。共检测到200条变异条带,各品种(系)变异条带数为1~45条,其中LS-2产生的变异条带最少,仅有1条,云烟85产生的变异条带最多,为45条;通过对各品种(系)的遗传相似性分析和聚类分析表明,烟草品种(系)及其航天诱变后代的遗传相似系数变幅为0.32~1.00,其中烟草品种K346及其航天诱变后代的差异最大,遗传相似系数仅为0.32。在各品种航天诱变后代中均存在遗传相似系数为1.0的单株;K346、翠碧一号、云烟85及其诱变后代中都存在原始亲本与诱变单株遗传相似系数为1.0的现象,而云烟317、云烟87、红花大金元、K326、CF209及其诱变单株中没有出现。航天诱变育种技术可对参试烟草品种产生较好的诱变效果,烟草品种不同,其变异程度差异较大;在烟草基因组上航天诱变位点的发生具有一定随机性,但是推测在烟草基因组上可能存在容易发生诱变的区域。这些研究结果将为航天诱变育种技术在烟草育种中的应用提供理论依据。 展开更多
关键词 烟草 trap标记 航天诱变 多态性分析
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SRAP与TRAP分子标记及其在植物研究中的应用 被引量:6
5
作者 冯尚国 赵红燕 +3 位作者 胡旭 施农农 应奇才 王慧中 《杭州师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2010年第3期178-184,共7页
文章详细阐述了SRAP和TRAP标记的原理、引物设计、扩增检测条件及特点,综述了两种标记近年来在植物遗传多样性、遗传图谱构建及重要性状基因标记研究等方面的最新应用,并对其应用前景进行了展望.
关键词 SRAP trap 分子标记 植物 应用
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基于SRAP和TRAP标记的河北野生狗牙根种质遗传多样性分析 被引量:3
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作者 李会彬 赵玉靖 +3 位作者 梁中银 郭丽果 王丽宏 边秀举 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1013-1019,共7页
以SRAP和TRAP 2种标记技术对36份狗牙根材料的遗传多样性及亲缘关系进行了分析,其中包含34份河北省野生狗牙根种质资源。分别由238对SRAP和85对TRAP引物组合中筛选获得具有多态性的SRAP和TRAP引物组合各10对,PCR扩增总条带分别为186和16... 以SRAP和TRAP 2种标记技术对36份狗牙根材料的遗传多样性及亲缘关系进行了分析,其中包含34份河北省野生狗牙根种质资源。分别由238对SRAP和85对TRAP引物组合中筛选获得具有多态性的SRAP和TRAP引物组合各10对,PCR扩增总条带分别为186和161条,多态性条带156和132条,平均每对引物扩增出多态性条带各15.6和13.2条,多态性位点比率分别为83.4%和81.0%。2种标记合并进行聚类分析,所有供试的36份狗牙根材料遗传相似系数GS=0.519~0.983,平均为0.7。当GS=0.68时,可将36份供试材料分为4个类群。本研究结果表明河北野生狗牙根种质资源存在较丰富的遗传多样性,可为种质资源保护和选育优良狗牙根新品种提供科学依据。 展开更多
关键词 狗牙根 种质资源 SRAP标记 trap标记 遗传多样性
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开发TRAP标记的新策略 被引量:3
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作者 任民 王志德 +2 位作者 贾兴华 蒋彩虹 王日新 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2009年第B12期25-31,共7页
