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采用蛋白组学技术分析质粒介导siRNA的“Off-target”效应 被引量:1
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作者 周昌华 章崇杰 +2 位作者 彭晓东 魏大鹏 王光迪 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期170-180,共11页
siRNA的"脱靶效应"(off-target effects)是RNA干扰应用研究领域的热点问题.采用蛋白组学技术对质粒介导的siRNA稳定沉默原癌基因c-myc可能存在的"off-target"效应进行初步研究,为siRNA靶向特异性的系统评价奠定理... siRNA的"脱靶效应"(off-target effects)是RNA干扰应用研究领域的热点问题.采用蛋白组学技术对质粒介导的siRNA稳定沉默原癌基因c-myc可能存在的"off-target"效应进行初步研究,为siRNA靶向特异性的系统评价奠定理论与实验基础.构建靶向c-myc的siRNA真核表达质粒p-Mat01-1及其错配质粒p-Mis09-1,空质粒pEGFP-C1为对照,并稳定转染MCF-7人乳腺癌细胞.通过RT-PCR和Western印迹分析结果显示p-Mat01-1稳定转染克隆中c-myc/c-MYC的表达降低.采用2-DE及LC-ESI-MS/MS等方法,研究了p-Mat01-1与pEGFP-C1稳定转染克隆的蛋白组表达差异.结果显示,p-Mat01-1稳定转染克隆中有47个c-myc非调控蛋白点表达升高或降低,约占423个随机检测蛋白点的11.1%.这些蛋白涉及细胞骨架、代谢、增殖、信号传导、分子伴侣、氧化还原等多条途径.实验结果表明,质粒介导靶向c-myc的siRNA在MCF-7细胞中存在明显的"off-target"效应,提示在设计siRNA实验及应用研究时应系统考察其靶向特异性. 展开更多
关键词 C-MYC rna干扰 小干扰rna 脱靶效应 蛋白组学
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Nanoparticles for targeted delivery of therapeutics and small interfering RNAs in hepatocellular carcinoma 被引量:10
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作者 Jaleh Varshosaz Maryam Farzan 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2015年第42期12022-12041,共20页
Hepatocellular carcinoma(HCC) is the 5th most common malignancy which is responsible for more than half million annual mortalities; also, it is the third leading cause of cancer related death. Unfavorablesystemic side... Hepatocellular carcinoma(HCC) is the 5th most common malignancy which is responsible for more than half million annual mortalities; also, it is the third leading cause of cancer related death. Unfavorablesystemic side-effects of chemotherapeutic agents and susceptibility to the degradation of small interfering RNAs(si RNAs), which can knock down a specific gene involved in the disease, have hampered their clinical application. So, it could be beneficial to develop an efficient carrier for the stabilization and specific delivery of drugs and si RNA to cells. Targeted nanoparticles have gained considerable attention as an efficient drug and gene delivery system, which is due to their capability in achieving the highest accumulation of cytotoxic agents in tumor tissue, modifiable drug pharmacokinetic- and bio-distribution, improved effectiveness of treatment, and limited sideeffects. Recent studies have shed more light on the advantages of novel drug loaded carrier systems vs free drugs. Most of the animal studies have reported improvement in treatment efficacy and survival rate using novel carrier systems. Targeted delivery may be achieved passively or actively. In passive targeting, no ligand as homing device is used, while targeting is achieved