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鸡滑液囊支原体TaqMan实时荧光定量PCR方法的建立及应用 被引量:2
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作者 李梅 王柏林 +6 位作者 岳筠 杨美 宋春 朱二鹏 单春兰 文明 程振涛 《动物医学进展》 北大核心 2023年第3期15-20,共6页
为了快速、准确检测鸡滑液囊支原体(MS),对MS标准株vlhA基因进行分析,设计并合成特异性引物和探针,优化反应条件,构建了基于vlhA基因的TaqMan实时荧光定量PCR快速检测方法。结果显示,所构建方法标准曲线所对应的相关系数R^(2)=1.000,斜... 为了快速、准确检测鸡滑液囊支原体(MS),对MS标准株vlhA基因进行分析,设计并合成特异性引物和探针,优化反应条件,构建了基于vlhA基因的TaqMan实时荧光定量PCR快速检测方法。结果显示,所构建方法标准曲线所对应的相关系数R^(2)=1.000,斜率S=-3.452,截距I=43.950,表明标准质粒浓度与Ct值的线性关系良好;该方法除MS外,其他参考菌(毒)株均无目的基因扩增,其最小检测浓度为1×10^(1)copies/μL,组内重复及组间重复的变异系数均低于0.1;运用所建立方法与普通PCR方法对4份疑似MS临床样本进行检测,检测结果完全相符合;应用该方法对贵州省7个地区107份疑似MS样本进行检测,发现总体阳性率为26.17%。说明建立的方法具有较好的特异性、敏感性和重复性,可应用于临床检测。 展开更多
关键词 鸡滑液囊支原体 vlhA基因 taqman探针 实时荧光定量PCR
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SNP Genotyping of Myostatin (MSTN) Gene through Taq Man Probe Assay and Association Study between MSTN Genotypes and Growth Traits of Tan Sheep
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作者 Ma Lina Li Yingkang +2 位作者 Yu Yang E-er Hehua Ma Qing 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2016年第6期333-335,共3页
To establish a rapid, accurate and economical real-time PCR assay system based on TaqMan probe technology for the detection of genetic variations of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in myestatin (MSTN) gene,... To establish a rapid, accurate and economical real-time PCR assay system based on TaqMan probe technology for the detection of genetic variations of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in myestatin (MSTN) gene, a pair of TaqMan probes were designed on the polymorphism loci of MSTN gene and used in PCR reaction system for SNP genotyping. Meanwhile, an association study was performed between MSTN genotypes and growth traits of Tan sheep, including birth weight, weaning weight, 3-month weight, and 6-month weight. The results showed that rs417816017 locus of MSTN gene in Tan sheep had two genotypes : YY and XY. The individuals with genotype XY had a growth advantage over the ones with genotype YY. The results indicate that TaqMan probe-based real-time PCR assay can be used to detect the genotype of MSTN gene, which will provide candidate genes for breeding of Tan sheep. 展开更多