烟草作为重要的经济作物和生物工程研究领域的模式植物,由于基因组庞大、结构复杂、重复序列较多以及缺少理想的分子标记,致使大量重要农艺、品质性状缺少分子水平上的遗传研究。因此开发适合烟草的分子标记对其遗传研究具有重要意义。... 烟草作为重要的经济作物和生物工程研究领域的模式植物,由于基因组庞大、结构复杂、重复序列较多以及缺少理想的分子标记,致使大量重要农艺、品质性状缺少分子水平上的遗传研究。因此开发适合烟草的分子标记对其遗传研究具有重要意义。本研究在以往TRAP标记开发经验的基础上,探索了一种直接利用EST-SSR引物作为固定引物开发TRAP标记的新方法,降低了TRAP标记的开发难度和成本,在短期内能开发出丰富的TRAP标记组合。本研究开发了首套烟草TRAP标记,结果显示其扩增带型理想,多态性较高,并在普通烟草品种中筛选到一条类香料烟特殊高香气基因型特征带,显示出良好的应用前景。 展开更多
关键词 trap 分子标记开发 烟草 类香料烟特殊高香气
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利用TRAP标记分析玉米遗传多样性的研究 被引量:6
8
作者 张丽 郭志富 +3 位作者 刘君 何晶 张立军 马慧 《作物杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期66-70,共5页
本研究利用24对TRAP引物对16个玉米自交系进行了遗传多样性分析,目的是探讨利用TRAP标记进行玉米种质资源遗传多样性分析和杂种优势群划分的价值及可行性。结果共扩增出475条具多态性的谱带,平均多态性信息量为0·9044,平均多态性... 本研究利用24对TRAP引物对16个玉米自交系进行了遗传多样性分析,目的是探讨利用TRAP标记进行玉米种质资源遗传多样性分析和杂种优势群划分的价值及可行性。结果共扩增出475条具多态性的谱带,平均多态性信息量为0·9044,平均多态性比率为84·8%。通过聚类分析将16个自交系分为5个类群,其划分结果与系谱分析结果基本一致。表明TRAP标记是一种适合于玉米种质遗传多样性研究的分子标记。 展开更多
关键词 trap 遗传多样性 玉米 分子标记 杂种优势
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基于TRAP的长穗偃麦草SCAR标记的开发及应用 被引量:5
9
作者 秦树文 戴毅 +6 位作者 陈士强 张璐璐 刘慧萍 曹文广 FEDAK George 高勇 陈建民 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1595-1602,共8页
为了开发长穗偃麦草的特异标记,依据TRAP技术,利用56对固定引物与随机引物的组合对中国春-长穗偃麦草附加系等材料进行PCR扩增,共筛选出160条分布于长穗偃麦草1E-7E染色体的特异扩增片段。通过对104个片段的序列进行同源比对,选择与小... 为了开发长穗偃麦草的特异标记,依据TRAP技术,利用56对固定引物与随机引物的组合对中国春-长穗偃麦草附加系等材料进行PCR扩增,共筛选出160条分布于长穗偃麦草1E-7E染色体的特异扩增片段。通过对104个片段的序列进行同源比对,选择与小麦无同源序列的区段设计138对引物,分别对中国春、长穗偃麦草、中国春-长穗偃麦草附加系进行PCR扩增,最终获得30个长穗偃麦草特异SCAR标记,发展标记的效率为53.6%。利用这些特异SCAR标记对硬粒小麦(AABB)与异源六倍体小麦(AABBEE)杂交产生的F2中38个单株进行扩增鉴定,9个单株仅附加了1条相同的E染色体,其余为多条E染色体或者无E染色体附加。这些SCAR标记在不同材料和世代表现出优越的特异性和稳定性,可用于检测小麦背景中附加的相关长穗偃麦草染色体。 展开更多
关键词 长穗偃麦草 小麦 trap技术 基因组特异标记 染色体特异标记
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TRAP分子标记技术在植物分子遗传育种中的应用 被引量:4
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作者 苗培明 范玲 《新疆农业科学》 CAS CSCD 2007年第B11期50-52,共3页
近年来,随着生物技术的迅速发展,分子标记技术也得到了广泛应用。作为一种新兴研究手段,目标区域扩增多态性(TRAP)分子标记技术已经在分子遗传图谱构建、基因定位、遗传多样性、系谱分析等方面取得了重要的研究进展。简介了TRAP分子标... 近年来,随着生物技术的迅速发展,分子标记技术也得到了广泛应用。作为一种新兴研究手段,目标区域扩增多态性(TRAP)分子标记技术已经在分子遗传图谱构建、基因定位、遗传多样性、系谱分析等方面取得了重要的研究进展。简介了TRAP分子标记技术及其在分子遗传育种中的应用。 展开更多