by incorporating the therapeutic agent into a macromolecule or nanoparticle that passively reaches the target organ. However, in active targeting, the therapeutic agent or carrier system is conjugated to a tissue or cell-specific receptor which is overexpressed in a special malignancy using a ligand called a homing device. This review covers a broad spectrum of targeted nanoparticles as therapeutic and nonviral si RNA delivery systems, which are developed for enhanced cellular uptake and targeted gene silencing in vitro and in vivo and their characteristics and opportunities for the clinical applications of drugs and therapeutic si RNA are discussed in this article. Asialoglycoprotein receptors, low-density lipoprotein, ganglioside GM1 cell surface ligand, epidermal growth factor receptor receptors, monoclonal antibodies, retinoic acid receptors, integrin receptors targeted by Arg-Gly-Asp peptide, folate, and transferrin receptors are the most widely studied cell surface receptors which are used for the site specific delivery of drugs and si RNA-based therapeutics in HCC and discussed in detail in this article. 展开更多
关键词 SMALL interfering rna targetED delivery Nanopartic
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Small Interfering RNA Targeting TNF-α Gene Significantly Attenuates Renal Ischemia-Reperfusion Injury in Mice 被引量:4
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作者 侯凌 陈刚 +5 位作者 冯彪 张旭升 郑秀芬 向莹 赵光远 闵卫平 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2016年第5期634-638,共5页
Tumor necrosis factor-alpha(TNF-α) has been found to be centrally involved in the development of ischemia-reperfusion injury(IRI)-induced inflammation and apoptosis. Knockdown of TNF-α gene using small interferi... Tumor necrosis factor-alpha(TNF-α) has been found to be centrally involved in the development of ischemia-reperfusion injury(IRI)-induced inflammation and apoptosis. Knockdown of TNF-α gene using small interfering RNA(si RNA) may protect renal IRI. Renal IRI was induced in mice by clamping the left renal pedicle for 25 or 35 min. TNF-α si RNA was administered intravenously to silence the expression of TNF-α. The therapeutic effects of si RNA were evaluated in terms of renal function, histological examination, and overall survival following lethal IRI. A single systemic injection of TNF-α si RNA resulted in significant knockdown of TNF-α expression in ischemia-reperfusion injured kidney. In comparison with control mice, levels of BUN and serum creatinine were significantly reduced in mice treated with si RNA. Pathological examination demonstrated that tissue damage caused by IRI was markedly reduced as a result of TNF-α si RNA treatment. Furthermore, survival experiments showed that nearly 90% of control mice died from lethal IRI, whereas more than 50% of si RNApretreated mice survived until the end of the eight-day observation period. We have demonstrated for the first time that silencing TNF-α by specific si RNA can significantly reduce renal IRI and protect mice against lethal kidney ischemia, highlighting the potential for si RNA-based clinical therapy. 展开更多