关键词 Tan sheep Myestatin (MSTN) gene taqman probe Single nucleotide polymorphism (SNP) Growth trait Association
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基于TaqMan MGB探针的人粪便中华支睾吸虫虫卵实时荧光PCR检测方法的建立及应用
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作者 马文晨 杨迪 +2 位作者 于欣 赵欣玥 李文君 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2023年第3期143-147,共5页
本研究根据华支睾吸虫cox 1基因序列设计合成特异性引物和探针,建立基于TaqMan MGB探针的人粪便中华支睾吸虫虫卵实时荧光PCR检测方法,同时评价该方法的特异性、敏感性、重复性。采用建立的荧光PCR方法对临床样本进行检测,并与改良加藤... 本研究根据华支睾吸虫cox 1基因序列设计合成特异性引物和探针,建立基于TaqMan MGB探针的人粪便中华支睾吸虫虫卵实时荧光PCR检测方法,同时评价该方法的特异性、敏感性、重复性。采用建立的荧光PCR方法对临床样本进行检测,并与改良加藤厚涂片法检测结果进行比对。结果显示,本研究建立的方法与形态和种属关系相近的寄生虫无交叉反应;以9.97×10^(7)~9.97×10^(0)copies/μL浓度的质粒作为标准品建立标准曲线,检测灵敏度为9.97 copies/μL;组内、组间重复性试验变异系数均小于0.4%。采用该方法检测280份居民粪便样本,检出阳性54份,经对比该方法敏感性高于改良加藤厚涂片法。本研究所建立的方法可用于华支睾吸虫虫卵的检测及诊断。 展开更多
关键词 华支睾吸虫 虫卵 cox 1基因 taqman MGB探针 实时荧光PCR
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马疱疹病毒8型TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立
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作者 纪言霏 齐来勇 +4 位作者 张健鹏 许丹丹 张敬文 赵霞 刘文强 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2023年第8期24-28,共5页
为了建立一种能够快速检测马疱疹病毒8型(EHV-8)的方法,本试验以EHV-8的全基因组序列为模板,针对糖蛋白B(gB)基因的保守序列,进行对比分析,设计EHV-8的特异性引物和探针,优化反应条件,建立EHV-8 TaqMan实时荧光定量PCR检测方法,并对该... 为了建立一种能够快速检测马疱疹病毒8型(EHV-8)的方法,本试验以EHV-8的全基因组序列为模板,针对糖蛋白B(gB)基因的保守序列,进行对比分析,设计EHV-8的特异性引物和探针,优化反应条件,建立EHV-8 TaqMan实时荧光定量PCR检测方法,并对该方法的敏感性、特异性和重复性进行验证,使用该方法进行临床样本检测。结果显示,建立的EHV-8 TaqMan实时荧光定量PCR检测方法对EHV-8 DNA模板的最低检测限为1.1×10^(2)copies/μL,敏感性高;EHV-8与EHV-1、EHV-4、马流产沙门氏菌和肠产毒性大肠杆菌均无交叉反应,特异性强;批内重复性试验和批间重复性试验均表明该方法重复性好。对132份临床样本的检测结果显示,阳性检出率为10.61%,基因测序正确。由此可见,本试验建立的EHV-8 TaqMan实时荧光定量PCR检测方法能够满足EHV-8的检测需求,且该方法敏感性高、特异性强、重复性好,为EHV-8的进一步研究提供了有效的辅助检测手段。 展开更多
关键词 马疱疹病毒8型 糖蛋白B(gB)基因 实时荧光定量PCR taqman探针
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toxR基因作为荧光定量PCR靶基因设计TaqMan探针快速检测副溶血弧菌 被引量:28
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作者 覃倚莹 吴晖 +4 位作者 肖性龙 杨晓泉 张经纬 余以刚 李惠芳 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1837-1842,共6页