关键词 trap 分子标记 分子遗传育种
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乙型肝炎肝硬化并发门静脉血栓形成患者中性粒细胞胞外陷阱标志物变化
11
作者 吴大海 刘其林 +1 位作者 卢杰夫 梁玉梅 《实用肝脏病杂志》 CAS 2024年第3期394-397,共4页
目的初步探讨乙型肝炎肝硬化并发门静脉血栓形成(PVT)患者血清中性粒细胞胞外陷阱(NETs)标志物变化。方法2018年9月~2022年10月我院诊治的乙型肝炎肝硬化患者55例,经医院HIS系统采集病例资料,使用超声检查诊断PVT。;采用ELISA法检测血... 目的初步探讨乙型肝炎肝硬化并发门静脉血栓形成(PVT)患者血清中性粒细胞胞外陷阱(NETs)标志物变化。方法2018年9月~2022年10月我院诊治的乙型肝炎肝硬化患者55例,经医院HIS系统采集病例资料,使用超声检查诊断PVT。;采用ELISA法检测血清髓过氧化物酶(MPO)、中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)和瓜氨酸组蛋白H3(CitH3)水平。结果经超声检查,本组发现PVT患者21例(38.2%);PVT组MELD评分、Child C级和脾切除术史占比分别为18.2(17.6,19.5)分、52.4%和42.9%,显著高于非PVT组【分别为13.2(9.3,16.8)分、14.7%和2.9%,差异显著(P<0.05);PVT组血清总胆红素、D-二聚体、中性粒细胞/淋巴细胞比率、MPO、NE和CitH3水平分别为25.6(21.6,36.0)μmol/L、1095.0(532.5,2202.5)ng/ml、2.3(1.9,4.2)、42.4(20.7,78.9)ng/ml、2468.2(1344.8,5620.6)ng/ml和79.2(44.8,126.2)ng/ml,均显著大于非PVT组【分别为18.9(16.5,28.3)μmol/L、390.0(280.0,680.0)ng/ml、1.9(1.2,2.6)、10.8(5.6,16.0)ng/ml、623.5(241.4,1006.3)ng/ml和28.8(10.4,39.6)ng/ml,P<0.05】,而血清白蛋白水平为(31.5±5.8)g/L,显著低于非PVT组【(35.4±5.8)g/L,P<0.05】。结论脾切除手术可能诱发乙型肝炎肝硬化患者发生PVT。术后,可能纠正了血细胞降低,但血清NETs标志物水平升高可能具有一定的提示作用,需要密切随访,以期早期发现和处理。 展开更多
关键词 肝硬化 脾切除 门静脉血栓形成 中性粒细胞胞外陷阱
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紫色叶用莴苣遗传多样性及亲缘关系的TRAP分析 被引量:8
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作者 王亚楠 韩莹琰 +1 位作者 范双喜 卜斌 《中国蔬菜》 北大核心 2015年第3期25-32,共8页
利用TRAP标记对47份紫色叶用莴苣种质进行亲缘关系及遗传多样性分析。20对引物组合共扩增出多态性条带430条,多态性比率(PPB)为67.08%。47份紫色叶用莴苣材料的遗传相似系数在0.7063~0.9828之间,Nei’s基因多样性指数(He)和Shannon’s... 利用TRAP标记对47份紫色叶用莴苣种质进行亲缘关系及遗传多样性分析。20对引物组合共扩增出多态性条带430条,多态性比率(PPB)为67.08%。47份紫色叶用莴苣材料的遗传相似系数在0.7063~0.9828之间,Nei’s基因多样性指数(He)和Shannon’s信息指数(I)分别为0.2553和0.3976,遗传多样性水平较低。聚类分析结果表明,47份紫色叶用莴苣材料分为2大类群,第Ⅱ类群又分为5个亚类,叶片形态相似的种质基本上聚在一起,亲缘关系较近。 展开更多
关键词 紫色叶用莴苣 trap标记 遗传多样性
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利用TRAP标记分析8个福瑞鲤家系的遗传多样性 被引量:2
