果蝇Tap蛋白结构与功能的生物信息学分析

目的利用生物信息学方法分析果蝇Tap蛋白的结构和功能。方法基于NCBI数据库中果蝇Tap蛋白的氨基酸序列,从蛋白质理化性质、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、结构域、三维结构及物种间同源蛋白进化关系等方面进行分析。结果Tap蛋白为不稳定亲水性蛋白,无跨膜区和信号肽,在细胞核中发挥生物学效应,具有碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域。Tap蛋白与来源于NeuroD1的模板2ql2.1.B有61.02%的氨基酸序列一致,Tap蛋白与人类和啮齿动物的编码产物高度同源,在系统发生树中距离最近。结论果蝇Tap蛋白具有bHLH蛋白家族的典型结构,可能在果蝇胚胎发育早期的神经发生、分化等过程中发挥作用。

肿瘤异常蛋白(TAP)检测在Barrett食管及食管腺癌临床诊断中的意义

目的探讨TAP检测对Barrett食管及食管腺癌的诊断价值和临床意义。方法 75例Barrett食管患者,61例食管腺癌患者,88例正常体检人群,应用双盲法检测末梢血TAP,并计算其灵敏度及特异度。结果 TAP阳性率正常体检人群为12.5%;Barrett食管组为81.33%,食管腺癌组为85.25%,均明显高于正常体检人群,差异有统计学意义(P<0.05)。TAP在Barrett食管筛选中灵敏度为81.33%;对食管腺癌的灵敏度为85.25%。结论 TAP检测可以提高Barrett食管及食管腺癌患者的早期诊断率,对其早诊早治有重要的意义,适用于健康人和高危人群的Barrett食管和食管腺癌筛查。

肺癌患者血浆肿瘤异常糖链蛋白(TAP)的表达及其临床分析

目的探讨肺癌患者血浆肿瘤异常糖链蛋白(TAP)的表达及其临床分析。方法回顾性分析2018年1月~2019年1月在我院呼吸内科治疗的100例肺癌患者的临床资料,将其作为观察组,选取同期100例健康体检者作为对照组,比较两组血标本中TAP浓度,分析TAP表达的差异性及临床资料。结果观察组血TAP凝聚物面积为(187.92±52.28)μm^2,对照组为(67.38±21.62)μm^2,观察组显著高于对照组(P<0.05);观察组化疗后TAP凝聚物面积为(136.84±36.59)μm^2,明显低于化疗前(P<0.05);观察组TAP阳性率为84.00%,对照组为3.00%,差异有统计学意义(P<0.05);TAP检测的敏感度为84%(84/100),特异度为97%(97/100),约登指数为84%+97%-1≈0.81;TAP阳性与胸水、远处转移有明显关联(P<0.05),与性别、年龄、临床分期等无明显关联(P>0.05)。结论肺癌患者血浆TAP表达明显升高,对肺癌的早发现、早诊断有重要意义,并可用于疗效监测,评估治疗效果及预后。

