对山东地区TTV基因片段的检测及其部分核酸序列测定

目的 了解山东地区输血传播病毒 (TTV)分离株感染状况及基因变异的情况 .方法 应用逆转录—聚合酶链反应法 (RT- PCR)检测山东地区 2 6例非甲～戊型肝炎和 1 2例肝细胞癌患者血清中的 TTV DNA,对阳性扩增的产物进行测序 ,并分析其基因变异情况 .结果 2 6例非甲～戊型肝炎患者检出 TTV DNA阳性者 1 1例 (42 % ) .对其中 2例(TTVSD4,TTVSD5)进行 PCR产物直接测序 ,并与日本株(AB0 0 8394)相比较 ,其核苷酸序列同源性分别为 99.9%和1 0 0 % .而 1 2例肝细胞癌患者中 TTVDNA阳性 3例 (2 5% ) ,对其中 1例 (TTVSD6)测序 ,与日本株 (AB0 0 8394)相比较 ,其核苷酸序列同源性为 99% ;TTVSD4、 TTVSD5和TTVSD6之间的核苷酸同源性均为 99% .结论 山东地区非甲～戊型肝炎和肝细胞癌患者中 TTV感染率较高 ,测序结果表明其与日本株 (AB0 0 8394)

一种新的TTV基因群全基因序列测定及基因结构分析

目的 测定 2株TTV高度变异株全基因序列 ,对其基因结构、基因分型及分子流行病学分析。方法 从 2名感染TTV高度变异株的婴儿血清中抽提其DNA ,用longinvertedPCR扩增出全基因组并测定其序列 ,同时对测序结果进行分析。根据测定的序列设计引物 ,对人群中此类变异株的感染情况进行研究。结果 首次报道了TTV一个新基因群———第 5基因群 ;测定了该基因群中 2株变异株的全基因序列。该基因群在小于 30日龄、1～ 6月龄、7～ 12月龄的婴儿中检出率分别为 0、2 7.3%、39.5 %,献血员中检出率为 45 .8%。结论 虽然第 5基因群基因组核酸序列呈高度异质性 ,但其基本结构及功能与已报道的TTV各基因群十分相似 ;婴儿中该基因群的感染主要与环境因素有关。