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小麦TaBTLs基因家族全基因组鉴定与表达模式分析
被引量:
1
1
作者
车卓
景凡丽
+4 位作者
苗永平
张沛沛
陈涛
刘媛
杨德龙
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期181-190,共10页
【目的】鉴定和分析小麦TaBTLs基因家族成员。【方法】通过生物信息学方法,分析小麦TaBTLs家族成员的数量、生化性质、基因结构、共线性关系、系统进化关系和启动子顺式作用元件;利用小麦RNA-Seq数据,分析TaBTL基因在不同组织器官和发...
【目的】鉴定和分析小麦TaBTLs基因家族成员。【方法】通过生物信息学方法,分析小麦TaBTLs家族成员的数量、生化性质、基因结构、共线性关系、系统进化关系和启动子顺式作用元件;利用小麦RNA-Seq数据,分析TaBTL基因在不同组织器官和发育时期的表达模式以及对非生物胁迫的响应水平。【结果】小麦共有35个TaBTLs基因家族成员,所有成员均含RING-H2和BZF保守结构域,相对分子量介于29.64~45.16 ku之间。TaBTLs基因分布在除2A、2B和2D染色体以外的所有染色体上,且各成员之间存在大量重复事件。不同物种间BTLs基因分为7个亚族。TaBTLs基因在启动子区域存在大量的植物生长发育和逆境响应顺式作用元件;该基因家族成员在不同的组织和器官中广泛表达,并且受盐和干旱胁迫诱导。【结论】研究结果为阐明TaBTLs基因家族的进化关系和进一步研究其家族成员的功能提供理论依据和前期工作基础。
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关键词
小麦
tabtls
生物信息学
重复事件
表达模式分析
下载PDF
职称材料
题名
小麦TaBTLs基因家族全基因组鉴定与表达模式分析
被引量:
1
1
作者
车卓
景凡丽
苗永平
张沛沛
陈涛
刘媛
杨德龙
机构
甘肃农业大学生命科学技术学院
甘肃省种子总站
干旱生境作物学国家重点实验室
出处
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期181-190,共10页
基金
甘肃省自然科学基金项目(21JR7RA828)
国家自然科学基金项目(32160487)
+2 种基金
甘肃省高等学校创新基金项目(2021B-125)
甘肃省农业重点研发计划(21YF5NA089)
甘肃省高等学校产业支撑计划项目(2022CYZC-44)。
文摘
【目的】鉴定和分析小麦TaBTLs基因家族成员。【方法】通过生物信息学方法,分析小麦TaBTLs家族成员的数量、生化性质、基因结构、共线性关系、系统进化关系和启动子顺式作用元件;利用小麦RNA-Seq数据,分析TaBTL基因在不同组织器官和发育时期的表达模式以及对非生物胁迫的响应水平。【结果】小麦共有35个TaBTLs基因家族成员,所有成员均含RING-H2和BZF保守结构域,相对分子量介于29.64~45.16 ku之间。TaBTLs基因分布在除2A、2B和2D染色体以外的所有染色体上,且各成员之间存在大量重复事件。不同物种间BTLs基因分为7个亚族。TaBTLs基因在启动子区域存在大量的植物生长发育和逆境响应顺式作用元件;该基因家族成员在不同的组织和器官中广泛表达,并且受盐和干旱胁迫诱导。【结论】研究结果为阐明TaBTLs基因家族的进化关系和进一步研究其家族成员的功能提供理论依据和前期工作基础。
关键词
小麦
tabtls
生物信息学
重复事件
表达模式分析
Keywords
wheat
tabtls
bioinformatics
repeated events
expression pattern analysis
分类号
S512.101 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦TaBTLs基因家族全基因组鉴定与表达模式分析
车卓
景凡丽
苗永平
张沛沛
陈涛
刘媛
杨德龙
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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