左归丸对^(60)Coγ射线损伤大鼠外周血细胞及卵巢组织TAP63和Bcl-2蛋白表达的影响

目的探讨^(60)Coγ射线对性成熟期大鼠外周血细胞和性激素水平以及卵巢组织凋亡的影响以及左归丸的干预效应。方法选择10~12周龄雌性SPF级SD大鼠50只,随机分成正常组、辐射组、补佳乐组、左归丸高剂量组和左归丸低剂量组。^(60)Coγ射线一次性照射(6.0 Gy,LD40)24 h后连续给补佳乐[0.09 g/(kg·d)]、左归丸高剂量(0.946 g生药/200 g)和左归丸低剂量(0.189 g生药/200 g),1次/d,治疗21 d,检测不同时间段血细胞变化、EILSA法检测外周血激素[促卵泡生成素(follicle-stimulating hormone,FSH)、黄体生成素(luteinizing hormone,LH)、雌二醇(estradiol,E_(2))],光镜下过程卵巢的组织形态变化,用免疫组化检测卵巢组织蛋白TAP63和Bcl-2蛋白表达。结果辐射后大鼠外周血细胞数量减少,尤以白细胞减少最显著,辐射组与对照组比较有显著统计学意义(P<0.01),辐射照组成熟卵泡数量减少,卵巢血管增生,有纤维化,E_(2)[(49.40±12.54)pg/mL]降低,FSH[(1.97(0.78))pg/mL]和LH[(1.65±1.57)pg/mL]水平增加,之后FSH[(0.55±0.49)pg/mL]和LH[(0.704±0.093)pg/mL]逐渐降低(P<0.01);TAP63和Bcl-2蛋白表达明显减(P<0.01),在给予补佳乐和左归丸治疗后逐渐恢复正常,尤以左归丸高剂量组作用显(P<0.01)。结论辐射损伤抑制骨髓造血、促进卵巢颗粒细胞凋亡和卵泡闭锁,导致卵巢功能快速衰退,左归丸通过刺激骨髓造血,促进卵巢组织TAP63蛋白表达,激活Bcl-2基因抑制颗粒细胞和卵母凋亡,增加颗粒细胞合成雌激素,达到促进卵巢功能修复的作用。

肿瘤异常蛋白(TAP)对肿瘤的检测意义

目的 探讨肿瘤异常蛋白（TAP）对肿瘤的检测意义。方法 选取2015年3月－2016年3月在医院接受健康体检者1 000名作为对照组,门诊自愿检测者500例为观察组作为研究对象,对已知门诊自愿检测者中患有恶性肿瘤患者135例作治疗效果观察,采集指端末梢血0.25μl,使用仪器进行检验,对两组进行TAP检测,分析比较两组TAP检测阳性率情况、不同年龄阳性率情况、不同性别阳性率情况、恶性肿瘤与健康人群结果情况。结果 对照组中检测出的阳性人数为44例,阳性率为4.4%,观察组中检测出阳性人数为165例,阳性率为33.0%,总阳性人数为209例,阳性率为13.9%;阳性率最高的是超过70岁的受检者,阳性率为23.6%;男性为876例,阳性人数为133例,阳性率15.2%,女性为624例,阳性人数为76例,阳性率12.2%;健康人群阳性率为4.4%,阴性率为95.6%,135例恶性肿瘤患者阳性人数为116例,阳性率为85.9%,阴性率为14.1%。结论 TAP是一种全新的肿瘤标志物,是一种非常高效的肿瘤诊断筛检方法,在对健康人群的体检和恶性肿瘤疗程观察中值得应用。

卡瑞利珠单抗结合DSOX方案对晚期胃癌患者血清BARD1、TAP表达的影响

目的探讨卡瑞利珠单抗结合多西他赛+奥沙利铂+替吉奥(DSOX)方案对晚期胃癌患者血清乳腺癌肿瘤易感基因(BRCA)1相关环指结构域蛋白(BARD)1、肿瘤异常蛋白(TAP)表达的影响。方法选取116例晚期胃癌患者116例按照随机数字表分为对照组及观察组各58例,对照组给予DSOX化疗,观察组在对照组基础上静脉注射卡瑞利珠单抗,观察两组临床预期生存时间、临床有效率、化疗后不同血清TAP水平变化及治疗前后血清癌胚抗原(CEA)、糖类抗原(CA)199、CA125表达水平变化、血清CD3^(+)、CD4^(+)、CD8^(+)、CD4^(+)/CD8^(+)表达水平、患者临床症状、BARD1及TAP表达比较。结果治疗后观察组治疗临床有效率明显优于对照组(P<0.05)。治疗后,相比于观察组,对照组患者生存时间显著缩短(P<0.05)。观察组与对照组CEA、CA199、CA125及CD3^(+)、CD4^(+)、CD8^(+)、CD4^(+)/CD8^(+)比较差异具有统计学意义(均P<0.05)。治疗前,两组BARD1及TAP表达水平无明显差异(P>0.05),治疗后,两组上述而指标表达差异存在统计学意义(P<0.05)。结论卡瑞利珠单抗结合DSOX方案治疗晚期胃癌患者,对患者生存率有提高作用,有较好的治疗疗效,对血清CA125、CA19-9、CEA水平有降低作用,降低胃癌患者血清肿瘤标志物水平,同时研究发现血清和胃癌患者组织中BARD1表达升高,其血清水平与胃癌的恶性程度和预后存在相关性,提示BARD1可能与胃癌的发生发展有关,同时患者血清TAP水平与其疗效及预后有关。