以toxR基因为靶基因,通过优化反应条件建立了快速检测副溶血弧菌的TaqMan实时荧光PCR方法。特异性试验表明,该方法能选择性检测副溶血弧菌,而与金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、单增李斯特杆菌等多种常见的食源性病原菌没有交叉反应;灵敏度... 以toxR基因为靶基因,通过优化反应条件建立了快速检测副溶血弧菌的TaqMan实时荧光PCR方法。特异性试验表明,该方法能选择性检测副溶血弧菌,而与金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、单增李斯特杆菌等多种常见的食源性病原菌没有交叉反应;灵敏度试验表明,该方法最少可检测到25个拷贝的toxR基因重组质粒,对纯培养物和模拟食品样品直接检测的灵敏度分别为21 cfu/mL和210 cfu/g;重复性试验表明,同一样品于试验内及试验间的变异系数分别为0.9%和1.3%;所制作的标准曲线在2.5×101~2.5×106拷贝数之间有较好的线性关系,能对副溶血弧菌进行准确的定量分析。结果表明,本研究所建立的副溶血弧菌实时荧光PCR检测方法具有特异性好、灵敏度高、重复性好的特点,能进行定量检测,而且检测时间从核酸抽提到出实验结果仅需要3 h,是快速检测副溶血弧菌的有效手段。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 实时荧光定量PCR toxR基因 taqman探针 检测
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VDR基因多态性与宫颈病变及HPV感染转归的相关性
6
作者 杨佳琦 陈晓月 +2 位作者 高宇峰 李娟 李东燕 《山西医科大学学报》 CAS 2024年第6期790-797,共8页
目的 分析维生素D受体(vitamin D receptor, VDR)基因多态性与宫颈病变的关系,并探讨其对高危型人乳头瘤病毒(high risk-human papillomavirus, HR-HPV)感染转归的影响。方法 选取2020年9月至2021年10月于山西医科大学第二医院行阴道镜... 目的 分析维生素D受体(vitamin D receptor, VDR)基因多态性与宫颈病变的关系,并探讨其对高危型人乳头瘤病毒(high risk-human papillomavirus, HR-HPV)感染转归的影响。方法 选取2020年9月至2021年10月于山西医科大学第二医院行阴道镜检查的患者376例,将病理结果示慢性宫颈炎和宫颈上皮内瘤变Ⅰ级者设为对照组(188例),宫颈上皮内瘤变Ⅱ级及以上者(CINⅡ+)为病例组(188例)。收集患者外周静脉血行VDR基因多态性检测,包括FOKI、BsmL、Apal和Taql的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)位点,分析VDR基因多态性与宫颈病变的关系。对选择行宫颈锥形切除术进行治疗的142例CINⅡ-Ⅲ级患者的HPV转归情况进行6个月的随访,根据随访结果分为HPV转阴者和同一型别HPV持续感染者,即转阴组和持续感染组,分析VDR基因多态性是否影响HPV感染的转归。结果 随访结果显示,104例患者的HPV感染呈转阴状态,33例患者持续感染同一型别的HPV,而另外5例患者则感染了其他型别的HPV。VDR基因多态性检测结果表明,FOKI SNPs ff基因型及f等位基因与CINⅡ+发生显著相关(P<0.05),并且与HR-HPV持续感染相关(P<0.05);TaqI SNPs tt及Tt基因型均增加CINⅡ+发生的风险(P<0.05),t等位基因与CINⅡ+发生风险增加有关(P<0.05),但与HPV持续感染未见相关性(P>0.05)。结论 VDR基因多态性与宫颈病变及HR-HPV感染转归相关,其中FOKI SNPs ff基因型及f等位基因和TaqI SNPs tt、Tt基因型及t等位基因与宫颈病变的发生存在关联,并且FOKI SNPs ff基因型及f等位基因可能影响HR-HPV感染的转归结果。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 维生素D受体 基因多态性 宫颈病变 taqman基因探针 单核苷酸多态性
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TaqMan探针双重荧光PCR法检测副溶血性弧菌 被引量:12
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作者 许龙岩 袁慕云 +1 位作者 曹际娟 凌莉 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第18期263-266,共4页
目的:建立同时检测副溶血性弧菌(VP)和其毒力基因的方法。方法:根据VP的toxR基因和tdh基因,分别设计引物和探针,建立基于TaqMan探针双重荧光聚合酶链式反应扩增体系,进行特异性、敏感性实验,并用建立的方法检测从广东地区和辽宁地区进... 目的:建立同时检测副溶血性弧菌(VP)和其毒力基因的方法。方法:根据VP的toxR基因和tdh基因,分别设计引物和探针,建立基于TaqMan探针双重荧光聚合酶链式反应扩增体系,进行特异性、敏感性实验,并用建立的方法检测从广东地区和辽宁地区进出口食品中分离的VP菌株的毒力基因分布情况。结果:VP标准菌株和3株从食物中毒病人中分离株均出现toxR基因和tdh基因扩增曲线,而31株包括溶藻弧菌、单增李斯特菌等弧菌属和肠杆菌科的菌株扩增结果呈阴性;敏感性实验结果表明,VP浓度与Ct值有很好的反向的线性关系,toxR和tdh线性方程的R2分别为0.999、0.997,最低检测浓度达到3.6×102CFU/mL;检测食品中分离的37株VP只出现toxR基因扩增曲线,未见tdh基因扩增曲线,表明37株VP分离株均未带tdh毒力基因。结论:建立的方法特异性好、灵敏度高,可用于食品中VP的特异性及毒力基因检测。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 toxR基因 tdh基因 taqman探针 双重荧光聚合酶链式反应 检测 食品