关键词 rna targeting silence creatinine injured silencing histological lethal interfering neutrophil
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LncRNA靶向miRNA调控子宫内膜癌发生发展的研究进展 被引量:1
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作者 钟雪艳 罗艳露 +1 位作者 孙欣昭 范江涛 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第10期1902-1906,共5页
长链非编码RNA(LncRNA)在多种肿瘤进展中扮演重要角色,MicroRNAs(miRNAs)是目前研究最多的LncRNA下游靶点,LncRNA靶向miRNAs可以直接参与肿瘤细胞生物学行为的调控。高表达或低表达的LncRNA可靶向miRNA调控下游信号通路,促进或抑制子宫... 长链非编码RNA(LncRNA)在多种肿瘤进展中扮演重要角色,MicroRNAs(miRNAs)是目前研究最多的LncRNA下游靶点,LncRNA靶向miRNAs可以直接参与肿瘤细胞生物学行为的调控。高表达或低表达的LncRNA可靶向miRNA调控下游信号通路,促进或抑制子宫内膜癌(endometrial cancer, EC)进展。随着对LncRNA/miRNA调控轴在子宫内膜癌研究的深入,LncRNA和miRNA有望成为EC诊疗的新靶点和预后标志物。本文围绕LncRNA及miRNA对EC的调控、lncRNA调控miRNA在EC中的作用进行综述。 展开更多
关键词 Lncrna MIrna Lncrna靶向mirna 子宫内膜癌
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Creation of targeted inversion mutations in plants using an RNA-guided endonuclease 被引量:7
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作者 Congsheng Zhang Changlin Liu +4 位作者 Jianfeng Weng Beijiu Cheng Fang Liu Xinhai Li Chuanxiao Xie 《The Crop Journal》 SCIE CAS CSCD 2017年第1期83-88,共6页
Inversions are DNA rearrangements that are essential for plant gene evolution and adaptation to environmental changes. We demonstrate the creation of targeted inversions and previously reported targeted deletion mutat... Inversions are DNA rearrangements that are essential for plant gene evolution and adaptation to environmental changes. We demonstrate the creation of targeted inversions and previously reported targeted deletion mutations via delivery of a pair of RNA-guided endonucleases(RGENs) of CRISPR/Cas9. The efficiencies of the targeted inversions were2.6% and 2.2% in the Arabidopsis FLOWERING TIME(At FT) and TERMINAL FLOWER 1(At TFL1)loci, respectively. Thus, we successfully established an approach that can potentially be used to introduce targeted DNA inversions of interest for functional studies and crop improvement. 展开更多
关键词 rna-guided endonuclease CRISPR/Cas9 targeted inversion Genetic improvement
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LncRNA MAFG-AS1:恶性肿瘤的潜在生物标志物和治疗靶点 被引量:1
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作者 肖押男 陈许宇 +1 位作者 李杰 李娟 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第4期731-737,共7页
