基于ISSR和TRAP分子标记的东北地区栽培黑木耳遗传多样性研究

为探究东北地区黑木耳栽培菌株的遗传多样性及亲缘关系,采用ISSR和TRAP分子标记对50株栽培黑木耳菌株进行遗传多样性分析。利用22条高多态性、高分辨率的ISSR和TRAP分子标记引物,对栽培黑木耳进行了DNA扩增。结果表明,黑木耳ISSR和TRAP标记谱带多态性较高,分别占89.58%和84.71%,遗传相似系数为0.53~1.00;在ISSR标记的聚类图中相似系数大于0.96的菌株占44.0%,TRAP标记的聚类图中相似系数大于0.96的菌株占54.0%;STRUCTURE聚类结果显示,50株菌株可分为四大类;遗传多样性分析结果表明,东北地区黑木耳栽培菌株的遗传多样性主要来源于群体间,黑木耳栽培菌株的遗传多样性欠丰富,生产菌种资源的同质化较为突出。

SRAP与TRAP分子标记及其在植物研究中的应用

文章详细阐述了SRAP和TRAP标记的原理、引物设计、扩增检测条件及特点,综述了两种标记近年来在植物遗传多样性、遗传图谱构建及重要性状基因标记研究等方面的最新应用,并对其应用前景进行了展望.

开发TRAP标记的新策略

烟草作为重要的经济作物和生物工程研究领域的模式植物,由于基因组庞大、结构复杂、重复序列较多以及缺少理想的分子标记,致使大量重要农艺、品质性状缺少分子水平上的遗传研究。因此开发适合烟草的分子标记对其遗传研究具有重要意义。本研究在以往TRAP标记开发经验的基础上,探索了一种直接利用EST-SSR引物作为固定引物开发TRAP标记的新方法,降低了TRAP标记的开发难度和成本,在短期内能开发出丰富的TRAP标记组合。本研究开发了首套烟草TRAP标记,结果显示其扩增带型理想,多态性较高,并在普通烟草品种中筛选到一条类香料烟特殊高香气基因型特征带,显示出良好的应用前景。

利用TRAP标记分析玉米遗传多样性的研究

本研究利用24对TRAP引物对16个玉米自交系进行了遗传多样性分析,目的是探讨利用TRAP标记进行玉米种质资源遗传多样性分析和杂种优势群划分的价值及可行性。结果共扩增出475条具多态性的谱带,平均多态性信息量为0·9044,平均多态性比率为84·8%。通过聚类分析将16个自交系分为5个类群,其划分结果与系谱分析结果基本一致。表明TRAP标记是一种适合于玉米种质遗传多样性研究的分子标记。

TRAP分子标记技术在植物分子遗传育种中的应用

近年来,随着生物技术的迅速发展,分子标记技术也得到了广泛应用。作为一种新兴研究手段,目标区域扩增多态性(TRAP)分子标记技术已经在分子遗传图谱构建、基因定位、遗传多样性、系谱分析等方面取得了重要的研究进展。简介了TRAP分子标记技术及其在分子遗传育种中的应用。

利用TRAP标记分析8个福瑞鲤家系的遗传多样性

为了研究福瑞鲤不同家系的遗传多样性,利用TRAP分子标记对生长速度有差异的家系（4个生长速度快,4个生长速度慢）进行了遗传分析。结果显示：8个家系的多态性条带数在9.41至12.00之间,多态性比率范围为52.04%～66.02%,多态信息含量为0.1853～0.2430, Nei 遗传多样指数和 Shannon 信息指数分别为0.1875～0.2410和0.2780～0.3510,其中家系85^#的各遗传参数值最高,而家系74#的最低。家系间的遗传分化指数（Fst）及分子变异方差（AMOVA）分析结果显示,除了家系56^#与92^#（Fst=0.0516）及51^#与89^#（Fst=0.0956）这2对家系间处于中等程度的遗传分化（0.05≤Fst≤0.15）之外,其他家系间遗传分化水平均较低（Fst〈0.05）,群体的总遗传变异主要来源于家系内个体间的遗传差异,其方差分量的贡献率达98.3%。遗传距离分析结果表明,家系26^#与92#的遗传距离最大,家系85^#与89^#的遗传距离最小；基于此的UPGMA聚类分析结果显示,家系56^#与74^#以及家系85^#与89^#的亲缘关系比较近,聚类在同一分支上,而其他家系亲缘关系相对较远。研究结果说明8个福瑞鲤家系内遗传变异较大,遗传多样性水平较高,具有一定的育种潜力,可扩大福瑞鲤的选育空间。

