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Tae-miR9677小串联模拟靶标(STTM)表达载体构建及小麦的遗传转化研究 被引量:1
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作者 李赵杰 简超 +1 位作者 刘香利 赵惠贤 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期404-408,共5页
小串联模拟靶标(Short tandem target mimic,STTM)技术是一种新开发的miRNA功能研究方法。Tae-miR9677作为一种新发现的在小麦穗部特异性高表达的miRNA,其功能至今未知。为了进一步探索Tae-miR9677的功能,构建了Ubiqutin(UBI)启动子启动... 小串联模拟靶标(Short tandem target mimic,STTM)技术是一种新开发的miRNA功能研究方法。Tae-miR9677作为一种新发现的在小麦穗部特异性高表达的miRNA,其功能至今未知。为了进一步探索Tae-miR9677的功能,构建了Ubiqutin(UBI)启动子启动的Tae-miR9677 STTM过表达载体,并通过基因枪介导法对小麦品种绵阳19幼胚愈伤组织进行转化。结果表明,3 683个愈伤组织经过PPT(Phosphinothricin)筛选,最终分化获得42株再生植株;利用特异性引物进行PCR检测,鉴定出8株T0代阳性植株。 展开更多
关键词 tae-mir9677 小串联模拟靶标(STTM) 小麦 载体构建 转基因
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小麦miRNA靶基因的体外实验验证
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作者 房春豪 陈志浩 +6 位作者 王开 汪晓璐 徐文竞 祁广 马朋涛 韩冉 刘成 《山东农业科学》 北大核心 2024年第2期1-7,共7页
miRNA是一类内源非编码单链小RNA,广泛存在于动植物中,主要通过切割靶基因或者抑制靶基因表达参与细胞分化、生长和发育等多种生物学调控。目前缺少一种快速简便验证miRNA靶基因的方法。本研究基于前期筛选到的小麦特有的miRNA——Tae-m... miRNA是一类内源非编码单链小RNA,广泛存在于动植物中,主要通过切割靶基因或者抑制靶基因表达参与细胞分化、生长和发育等多种生物学调控。目前缺少一种快速简便验证miRNA靶基因的方法。本研究基于前期筛选到的小麦特有的miRNA——Tae-miR9666a,合成其前体及前体突变体,并连接到表达载体上,构建含有GFP(绿色荧光蛋白)标记的靶基因过表达载体,共转化烟草,通过观察GFP的荧光亮度判断靶基因的切割情况,以此来验证miRNA与靶基因的相互作用。结果发现,共转miRNA前体的烟草叶片的荧光亮度较低,表明靶基因被miRNA切割,其后的GFP无法正常表达;共转miRNA前体突变体的烟草叶片的荧光亮度与单转靶基因的相当,表明miRNA前体突变体未切割靶基因,导致GFP正常表达。本实验有效证明了miRNA的靶基因切割情况,也表明利用烟草验证miRNA与靶基因相互作用是可行的。 展开更多
关键词 小麦miRNA 靶基因 tae-mir9666a GFP 本氏烟草
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小麦miR166基因家族鉴定及表达分析
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作者 雷晓彤 徐渴 +3 位作者 孙若希 张树华 杨学举 赵勇 《中国科技论文在线精品论文》 2024年第1期41-49,共9页
miR166作为重要的转录后调节因子,在植物的生长发育和对逆境胁迫的反应中扮演着重要的角色。利用PmiREN、Ensembl Plants数据库、MEGA-X、DNAMAN软件以及RNAfold web server、WebLogo和psRNA Target在线网站对小麦miR166(Tae-miR166)基... miR166作为重要的转录后调节因子,在植物的生长发育和对逆境胁迫的反应中扮演着重要的角色。利用PmiREN、Ensembl Plants数据库、MEGA-X、DNAMAN软件以及RNAfold web server、WebLogo和psRNA Target在线网站对小麦miR166(Tae-miR166)基因家族的进化特性和表达模式进行分析。在PmiREN数据库中搜索到19个Tae-miR166基因家族成员,染色体定位发现Tae-miR166成员定位于14条染色体上。序列比对发现Tae-miR166的成熟体序列高度保守。进化分析结果表明,Tae-miR166基因家族成员分别处于4个进化分支。靶基因预测结果表明,Tae-miR166的靶基因包括Ⅲ类同源异型结构域亮氨酸拉链蛋白、β半乳糖苷酶和钙依赖性蛋白激酶等。转录组数据分析表明Tae-miR166家族19个成员在小麦6个组织中都有表达,在籽粒和穗中表达量最高。荧光定量PCR结果表明,Tae-miR166家族15个成员在镉、干旱和低温胁迫处理后的表达模式存在差异,说明Tae-miR166基因家族在植株抵御非生物胁迫时发挥着重要作用。本研究为进一步阐明Tae-miR166基因家族的功能提供了理论依据。 展开更多