长链非编码RNA(long non-coding RNAs,LncRNAs)在肿瘤发展中的调控作用已引起广泛关注。LncRNA MAFG-AS1是一种新型的致癌长链非编码RNA,在肺癌、乳腺癌和肝细胞癌等多种肿瘤组织中高表达,与肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭等恶性行为密切相... 长链非编码RNA(long non-coding RNAs,LncRNAs)在肿瘤发展中的调控作用已引起广泛关注。LncRNA MAFG-AS1是一种新型的致癌长链非编码RNA,在肺癌、乳腺癌和肝细胞癌等多种肿瘤组织中高表达,与肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭等恶性行为密切相关。此外,大量证据表明,LncRNA MAFG-AS1的上调与肿瘤患者的临床病理分期和不良生存预后有关。本文系统总结了近年来LncRNA MAFG-AS1在各种肿瘤中的表达、生物学功能、分子机制和临床意义的研究,并强调了LncRNA MAFG-AS1可作为新型诊断、预后生物标志物,以及癌症治疗的重要靶标。 展开更多
关键词 长非编码rna Lncrna MAFG-AS1 癌症 生物标志物 治疗靶标
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长链非编码RNA在肝细胞癌耐药中的研究进展
7
作者 王蒙蒙 张海婧 程树群 《海军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期880-890,共11页
肝细胞癌是原发性肝癌中最常见的类型,进展迅速、侵袭力强,治疗方法多样。但因其发生、发展所涉及的基因较多、机制复杂,不可避免地出现了治疗耐药性,导致治疗效果不明显,而耐药相关机制尚未完全明确。lncRNA是一类具有多种生物学功能... 肝细胞癌是原发性肝癌中最常见的类型,进展迅速、侵袭力强,治疗方法多样。但因其发生、发展所涉及的基因较多、机制复杂,不可避免地出现了治疗耐药性,导致治疗效果不明显,而耐药相关机制尚未完全明确。lncRNA是一类具有多种生物学功能的新型非编码RNA,能通过基因突变等作用于肝癌的发展、转化和侵袭,同时可以通过影响肿瘤免疫微环境、调节肿瘤细胞生物学功能等参与肝癌耐药。本文对lncRNA在肝细胞癌放化疗、靶向和免疫治疗耐药中的作用机制及相关进展进行综述,以期为解决肝癌耐药提供新思路。 展开更多
关键词 肝细胞癌 肿瘤抗药性 长链非编码rna 化学疗法 靶向治疗 免疫治疗
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非编码RNA在糖尿病肾病中的研究进展
8
作者 谢小海 徐小惠 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第12期2232-2235,共4页
糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)是1型和2型糖尿病中的一种重要的常见并发症,也是全球范围内引发终末期肾病的主要因素之一。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是一类具有异质性的RNA分子,主要分为环状RNA(circRNA)、微小RNA (miRNA... 糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)是1型和2型糖尿病中的一种重要的常见并发症,也是全球范围内引发终末期肾病的主要因素之一。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是一类具有异质性的RNA分子,主要分为环状RNA(circRNA)、微小RNA (miRNA)和长链非编码RNA (lncRNA)。大量研究表明非编码RNA可以作为DN治疗的潜在靶点和生物标志物。近年来,研究发现中药中的有效成分能够通过调控ncRNA的表达而作为DN治疗的主要或替代疗法,具有良好的临床效益。该文主要综述了circRNA、miRNA和lncRNA在DN中的研究进展,以及探索中药调控ncRNA治疗DN的研究现状,旨在为探索新的DN防治措施提供新靶点和新思路。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 非编码rna 治疗靶点 生物标志物 凋亡 中医药
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MicroRNAs as disease progression biomarkers and therapeutic targets in experimental autoimmune encephalomyelitis model of multiple sclerosis 被引量:11
9
作者 Bridget Martinez Philip V.Peplow 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2020年第10期1831-1837,共7页
Multiple sclerosis is an autoimmune neurodegenerative disease of the central nervous system characterized by pronounced inflammatory infiltrates entering the brain,spinal cord and optic nerve leading to demyelination.... Multiple sclerosis is an autoimmune neurodegenerative disease of the central nervous system characterized by pronounced inflammatory infiltrates entering the brain,spinal cord and optic nerve leading to demyelination.Focal demyelination is associated with relapsing-remitting multiple sclerosis,while progressive forms of