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TaqMan MGB实时荧光PCR对转基因大豆定量检测的研究 被引量:8
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作者 黄东东 翁少萍 +2 位作者 吕玲 常迪 何建国 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期140-142,共3页
利用实时荧光定量PCR技术,根据转基因大豆(Roundup ReadyTM)的外源基因35S启动子序列设计引物和TaqMan MGB探针,对大豆粉中Roundup ReadyTM大豆含量进行了定量检测,根据这个检测体系建立了35S启动子Ct值与样品中转基因成分数量之间的标... 利用实时荧光定量PCR技术,根据转基因大豆(Roundup ReadyTM)的外源基因35S启动子序列设计引物和TaqMan MGB探针,对大豆粉中Roundup ReadyTM大豆含量进行了定量检测,根据这个检测体系建立了35S启动子Ct值与样品中转基因成分数量之间的标准曲线和线性回归方程(相关系数r2:0.9942)。本研究设计的方法还可以应用到多组分的食品、饲料等加工产品,检测转基因成分的含量,并可作为转基因食品常规PCR定性检测方法。 展开更多
关键词 转基因大豆 实时定量PCR taqman MGB探针 基因 生物技术 食品技术
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鸭疫里默氏杆菌TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:3
9
作者 万春和 程龙飞 +3 位作者 邵周伍林 刘思国 黄瑜 张云 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期458-461,共4页
为建立鸭疫里默氏杆菌(Riemerella anatipestife,RA)定量检测方法,本研究根据RA的铁依赖抑制子基因(RaDtxR)序列,设计特异性引物和探针,建立基于TaqMan探针检测RA的荧光定量PCR方法。该方法检测RA RaDtxR在4.27×102拷贝/μL^4.27&#... 为建立鸭疫里默氏杆菌(Riemerella anatipestife,RA)定量检测方法,本研究根据RA的铁依赖抑制子基因(RaDtxR)序列,设计特异性引物和探针,建立基于TaqMan探针检测RA的荧光定量PCR方法。该方法检测RA RaDtxR在4.27×102拷贝/μL^4.27×106拷贝/μL范围内具有良好的线性关系,其扩增相关系数为0.998,扩增效率为99%,最低检测下限为4.27×102拷贝/μL。对常见RA血清型(1型、2型、3型和10型)检测结果均为阳性;而对大肠杆菌、巴氏杆菌、沙门氏菌、Ⅰ型鸭肝炎病毒、禽坦布苏病毒和鸭圆环病毒等常见鸭群病原检测均为阴性。该方法重复性好,组内和组间变异系数分别为0.23%~0.77%和0.93%~1.32%。该方法的建立为RA感染宿主靶器官的感染程度和定量分析奠定基础。 展开更多
关键词 鸭疫里默氏杆菌 铁依赖抑制子基因 taqman探针 荧光定量PCR
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黏菌素耐药基因mcr-1 TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:8
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作者 施开创 尹彦文 +3 位作者 温丽霞 屈素洁 王海清 胡杰 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期1447-1452,共6页
【目的】建立针对黏菌素耐药基因mcr-1的Taq Man-MGB荧光定量PCR检测方法,为监控mcr-1基因携带细菌提供技术支持。【方法】针对mcr-1基因保守序列设计特异性引物和MGB探针,构建重组质粒作为阳性标准品,优化引物、探针浓度及Rox参比染料... 【目的】建立针对黏菌素耐药基因mcr-1的Taq Man-MGB荧光定量PCR检测方法,为监控mcr-1基因携带细菌提供技术支持。【方法】针对mcr-1基因保守序列设计特异性引物和MGB探针,构建重组质粒作为阳性标准品,优化引物、探针浓度及Rox参比染料用量、退火温度等反应条件,建立针对mcr-1基因的Taq Man-MGB荧光定量PCR检测方法,并通过特异性、敏感性、重复性试验及临床应用验证其实用性。