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小麦耐盐基因TaHKT1的新单倍型及其耐盐性评价
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作者 钮力亚 邹景伟 +5 位作者 王伟伟 王志 张玉杰 罗政辉 赵振杰 于亮 《种子》 北大核心 2024年第4期51-63,共13页
本研究利用0.5%盐胁迫对275份小麦品种(系)进行芽期耐盐性鉴定,测定发芽率、芽长、根长、根数、芽鲜质量、根鲜质量及根冠比等指标。利用主成分分析法将7个指标转化为3个主成分,累积贡献率为74.35%。通过主成分贡献率和隶属函数分析进... 本研究利用0.5%盐胁迫对275份小麦品种(系)进行芽期耐盐性鉴定,测定发芽率、芽长、根长、根数、芽鲜质量、根鲜质量及根冠比等指标。利用主成分分析法将7个指标转化为3个主成分,累积贡献率为74.35%。通过主成分贡献率和隶属函数分析进一步将3个主成分简化为综合评价值(D)。根据D值的大小,利用聚类分析法将275份小麦品种(系)划分为高耐盐、中耐盐、耐盐、盐敏感和盐高敏感共5个等级,筛选出高耐盐种质11份、中耐盐107份、耐盐60份,累计占比64.7%。通过对13个小麦品种(系)进行TaHKT1基因序列分析,发现T∶T新单倍型与耐盐性相关。利用KASP标记对275份小麦品种(系)进行检测,有98份小麦品种(系)为新单倍型,占35.64%;新单倍型小麦品种(系)在各省份中所占比例不同。将小麦品种(系)的TaHKT1基因T∶T单倍型与耐盐性D值进行关联分析,结果表明,TaHKT1基因T∶T单倍型与小麦芽期耐盐性差异达极显著水平(p<0.01)。 展开更多
关键词 小麦 耐盐性 tahkt1基因 新单倍型
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小麦TaHKT家族基因的生物信息学分析
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作者 苏瑞平 张宝 +2 位作者 王玉宁 张淑娟 秦余香 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期147-157,共11页
高亲和性钾离子转运蛋白(high-affinity K+transporter, HKT)是植物体内一种非常重要的离子转运蛋白,具有运输Na+/K+的能力,在植物响应盐胁迫过程中发挥重要作用。为系统了解小麦TaHKT家族基因,挖掘有效的小麦耐盐基因,本研究采用生物... 高亲和性钾离子转运蛋白(high-affinity K+transporter, HKT)是植物体内一种非常重要的离子转运蛋白,具有运输Na+/K+的能力,在植物响应盐胁迫过程中发挥重要作用。为系统了解小麦TaHKT家族基因,挖掘有效的小麦耐盐基因,本研究采用生物信息学的方法,对小麦TaHKT家族基因进行了全基因组分析,鉴定了家族成员,构建了系统进化树,并对其跨膜结构域、染色体定位、基因结构、Motif、上游顺式作用元件、共线性以及表达谱等进行了分析。结果鉴定出23个TaHKT基因,其编码蛋白质长度为443~590 aa,等电点范围8.2~10.4,跨膜结构域为6~8个。23个基因分布于小麦的2、4、6、7号染色体上,根据亲缘关系可将其分为3个亚族,同一亚族的成员具有较为相似的Motif组成和基因结构。23个基因中,发现了4对串联重复基因,10对大片段复制基因,具有良好的共线性。顺式作用元件分析发现,大部分TaHKT成员含有盐胁迫响应元件MYB、G-box、ABRE和DRE。表达谱分析发现,TaHKT基因在小麦的16种组织中均有表达,在根、茎中的表达量较高,其中TraesCS4D02G361300(ID,下同)在根中的表达量最高。在盐胁迫处理后,不同成员对盐胁迫响应程度不同,TraesCS7B02G318400在盐胁迫处理后表达量逐渐降低;TraesCS2B02G451400和TraesCS2D02G428200在盐胁迫处理后的表达量也明显降低;TraesCS2B02G451800在根部几乎不表达,但在受到盐胁迫处理后表达量逐渐提高,推测它们在小麦抵御盐胁迫过程中发挥不同作用。 展开更多
关键词 小麦 tahkt 生物信息学 基因家族分析 盐胁迫
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六倍体小麦TaHKT2;2基因的克隆与多样性分析
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作者 李孟军 李亚青 +2 位作者 张士昌 张楠 史占良 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2017年第12期1-7,共7页