肿瘤异常蛋白检测在结直肠癌临床诊断中的意义

目的探讨肿瘤异常蛋白（Tumor abnormal protein，TAP）检测在结直肠癌早期诊治中的临床价值。方法通过TAP检测系统对正常人群（n=60）及结直肠癌患者（n=50）的TAP阳性率进行比较，并分析结直肠癌患者阳性率与临床病理的相关性。结果结直肠癌组TAP阳性率（78．00％）明显高于正常对照组（16．67％），差异有统计学意义（P=0．00）。50例结直肠癌中TAP阳性率与患者年龄、性别、肿瘤部位、是否肝转移无明显相关性；与患者临床分期、肿瘤分化程度及淋巴结转移情况相关（P〈0．05）。以凝聚物面积〉121μm。为阳性标准，TAP诊断结直肠癌的灵敏度为78．00％，特异度为83．33％，准确度为80．91％，ROC曲线下面积为0．95。结论TAP检测对结直肠癌的早期筛查，早期诊断及评估肿瘤进展均有一定临床价值。

非小细胞肺癌患者血清肿瘤异常蛋白的表达与化疗疗效的相关性

目的研究肿瘤异常蛋白(TAP)与非小细胞肺癌(NSCLC)化疗疗效之间的相关性。方法对83例非小细胞肺癌患者采用凝集素凝聚法测定化疗前后外周静脉血TAP水平,根据化疗后肺部CT复查情况分为完全缓解(CR)、部分缓解(PR)、病情稳定(SD)和病情进展(PD)。将CR+PR归为缓解组(22例),将SD归为稳定组(53例)、将PD归为进展组(8例)。这些患者中肺腺癌44例、肺鳞癌39例,病理分期I~Ⅱ期20例,Ⅲ期17例,Ⅳ期46例。分别比较不同组间及同组化疗前后TAP水平的差异,并对相关性、病理分型及分期进行统计分析。结果化疗前后外周静脉血TAP水平差异有统计学意义(P<0.05);化疗结束后缓解组和稳定组外周静脉血TAP水平明显下降(P<0.05),而进展组外周静脉血TAP水平明显升高(P<0.05),不同化疗疗效患者化疗前后外周静脉血TAP的变化存在差异(P<0.05);化疗疗效与患者化疗前后外周静脉血TAP的变化存在相关性(r=-0.557,P<0.05);不同病理分型间无差异(P>0.05),但病理分期越晚,TAP水平越高(F=8.049,P<0.05)。结论非小细胞肺癌患者外周静脉血TAP水平可作为评价化疗疗效的指标之一,在一定程度上可指导后续治疗。

肿瘤异常糖链糖蛋白在肾癌中的诊断价值

目的:研究外周血肿瘤异常糖链糖蛋白(tumor abnormal protein,TAP)的表达对早期肾癌的诊断价值。方法:对45例肾癌患者(肾癌组)、32例肾脏良性病变患者(肾良性病变组)和42例体检健康人群(正常组)的外周血TAP值进行分析;绘制受试者工作特征(receiver operating characteristics,ROC)曲线评估TAP对肾癌的诊断效能;分析肾癌组中TAP阳性表达与患者临床病理特征的关系。结果:肾癌组中外周血TAP水平明显高于肾良性病变组和正常组。通过评估TAP对肾癌的诊断效能,发现TAP诊断肾癌的ROC曲线下面积为0.92(95%CI:0.82~0.95),其诊断肾癌的灵敏度和特异度分别为73%和91%。结论:肾癌患者外周血中TAP呈高表达,可作为肾癌早期诊断的肿瘤标志物。