the disease show axonal degeneration and neuronal loss.The tests currently used in the clinical diagnosis and management of multiple sclerosis have limitations due to specificity and sensitivity.MicroRNAs(miRNAs)are dysregulated in many diseases and disorders including demyelinating and neuroinflammatory diseases.A review of recent studies with the experimental autoimmune encephalomyelitis animal model(mostly female mice 6–12 weeks of age)has confirmed miRNAs as biomarkers of experimental autoimmune encephalomyelitis disease and importantly at the pre-onset(asymptomatic)stage when assessed in blood plasma and urine exosomes,and spinal cord tissue.The expression of certain miRNAs was also dysregulated at the onset and peak of disease in blood plasma and urine exosomes,brain and spinal cord tissue,and at the post-peak(chronic)stage of experimental autoimmune encephalomyelitis disease in spinal cord tissue.Therapies using miRNA mimics or inhibitors were found to delay the induction and alleviate the severity of experimental autoimmune encephalomyelitis disease.Interestingly,experimental autoimmune encephalomyelitis disease severity was reduced by overexpression of miR-146a,miR-23b,miR-497,miR-26a,and miR-20b,or by suppression of miR-182,miR-181c,miR-223,miR-155,and miR-873.Further studies are warranted on determining more fully miRNA profiles in blood plasma and urine exosomes of experimental autoimmune encephalomyelitis animals since they could serve as biomarkers of asymptomatic multiple sclerosis and disease course.Additionally,studies should be performed with male mice of a similar age,and with aged male and female mice. 展开更多
关键词 animal model blood plasma blood serum brain tissue disease biomarkers experimental autoimmune encephalomyelitis MICROrnaS multiple sclerosis spinal cord therapeutic targets urine exosomes
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长链非编码RNA-LUCAT1在泌尿生殖系统肿瘤中的作用
10
作者 龚小川 赵伟 +5 位作者 雷坚 骆锡科 雷旭 何浩 尹娜 王彦 《中国处方药》 2024年第5期166-169,共4页
长链非编码RNA(Long non-coding RNAs,lncRNAs)是指一种长度超过200个核苷酸、缺乏蛋白质编码能力的RNA分子。它们通过与蛋白质、RNA和DNA相互作用调节基因表达。肺癌相关转录物1(the lung cancer-related transcript 1,LUCAT1),又名SCA... 长链非编码RNA(Long non-coding RNAs,lncRNAs)是指一种长度超过200个核苷酸、缺乏蛋白质编码能力的RNA分子。它们通过与蛋白质、RNA和DNA相互作用调节基因表达。肺癌相关转录物1(the lung cancer-related transcript 1,LUCAT1),又名SCAL1(Smoke and Cancer Associated LncRNA1),是首次于吸烟相关性肺癌组织中发现的一种lncRNA,它位于5号染色体q14.3区的反义链上。已有众多研究表明,lncRNA-LUCAT1在泌尿生殖系统肿瘤、消化系统肿瘤、肺癌、胶质瘤等肿瘤中均高表达,且与这些肿瘤的增殖、迁移、侵袭有密切的关系。另外已有研究明确表明,lncRNA-LUCAT1在肿瘤中的高表达与其不良预后显著相关。本文就lncRNA-LUCAT1在泌尿生殖系统肿瘤中的表达情况、致病机理、分子机制进行综述,为泌尿生殖系统肿瘤的早期诊断、靶向治疗、预测预后提供新方向和新策略。 展开更多
关键词 肿瘤 泌尿生殖系统 长链非编码rna LUCAT1 靶向治疗
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微小RNA-34a-5p通过靶向鼠双微体4抑制巨噬细胞氧化应激损伤的作用
11