TRAP分子标记在棉花海陆渐渗杂交后代选择中的应用研究

利用与棉花纤维伸长相关和纤维细胞次生壁发育相关的基因设计了9条固定引物,与42条随机引物组合形成378对引物。从中筛选出亲本间有显著差异长绒棉共显性TRAP(目标区域扩增多态性)标记12个。用这12个标记对4个海陆杂交组合、每组合40个BC1单株的后代进行了鉴定,用3个标记对另7个海陆杂交组合、每组合40个BC1单株的后代进行了鉴定,发现分离是普遍存在的,在所有检测的BC1代中,平均分离比例接近50%。显示这些长绒棉共显性的标记可以广泛的用于任意海陆杂交或渐渗杂交后代是否携带与标记相关海岛棉基因的选择,不只针对特殊的亲本和一对杂交亲本的分离群体。为实现TRAP分子标记辅助育种与棉花品质性状的遗传改良奠定了基础。

基于淀粉合成基因TRAP标记的甘薯种质资源遗传多样性分析

为探究淀粉合成相关基因在甘薯种质资源中的遗传多样性,通过对锚定引物的筛选构建了基于淀粉合成基因的TRAP分子标记技术,并对59份不同作用类型的甘薯种质资源进行遗传多样性分析。TRAP分子标记筛选结果表明:SAI/me2、AGPase/em4和β-Amylase/me2这3对引物组合在分子标记中存在较为丰富的多态性片段,结果重复性好,可作为TRAP分子标记;其中,AGPase/em4分子标记的区分能力最强,能将59份甘薯资源进行较好的区分。甘薯种质资源遗传多样性分析结果表明:不同类型的甘薯种质资源之间无明显的遗传群体区分。研究表明,甘薯基因组为六倍体起源,其淀粉合成相关基因存在多基因遗传作用,在不同甘薯种质资源之间存在一定的遗传差异,因而可以开发成有效的分子标记。

三种白腐菌生物学特性与木质纤维素酶基因遗传多样性

以采自东北林业大学帽儿山实验林场的3种白腐真菌——木蹄层孔菌(Fomes fomentarius)、鲍姆鲍姆木层孔菌(Phellinus baumiibaumii)和火木层孔菌(Phellinus igniarius)为材料,用菌落直径测量法比较3种白腐菌在马铃署葡萄糖固体培养基上的生长速度,采用菌丝体干重法比较其在马铃署葡萄糖液体培养基中的生物量变化。结果显示:马铃薯葡萄糖固体培养基上3种白腐菌均为快速生长类型,其生长速度木蹄层孔菌>火木层孔菌>鲍姆鲍姆木层孔菌;马铃署葡萄糖液体培养基中生物量增长速度木蹄层孔菌>鲍姆鲍姆木层孔菌>火木层孔菌。用比色法测量其木质纤维素酶活性,结果显示:木蹄层孔菌产锰过氧化物酶和漆酶量较高,鲍姆鲍姆木层孔菌和火木层孔菌产木质素过氧化物酶量较高;木蹄层孔菌、鲍姆鲍姆木层孔菌和火木层孔菌3种白腐菌的3种主要木质素酶(锰过氧化物酶、漆酶和木质素过氧化物酶)的表达量,种间差异显著(F=3.75*、5.20**、3.01*),白桦木屑诱导处理与对照间差异显著(F=3.84*、4.19*、5.28*);两种主要纤维素酶(葡聚糖内切酶、葡聚糖外切酶)的表达量,种间差异不显著,受碳源影响作用显著(F=3.99*、4.04*)。筛选29对引物组合,对3种白腐菌几种主要木质纤维素酶基因进行TRAP-PCR分子标记检测,比较3菌种间遗传差异,扩增总条带数为357条,多态性条带数为255条,多态性条带的比例为71.43%,其中木质素降解酶基因总多态位点比率为73.77%,纤维素降解酶基因总多态位点比率为68.97%。3种白腐菌的木质纤维素降解酶基因在种间均存在较高的遗传差异。因此,特定基因的TRAP分子标记可以用于木腐菌的遗传变异分析。

基于特定引物PCR的DNA分子标记技术研究进展

SSR、SCAR、SRAP和TRAP是4种最新发展的基于特定引物PCR的新型DNA分子标记技术,具有简便、高效、重复性好等优点,已在遗传育种和种质资源研究等各个方面得到广泛应用。介绍了这4种分子标记的基本原理和特点,综述了它们在分子生物学研究中的应用。

