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猪传染性胃肠炎病毒TS株非编码区的克隆及其一二级结构的分析
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作者 李建强 柳纪省 胡永浩 《动物医学进展》 CSCD 2005年第12期71-74,共4页
参照GenBank中Purdue株全序列对5′和3′非编码区各设计一对特异性引物,经RT-PCR分别获得了2 957 bp和516 bp大小的片段,与预期结果大小相符。猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)TS株与Puedue株、TH-98和FS772/70株的5′UTR核苷酸序列同源性分别... 参照GenBank中Purdue株全序列对5′和3′非编码区各设计一对特异性引物,经RT-PCR分别获得了2 957 bp和516 bp大小的片段,与预期结果大小相符。猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)TS株与Puedue株、TH-98和FS772/70株的5′UTR核苷酸序列同源性分别为99.4%,99.3%,99.0%,TGEV TS株的3′UTR与Miller、Purdue、Niigata、h-5株的核苷酸同源性均为100.0%,与Aomori和Ogawa的同源性为99.3%。对非编码区的二级结构进行分析发现其具有复杂的二级结构。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 ts 非编码区 克隆分析
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猪繁殖与呼吸综合征病毒TS株结构蛋白基因的克隆与变异分析
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作者 王娇 赵泽坤 +1 位作者 王坤 孙继国 《中国动物检疫》 CAS 2010年第5期28-30,共3页
从河北唐山分离到一株疑似猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),接种Marc-145细胞,经2代盲传后出现细胞病变,经鉴定为PRRSV,命名为TS株。利用RT-PCR扩增出TS株各基因的cDNA片段,然后克隆入pMD19-T载体并测序。应用DNAStar软件,结合其它河北... 从河北唐山分离到一株疑似猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),接种Marc-145细胞,经2代盲传后出现细胞病变,经鉴定为PRRSV,命名为TS株。利用RT-PCR扩增出TS株各基因的cDNA片段,然后克隆入pMD19-T载体并测序。应用DNAStar软件,结合其它河北毒株与多株GenBank中已发表的PRRSV毒株相应基因进行序列比较。结果表明:PRRSV TS株与VR-2332同源性为88.9%-94.7%,与河北省2007年以来发现的8个毒株同源性很强,为98.0%-99.7%;与LV株的亲缘关系较远,同源性为61.2%-69.0%,属于美洲型。遗传进化树表明国内美洲型分离株明显分为2个亚群,所有河北省流行毒株属于同一亚群,且TS株与高致病性代表毒株JXA1关系非常近。本研究将为河北省预防和控制PRRS提供重要的理论数据。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 ts 结构蛋白基因 遗传变异分析
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TGEV的sM、M和N基因克隆及特征分析 被引量:5
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作者 程杰 柳纪省 +4 位作者 吴润 殷相平 李宝玉 兰喜 王辉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期695-700,共6页
参照GenBank中收录的TGEVsM、M和N基因序列各设计1对特异引物,经RTPCR扩增获得了TS株的相应基因片段,分别约为346、932和1217bp,其大小与预计的目的片段相符。与其他毒株的相应基因相比较,并经剪接后,TS株的sM、M和N基因全长分别为248、... 参照GenBank中收录的TGEVsM、M和N基因序列各设计1对特异引物,经RTPCR扩增获得了TS株的相应基因片段,分别约为346、932和1217bp,其大小与预计的目的片段相符。与其他毒株的相应基因相比较,并经剪接后,TS株的sM、M和N基因全长分别为248、789和1149bp,各编码82个、262个和382个氨基酸;TS株与Purdue株、TFI株和961933株的sM基因核苷酸序列同源性分别为95.2%、92.7%和90.2%;推导氨基酸的同源性分别为95.9%、97.2%、98.8%;与Purdue株、TFI株、TGEVH株和961933株的M基因核苷酸序列同源性分别为95.2%、98.0%、99.6%和95.0%;推导氨基酸的同源性分别为97.0%、97.3%、98.5%、93.5%;与Purdue株、TFI株、FS722/70株、Korea株、TO14株、TGEVH株和961933株的N基因核苷酸序列同源性分别为98.1%、97.7%、99.0%、98.3%、99.2%、99.0%和95.9%,推导氨基酸的同源性分别为97.9%、98.4%、99.0%、97.7%、99.5%、96.2%、96.6%。并对TS株基因间的保守序列和sM、M和N基因及其编码的相应氨基酸的结构特征进行了分析,发现sM和N基因在TGEV中保守;并提示在我国不仅存在有2个不同亚基因型的TGEV,而且我国的TGEV可能是输入性的。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 TGEV ts sM基因 M基因 N基因 克隆