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作者 丁敬波 董在杰 +3 位作者 朱文彬 苏胜彦 公翠萍 阎明信 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期1077-1086,共10页
为了研究福瑞鲤不同家系的遗传多样性,利用TRAP分子标记对生长速度有差异的家系(4个生长速度快,4个生长速度慢)进行了遗传分析。结果显示:8个家系的多态性条带数在9.41至12.00之间,多态性比率范围为52.04%~66.02%,多态信息含量为0.1... 为了研究福瑞鲤不同家系的遗传多样性,利用TRAP分子标记对生长速度有差异的家系(4个生长速度快,4个生长速度慢)进行了遗传分析。结果显示:8个家系的多态性条带数在9.41至12.00之间,多态性比率范围为52.04%~66.02%,多态信息含量为0.1853~0.2430, Nei 遗传多样指数和 Shannon 信息指数分别为0.1875~0.2410和0.2780~0.3510,其中家系85^#的各遗传参数值最高,而家系74#的最低。家系间的遗传分化指数(Fst)及分子变异方差(AMOVA)分析结果显示,除了家系56^#与92^#(Fst=0.0516)及51^#与89^#(Fst=0.0956)这2对家系间处于中等程度的遗传分化(0.05≤Fst≤0.15)之外,其他家系间遗传分化水平均较低(Fst〈0.05),群体的总遗传变异主要来源于家系内个体间的遗传差异,其方差分量的贡献率达98.3%。遗传距离分析结果表明,家系26^#与92#的遗传距离最大,家系85^#与89^#的遗传距离最小;基于此的UPGMA聚类分析结果显示,家系56^#与74^#以及家系85^#与89^#的亲缘关系比较近,聚类在同一分支上,而其他家系亲缘关系相对较远。研究结果说明8个福瑞鲤家系内遗传变异较大,遗传多样性水平较高,具有一定的育种潜力,可扩大福瑞鲤的选育空间。 展开更多
关键词 trap分子标记 福瑞鲤 家系 遗传多样性 遗传分化
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黄淮海和南方大豆育成品种TRAP标记的遗传结构研究 被引量:1
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作者 刘嘉霖 陈琪 +3 位作者 谢慧敏 罗火林 杨柏云 熊冬金 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期341-351,共11页
为采用新型分子标记技术有效评估与利用黄淮海和南方大豆种质资源,本研究通过目标区域扩增多态性(TRAP)功能标记对来自中国黄淮海和南方地域的158份大豆育成品种进行遗传结构及多样性分析。从随机组合的84组引物中筛选出21组多态性丰富... 为采用新型分子标记技术有效评估与利用黄淮海和南方大豆种质资源,本研究通过目标区域扩增多态性(TRAP)功能标记对来自中国黄淮海和南方地域的158份大豆育成品种进行遗传结构及多样性分析。从随机组合的84组引物中筛选出21组多态性丰富的引物,共扩增出436条DNA条带,各引物条带数变幅为18~26个,平均20.7个。Nei′s基因多样性(H)变化范围为0.172 5~0.473 6,香农信息指数(I)变化范围为0.492 2~0.679 2,多态信息含量(PIC)变化范围为0.144 6~0.360 7。基于TRAP分子标记的聚类分析表明大豆材料共分为3类,其中I、II两小类亚群主要为黄淮海地域品种,III类大亚群黄淮海和南方地域品种分布均匀。Structure遗传结构分析将大豆育成品种划分为3个不同血缘关系。大豆材料的TRAP标记聚类分析和遗传结构分析结果表示大豆品种的分布无明显的地域相关性。 展开更多
关键词 大豆 黄淮海 南方 育成品种 trap标记 遗传多样性
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TRAP分子标记在棉花海陆渐渗杂交后代选择中的应用研究 被引量:1
15
作者 范玲 王冬梅 +6 位作者 师维军 马盾 王娟 吕萌 李建平 秦超 袁辉 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期784-788,共5页
