Trizol试剂法快速高效提取3种作物不同组织总RNA

【目的】建立适用于禾本科作物不同组织总RNA的快速、高效提取方法,为进行后续的分子生物学研究奠定基础。【方法】采用Trizol试剂法,通过改变抽提上清液吸取量、沉淀方法及沉淀漂洗次数,对甘蔗、玉米和水稻的叶片、茎尖和根尖的总RNA提取方法进行优化。【结果】与吸取0.4mL上清液相比,吸取0.2mL上清液的总RNA OD260/OD280、OD260/OD230值分别在1.95～2.00和2.11～2.44,所获得的总RNA纯度较高。沉淀漂洗两次的OD260/OD230值(2.11～2.47)明显高于沉淀漂洗1次的总RNA OD260/OD230值(1.01～1.61),总RNA纯度较高。经异丙醇沉淀所得的各材料的总RNA28S、18S和5S谱带清晰,无拖尾现象,总RNA完整性较好;LiCl沉淀法的RNA条带较模糊粘连,5S条带明显弥散,总RNA产率相对较低。以Trizol-异丙醇法提取的甘蔗总RNA为模板进行GAPDH基因片段扩增,所获甘蔗的叶片、茎尖和根尖的GAPDH基因表达丰度很强,无特异扩增,目的片段长度为153bp。【结论】改良Trizol-异丙醇法提取甘蔗、玉米和水稻不同组织的总RNA带型清晰、完整性好、纯度和产率高,适用于快速、高效提取禾本科植物不同组织总RNA。

改良的一步热酚法及Trizol试剂盒提取组织中RNA的比较

目的 :比较改良的一步热酚法及Trizol试剂盒提取组织中RNA的差别。方法 :应用两种方法分别提取 2 0例兔肝脏的总RNA ,对所提RNA的产率、纯度及完整性进行鉴定。结果 :对比两种方法所提的RNA的产率、纯度及完整性 ,均无显著性差异 ,且RT_PCR产生均扩增出了 β_actin的目的条带。 结论 :采用改良一步热酚法较之Trizol试剂盒更具有简便经济的特点 。

酵母破壁酶和蜗牛酶辅助TRIzol试剂法提取酿酒酵母总RNA

该研究以酵母破壁酶、蜗牛酶破碎酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)细胞壁,再使用总核糖核酸(RNA)提取试剂(TRIzol)法提取酵母总RNA,通过对总RNA进行浓度与纯度的分析,比较酶处理对RNA提取的影响。结果表明,酵母破壁酶的最佳提取条件为加酶量37.5μL,提取温度27℃,提取时间15 min。在此最佳提取条件下,提取RNA质量浓度为1079.05 ng/μL,A260 nm/A280 nm为2.10,A260 nm/A230 nm为2.15;蜗牛酶的最佳提取条件为加酶量30 mg/mL,提取温度37℃,提取时间30 min。在此最佳提取条件下,提取RNA质量浓度为1673.39 ng/μL,A260 nm/A280 nm为1.99,A260 nm/A230 nm为1.81。结果显示,酵母破壁酶的提取效果优于蜗牛酶。

利用TRIzol 试剂和液氮提取大鼠胰腺高质量总RNA

目的建立胰腺高质量总RNA快速、经济、稳定的提取方法。方法应用TRIzol试剂和液氮提取大鼠胰腺总RNA,通过总RNA含量和A260/280比值的测定及10 g/L非变性琼脂糖凝胶电泳评估总RNA的质量,并用RT-PCR检测大鼠胰岛素1、胰高血糖素、胰α-淀粉酶和β-actin的表达。结果利用TRIzol和液氮提取的大鼠胰腺总RNA量可达到3～6μg/mg胰腺组织,A260/280比值在1.75～1.89之间。在10 g/L非变性琼脂糖凝胶电泳时,均可见28S及18S条带,并且在28S、18S条带间可见明显的云雾状阴影。大鼠胰岛素1、胰高血糖素、胰α-淀粉酶、β-actin RT-PCR产物电泳结果显示均有清晰的条带。结论应用TRIzol试剂和液氮成功地提取了大鼠胰腺高质量的总RNA,后者可用于RT-PCR研究。

不同破壁方法提取酵母菌总RNA的比较

选择液氮碾磨、反复冻融、超声波、加玻璃珠漩涡振荡和蜗牛酶酶解5种方法破碎酵母菌细胞壁,再使用Trizol法提取酵母菌总RNA,通过对总RNA进行质量浓度和纯度分析,比较不同破壁方法对酵母菌总RNA提取的影响。结果表明:在使用Trizol法提取酵母菌总RNA的实验中,反复冻融和液氮碾磨是较为有效且简便的酵母菌细胞壁破碎方法。

