Natural diet and food habitat use of the Tarim red deer,Cervus elaphus yarkandensis

为了决定自然食谱和食物产地， Tarim 红鹿(Cervus elaphus yarkandensis ) 使用，研究在 Qiemo 被执行， Xinjiang，从 2000 年 10 月的中国到 2001 年 6 月。与排泄物的分析方法相结合的直接观察被用来决定红鹿的自然食谱。植物的 15 不同种类作为食物项目被识别。在他们之中，植物的 13 种类在夏天在冬季饮食和 9 种类被识别。因为他们的滋养的要求以及食物和高质量的牧草的缺乏的缺乏，红鹿在学习区域在冬季消费了大量种类。Phragmites communis， Glycyrrhiza inflata 和 populus diversifolia 经常是在鹿食谱的现在每当时在冬季和夏天。在他们之中， Phragmites communis 是在区域的最丰富的植物并且在鹿食谱被包括。俘虏 Tarim 红鹿的食物选择频率上的观察证明 Populus diversifolia 是首先比较喜欢的种类。然而，这食物在学习区域被限制。五种食物产地类型根据植物协会在学习区域被发现：(1 ) Phragmites communis-Tamarix ramosissima 协会，(2 ) Tamarix ramosissima-Halostachys caspica 协会，(3 ) Tamarix ramosissima-Phragmites communis 协会，(4 ) Populus diversifolia-Phragmites communis 协会，(5 ) 烧了区域。在他们之中， Phragmites communis-Tamarix ramosissima 协会(芦苇草地和芦苇沼泽地) 在学习区域以内被喜欢而不是另外的类型每当时在夏天和冬季。稠密的芦苇盖子能从食肉动物减少察觉的机会并且从食肉动物妨碍攻击。在芦苇的盖子下面，而且， Tarim 红鹿在夏天在热白天的小时期间被保护免受直接太阳的放射的伤害。芦苇草地和沼泽地被比较喜欢，因为当寻找食物时，红鹿能最小化他们的运动，大概流水并且盖住。

基于SMRT测序技术的塔里木马鹿冬季肠道菌群多样性分析

为探究塔里木河流域塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)冬季肠道菌群群落结构、多样性与功能,采用PacBio平台的单分子实时测序技术(single molecule realtime sequencing,SMRT)对塔里木河上游湿地自然保护区采集并筛选的25份塔里木马鹿粪便样本的16S rRNA基因全长进行测序,共获得298578个clean reads,clean reads聚类获得28026个OTU,包括25门684属。Alpha多样性分析结果显示,塔里木马鹿冬季肠道菌群Shannon指数为(7.764±0.044),Simpson指数为(0.015±0.001),Chao1指数为(12242.668±695.106),ACE指数为(9366.423±407.612)。塔里木马鹿优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes,60.51%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,26.02%)、变形菌门(Proteobacteria,3.61%)、疣微菌门(Verrucomicrobia,1.57%)和浮霉菌门(Planctomycetes,1.46%)。相对丰富度在前10的菌属为Papillibacter(5.48%)、拟杆菌属(Bacteroides,5.12%)、Muribaculum(4.69%)、Phocaeicola(4.49%)、Lawsonibacter(4.31%)、瘤胃球菌属(Ruminococcus,4.09%)、Intestinimonas(3.06%)、普氏菌属(Prevotella,2.87%)、克里斯滕森菌属(Christensenella,2.71%)和弯曲杆菌属(Campylobacter,2.54%)。PICRUSt 16S功能预测结果表明,塔里木马鹿肠道菌群基因功能主要富集于新陈代谢(48.58%)、遗传信息处理(19.04%)和环境信息处理(12.08%);其中新陈代谢主要以碳水化合物代谢(9.47%)、氨基酸代谢(9.93%)为主,并且环境信息处理的膜转运(9.96%)基因相对丰富度最高。研究揭示了野生塔里木马鹿冬季肠道菌群特征和功能,为塔里木马鹿野生种群的保护提供基础数据。