利用与棉花纤维伸长相关和纤维细胞次生壁发育相关的基因设计了9条固定引物,与42条随机引物组合形成378对引物。从中筛选出亲本间有显著差异长绒棉共显性TRAP(目标区域扩增多态性)标记12个。用这12个标记对4个海陆杂交组合、每组合40个... 利用与棉花纤维伸长相关和纤维细胞次生壁发育相关的基因设计了9条固定引物,与42条随机引物组合形成378对引物。从中筛选出亲本间有显著差异长绒棉共显性TRAP(目标区域扩增多态性)标记12个。用这12个标记对4个海陆杂交组合、每组合40个BC1单株的后代进行了鉴定,用3个标记对另7个海陆杂交组合、每组合40个BC1单株的后代进行了鉴定,发现分离是普遍存在的,在所有检测的BC1代中,平均分离比例接近50%。显示这些长绒棉共显性的标记可以广泛的用于任意海陆杂交或渐渗杂交后代是否携带与标记相关海岛棉基因的选择,不只针对特殊的亲本和一对杂交亲本的分离群体。为实现TRAP分子标记辅助育种与棉花品质性状的遗传改良奠定了基础。 展开更多
关键词 陆地棉 海岛棉 渐渗 分子标记 目标区域扩增多态性
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甘薯抗病虫相关基因SGT1的TRAP分析
16
作者 王崇 杨新笋 +4 位作者 雷剑 苏文瑾 柴沙沙 张文英 王连军 《湖北农业科学》 2019年第17期119-122,共4页
以抗病虫相关基因SGT1作为靶标基因,设计出1条固定引物,与11条随机引物组合.利用这11对引物对试验材料鄂薯11和鄂紫薯13进行TRAP-PCR扩增,发现11对引物组合扩增出清晰条带,且表现出良好的多态性.研究获得与SGT1基因相关联的TRAP标记,该... 以抗病虫相关基因SGT1作为靶标基因,设计出1条固定引物,与11条随机引物组合.利用这11对引物对试验材料鄂薯11和鄂紫薯13进行TRAP-PCR扩增,发现11对引物组合扩增出清晰条带,且表现出良好的多态性.研究获得与SGT1基因相关联的TRAP标记,该标记可进行甘薯[Ipomoea batatas(L.)Lam.]群体的遗传多样性分析,为甘薯的抗病虫育种提供理论依据. 展开更多
关键词 甘薯[Ipomoea batatas(L.)Lam.] 抗病虫 SGT1基因 trap标记
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甘薯抗病相关基因TAO1-like的TRAP分析
17
作者 王崇 王连军 +4 位作者 雷剑 苏文瑾 柴沙沙 杨新笋 张文英 《湖北农业科学》 2019年第18期152-155,共4页
NBS-LRR是植物中已分离抗病基因最大的一类,TargetofAvrBOperation(TAO1)属于NBS-LRR类基因。以甘薯[Ipomoea batatas(L.)Lam.]抗病相关的TAO1基因作为靶标基因,设计出1条固定引物,与11条随机引物组合成11对引物。利用这11对引物对甘薯... NBS-LRR是植物中已分离抗病基因最大的一类,TargetofAvrBOperation(TAO1)属于NBS-LRR类基因。以甘薯[Ipomoea batatas(L.)Lam.]抗病相关的TAO1基因作为靶标基因,设计出1条固定引物,与11条随机引物组合成11对引物。利用这11对引物对甘薯品种鄂薯11、鄂紫薯13进行TRAP-PCR扩增,发现11个引物组合扩增出清晰条带,且表现出良好的多态性。该研究获得与TAO1-like基因相关联的TRAP标记,该标记可进行甘薯群体的遗传多样性分析,为甘薯的抗病育种奠定基础。 展开更多
关键词 甘薯[Ipomoea batatas(L.)Lam.] 抗病 NBS-LRR类基因 TAO1 trap标记
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基于淀粉合成基因TRAP标记的甘薯种质资源遗传多样性分析
18
作者 张道微 殷勤 +4 位作者 董芳 黄艳岚 周虹 张亚 张超凡 《湖南农业科学》 2018年第12期13-17,共5页