作者 刘磊 傅立国 鞠勐 《中国当代医药》 CAS 2024年第23期28-31,共4页
目的探讨微小RNA-34a-5p(miR-34a-5p)通过靶向鼠双微体4(MDM4)抑制巨噬细胞氧化应激损伤的作用。方法THP-1人单核细胞复苏后,培养分化为巨噬细胞。设立空白对照组。剩余细胞加入人源氧化低密度脂蛋白,孵育48 h,分化为巨噬泡沫细胞。设... 目的探讨微小RNA-34a-5p(miR-34a-5p)通过靶向鼠双微体4(MDM4)抑制巨噬细胞氧化应激损伤的作用。方法THP-1人单核细胞复苏后,培养分化为巨噬细胞。设立空白对照组。剩余细胞加入人源氧化低密度脂蛋白,孵育48 h,分化为巨噬泡沫细胞。设立动脉粥样硬化(AS)对照组。miR-34a-5p质粒转染,设为miR-34a-5p质粒转染组。每组24个重复。比较三组巨噬细胞凋亡情况,丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)蛋白及活性氧(ROS)水平,MDM4阳性率。结果空白对照组凋亡率为(2.55±0.32)%,AS对照组凋亡率为(28.16±4.23)%,miR-34a-5p转染组为(13.48±1.66)%,三组比较差异有统计学意义(P<0.05)。AS对照组高于空白对照组与miR-34a-5p转染组,miR-34a-5p转染组高于空白对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。三组MDA、SOD蛋白及ROS水平比较,差异均有统计学意义(P<0.05);AS对照组MDA、ROS水平最高,SOD水平最低,其次为miR-34a-5p转染组,组间比较差异均有统计学意义(P<0.05)。空白对照组MDM4阳性率为(8.33±0.35)%,AS对照组为(29.26±3.48)%,miR-34a-5p转染组为(14.26±1.59)%,三组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论miR-34a-5p可下调MDM4,进而抑制巨噬细胞氧化应激损伤。 展开更多
关键词 微小rna-34a-5p 靶向 鼠双微体4 巨噬细胞 氧化应激损伤
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非编码RNA调控内皮间质转化在疾病中的研究进展
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作者 秦玮 罗志洁 +1 位作者 荣瑞雪 陈雪英 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1215-1221,共7页
内皮间质转化(endothelial to mesenchymal transition,EndMT)是内皮细胞失去其内皮细胞表型和功能而获得间充质细胞表型和功能的过程。在胚胎时期,EndMT是心脏瓣膜、肺动脉和主动脉发育的必须途径。近年来大量研究表明,EndMT也参与如... 内皮间质转化(endothelial to mesenchymal transition,EndMT)是内皮细胞失去其内皮细胞表型和功能而获得间充质细胞表型和功能的过程。在胚胎时期,EndMT是心脏瓣膜、肺动脉和主动脉发育的必须途径。近年来大量研究表明,EndMT也参与如动脉粥样硬化、心肌纤维化、肺动脉高压、脑血管畸形等心血管疾病,以及器官纤维化和肿瘤等疾病的发生发展。非编码RNA(non-coding RNAs,ncRNAs)是指由基因组转录而成的不编码蛋白质的RNA分子。研究表明,ncRNAs异常表达可以通过调控EndMT参与多种疾病的发生发展,此类具有调控功能的ncRNAs主要包括微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)。该综述总结了ncRNAs在多种疾病中调控EndMT的分子机制,讨论了其在疾病治疗中的应用前景,为临床EndMT相关疾病治疗提供了新思路。 展开更多
关键词 非编码rna 内皮间质转化 治疗靶点 心血管疾病 器官纤维化 肿瘤
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长链非编码RNA CYP1B1-AS1对急性髓系白血病细胞增殖和迁移的影响及机制实验研究
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作者 姚云 廖冬 +2 位作者 周双雄 刘文俐 王荣 《陕西医学杂志》 CAS 2024年第6期723-728,共6页
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)CYP1B1-AS1对急性髓系白血病细胞增殖和迁移的影响及机制。方法:实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测CYP1B1-AS1在急性髓系白血病细胞系THP-1、NB4、HL-60、KG-1、SKM-1和骨髓基质细胞HS-5中的表达量。通过5-氮... 目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)CYP1B1-AS1对急性髓系白血病细胞增殖和迁移的影响及机制。方法:实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测CYP1B1-AS1在急性髓系白血病细胞系THP-1、NB4、HL-60、KG-1、SKM-1和骨髓基质细胞HS-5中的表达量。通过5-氮杂-2’-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)处理急性髓系白血病细胞系,RT-qPCR检测5-Aza-CdR对CYP1B1-AS1表达的影响。根据转染物不同分别将HL-60细胞分为NC组和CYP1B1-AS1组。克隆形成实验和划痕实验依次检测HL-60细胞的增殖和迁移能力。双荧光素酶实验验证CYP1B1-AS1与微小RNA(miR)-1306-5p的靶向关系。RT-qPCR检测CYP1B1-AS1对HL-60细胞miR-1306-5p表达的影响。免疫印迹法检测CYP1B1-AS1对HL-60细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、细胞周期素E(Cyclin E)和转录因子(Twist)、纤维连接蛋白(Fibronectin)表达的影响。