灰绿藜RNA提取方法及在cDNA文库构建中的应用

目的:为分离灰绿藜耐盐相关新基因,构建叶片cDNA文库,探索从盐生植物中提取高质量RNA的方法。方法:以灰绿藜叶片为材料,应用RNAPlant Reagent法(Tiangen)、Plant RNA purification Reagent法(Invitrogen)、UNIQ柱式总RNA试剂盒提取法(Sangon)、SDS-LiCl法、TRIZOL试剂法(Invitrogen)等进行总RNA的提取,并构建其全长cDNA文库和抑制消减文库。结果:RNA Plant Reagent法、Plant RNA purification Reagent法和UNIQ柱式总RNA试剂盒提取法获得的RNA完整性均不好;SDS-LiCl法提取的RNA完整性好(28S条带亮度是18S的2倍、条带锐利清晰)、纯度高(A280/A260为1.89±0.03,A260/A230为2.23±0.02),适合用于直接反转录及构建全长cDNA文库,并获得成功;TRIZOL试剂法简单快捷,产率高(2724±82μg/g),完整性较好,可经mRNA纯化后用于抑制消减文库的构建并获得成功。结论:建立了用于构建高质量cDNA文库的灰绿藜RNA的制备方法。

野生香蕉叶片总RNA提取方法研究

采用TRIZOL试剂盒法、RNAsio试剂法和改良CTAB法提取香蕉叶片总RNA,并通过凝胶电泳、紫外分光光度法检测提取的RNA样品的质量。研究结果表明:改良CTAB法提取的RNA具有28SrRNA和18SrRNA两条清晰的条带,OD260/OD280在1.80～1.95之间,OD260/OD230在1.75～2.10之间,具有较高的纯度;其他两种方法获得的RNA纯度不够,降解严重。将提取的RNA分别逆转录成cDNA,经RT-PCR扩增,只有改良CTAB法出现清晰的条带,进一步证明改良CTAB法提取的RNA具有很高的纯度,可以满足进一步分子生物学研究的要求。

红曲有效成分洛伐他汀对高脂小鼠血脂代谢及脂蛋白脂酶mRNA表达的作用

目的探讨红曲有效成分洛伐他汀对高脂小鼠血脂代谢调节的分子机制。方法昆明种雌性小鼠48只,按血清总胆固醇(TC)分为A、B、C、D、E、F 6组:正常对照组、高脂对照组、绞股蓝总苷阳性对照组、洛伐他汀低、中、高(5、15、30 mg/kg)剂量组。A组喂饲基础饲料,其他各组喂饲高脂饲料;按剂量分别ig给药6周,禁食12 h后,测定小鼠血脂水平相关指标;用Trizol试剂法提取总RNA,用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)法检测肝、脾组织脂蛋白脂酶(LPL)mRNA的表达。结果实验6周末,洛伐他汀低、中、高各剂量组使小鼠动脉硬化指数(AI)均极显著低于高脂组(P<0.01);洛伐他汀中、高剂量组和绞股蓝总苷阳性对照组使高脂小鼠血清TC、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白-胆固醇(LDL-C)均极显著低于高脂组(P<0.01);洛伐他汀低、中、高剂量组与高脂组相比,显著升高血清高密度脂蛋白-胆固醇(HDL-C)(P<0.01);洛伐他汀低、中、高剂量组均提高肝组织中LPLmRNA的表达,且呈剂量依赖关系。结论洛伐他汀通过促进LPL mRNA转录而调节高脂小鼠血清血脂代谢水平,这可能是其调节血脂,预防动脉粥样硬化(AS)等心脑血管疾病的机制之一。

人脂肪细胞总RNA的抽提及对脂联素mRNA的扩增

目的建立一种提取脂肪组织总RNA并能够有效地进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)的方法。方法利用Trizol试剂提取人皮下脂肪组织总RNA,用紫外分光光度法鉴定其产率及纯度,用琼脂糖凝胶电泳和RT-PCR鉴定所提取的总RNA的完整性。结果采用选择性mRNART-PCR试剂盒特异性地扩增出脂联素(adiponectin)和β肌动蛋白(β-actin)的mRNA。结论在脂肪组织总RNA抽提中容易混入基因组DNA,而采用选择性mRNART-PCR只针对mRNA进行特异的扩增。

2种微藻总RNA提取方法的比较

以微茫藻和莱茵衣藻为材料,比较Trizol试剂法和SDS-LiCl沉淀法提取2种微藻总RNA的效果,以期筛选出适合微藻RNA的提取方法。结果表明,SDS-LiCl沉淀法能从微茫藻中提取高质量的RNA,而Trizol法和SDS-LiCl沉淀法均能从莱茵衣藻中获得高质量的RNA,但Trizol法更为简单有效。RT-PCR结果表明,SDS-LiCl沉淀法提取的微茫藻总RNA和Trizol法提取的莱茵衣藻总RNA都能直接用于分子克隆和基因表达分析等分子生物学实验。

白腐真菌总RNA提取方法的研究

为寻求一种简便有效的白腐真菌总RNA的提取方法,在实验中分别采用Trizol试剂盒法、CTAB-LiCl法、硅藻土-STE法进行操作,琼脂糖凝胶电泳和紫外吸收光谱检测提取的RNA。通过对提取的总RNA实验操作过程、浓度、纯度以及完整性等方面的比较与分析,得出硅藻土-STE法是白腐真菌总RNA提取的理想方法。