为探究淀粉合成相关基因在甘薯种质资源中的遗传多样性,通过对锚定引物的筛选构建了基于淀粉合成基因的TRAP分子标记技术,并对59份不同作用类型的甘薯种质资源进行遗传多样性分析。TRAP分子标记筛选结果表明:SAI/me2、AGPase/em4和β-Am... 为探究淀粉合成相关基因在甘薯种质资源中的遗传多样性,通过对锚定引物的筛选构建了基于淀粉合成基因的TRAP分子标记技术,并对59份不同作用类型的甘薯种质资源进行遗传多样性分析。TRAP分子标记筛选结果表明:SAI/me2、AGPase/em4和β-Amylase/me2这3对引物组合在分子标记中存在较为丰富的多态性片段,结果重复性好,可作为TRAP分子标记;其中,AGPase/em4分子标记的区分能力最强,能将59份甘薯资源进行较好的区分。甘薯种质资源遗传多样性分析结果表明:不同类型的甘薯种质资源之间无明显的遗传群体区分。研究表明,甘薯基因组为六倍体起源,其淀粉合成相关基因存在多基因遗传作用,在不同甘薯种质资源之间存在一定的遗传差异,因而可以开发成有效的分子标记。 展开更多
关键词 甘薯 淀粉合成基因 遗传多样性 trap分子标记 聚类分析
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Harnessing the Annotated EST Information in Molecular Marker Development for Crop Improvement
19
作者 J.G. Hu 《分子植物育种》 CAS CSCD 2007年第2期251-251,共1页
Marker-assisted selection has become an integral component of many crop breeding programs in both the private and public sectors throughout the world. Various markers, such as RFLP, RAPD, AFLP and SSR are
关键词 分子标记 农作物 开发 基因多态性
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三种白腐菌生物学特性与木质纤维素酶基因遗传多样性 被引量:11
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作者 杨立霞 马欣然 +2 位作者 王玉英 闫绍鹏 王秋玉 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期2034-2043,共10页
以采自东北林业大学帽儿山实验林场的3种白腐真菌——木蹄层孔菌(Fomes fomentarius)、鲍姆鲍姆木层孔菌(Phellinus baumiibaumii)和火木层孔菌(Phellinus igniarius)为材料,用菌落直径测量法比较3种白腐菌在马铃署葡萄糖固体培养基上... 以采自东北林业大学帽儿山实验林场的3种白腐真菌——木蹄层孔菌(Fomes fomentarius)、鲍姆鲍姆木层孔菌(Phellinus baumiibaumii)和火木层孔菌(Phellinus igniarius)为材料,用菌落直径测量法比较3种白腐菌在马铃署葡萄糖固体培养基上的生长速度,采用菌丝体干重法比较其在马铃署葡萄糖液体培养基中的生物量变化。结果显示:马铃薯葡萄糖固体培养基上3种白腐菌均为快速生长类型,其生长速度木蹄层孔菌>火木层孔菌>鲍姆鲍姆木层孔菌;马铃署葡萄糖液体培养基中生物量增长速度木蹄层孔菌>鲍姆鲍姆木层孔菌>火木层孔菌。用比色法测量其木质纤维素酶活性,结果显示:木蹄层孔菌产锰过氧化物酶和漆酶量较高,鲍姆鲍姆木层孔菌和火木层孔菌产木质素过氧化物酶量较高;木蹄层孔菌、鲍姆鲍姆木层孔菌和火木层孔菌3种白腐菌的3种主要木质素酶(锰过氧化物酶、漆酶和木质素过氧化物酶)的表达量,种间差异显著(F=3.75*、5.20**、3.01*),白桦木屑诱导处理与对照间差异显著(F=3.84*、4.19*、5.28*);两种主要纤维素酶(葡聚糖内切酶、葡聚糖外切酶)的表达量,种间差异不显著,受碳源影响作用显著(F=3.99*、4.04*)。筛选29对引物组合,对3种白腐菌几种主要木质纤维素酶基因进行TRAP-PCR分子标记检测,比较3菌种间遗传差异,扩增总条带数为357条,多态性条带数为255条,多态性条带的比例为71.43%,其中木质素降解酶基因总多态位点比率为73.77%,纤维素降解酶基因总多态位点比率为68.97%。3种白腐菌的木质纤维素降解酶基因在种间均存在较高的遗传差异。因此,特定基因的TRAP分子标记可以用于木腐菌的遗传变异分析。 展开更多
关键词 白腐菌 木质纤维素降解酶 trap分子标记 遗传差异
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