结果:与HS-5细胞比较,CYP1B1-AS1在急性髓系白血病细胞系中表达量降低,且HL-60细胞系中CYP1B1-AS1表达量最低(均P<0.05)。5-Aza-CdR能够明显促进急性髓系白血病细胞系中CYP1B1-AS1的表达(均P<0.05)。与NC组比较,CYP1B1-AS1组HL-60细胞增殖能力和迁移率降低(均P<0.05)。过表达miR-1306-5p能够抑制野生型CYP1B1-AS1的荧光素酶活性(P<0.05)。与NC组比较,CYP1B1-AS1组HL-60细胞中miR-1306-5p表达减少,细胞增殖和迁移相关蛋白CDK2、Cyclin E、Twist、Fibronectin表达降低(均P<0.05)。结论:过表达CYP1B1-AS1可能通过靶向下调miR-1306-5p表达抑制急性髓系白血病细胞的增殖和迁移。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 长链非编码rna CYP1B1-AS1 微小rna-1306-5p 增殖 迁移 靶向关系
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动植物中RNA结合蛋白的研究进展 被引量:6
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作者 陈璇 李文正 +1 位作者 邵岩 曾千春 《生物技术通报》 CAS CSCD 2007年第3期9-15,共7页
RNA结合蛋白(RNA-binding proteins)在转录后基因表达调节中起着重要的作用,它通过和RNA相互作用来调节细胞的功能。RNA结合蛋白参与RNA剪接、多聚腺苷化作用、序列编辑、RNA转运、维持RNA的稳定和降解、细胞内定位和翻译控制等RNA代谢... RNA结合蛋白(RNA-binding proteins)在转录后基因表达调节中起着重要的作用,它通过和RNA相互作用来调节细胞的功能。RNA结合蛋白参与RNA剪接、多聚腺苷化作用、序列编辑、RNA转运、维持RNA的稳定和降解、细胞内定位和翻译控制等RNA代谢的各个方面。主要介绍了RNA结合蛋白的结构、靶标RNA及RNA结合蛋白在动植物和疾病中的研究。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 靶标rna 特异性 分子机制
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Ribozyme和靶RNA的相互作用对于切割反应的影响 被引量:3
15
作者 陆长德 庄旻 祁国荣 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1994年第4期21-25,共5页
锤头结构Ribozyme(Rz)通过与靶RNA上切卢、二狈帕5核普酸序列的碱基配对识别和切割靶RNA。通过改变Ribozyme与靶RNA之间碱基配对的长度以及性质,研究了Ribozyme与靶RNA相互作用对于它的切割... 锤头结构Ribozyme(Rz)通过与靶RNA上切卢、二狈帕5核普酸序列的碱基配对识别和切割靶RNA。通过改变Ribozyme与靶RNA之间碱基配对的长度以及性质,研究了Ribozyme与靶RNA相互作用对于它的切割反应的影响。结果表明:(1)缩短碱基配对长度和改变碱基配对的性质,使Ritiozyme与底物的熔卢、(Tm)降低,同时反应最适温度(Topt)也降低。(2)动力学分析表明,反应的Km值随温度升高而增加,当温度接近或高于Ribozyme与底物的熔点时,Km值增加大大加快。(3)反应的Kcat也随温度升高而增加,但Kcat增加的速度继而逐渐变慢,最后Kcat下降。 展开更多
关键词 RIBOZYME 切割 rna 分子
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microRNA靶基因预测算法研究概况及发展趋势 被引量:17
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作者 茹松伟 申卫红 +2 位作者 杨鹏程 赵屹 邵启祥 《生命科学》 CSCD 2007年第5期562-567,共6页
microRNA(miRNA)是一类约22个核苷酸(nt)长的非编码小分子RNA,广泛存在于动植物细胞中,通过和靶基因的不精确互补配对而裂解mRNA或抑制翻译的起始。准确地预测miRNA靶基因和正确地认识miRNA及其靶基因的作用机理已成为当前研究的热点。... microRNA(miRNA)是一类约22个核苷酸(nt)长的非编码小分子RNA,广泛存在于动植物细胞中,通过和靶基因的不精确互补配对而裂解mRNA或抑制翻译的起始。准确地预测miRNA靶基因和正确地认识miRNA及其靶基因的作用机理已成为当前研究的热点。作者试图对目前常用的10余个高等生物miRNA靶基因预测软件的实现原理、适用对象及各算法的创新之处等加以综述,以便为进行靶基因预测算法设计人员提供参考,对生物学实验验证提供更好的理论指导。 展开更多
关键词 MICROrnaS 靶基因预测 生物信息学 rna干扰
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甘蓝型油菜Bn19070的表达与同源基因At2g19070的amiRNAi研究 被引量:6
17
作者 李振波 王琢玉 +4 位作者 刘学群 覃瑞 黄军艳 董彩华 刘胜毅 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期197-202,209,共7页
基于原芯片杂交结果,油菜杂合双显性雄性核不育系差异表达基因Bn19070与拟南芥At2g19070基因高度同源,在油菜可育株雄蕊中高量表达,不育株雄蕊中表达量极低。从雄性不育基因At2g19070入手,利用amiR-NAi(人工微RNA干扰)技术对其两个RNA... 基于原芯片杂交结果,油菜杂合双显性雄性核不育系差异表达基因Bn19070与拟南芥At2g19070基因高度同源,在油菜可育株雄蕊中高量表达,不育株雄蕊中表达量极低。从雄性不育基因At2g19070入手,利用amiR-NAi(人工微RNA干扰)技术对其两个RNA区段分别设计靶标,转化拟南芥。在多个转基因拟南芥植株和后代中普遍观察到小孢子数量减少、成熟花粉萎缩失去活力、不结实或者少结实的不育表型。两个靶标的干扰使转基因拟南芥出现了类似的表型,基因表达抑制率都在90%以上,干扰效果好,暗示amiRNAi技术在靶标选择上具有一定的灵活性。At2g19070基因的干扰对Bn19070的功能研究有借鉴作用。 展开更多