新疆尉犁县某养殖场塔里木马鹿体表蜱和游离蜱的种类鉴定及分子遗传特征

[目的]了解塔里木马鹿体表蜱及其圈舍环境游离蜱种类及分子遗传特征。[方法]收集新疆尉犁县某规模化养殖场塔里木马鹿体表寄生和圈舍游离蜱共69只,使用体视显微镜对其进行形态学观察和种类初步鉴定;基于蜱线粒体SSU rRNA基因位点和COX I基因位点对其DNA进行PCR扩增,通过序列比对数据鉴定其种类,利用生物信息学方法解析其分子遗传特征。[结果]经形态学观察,鉴定69只蜱均属璃眼蜱属,雌蜱和雄蜱分别有37只和32只。基于SSU rRNA基因位点,对成功获得的63只蜱序列进行比对,鉴定出18只为残缘璃眼蜱,均为同一序列型,命名为SCtype1(n=18);45只为亚洲璃眼蜱,具有4种序列型,分别命名为SYtype1(n=3)、SYtype2(n=40)、SYtype3(n=1)和SYtype4(n=1)。基于COX I基因位点,对成功获得的64只蜱序列进行对比,鉴定出24只为残缘璃眼蜱,具有2种序列型,分别命名为CCtype1(n=22)和CCtype2(n=2);40只为亚洲璃眼蜱,具有5种序列型,分别命名为CYtype1(n=25)、CYtype2(n=7)、CYtype3(n=4)、CYtype4(n=3)和CYtype5(n=1)。种系进化分析显示,在SSU rRNA基因位点,亚洲璃眼蜱序列单独形成一个亚群分支,与其他璃眼蜱属蜱的序列形成一个大的亚群分支;在COX I基因位点,亚洲璃眼蜱序列和残缘璃眼蜱序列单独形成一个亚群分支,与其他属蜱的序列形成不同的亚群分支。[结论]新疆尉犁县塔里木马鹿体表蜱与游离蜱种类为亚洲璃眼蜱和残缘璃眼蜱。研究结果为鹿科动物寄生蜱的种类分布调查和遗传进化特征分析提供了基础数据。

基于RNA-Seq技术的野生和圈养塔里木马鹿皮肤组织转录组比较分析

为探寻野生和圈养塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)的基因表达谱是否存在差异,并进一步筛选该物种适应干旱环境的相关基因,利用RNA-Seq技术对野生和圈养塔里木马鹿的皮肤组织进行转录组测序,对测序数据质控后比对参考基因组,筛选差异表达基因并对其进行功能注释和富集分析,利用qRT-PCR方法对转录组测序结果进行可靠性检测。结果显示:与圈养塔里木马鹿相比,在野生塔里木马鹿皮肤组织中共有3 303个差异表达基因,包括上调表达基因1 535个,下调表达基因1 768个,其中上调表达基因显著富集在221个GO terms和12个KEGG通路上,下调表达基因显著富集在1 104个GO terms和38个KEGG通路上;qRT-PCR分析结果显示,转录组测序结果可靠。相比于圈养塔里木马鹿,皮肤和表皮发育相关基因、DNA损伤修复相关基因、转谷氨酰胺酶编码基因和热休克蛋白家族基因在野生塔里木马鹿皮肤组织中上调表达,表明这些基因可能直接或间接参与塔里木马鹿在极端干旱炎热环境中的皮肤保护策略,通过最大限度地减少水分流失和调节体温来保护机体免受外界刺激的损伤。皮肤发育相关基因(K2C6A)、热应激相关基因(HSPA4、TRAP1和HSPH1)和氧化应激相关基因(PRDX2和PRDX6)在塔里木马鹿干旱环境适应性中可能发挥潜在作用。