为深入研究小麦HKT基因家族其他成员的作用,利用同源序列克隆技术和六倍体小麦基因组BAC文库克隆了小麦TaHKT2;2基因。TaHKT2;2定位于小麦第7同源群,分别命名为TaHKT2;2-7A、TaHKT2;2-7B、TaHKT2;2-7D。TaHKT2;2与TaHKT2;1基因结构相同... 为深入研究小麦HKT基因家族其他成员的作用,利用同源序列克隆技术和六倍体小麦基因组BAC文库克隆了小麦TaHKT2;2基因。TaHKT2;2定位于小麦第7同源群,分别命名为TaHKT2;2-7A、TaHKT2;2-7B、TaHKT2;2-7D。TaHKT2;2与TaHKT2;1基因结构相同,均由3个外显子和2个内含子组成。在系统进化树上TaHKT2;2与TaHKT2;1聚类形成1个分支。TaHKT2;2-7A、TaHKT2;2-7B、TaHKT2;2-7D的基因编码区分别为1 602 bp、1 602 bp、1 596 bp,但利用RTPCR技术未能在8个六倍体小麦中克隆TaHKT2;2-7D c DNA。采用克隆测序技术分析了12个六倍体小麦中TaHKT2;2的自然多样性,结果表明,TaHKT2;2-7A的序列多样性高于TaHKT2;2-7B和TaHKT2;2-7D。TaHKT2;2仅见少数碱基发生改变,在TaHKT2;2 P-loop区无氨基酸变异。TaHKT2;2 5'侧翼序列保守性低于其编码区。TaHKT2;2在小麦驯化过程可能受到选择,属于驯化基因。 展开更多
关键词 六倍体小麦 HKT基因家族 tahkt2 2基因 BAC文库 多样性
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Cloning and Diversity Analysis of TaHKT2;2 in Hexaploid Wheat
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作者 Mengjun LI Yaqing LI +2 位作者 Shichang ZHANG Nan ZHANG Zhanliang SHI 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2018年第4期16-20,54,共6页
In order to study the roles of members of HKT gene fanfily in wheat, TaHKT2 ; 2 was isolated by using homologous cloning strategy and screening genomic BAC library. TaHKT2; 2 genes were mapped on chromosomes 7A, 7B an... In order to study the roles of members of HKT gene fanfily in wheat, TaHKT2 ; 2 was isolated by using homologous cloning strategy and screening genomic BAC library. TaHKT2; 2 genes were mapped on chromosomes 7A, 7B and 7D, named as TaHKT2; 2-7A, TaHKT2; 2-7B, and TaHKT2; 2-7D, respectively. TaHKT2 ; 2 and TaHKT2 ; 1 had the same genetic structure, composed of three exons and two introns, and formed a cluster with TaHKT2 ; 1 on the phylogenetic tree of plant HKT transporters. The coding sequences of TaHKT2 ; 2-7A, TaHKT2 ; 2-7B, and TaHKT2 ; 2-7D were 1 602, 1 602 and 1 596 bp long, respectively, but TaHKT2 ;2-7D cDNA sequence was not isolated by RT-PCR in eight wheat varieties. The natural diversity of TaHKT2 ;2 genes was analyzed by cloning and sequencing from 12 wheat varieties. The results showed that TaHKT2;2-7A was found to be more diverse than TaHKT2; 2-7B and TaHKT2; 2-7D. Only a few bases changed in the alleles of TaHKT2 ; 2 genes in wheat. No amino-acid natural variation lay in the P-loops of deduced protein sequences of all alleles of TaHKT2 ; 2 in 12 wheat varieties. The identity of coding sequences was nmch higher than that of 5' flanking regions of TaHKT2 ; 2 genes. TaHKT2 ; 2 nfight be selected over the comse of wheat domestication and belonged to domestication gene. 展开更多
关键词 Hexaploid wheat HKT gene family tahkt2 2 BAC library DIVERSITY
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