关键词 农艺学 tae-mir166 小麦 进化特征 靶基因
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小麦miR164基因家族的生物信息学分析及靶基因预测
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作者 武宁静 徐渴 +3 位作者 曹慧雯 张树华 赵勇 杨学举 《中国科技论文在线精品论文》 2024年第1期50-58,共9页
miR164家族是植物中一类特有的保守小RNA分子,广泛参与植物的生长发育及各种逆境胁迫响应。为了解小麦Tae-miR164基因家族成员的进化特征、表达模式及功能,对PmiREN数据库中Tae-miR164基因进行了生物信息学分析。结果共鉴定到13个家族成... miR164家族是植物中一类特有的保守小RNA分子,广泛参与植物的生长发育及各种逆境胁迫响应。为了解小麦Tae-miR164基因家族成员的进化特征、表达模式及功能,对PmiREN数据库中Tae-miR164基因进行了生物信息学分析。结果共鉴定到13个家族成员,成簇于小麦Chr1、Chr2和Chr6等3条染色体上。序列比对发现Tae-miR164家族13个成员的成熟序列均为21 bp,且相似性较高,仅在5’端第21个核苷酸处存在差异,前体序列均能形成稳定的二级茎环结构,成熟的miRNA序列处于5’端臂上。进化树分析表明,拟南芥、水稻、玉米、二穗短柄草、大麦、谷子、苜蓿、番茄和小麦中Tae-miR164家族成员主要分为4个分支。靶基因预测表明,Tae-miR164基因家族成员对应的靶基因为NAC转录因子家族成员。转录组数据分析表明,Tae-miR164a/b/c/d/e/f/g/h/i/m在小麦6个组织中均有表达,Tae-miR164j/k/l在花和籽粒中几乎不表达。实时荧光定量PCR结果表明,低温(4℃)胁迫处理48 h的小麦茎基部中Tae-miR164家族成员呈明显上调的表达模式。本研究为小麦Tae-miR164家族成员的功能鉴定奠定了理论基础。 展开更多
关键词 农艺学 小麦 tae-mir164基因家族 系统进化 靶基因预测
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tae-miR167d及靶基因ARF12在小麦中的表达模式分析
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作者 宋国琦 李玮 +6 位作者 张淑娟 张荣志 李玉莲 高洁 李吉虎 陈明丽 李根英 《山东农业科学》 北大核心 2021年第5期25-31,共7页
本研究通过分析tae-miR167d及其靶基因ARF12在小麦品种济麦22和西农889相同时期不同器官和不同时期相同器官中的表达水平,以及冷胁迫前后8个小麦品种叶片和幼穗中表达水平,以明确tae-miR167d及其靶基因ARF12在小麦中的表达时空分布情况... 本研究通过分析tae-miR167d及其靶基因ARF12在小麦品种济麦22和西农889相同时期不同器官和不同时期相同器官中的表达水平,以及冷胁迫前后8个小麦品种叶片和幼穗中表达水平,以明确tae-miR167d及其靶基因ARF12在小麦中的表达时空分布情况以及不同品种中冷胁迫前后的变化趋势。结果表明,在济麦22和西农889相同发育时期的叶片、叶鞘、茎和幼穗中tae-miR167d和ARF12的表达水平不同,并且随着发育时期的变化,tae-miR167d和ARF12的表达水平也发生变化。分析8个品种正常条件和冷胁迫下叶片和幼穗中tae-miR167d和ARF12的表达情况,发现除临麦4号的幼穗及周麦22和濮麦053的叶片以外,其余品种的叶片和幼穗中tae-miR167d和ARF12表达呈负调控关系;以济麦22的叶片和幼穗为参照,发现多数情况下,叶片中tae-miR167d的表达量低于ARF12,而幼穗中tae-miR167d的表达量高于ARF12。上述结果表明,在小麦的发育过程中,tae-miR167d和ARF12表达水平在不同器官和不同发育时期处于动态变化中,受到冷胁迫后二者呈负调控关系。 展开更多
关键词 小麦 tae-mir167d ARF12 冷胁迫
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冬小麦miR172响应抗寒的特征分析