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猪传染性胃肠炎病毒S基因的克隆及其结构特征 被引量:3
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作者 程杰 柳纪省 +4 位作者 吴润 殷相平 李宝玉 王辉 兰喜 《中国兽医科技》 CSCD 北大核心 2004年第9期3-11,共9页
参照GenBank中登录的TGEVS基因序列设计了 3对特异引物 ,经RT PCR扩增获得了TS株S基因的SⅠ、SⅡ和SⅢ 3个片段 ,其大小分别约为 12 6 2、2 36 8和 12 6 6bp。SⅠ、SⅡ和SⅢ片段经剪接后 ,可知TS株的S基因全长为 4 347nt ,共编码 14 4 ... 参照GenBank中登录的TGEVS基因序列设计了 3对特异引物 ,经RT PCR扩增获得了TS株S基因的SⅠ、SⅡ和SⅢ 3个片段 ,其大小分别约为 12 6 2、2 36 8和 12 6 6bp。SⅠ、SⅡ和SⅢ片段经剪接后 ,可知TS株的S基因全长为 4 347nt ,共编码 14 4 9个氨基酸。对TS株与其他毒株的S基因序列进行比较发现 ,TS株与Miller株、FS72 2 / 70株、TGEVH株、96 1933株、TFI株均在 112 4~112 9位有 5′ ATGATA 3′六个碱基 ,而在Purdue株、TH 98株、NEB72 RT株和PRCV HOL87株中缺失 ;TS株与Miller株、FS72 2 / 70株、TFI株、Purdue株、96 1933株、TGEVH株、TH 98株、NEB72 RT株和PRCV HOL87株的核苷酸序列同源性分别为 99.6 %、98.9%、98.0 %、98.3%、95 .7%、99.3%、97.7%、98.3%和 97.5 % ,推导氨基酸序列的同源性分别为 99.2 %、98.4 %、97.7%、97.8%、94 .8%、98.6 %、97.2 %、97.7%和 97.0 % ;TS株S蛋白的推导氨基酸序列较Purdue株、TH 98株和NEB72 RT株多出 2个潜在的糖基化位点 ,共 34个。与不同毒株比较后 ,推测在TGEV的S蛋白中第 71位的Asp(D)与呼吸道嗜性有关 ,第 2 19位的Ala(A) 展开更多
关键词 ts S基因 分子克隆 序列测定 结构特征
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猪繁殖与呼吸综合征病毒河北地方株ORF3基因的克隆及变异分析
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作者 王娇 赵泽坤 +1 位作者 王坤 孙继国 《广东畜牧兽医科技》 2010年第1期32-34,共3页
从河北唐山分离到一株疑似猪繁殖与呼吸综合征病毒,接种Marc-145细胞,经过4代盲传后,出现细胞病变,经鉴定为PRRSV,命名为TS株。根据GenBank公布的PRRSV JXA1株ORF3基因的核苷酸序列,设计并合成一对特异性引物,用RT-PCR方法扩增完整ORF3... 从河北唐山分离到一株疑似猪繁殖与呼吸综合征病毒,接种Marc-145细胞,经过4代盲传后,出现细胞病变,经鉴定为PRRSV,命名为TS株。根据GenBank公布的PRRSV JXA1株ORF3基因的核苷酸序列,设计并合成一对特异性引物,用RT-PCR方法扩增完整ORF3基因,将扩增产物连接到pMD19-T载体并转化克隆菌,将阳性重组质粒PMD-GP3进行序列测定与分析。应用DNA Star软件,将测序结果与国内外已发表野毒株和疫苗株的ORF3基因进行序列比较,并绘制系统进化树。这为研制PRRSV新型疫苗及诊断试剂奠定了基础。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 ts ORF3基因 变异分析
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DH&DP钢显微组织、力学性能及形变机制差异研究
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作者 周莉 薛仁杰 +1 位作者 曹晓恩 文才君 《钢铁钒钛》 CAS 北大核心 2023年第6期186-191,共6页
采用高速拉伸试验、综合成形试验、场发射扫描电镜(SEM)、X射线衍射(XRD)、电子背散射衍射(EBSD)等表征方法研究了DH780与DP780冷轧双相钢组织性能差异。研究表明,DH780与DP780显微组织差异关键在于是否存在残余奥氏体,前者存在约5.1%... 采用高速拉伸试验、综合成形试验、场发射扫描电镜(SEM)、X射线衍射(XRD)、电子背散射衍射(EBSD)等表征方法研究了DH780与DP780冷轧双相钢组织性能差异。研究表明,DH780与DP780显微组织差异关键在于是否存在残余奥氏体,前者存在约5.1%残余奥氏体,呈块状、薄膜状、链状与细小粒状位于相界面与铁素体晶界处,在变形过程中具有显著TRIP效应,同时残余奥氏体具有更多滑移系可有效减缓位错塞积、延缓应力集中与裂纹源的形成,使得DH780较DP780具有更优良的强塑积及扩孔性能。高速拉伸试验表明,DH780较DP780具有更高的应变速率敏感性特征;随着应变速率的提升,DH780强塑积增加至38.83 GPa·%,吸能性能显著增强。 展开更多
关键词 双相钢 残余奥氏体 TRIP效应 应变速率 强塑积 扩孔性能
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