一种快速提取烟草病毒的方法

为寻找高效快速提取植物总RNA的检测方法,以白肋烟叶片为材料,用Trizol试剂盒提取总RNA。依据黄瓜花叶病毒和马铃薯X病毒的外壳蛋白保守序列设计特异性引物,进行RT-PCR检测,从感病叶片中分别扩增出326bp、392bp的目的片断,而对照叶片中无此扩增带。将PCR产物连接pGEM-T载体上,转化大肠杆菌DH5α,得到了含有目的片断的重组子。序列分析表明,与Gene Bank中报道的这两种病毒核苷酸序列进行比较,同源性均达到96%以上。从而证明Trizol试剂盒可以在1 h内提取到纯度高、含量高、完整性好的总RNA,快速、简便、可靠。

植物总RNA提取研究进展

植物总RNA的提取尽管已成为一种常规的技术,但由于不同植物化学组分的差异,没有一种特定的方法适用于所有植物RNA的提取。该文介绍了异硫氰酸胍法、改进CTAB法、改进SDS法和Trizol试剂盒法提取植物总RNA的特点。

胀果甘草发芽率测定及总RNA提取初步研究

以胀果甘草(Glycyrrhiza inflata Batalin)种子为试验材料,通过实验室培养出甘草幼苗,利用Trizol试剂法来获取甘草叶片的总RNA,进一步通过琼脂糖凝胶电泳和测定吸光度(D值)以确定RNA浓度及纯度。试验结果表明,甘草种子的萌发率可达85%以上,采用本研究的方法可得到较纯RNA,紫外灯下可以观察到明显的28S、18S、5S的RNA条带,分光光度计测得的D值均为1.85,由此可以看出本实验室条件下培养的甘草萌发率较高,所获取的RNA完整且纯度较高。

外源性降钙素基因相关肽对脑死亡大鼠肺组织水通道蛋白1表达的影响

降钙素基因相关肽（CGRP）是一种具有肺保护以及免疫调节作用等多种生物学功能的多肽，并可促进水肿液回流入血管，减轻肺水肿程度。本实验旨在观察外源性CGRP对脑死亡大鼠肺组织水通道蛋白1（AQP-1）表达的影响。一、资料与方法1．一般资料：60只由河南省实验动物中心提供的SPF级健康Wistar大鼠，雌雄不限，体质量250～300g。CGRP购自Sigma公司，抗AQP-1多克隆抗体购自SantaCruz公司，聚合酶链反应（PCR）引物由上海生物工程技术服务有限公司合成。Trizol试剂购自Invitrogen公司，

高糖和脂多糖对腹膜间皮细胞β连环蛋白表达及纤维化的影响

腹膜间皮细胞（PMC）在腹膜纤维化中起着关键作用,在炎性反应及非生理性高糖透析液的环境下,其形态、结构及功能都发生了变化.在糖尿病肾病发病过程中,肾小管上皮细胞内的β连环蛋白（ β-catenin）含量及表达上调,使下游转分化及致炎、致纤维化因子高表达[1].一、材料与方法1.实验动物：SD大鼠,体质量160～200 g,普通级,由中国医科大学实验动物中心提供.2.药品和试剂：DMEM-F12干粉培养基（美国Hyclone）,胎牛血清（天津灏阳）,Trizol试剂（美国Invitrogen）,实时RT-PCR试剂盒（大连TaKaRa）,PCR引物由北京华大基因公司合成,兔抗3-catenin多克隆抗体、SABC试剂盒、DAB显色液（武汉博士德）,Wnt通路中的关键酶GSK-3β.

大鼠烫伤后早期转化生长因子β1／Smads信号通路的活化

1材料与方法 1．1主要试剂来源 一抗：小鼠抗大鼠β肌动蛋白单克隆抗体（美国Sigma公司），山羊抗大鼠磷酸化Smad2／3多克隆抗体、兔抗大鼠Smad3多克隆抗体（美国Santa Cruz公司）；二抗：辣根过氧化物酶（HRP）标记的驴抗兔或山羊多克隆抗体（美国Santa Cruz公司），HRP标记的山羊抗小鼠多克隆抗体（美国Calbioehem公司）。SB431542（美国Tocris公司），Trizol试剂（美国GibeoBRL公司），反转录（RT）-PCR试剂盒（大连宝生物工程有限公司），二辛丁酸（BCA）试剂盒、肿瘤坏死因子仅（TNF-α）酶联免疫吸附测定（ELISA）试剂盒及白细胞介素1β（IL-1β）ELISA试剂盒（美国Pierce公司），IL-6ELISA试剂盒（美国R＆D公司）。PCR仪（美国Biometa公司），半干电转移仪、图像分析仪、550型酶标仪（美国Bio—Rad公司）。