关键词 amirna干扰 雄性不育 At2g19070 rna靶标 拟南芥
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CCR5,CXCR4双靶区反义RNA重组腺病毒载体的构建 被引量:3
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作者 李文刚 邵沂 +3 位作者 陈红 王艳斌 于敏 徐小元 《第四军医大学学报》 北大核心 2004年第7期631-634,共4页
目的 :构建趋化因子受体CCR5 ,CXCR4双靶区反义RNA重组载体并获取重组腺病毒以用于抗HIV 1基因治疗的研究 .方法 :用RT PCR法从健康人外周血单个核细胞中分别扩增出趋化因子受体CCR5 ,CXCR4 5′端翻译起始区 6 5 3bp和6 36bp的cDNA片段 ... 目的 :构建趋化因子受体CCR5 ,CXCR4双靶区反义RNA重组载体并获取重组腺病毒以用于抗HIV 1基因治疗的研究 .方法 :用RT PCR法从健康人外周血单个核细胞中分别扩增出趋化因子受体CCR5 ,CXCR4 5′端翻译起始区 6 5 3bp和6 36bp的cDNA片段 ,将其反向插入腺病毒穿梭载体质粒pAd Track CMV中 ,再与包装质粒pAdEasy 1共转染BJ5 1 83细菌同源重组 ,卡那抗性培养基筛选阳性克隆 ;同源重组的载体用脂质体转染剂转染 2 93细胞包装、扩增 ,荧光显微镜下观察细胞中绿色荧光蛋白 (GFP)以及PCR法鉴定、氯化铯密度梯度离心法纯化重组腺病毒 .结果 :成功构建了CCR5 ,CXCR4双靶区反义RNA重组腺病毒载体 ,并于 2 93细胞中包装、扩增得到高滴度的重组腺病毒 ,其滴度为 :7.2× 1 0 1 2 PFU/mL .结论 :CCR5 ,CXCR4双靶区反义RNA重组腺病毒的构建为研究双靶位辅助受体反义RNA抗HIV 展开更多
关键词 趋化因子受体 腺病毒载体 双靶区反义rna
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逆转录病毒介导双靶区反义RNA在转基因小鼠肝细胞中的表达及对HBV DNA复制的影响 被引量:3
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作者 张政 席宏丽 +4 位作者 公维波 李文刚 于敏 曾争 徐小元 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2006年第25期2551-2555,共5页
目的:探讨逆转录病毒介导的乙型肝炎病毒(HBV)X,P单、双靶区的反义RNA在乙型肝炎转基因小鼠肝细胞中HBV复制的影响.方法:构建表达HBV X,P双靶区正、反义RNA的重组载体质粒,与脂质体混合,注入小鼠体内,第8周时取小鼠肝脏,提取肝组织总R... 目的:探讨逆转录病毒介导的乙型肝炎病毒(HBV)X,P单、双靶区的反义RNA在乙型肝炎转基因小鼠肝细胞中HBV复制的影响.方法:构建表达HBV X,P双靶区正、反义RNA的重组载体质粒,与脂质体混合,注入小鼠体内,第8周时取小鼠肝脏,提取肝组织总RNA,进行逆转录,将逆转录后的cDNA用PCR扩增,琼脂凝胶电泳和DNA测序定性,荧光聚合酶链反应定量:提取肝组织基因组DNA,利用荧光聚合酶链反应定量测定HBV DNA含量.结果:经过PCR扩增,琼脂凝胶电泳和DNA测序定性,荧光聚合酶链反应定量等方法检测到小鼠肝脏内反义RNA得到高效表达;8 wk后,对HBV DNA(×105 copies/g)的作用:与对照组相比(7.24±1.62),空质粒组(9.49±3.34)及正义RNA组(6.52±1.53)之间无明显差异,单(2.60±1.13,2.83±1.67)、双靶区反义RNA组(3.24±0.45)与对照组之间有明显差异(P<0.05),但单、双靶区反义RNA组间无明显差异(P>0.05).结论:将脂质体包裹逆转录病毒载体(质粒)介导的单、双靶区乙肝病毒反义RNA经iv导入转基因小鼠细胞的方法可行;反义RNA对乙型肝炎病毒转基因小鼠有显著抗HBV复制作用;对转基因小鼠肝脏中HBV DNA的复制有明显的抑制作用,但单、双靶区反义RNA组间无明显差异. 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 反义rna 转基因小鼠 HRV DNA
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miRNAs及其靶基因的识别 被引量:6
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作者 宋宝 宋现让 +1 位作者 刘杰 魏玲 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2007年第9期1063-1065,共3页
microRNAs(miRNAs)是人类新发现的一类非编码小分子RNA,广泛分布于真核细胞内。miRNAs通过与靶基因互补位点配对结合,在转录后水平负性调控靶基因的表达,参与生长发育、细胞增殖、细胞凋亡、细胞分化等生命过程。据推测,大约1%... microRNAs(miRNAs)是人类新发现的一类非编码小分子RNA,广泛分布于真核细胞内。miRNAs通过与靶基因互补位点配对结合,在转录后水平负性调控靶基因的表达,参与生长发育、细胞增殖、细胞凋亡、细胞分化等生命过程。据推测,大约1%的人类已知基因编码miRNAs,而miRNAs可调控人类基因组中10%-30%的基因。本文就如何识别miRNAs及其靶基因作一简要介绍。 展开更多
关键词 micrornas(mirnas) 非编码rna 靶mrna
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