小鼠骨髓和鹿茸来源间充质干细胞基本生物学特征比较

为研究塔里木马鹿茸间充质干细胞(MSCs)的生物学特征,本试验对来源于小鼠骨髓和塔里木马鹿茸的2种MSCs进行了体外培养,检测比较了其生长曲线;同时利用光学显微镜和透射电镜对细胞形态特征、结构、细胞器组成和数量进行观察对比。研究发现鹿茸MSCs体外培养呈“S”形生长趋势,增殖速度极显著高于小鼠BMSCs(P<0.01)。鹿茸MSCs形态呈梭形,排列规律,形态均一;小鼠BMSCs形态不规则,呈三角形,多边形;鹿茸MSCs胞体、胞核面积分别为963.053μm^(2)和134.093μm^(2),极显著高于小鼠BMSCs的551.026μm^(2)和79.938μm^(2)(P<0.01);鹿茸MSCs的核质比为0.167,显著低于小鼠BMSCs的0.206(P<0.05);超微结果显示鹿茸MSCs胞体面积较大,细胞器种类简单,线粒体、内质网等细胞器形态具备早期幼稚细胞发育特征。塔里木马鹿茸MSCs增殖能力高于小鼠BMSCs,在开发利用方面具备更广泛的优势。

圈养条件下新疆马鹿两个亚种的肠道菌群比较分析

肠道菌群组成复杂,与宿主肠道内环境动态平衡和健康息息相关。马鹿是鹿科动物中分布最广的种类,亚种分化众多,但现有马鹿肠道菌群研究较少。为丰富马鹿肠道菌群数据,以马鹿的两个亚种为阶元,运用高通量16S rRNA基因测序技术检测了7头雄性天山马鹿和7头雄性塔里木马鹿的肠道微生物,对其核心菌群、结构组成、多样性及肠道微生物的差异进行分析,旨在了解不同马鹿亚种肠道微生物组成差异,为两亚种间肠道菌群的差异提供参考。研究结果表明,塔里木马鹿菌群多样性及丰度低于天山马鹿。厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)及拟杆菌门(Bacteroidetes)为两组马鹿的优势菌门。此外,天山马鹿肠道中分解蛋白质、脂质的拟杆菌门和变形菌门相对丰度高于塔里木马鹿,而分解植物纤维的双歧杆菌(Bifidobacterium)、瘤胃球菌科UCG 014(Ruminococcaceae UCG 014)的相对丰度低于塔里木马鹿。本研究对天山马鹿及塔里木马鹿肠道菌群组成进行初步了解,可根据研究结果调整其饲料配比,为马鹿饲养管理的改善提供参考。

塔里木马鹿、天山马鹿和梅花鹿同期发情调控技术研究

试验采用CIDR(阴道药栓)+PMSG(孕马血清促性腺激素)的方法分别对塔里木马鹿(Cervusela-phusyarkandensis)、天山马鹿(Cervuselaphussongaricus)和梅花鹿(Cervusnippon)进行了同期发情处理,目的是将自行研制的CIDR与新西兰产CIDR从处理效果与成本上进行比较。此外,还将GnRH与hCG对母鹿的促排卵作用进行了比较,其中重点对塔里木马鹿进行了较深入的研究。结果表明,本试验设计的CIDR及配套处理方案与新西兰进口CIDR的处理效果无明显差异(P>0.05),但成本价格降低约50%;GnRH与hCG均可显著提高母鹿排卵率(P<0.05),而二者在处理效应上无明显差异(P>0.05)。