血清TAP、bFGF及CDCA5在老年宫颈癌患者中表达水平及其与预后的关系

目的 探讨血清肿瘤异常蛋白(TAP)、碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)及细胞分裂周期相关蛋白(CDCA)5在老年宫颈癌患者中的表达水平及其与预后的关系。方法 选取98例宫颈癌患者为癌症组,另选取同期女性体检健康的56例为健康组,比较两组血清TAP、bFGF及CDCA5的表达水平并应用Cox比例风险模型分析其与预后的关系。结果 癌症组TAP、bFGF及CDCA5的表达水平明显高于健康组(P<0.05);多因素分析结果显示,病理类型、FIGO分期、TAP、bFGF及CDCA5的表达水平均为影响老年宫颈癌患者预后的独立危险因素(P均<0.05)。结论 血清TAP、bFGF及CDCA5在老年宫颈癌患者中表达水平较高,可作为预测患者预后的重要因素。

vIL-10对鼻咽癌细胞株MHC-1类分子抗原加工提呈“操纵子”表达的影响

目的研究病毒白介素-10(vIL-10)对鼻咽癌细胞株MHC-1类分子抗原加工提呈"操纵子"表达的影响。方法收集不同时间段vIL-10处理的鼻咽癌细胞(CNE-1和CNE-2),采用RT-PCR、Western blot方法检测vIL-10处理的鼻咽癌细胞中MHC-1类分子抗原加工提呈"操纵子"(TAP-1、2,LMP-2、7及HLA-I)表达的变化。结果1mRNA水平:CNE-1和CNE-2的TAP-1水平在不同时间点均未表现出显著差异;vIL-10作用1、4、6、12h时,CNE-1和CNE-2的TAP-2、LMP-2均未出现变化,24h时,两者均出现显著下降甚至消失;CNE-1在vIL-10作用后4h即出现LMP-7下降,而CNE-2在vIL-10作用后6h出现下降;在vIL-10作用24h时CNE-1和CNE-2的HLA-I出现显著下降。2蛋白水平:vIL-10作用后24h时,两种细胞的TAP-1均出现显著下降,TAP-2则在vIL-10作用后1、6、12、24h出现逐渐下降;CNE-2的LMP-2、LMP-7在vIL-10作用后随时间逐渐下降,而CNE-1的两种蛋白仅在作用后12h出现显著下降;HLA-I在vIL-10作用后出现下降趋势,但在CNE-1中各时间段变化无统计学差异,CNE-2在24h显著下降。结论 vIL-10可明显抑制鼻咽癌MHC-I类分子抗原加工和提呈的"操纵子"的表达,并且呈一定的时间依赖性。

外周血异常糖链糖蛋白(TAP)检测对于肿瘤筛查及早期辅助诊断的意义分析

分析外周血异常糖链糖蛋白(TAP)检测对于肿瘤筛查及早期辅助诊断的意义。方法 通过随机方法收集在2022年3-2023年8月期间于江阴市人民医院之中的体检中心做过TAP检测,对于2022年3~2023年8月期间江阴市人民医院门诊及住院部曾行TAP检测的患者进行收集,采取组织病理学检查的方式,归为癌前病变组,于江阴市人民医院做过TAP检测,并采取内镜、影像学等检查排除器质性病变的人员,并且采取内镜检查排除器质性病变的健康体检人员共有1742例,设为对照组,对于相关的TAP结果进行比较。结果 在对照组之中共有1742例,其中健康体检人群之中共有18例阳性,其中阳性率为1.03%,而299例癌前病变的患者共有21例阳性,阳性的概率为7.02%,而对于现行391例患者之中,检测出共有阳性315例,其阳性的概率为80.56%,对于三组之中间的TAP的阳性率进行比较,差异有着一定的统计学意义。TAP的检测对于肿瘤辅助诊断整体的灵敏度、特异度以及阳性预测值分别是89.2%、95.4%、87.9%,覆盖肿瘤的范围比较广。TAP的在阳性率方面分别和对照组癌前病变组以及恶性肿瘤的组别之中的患者都和性别没有明显的关联,差异不具备统计学意义,p>0.05。结论 外周血异常糖链糖蛋白(TAP)检测的方法整体的灵敏度以及特异度比较高,且整体不会受性别的限制,且癌谱比较广,在健康体检肿瘤筛查的过程之中得到了广泛的应用,对于患者早期的肿瘤诊断有着重要的参考作用。