【结果】Taq Man-MGB荧光定量PCR最佳反应体系20.00μL:Premix Ex Taq^(TM)10.00μL,Rox参比染料(50×)0.25μL,引物MCR-1F/MCR-1R(10μmol/L)各0.50μL,MCR-1-P探针(10μmol/L)0.50μL,重组质粒pMCR-1(模板)2.00μL,灭菌双蒸水6.25μL。扩增程序:95℃预变性20 s;95℃10 s,60℃20 s,进行40个循环。该检测方法能特异性扩增出mcr-1基因,其检测敏感性为2.85拷贝/μL,是常规PCR的100倍,组内和组间重复性试验的变异系数为0.37%~1.18%,均小于1.20%。采用建立的Taq Man-MGB荧光定量PCR对82株广西鸡源致病性沙门氏菌分离株进行检测,结果未发现有携带mcr-1基因的菌株。【结论】针对mcr-1基因建立的Taq Man-MGB荧光定量PCR检测方法具有特异性强、敏感性高、重复性好的特点,可用于临床筛查mcr-1基因,为监控mcr-1基因携带细菌提供技术支持。 展开更多
关键词 黏菌素 mcr-1基因 taqman-MGB探针 荧光定量PCR
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TaqMan探针实时荧光定量PCR快速检测土拉弗朗西斯菌 被引量:3
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作者 赵素慧 王春晖 +6 位作者 周莹 韦耀 韩桂圆 钮红岺 赵卫 张其威 万成松 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期602-606,共5页
目的建立TaqMan探针实时荧光定量PCR方法(QF-PCR),快速检测土拉弗朗西斯菌。方法针对土拉弗朗西斯菌的外膜蛋白fopA基因,利用Primer 5.0设计引物及TaqMan探针,人工合成fopA基因保守片段,克隆到载体作为阳性标准品,进行荧光定量检测,制... 目的建立TaqMan探针实时荧光定量PCR方法(QF-PCR),快速检测土拉弗朗西斯菌。方法针对土拉弗朗西斯菌的外膜蛋白fopA基因,利用Primer 5.0设计引物及TaqMan探针,人工合成fopA基因保守片段,克隆到载体作为阳性标准品,进行荧光定量检测,制作定量标准曲线,并以合成fopA基因为模板,PF、PR为引物,研究其灵敏度、特异性和准确性。结果构建了含fopA基因的重组质粒,以不同浓度的重组质粒制作标准曲线,在103~107拷贝数之间有较好的线性关系。灵敏度试验表明,该方法可检测到30.6个拷贝数的重组质粒,比普通PCR灵敏度高;特异性试验表明,能选择性检测土拉弗朗西斯菌,而与其他病原菌无交叉反应,与普通菌落PCR结果一致;重复性试验表明,拷贝数为3.06×106样品5次平行试验,标准差为0.201,变异系数为0.88%。结论本研究建立了TaqMan探针QF-PCR快速检测技术,具有灵敏度高、特异性强、重复性好等特点,可用于快速、实时、定量检测土拉弗朗西斯菌,为快速检测生物战剂级微生物建立了一种人工合成特异基因TaqMan探针实时荧光定量PCR新方法。 展开更多
关键词 土拉弗朗西斯菌 taqman探针 fopA基因 荧光定量PCR
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TaqMan荧光定量RT-PCR检测犬瘟热病毒方法的建立与初步应用 被引量:3
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作者 吕品 胡传伟 +2 位作者 谢之景 杨笃宝 任月 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期293-297,共5页
To establish a TaqMan-based real-time RT-PCR method for detection of canine distemper virus,the pair of primers and the TaqMan-based probe were designed according to the M protein genes of canine distemper virus strai... To establish a TaqMan-based real-time RT-PCR method for detection of canine distemper virus,the pair of primers and the TaqMan-based probe were designed according to the M protein genes of canine distemper virus strains.The reactive conditions were optimized to improve the sensitivity and specificity of the method.The specificity and sensitivity of the method were high.Canine distemper virus in the thirty-eight samples had been tested by the TaqMan-based real-time RT-PCR,the common RT-PCR and electron microscopy.The sensitivity of the TaqMan-based real-time RT-PCR was higher than the common RT-PCR and electron microscopy.This suggests that the method may be used in clinical diagnosis,epizootic study and laboratory research. 展开更多