不同来源鹿茸肽对成骨细胞作用的比较

目的比较塔里木马鹿茸肽与梅花鹿茸肽对成骨细胞增殖分化的影响,并分析药材差异性。方法以相同工艺从两种鹿茸中提取不同肽段的鹿茸肽。以MTT法及PNPP法检测不同肽段鹿茸肽对原代大鼠成骨细胞的增殖分化作用。采用粉末鉴别及薄层色谱法分析塔里木马鹿茸与梅花鹿茸的结构及甘氨酸含量差异。以凝胶电泳法及HPLC法分析鹿茸肽成分差异。结果从塔里木马鹿茸中分离得到3种不同肽段的鹿茸肽,分别为相对分子质量(Mr)>30 kD组分(样A)、Mr5～10 kD组分(样B)、Mr>5 kD组分(样C);从梅花鹿茸中分离得到3种不同肽段的鹿茸肽,分别为Mr>30 kD组分(样D)、Mr5～10 kD组分(样E)、总肽组分(样F)。样B和C显著促进大鼠成骨细胞增殖并上调碱性磷酸酶活性,样F仅具有促进细胞增殖作用,其余组分作用微弱。塔里木马鹿茸与梅花鹿茸粉末形态类似,但含有更多甘氨酸成分,其鹿茸肽含更多潜在活性成分。结论塔里木马鹿茸与梅花鹿茸存在较大差异,前者包含抗骨质疏松成分。

塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)遗传结构及遗传多样性分析

目的:塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)为马鹿的新疆特有亚种,自20世纪50年代以来,由于自然和人为因素影响,种群数量急剧下降,现已隔离成3个孤立的小种群,即沙雅种群、尉犁种群和且末种群。为了更好地保护这一濒危野生动物。方法:基于塔里木马鹿线粒体控制区部分序列对3个种群的控制区结构和遗传多样性进行了研究。结果:在34个序列比对中得到342bp的片段,含变异位点12个,占分析序列长度的3.51%,由此定义了6个单倍型。显示出3个种群总的核苷酸多样性较低(0.01351±0.00063),单倍型多样性较高(0.693±0.051);就单个种群而言,且末种群的遗传多样性最低,而沙雅种群最高。从Tajima’sD和FuandLi’sD值的估算结果来看,塔里木马鹿尉犁和沙雅种群相对于中性进化的歧异度并没有明显的偏离(P>0.1),且末种群则出现了明显的偏离(分别为P<0.05和P<0.02),这预示着3个塔里木马鹿种群间可能存在一定的平衡选择。分子变异分析表明,沙雅和尉犁种群间基因流Nm大于4,说明这2个塔里木马鹿种群间存在着非常丰富的基因流,且末种群分别与沙雅、尉犁种群间基因流Nm均小于1,而且且末种群分别与沙雅和尉犁种群产生了明显的遗传分化(Fst分别为0.409;0.718,P值均小于0.001),以及3个塔里木马鹿种群单倍型间的序列差异为0.012。结论:以上数据都显示了3个塔里木马鹿种群的单倍型间已经出现了明显分化。结合系统发生关系分析,应将沙雅种群和尉犁种群联合建立管理单元进行重点保护。

新疆塔里木马鹿遗传多样性的微卫星分析

利用5个微卫星标记对新疆塔里木马鹿遗传多样性进行了检测。统计了塔里木马鹿3个群体的等位基因组成、平均有效等位基因数(E)和平均基因纯合率(Rh),利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(h)、多态信息含量(PIC)。结果表明5个微卫星位点在库尔勒、阿拉尔和沙雅县塔里木马鹿3个群体的平均多态信息含量分别为0.5884、0.5754、0.5344,除微卫星位点BM5004外均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于塔里木马鹿遗传多样性分析;塔里木马鹿三个群体总平均PIC、h、Rh和E分别为:0.5661、0.5995、0.4474和2.7。分析认为塔里木马鹿遗传变异度较高,遗传多样性相对丰富,具有较大的遗传潜力。

塔里木马鹿车尔臣河种群栖息地现状及影响因素分析

采用地理信息系统(GIS)分析方法对车尔臣河下游马鹿塔里木亚种(Cervus elaphus Yarkandensis)栖息地现状及影响因素进行了研究。结果表明,在车尔臣河下游马鹿塔里木亚种栖息地面积为1 758.485 km2,包括湿生芦苇、旱生芦苇、水体、盐碱地、柽柳密灌丛等5种类型。根据马鹿对栖息地的利用频率,把栖息地分为适宜区、次适宜区和不适宜区等三种类型,其中不适宜区面积占总面积的50.69%,次适宜区为36.64%。同时发现该地区影响马鹿栖息地的主要因素是人类活动,特别是近年来的芦苇开发利用严重破坏其生存空间导致栖息地的破碎化,从而使马鹿种群数量不断下降。