不同品种鸡TAPBP基因序列分析

TAPBP是抗原呈递相关转运体(TAP)相关蛋白,在先天性和适应性免疫反应中均发挥着重要作用,与多种疾病的抗性或易感性相关。对25个不同品种鸡TAPBP基因序列进行目标捕获测序,利用MEGA软件对不同品种鸡序列进行比对分析,筛选不同品种鸡TAPBP基因上的SNPs及Indel位点,并根据基因序列进行系统进化树的构建。结果表明:TAPBP基因存在较多的SNPs和Indels位点,有着丰富的遗传多样性。不同地方鸡品种相对外来鸡品种呈现出高度多态性,可能与抗病性存在密切联系。青脚麻鸡、太湖鸡、如皋草鸡等抗性较好的鸡品种在系统进化树中拥有较高的亲缘系数。此外,固始鸡、如皋草鸡、安卡鸡等品种在第8外显子上存在特异性的插入缺失,且引起氨基酸变化,可作为鸡抗性研究的候选分子标记。

联合检测TAP,CEA,CA19-9,CA72-4在早期胃癌中的诊断价值

目的研究联合检测异常糖链糖蛋白(肿瘤异常蛋白,TAP)、癌胚抗原(CEA)、糖类抗原19-9(CA19-9)、糖类抗原72-4(CA72-4)对早期胃癌的诊断价值。方法采集61例胃癌患者(胃癌组)、57例胃良性疾病患者(胃良性疾病组)、52例健康体检者(对照组)血清,用电化学发光法检测CEA,CA19-9,CA72-4水平,用凝集法检测TAP含量,并进行统计学分析。结果胃癌组血清中TAP,CEA,CA19-9,CA72-4水平均高于胃良性疾病组和健康对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。胃良性疾病组血清TAP水平高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05),胃良性疾病组血清中CEA,CA19-9,CA72-4水平分别与健康对照组相比差异无统计学意义(P>0.05)。4项联合检测对胃癌的敏感度可达93.44%,均高于4项单独检测,差异有统计学意义(P<0.05)。4项联合检测对胃癌的特异度为61.47%,低于TAP,CA72-4单独检测(P<0.05),但与CEA,CA19-9单独检测相比差异无统计学意义(P>0.05)。结论联合检测TAP,CEA,CA19-9,CA72-4有助于提高早期胃癌的诊断率。

直肠癌根治术患者术后TAP、CEA水平变化在复发监测中的应用价值

探讨行直肠癌根治术患者的肿瘤异常蛋白(TAP)、癌胚抗原CEA水平与直肠癌复发转移的相关性。方法:选取2019年1月至2020年1月聊城市第二人民医院直肠癌根治术的82例患者,分为两组:复发组和无复发组,其中复发组30例,无复发组52例,选取查体中心的82例健康检查人员,通过检测其TAP、CEA水平,分析TAP、CEA水平与直肠癌复发转移的关系。结果:直肠癌根治术患者的TAP、CEA水平比健康体检人员明显升高(P<0.05)。直肠癌根治术患者的术毕检测TAP、CEA水平明显低于术前水平(P<0.05)。复发组术后的TAP、CEA水平有一定上升趋势,无复发组的TAP、CEA水平有一定下降的趋势,复发组患者的术后第3、6、9、12个月的TAP、CEA检测水平高于无复发组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:直肠癌根治术后患者TAP、CEA水平与直肠癌复发转移具有一定的相关性,监测TAP、CEA水平变化,有助于对是否复发转移进行评估。