关键词 荧光定量RT-PCR taqman探针 犬瘟热病毒 M基因
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鸭腺病毒A型TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:2
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作者 万春和 刘荣昌 +5 位作者 程龙飞 施少华 傅光华 陈红梅 傅秋玲 黄瑜 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第5期1341-1348,共8页
试验旨在建立鸭腺病毒A型(duck adenovirus A,DAdV-A)TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。根据DAdV-A Hexon基因序列设计特异性引物和探针,建立了基于TaqMan探针检测DAdV-A的实时荧光定量PCR检测方法,对其特异性、灵敏性、重复性进行检测,... 试验旨在建立鸭腺病毒A型(duck adenovirus A,DAdV-A)TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。根据DAdV-A Hexon基因序列设计特异性引物和探针,建立了基于TaqMan探针检测DAdV-A的实时荧光定量PCR检测方法,对其特异性、灵敏性、重复性进行检测,用建立的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法和常规PCR方法同时对福建地区临床收集的85份番鸭源病料进行DAdV-A感染的检测,比较其符合率。结果表明,试验成功建立了检测DAdV-A的实时荧光定量PCR检测方法,其扩增相关系数为0.996,扩增效率为99.9%;特异性强,对鸭常见病原(如鸭瘟病毒、鹅细小病毒、番鸭细小病毒、鸭圆环病毒、鸭源大肠杆菌、鸭疫里默氏杆菌和鸭源禽多杀性巴氏杆菌)检测均为阴性;灵敏度高,最低检测限为8.37拷贝/μL;重复性好,组内变异系数和组间变异系数分别为0.54%~1.28%和0.61%~2.39%。对临床送检的85份病料,TaqMan实时荧光定量PCR方法的阳性率为7.06%(6/85),PCR方法的阳性率为5.88%(5/85),且PCR检测的阳性样品经TaqMan实时荧光定量PCR方法检测均为阳性,符合率为100%。本研究建立了基于TaqMan探针检测DAdV-A的实时荧光定量PCR检测方法,为鸭群中开展DAdV-A的分子流行病学研究提供了有效技术手段。 展开更多
关键词 鸭腺病毒A型 Hexon基因 taqman探针 实时荧光定量PCR方法
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弓形虫TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:2
14
作者 陈千林 刘梦丽 +4 位作者 许正茂 王振宝 曹政 赵扬扬 巴音查汗 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期725-728,共4页
为建立一种快速、敏感的弓形虫检测方法,本研究根据弓形虫GRA7基因保守序列设计特异性检测引物和TaqMan-MGB探针,建立了弓形虫荧光定量PCR检测方法。结果显示,该方法能特异地检测弓形虫DNA,而对新孢子虫、牛巴贝斯、马驽巴贝斯等虫DNA... 为建立一种快速、敏感的弓形虫检测方法,本研究根据弓形虫GRA7基因保守序列设计特异性检测引物和TaqMan-MGB探针,建立了弓形虫荧光定量PCR检测方法。结果显示,该方法能特异地检测弓形虫DNA,而对新孢子虫、牛巴贝斯、马驽巴贝斯等虫DNA的检测均为阴性,具有良好的特异性;经3D数字PCR判定,其最低检测限为4.58拷贝/μL,灵敏度是常规PCR的1 000倍;重复性试验的组内、组间变异系数均小于5%;对62份疑似弓形虫感染流产的胎牛脑组织DNA进行检测,荧光定量PCR阳性检出率为24.19%(15/62),常规PCR为19.35%(12/62),阳性样品均包含于荧光定量PCR阳性样品中。本研究建立的荧光定量PCR检测方法可用于弓形虫病的早期诊断和日常监测,为监控弓形虫"带虫宿主"提供了良好的技术支持。 展开更多
关键词 弓形虫 荧光定量PCR taqman—MGB探针 3D数字PCR