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作者 王多佳 王政委 +5 位作者 任志鹏 彭瞰看 田宇 张达 徐庆华 苍晶 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1304-1310,共7页
东农冬麦1号(Dn1)是我国首个能在黑龙江省高寒地区安全越冬的强抗寒冬小麦品种。为了解tae-miR172在Dn1抗寒中的调控机制,本研究克隆了Dn1中tae-miR172的前体pre-tae-miR172,根据生物信息学分析预测其靶基因为AP2dn1(TraesCS5D02G486600... 东农冬麦1号(Dn1)是我国首个能在黑龙江省高寒地区安全越冬的强抗寒冬小麦品种。为了解tae-miR172在Dn1抗寒中的调控机制,本研究克隆了Dn1中tae-miR172的前体pre-tae-miR172,根据生物信息学分析预测其靶基因为AP2dn1(TraesCS5D02G486600)。通过农杆菌介导的烟草瞬时表达试验,进一步证明tae-miR172靶向AP2dn1;利用qRT-PCR技术对大田越冬期Dn1分蘖节中pre-tae-miR172和Ap2dn1的相对表达量进行分析。结果表明,pre-tae-miR172的表达量随温度降低呈先升后降的变化趋势,而靶基因Ap2dn1的表达量变化趋势则相反,说明tae-miR172负调控Ap2dn1的表达。 展开更多
关键词 冬小麦 tae-mir172 AP2dn1 低温胁迫 表达模式
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The miR164-TaNAC14 module regulates root development and abiotic-stress tolerance in wheat seedlings 被引量:1
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作者 CHI Qing DU Lin-ying +6 位作者 MA Wen NIU Ruo-yu WU Bao-wei GUO Li-jian MA Meng LIU Xiang-li ZHAO Hui-xian 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2023年第4期981-998,共18页
Previous studies have revealed the miR164 family and the miR164-targeted NAC transcription factor genes in rice(Oryza sativa)and Arabidopsis that play versatile roles in developmental processes and stress responses.In... Previous studies have revealed the miR164 family and the miR164-targeted NAC transcription factor genes in rice(Oryza sativa)and Arabidopsis that play versatile roles in developmental processes and stress responses.In wheat(Triticum aestivum L.),we found nine genetic loci of tae-miR164(tae-MIR164 a to i)producing two mature sequences that downregulate the expression of three newly identified target genes of TaNACs(TaNAC1,TaNAC11,and TaNAC14)by the cleavage of the respective mRNAs.Overexpression of tae-miR164 or one of its target genes(TaNAC14)demonstrated that the miR164-TaNAC14 module greatly affects root growth and development and stress(drought and salinity)tolerance in wheat seedlings,and TaNAC14 promotes root growth and development in wheat seedlings and enhances drought tolerance,while tae-miR164 inhibits root development and reduces drought and salinity tolerance by downregulating the expression of TaNAC14.These findings identify the miR164-TaNAC14 module as well as other taemiR164-regulated genes which can serve as new genetic resources for stress-resistance wheat breeding. 展开更多