塔里木马鹿生茸期鹿茸细胞中Ca2+变化规律的研究

为了确定塔里木马鹿生茸期鹿茸细胞中Ca^2＋变化规律,试验以fluo-3/AM荧光指示剂负载采用激光共聚焦技术观察细胞外Ca^2＋向胞内流动的情况并测定胞内钙离子浓度,分析鹿茸细胞增殖情况与钙离子浓度的相关关系。结果表明：间充质细胞（MSC）、前成软骨细胞（ACC）易培养,软骨细胞（CC）生长较慢不易培养;CC的Ca^2＋浓度较低,补充外源性钙时,CC胞外Ca^2＋流入胞内需要的时间较长、需要Ca^2＋的量较大。说明鹿茸的生长与MSC、ACC的分化能力有关,鹿茸的钙化与CC的数量、胞外Ca^2＋的浓度有关。

塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)且末种群栖息地动态变化分析

本文采用地理信息系统(GIS)分析方法对1972—2001年车尔臣河中下流域马鹿(Cervus elaphusyarkandensis)栖息地变化进行了研究.结果表明:车尔臣河流域马鹿栖息地从1972—2001年呈现下降趋势,1972年的栖息地总面积为2 063.585 km2,其中适宜栖息地有869.894 km2,1990年的栖息地总面积为1 916.298km2,其中适宜栖息地有466.848 km2,2001年的栖息地总面积为1 758.485 km2,其中适宜栖息地有222.786km2.车尔臣河中下流域马鹿现正遭受栖息地质量退缩和适宜栖息地面积不断减少的双重影响.

塔里木马鹿生茸期机体骨骼Ca^(2+)变化规律研究

为了确定不同年龄段塔里木马鹿生茸期机体骨骼中Ca^(2+)的变化规律,试验选取老、中、青三个年龄段的塔里木马鹿各3头,分别于生茸前期、生茸期、骨化期三个不同时期屠宰后取其机体各部位骨骼,采用火焰原子吸收分光光度法进行骨中Ca^(2+)含量的检测。结果表明:中年组塔里木马鹿在三个不同时期Ca^(2+)含量均最高,其次是老年组,最后是青年组;老、中、青三个组机体骨骼Ca^(2+)含量随鹿茸的生长及骨化均呈下降趋势,这表明其对鹿茸生长与骨化均有供钙作用;但各类骨骼中肋骨Ca^(2+)在整个生茸期内变化幅度最大,其对鹿茸生长及骨化的贡献值最高。

用粪便形态特征初步研究新疆塔里木马鹿种群年龄和性别(英文)

塔里木马鹿分布在干旱地区,是唯一的适应干旱荒漠环境的特殊马鹿亚种之一.目前,塔里木马鹿种群面临着栖息地退缩和片段化的双重影响,这不仅导致了种群数量的锐减,而且也因物种遗传漂变和近亲繁殖的不断增加,进一步加剧其濒危程度.为了有效地保护该物种,全面了解种群结构是至关重要.对塔里木马鹿粪便的长度、宽度、长度/宽度比例和体积等参数进行了测量,并采用判别分析方法划分种群年龄.结果表明,塔里木马鹿粪便形态在不同性别之间有差异,一般雌性的粪便大于雄性(P<0.05).同时根据粪便形态对种群年龄划分为成年雄性、成年雌性和幼体等3个年龄组.