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鸭瘟病毒TaqMan实时荧光定量PCR方法的建立 被引量:2
15
作者 万春和 刘荣昌 +6 位作者 陈翠腾 程龙飞 施少华 傅光华 陈红梅 傅秋玲 黄瑜 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2018年第6期722-728,共7页
根据鸭瘟病毒(DEV) gE基因的特征,设计特异性引物和探针,经条件优化后,建立检测DEV的TaqMan实时荧光定量PCR方法.结果表明:当gE基因含量为1.0×10~1~1.0×10~6拷贝·μL^(-1)时,建立的实时荧光定量PCR检测方法有良好的线... 根据鸭瘟病毒(DEV) gE基因的特征,设计特异性引物和探针,经条件优化后,建立检测DEV的TaqMan实时荧光定量PCR方法.结果表明:当gE基因含量为1.0×10~1~1.0×10~6拷贝·μL^(-1)时,建立的实时荧光定量PCR检测方法有良好的线性扩增,其标准曲线方程为:y=-3.480x+37.955,扩增相关系数为0.999;敏感性强,最低检测限为10拷贝·μL^(-1);特异性好,仅对DEV强毒株和弱毒活疫苗株检测到阳性扩增信号,对鸭源其他传染病病原(番鸭细小病毒、鹅细小病毒、鸭腺病毒A型、鸭甲肝病毒1型、鸭甲肝病毒3型、番鸭呼肠孤病毒、新型鸭呼肠孤病毒、H9N2亚型禽流感病毒、禽1型副粘病毒、鸭源大肠杆菌、鸭疫里默氏杆菌、鸭源禽多杀性巴氏杆菌)检测均为阴性;重复性好,组内变异系数和组间变异系数分别为0.62%~1.14%和0.69%~2.40%.对临床送检疑似DEV感染的14份样品进行检测,并与常规PCR方法、病毒分离鉴定进行比较,阳性率分别为85.71%(12/14)、71.43%(10/14)和57.14%(8/14);且与常规PCR方法、病毒分离鉴定的阳性符合率均为100%.本试验建立的TaqMan实时荧光定量PCR方法,可用于开发DEV快速诊断试剂盒,用于开展DEV流行病学调查. 展开更多
关键词 鸭瘟病毒 GE基因 taqman探针 实时荧光定量PCR方法
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TaqMan探针荧光定量PCR检测花生油中掺入棕榈油的研究 被引量:3
16
作者 周慧 梁宇斌 +3 位作者 吴苏喜 李晓明 裴伟 杨涛 《中国油脂》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期84-87,共4页
根据棕榈内源基因MT3-B设计引物和TaqMan探针,采用基因重组技术构建用于检测棕榈基因MT3-B的重组质粒作为绝对定量标准品,建立标准曲线,对花生油中掺入棕桐油1%~40%梯度混合油品提取DNA进行棕榈成分定量检测。结果表明,重组质粒... 根据棕榈内源基因MT3-B设计引物和TaqMan探针,采用基因重组技术构建用于检测棕榈基因MT3-B的重组质粒作为绝对定量标准品,建立标准曲线,对花生油中掺入棕桐油1%~40%梯度混合油品提取DNA进行棕榈成分定量检测。结果表明,重组质粒标准品荧光定量标准曲线对数线性回归分析相关系数(R2)为0.996;花生油中掺入棕榈油达到5%时,可检出每亳升混合油品中棕榈MT3-B基因17.431copies,检测的重复性和特异性好。 展开更多
关键词 荧光定量PCR taqman探针 MT3-B基因 棕榈油 花生油
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TaqMan荧光定量PCR技术快速检测霍乱弧菌方法的建立 被引量:20
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作者 黄世旺 卢亦愚 +4 位作者 徐丹戈 方叶珍 徐昌平 包芳珍 高海明 《中国卫生检验杂志》 CAS 2006年第8期923-924,984,共3页
目的:建立特异、灵敏、快速的TaqM an荧光定量PCR方法用于快速检测霍乱弧菌。方法:根据GenBank上的霍乱毒素(cholera toxin,CT)基因序列,在其保守区域设计特异性引物与TaqM an探针,并对荧光定量PCR体系与反应条件进行优化,同时验证方法... 目的:建立特异、灵敏、快速的TaqM an荧光定量PCR方法用于快速检测霍乱弧菌。方法:根据GenBank上的霍乱毒素(cholera toxin,CT)基因序列,在其保守区域设计特异性引物与TaqM an探针,并对荧光定量PCR体系与反应条件进行优化,同时验证方法的特异性、敏感性和重复性。结果:本方法对霍乱弧菌的检测具有高度特异性,与副溶血性弧菌、沙门菌、志贺菌、变形杆菌、大肠埃希菌、蜡样芽孢杆菌、金黄色葡萄球菌等均无交叉反应;检测灵敏度达10 cfu/m l;反应体系具有很高的稳定性;整个操作过程仅需2 h。结论:本研究建立的TaqM an荧光定量PCR方法特异、灵敏、快速,适用于霍乱弧菌的日常监测和爆发疫情的应急诊断。 展开更多
关键词 荧光定量PCR taqman探针 霍乱弧菌 CT基因
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胎儿弯杆菌病TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:3