关键词 Triticum aestivum L. tae-mir164 miR164-targeted TaNACs miR164-TaNAC14 module growth and development abiotic-stress tolerance
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小麦miR5062靶基因的鉴定及功能研究
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作者 刘涛 吴保为 +3 位作者 李志杰 刘振兰 王倩 赵惠贤 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期1-10,共10页
miRNA作为一种植物中重要的内源小分子,通过调控靶基因的表达来行使其功能。为了探索小麦(Triticum aestivum)中新发现的miRNA tae-miR5062的靶基因,利用生物信息学方法对tae-miR5062的靶基因进行预测和进一步分析,将属于小麦AGO2家族的... miRNA作为一种植物中重要的内源小分子,通过调控靶基因的表达来行使其功能。为了探索小麦(Triticum aestivum)中新发现的miRNA tae-miR5062的靶基因,利用生物信息学方法对tae-miR5062的靶基因进行预测和进一步分析,将属于小麦AGO2家族的TaAGO2确定为其靶基因;进一步构建重组表达载体pBI121-pre-miR5062和pBI121-TaAGO2,分别转入农杆菌GV3101感受态细胞,然后在烟草叶片上分区注射进行农杆菌介导的烟草瞬时共转化实验。结果表明,tae-miR5062与其靶基因TaAGO2互作降解,并降低了TaAGO2的表达。利用实时定量PCR方法检测TaAGO2在小麦不同组织中的转录水平,结果显示,TaAGO2在小麦根和叶中表达量不高,但在旗叶、茎、穗、籽粒和生长点中都有较高的表达。将C端连有GFP的TaAGO2融合表达载体转入水稻黄化苗叶鞘的原生质体后瞬时表达的亚细胞定位结果显示,TaAGO2蛋白定位于细胞核和细胞质中;与拟南芥过量表达TaAGO2的转基因植株相比,野生型对照并无明显的表型。 展开更多
关键词 小麦 tae-mir5062 靶基因 基因功能
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小麦中MIR160基因家族的生物信息学分析及靶基因鉴定 被引量:1
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作者 赵思航 刘昊东 +3 位作者 徐渴 张树华 赵勇 杨学举 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2023年第1期27-35,共9页
MicroRNA(MIRNA)在植物的生长、发育和逆境胁迫应答等生物学过程中发挥着重要的作用。为了研究小麦中MIR160家族(MIR160s)的进化规律、表达模式及其靶基因,以小麦中11个MIR160s成员的前体和成熟体序列为基础,进行生物信息学分析,利用RT-... MicroRNA(MIRNA)在植物的生长、发育和逆境胁迫应答等生物学过程中发挥着重要的作用。为了研究小麦中MIR160家族(MIR160s)的进化规律、表达模式及其靶基因,以小麦中11个MIR160s成员的前体和成熟体序列为基础,进行生物信息学分析,利用RT-qPCR结合RNA-seq数据明确MIR160s在不同小麦组织的表达模式,利用降解组测序和5'RLM-RACE技术验证小麦中MIR160s与靶基因的靶向关系。结果表明,MIR160s成熟体的序列在32个植物物种中高度保守,仅在第15和21位碱基存在多样性;小麦中MIR160s成员分别定位于1、5、6和7号染色体上;Tae-MIR160s成熟体在成熟叶片中表达量较高,其中Tae-MIR160c表达量最低;Tae-MIR160s分别可以在第1716、1562、1305和1931位碱基靶向切割TaARF11、TaARF25、TaARF34、TaARF54生长素响应因子(Auxinresponse factor)。本研究通过揭示Tae-MIR160s的进化规律、表达模式和靶基因,为小麦中MIR160s应答响应机制的解析提供了参考。 展开更多
关键词 小麦 tae-mir160s 进化规律 靶基因
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