应用E_2P_4浓度比判断雌性多浪绵羊和塔里木马鹿血浆P_4含量的波动

为了找出能够准确反映雌性哺乳动物体内血浆孕酮(P4)波动的检测方法,实验以多浪绵羊和塔里木马鹿为实验动物,分别对其发情周期各阶段的血液样本外周血雌二醇(E2),P4与促黄体生成素(LH)含量进行了放射免疫分析(RIA)测定。发现,应用E2 P4比值比传统的方法更能准确反映雌性哺乳动物体内血浆孕酮含量的波动情况。

圈养塔里木马鹿白昼活动时间分配及行为格局的初步研究

2004年10月3日至12日,在新疆南部且末县塔特让乡塔里木马鹿人工饲养场对15只圈养塔里木马鹿的活动时间分配及种群的站立和运动、休息(静卧)、摄食和饮水、反刍等4种行为,采用目标及扫描取样方法进行了观察,并对各行为的发生率进行了统计分析.结果表明:圈养塔里木马鹿白天用大多数时间来休息和静卧,摄食集中于早晨和晚上,反刍行为出现在摄食后,通常在中午和下午的高温下,停止摄食活动,进行反刍.另外圈养塔里木马鹿对栖息地环境有明显的选择行为,其喜好程度依次为干土地、摄食区、沼泽地、水泥地、水沟.

塔里木胡杨林保护区塔里木马鹿生境动态及其影响因素分析

采用GIS技术,结合实地考察数据和历史数据,通过对信息加工与处理,对1973-2003年间塔里木胡杨林自然保护区马鹿塔里木亚种(Cervus elaphus yarkandensis)分布区的生境动态情况进行了研究,同时对影响塔里木马鹿栖息地变化的主要因素进行了分析。结果表明,自1973-2003年在塔里木胡杨林自然保护区中各种生境类型的变化比较显著,其中(1)水资源严重缺乏,水量剧烈减少,水域面积大幅缩小(2)沙漠面积和低盖度植被面积略有减少,高盖度植被面积减少强烈,保护区内耕地面积快速增加,荒漠化趋势明显,总体上马鹿塔里木亚种分布区的各种生境类型处于变化状态,栖息地环境趋向恶化。

塔里木河中游塔里木马鹿对生境选择的初步分析

开展塔里木马鹿生境选择的研究,对分析塔里木马鹿生境丧失的原因和该物种的保护具有重要的意义。2006年7月和12月在塔里木河中游塔里木胡杨林自然保护区对塔里木马鹿夏季和冬季生境的选择进行了研究。选择5类生态因子,并设置180个10×10(m)样方。选择指数的结果表明,塔里木马鹿喜欢胡杨和芦苇、植物覆盖度较大、水源距离较近和认为干扰距离>1000 m的环境。其中夏季多选择芦苇灌丛和胡杨林,冬季选择胡杨林,芦苇和柽柳灌丛。对生境特征的主成分分析显示,前3个主成分的累计贡献率夏季达到61.683%,冬季达到60.039%,可以反映塔里木马鹿的生境特征,同时表明,影响塔里木马鹿生境选择的主要因素依次为人为干扰、植被类型和距水源距离。

塔里木马鹿鹿茸VEGF基因克隆及其在不同鹿茸组织中的表达研究

试验旨在从塔里木马鹿鹿茸顶端组织中克隆血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)的编码序列,分析其分子特性及其在鹿茸组织中的表达情况。本研究采用改良的Trizol法提取鹿茸顶端组织总RNA,以RT-PCR方法获得VEGF基因,回收纯化后连接到pMD18-T载体,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞并鉴定,利用免疫组化法确定VEGF蛋白在塔里木马鹿鹿茸顶端组织茸皮层、间充质层和软骨层中的表达水平。结果显示,VEGF基因开放读码框(ORF)全长为648bp,编码216个氨基酸。通过其序列比对和进化分析发现,塔里木马鹿茸中VEGF与人、牛、羊、猪的VEGF核苷酸序列同源性分别为98.75%、96.55%、97.58%和97.56%,其中与人VEGF同源性较高。免疫组化试验表明,塔里木马鹿VEGF蛋白在间充质、茸皮层和软骨中均有表达,但无明显表达差异。说明塔里木马鹿鹿茸可能会是人类研究再生医学和血管相关疾病的理想模型,同时,本研究为不同发育期塔里木马鹿鹿茸再生干细胞比较蛋白质组学研究提供了基础试验数据。