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作者 赵海玲 刘慧芳 +3 位作者 杜艳芬 司微 王春来 刘思国 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期874-877,共4页
为建立胎儿弯杆菌(C.fetus)定量检测方法,本研究根据C.fetus毒力因子表面蛋白(SapA)的基因序列设计引物和一条特异的TaqMan水解探针,建立了一种敏感、特异、重复性好的快速检测C.fetus的TaqMan荧光定量PCR方法。对该方法的特异性与敏感... 为建立胎儿弯杆菌(C.fetus)定量检测方法,本研究根据C.fetus毒力因子表面蛋白(SapA)的基因序列设计引物和一条特异的TaqMan水解探针,建立了一种敏感、特异、重复性好的快速检测C.fetus的TaqMan荧光定量PCR方法。对该方法的特异性与敏感性研究,结果显示,该方法检测C.fetus结果均为阳性,而非C.fetus均为阴性;对带有SapA基因的阳性质粒的检测敏感性为108拷贝~102拷贝/μL范围内具有良好的线性关系,可敏感地检测到模板中13个拷贝的细菌DNA,其灵敏度是常规PCR方法的100倍。该方法具有简便、快速、特异性强、敏感性高等特点。该方法为C.fetus快速检测试剂盒的研制打下了良好的基础。 展开更多
关键词 C.fetus 表面蛋白基因SapA 实时荧光PCR taqman水解探针
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Taqman探针检测VEGF基因多态性的实验研究 被引量:4
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作者 杨莹 张瑛 +3 位作者 李晓进 李显丽 李惠民 陶文玉 《昆明医学院学报》 2008年第6期54-57,共4页
目的确定Taqman探针等位基因鉴别技术检测VEGF基因C-634G多态性的最适实验条件.方法对影响VEGF基因C-634G多态性Taqman探针检测的反应体系及探针、引物浓度等主要因素进行了系统研究.结果最适反应体系为12.5μL,最适探针、引物浓度为:0.... 目的确定Taqman探针等位基因鉴别技术检测VEGF基因C-634G多态性的最适实验条件.方法对影响VEGF基因C-634G多态性Taqman探针检测的反应体系及探针、引物浓度等主要因素进行了系统研究.结果最适反应体系为12.5μL,最适探针、引物浓度为:0.3/12.5μL.结论建立了Taqman探针检测VEGF基因多态性的稳定实验方法. 展开更多
关键词 taqman探针 多态性 VEGF基因 实验条件
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新型鸭呼肠孤病毒TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用 被引量:6
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作者 张博 陈立功 +5 位作者 武华 阴雅洁 孟利佳 郭康康 侯绍华 董世山 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期80-84,共5页
为了快速、准确检测新型鸭呼肠孤病毒(Novel duck reovirus,NDRV),本试验采用NDRVσB基因的序列保守区,设计特异性引物和TaqMan探针,经优化反应条件,建立了NDRV实时荧光定量RT-PCR检测方法标准曲线,并进行特异性试验、敏感性试验、重复... 为了快速、准确检测新型鸭呼肠孤病毒(Novel duck reovirus,NDRV),本试验采用NDRVσB基因的序列保守区,设计特异性引物和TaqMan探针,经优化反应条件,建立了NDRV实时荧光定量RT-PCR检测方法标准曲线,并进行特异性试验、敏感性试验、重复性试验和临床样品检测试验。结果表明:所建立的TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法标准曲线方程为y=-3.354x+44.818,扩增效率为98.7%,标准曲线的相关系数为0.999;该方法可以特异性检测NDRV,但对MDRV、ARV、TMUV、DHAV均无反应信号;该方法检测质粒标准品最低检测浓度为10拷贝/μL,是普通PCR方法检测敏感性的1000倍;该方法的组内与组间变异系数均小于2%;用该方法检测临床样品,结果显示NDRV阳性率为45%,而常规RT-PCR阳性率为33%,比常规RT-PCR敏感。说明本研究建立的TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法可为NDRV的监测和早期诊断提供可靠的技术支撑。 展开更多
关键词 新型鸭呼肠孤病毒 σB基因 荧光定量 RT-PCR taqman探针 应用
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