几种DNA分子标记技术及其在茶树种质资源研究中的应用

对近年来发展的几种DNA分子标记技术ACGM、SRAP、TRAP、SCAR、RSAP及SCoT的原理、特点进行介绍,综述这些DNA分子标记技术在茶树种质资源研究中的应用,并对其在茶树种质资源研究中的应用前景进行了分析。

植物功能基因组研究中的几种新型分子标记

综述了植物功能基因组研究中出现的EST-SSR、SRAP、TRAP、SNP和DArT等新型分子标记,这些标记具有显著的优势,已广泛应用于遗传图谱构建、重要性状基因定位、比较作图、遗传多样性和品种鉴别、分子标记辅助育种等研究中。简要论述了这几种新型分子标记的应用现状、优点和不足,并对其应用前景进行了展望。

DNA分子标记的研究进展及几种新型分子标记技术

分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种比较理想的遗传标记技术。综述了DNA分子标记的类型,基本原理和特点,同时还对几种最新出现的分子标记技术作了简要的介绍。

甘薯种质资源花青素积累的遗传多态性分析

甘薯种质资源中花青素的积累呈现极为丰富的形态学多态性,作为花青素天然原料开发具有明显的优势,因而开展花青素积累的遗传多态性研究对优质专用型甘薯新品种的选育具有重要参考意义。本研究以66份来源不同的甘薯种质资源为材料,分析了不同生长位点之间花青素积累的关联性,并针对主要花青素合成基因设计TRAP等分子标记,探索了该表型多态性产生的原因。结果表明:(1)甘薯薯块和叶片的花青素积累性状在形态学上相对独立,与其他生长位点无必然关系;薯皮色、须根色与须根根原基色之间紧密关联。(2)TRAP分子标记分析表明花青素合成途径IbCHS、IbDFR等基因在甘薯基因组中存在多个拷贝,不同种质资源之间存在较大遗传多态性差异;转录因子IbMYB1-2a/b仅与薯块花青素积累直接相关,且并非所有紫心甘薯存在IbMYB1-2a/b基因。(3)研究筛选出CHSRV1/AN4引物组合为较理想的TRAP分子标记,能较好地区分66份甘薯种质资源,相对于形态学标记,其聚类分析图能更客观地反映甘薯种质资源之间的遗传关系。本研究为培育茎叶菜用型和紫心甘薯新品种提供了研究基础,也为追溯紫心甘薯起源提供了重要线索。

基于TRAP分子标记的铁皮石斛野生居群的分析与鉴别

本文根据铁皮石斛多糖合成途径中磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因(PEPC)、尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)和生物碱合成过程中苯丙氨酸解氨酶基因(PAL)构建目标区域扩增多态性(TRAP)分子标记,对铁皮石斛野生居群及其杂交后代进行分子鉴别。结果表明,在54对TRAP引物中,筛选出的7对引物可将铁皮石斛野生居群鉴别开。同时,在杂交后代中均能检测到父母本特征条带和新产生条带,能够有效地将亲本及其杂交后代鉴别开来。聚类分析表明,当以云南广南铁皮石斛为亲本时,正反杂交后代均先与其聚为一支,再与另一亲本聚为一支,体现了子代与云南广南铁皮石斛的亲缘关系较近。采用TRAP分子标记对铁皮石斛野生居群及其杂交后代进行分子鉴别,有利于选择优质居群进行人工培育,实现了杂交后代的早期鉴别,提高种质质量的控制,为改善铁皮石斛品质提供理论依据。

短葶山麦冬遗传多样性TRAP标记研究

目的：利用TRAP分子标记技术研究短葶山麦冬遗传多样性。方法：以果糖、光合或甾体皂苷代谢途径7个关键酶基因和1个凝集素基因作为靶标序列设计固定引物13条,筛选随机引物19条,利用其中11对多态性较高引物组合对50份短葶山麦冬种质进行分析。结果：共扩增了335条带,其中多态性带323条,占96.42%。引物平均多态信息量0.930。遗传分化系数0.610。UPGMA聚类表明相似系数0.52~0.98。结论：短葶山麦冬遗传多样性水平较高,出现了一定程度的遗传分化。

不同产地丹参的TRAP分子标记研究

采用新型分子标记TRAP对不同产地的丹参进行研究,建立丹参鉴别的新方法,并探索其遗传变异规律。应用CTAB法提取DNA,采用PopGene32软件进行聚类分析,并构建遗传系统树。筛选的6对引物扩增出203个条带,其中多态性条带为43,占21.1%。聚类分析结果显示4种丹参被分为2类群3亚群,其遗传一致性平均为0.0788,遗传距离平均为0.9245。实验结果表明:TRAP分子标记技术可以在分子水平上鉴别丹参的不同品种,四地丹参具有较高的遗传稳定性。