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羚牛苦味受体3(Tas2R3)基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
周明
余姣姣
+2 位作者
李彪
欧阳菠
杨建东
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期1957-1968,共12页
Tas2R3是苦味受体基因家族中一个重要的成员,为了进一步了解和研究羚牛(Budorcas taxicolor)苦味受体基因的结构和功能,本研究对羚牛苦味受体3 (Tas2R3)基因进行了克隆和生物信息学分析(GenBank登录号:MG650195)。结果显示,羚牛Tas2R3...
Tas2R3是苦味受体基因家族中一个重要的成员,为了进一步了解和研究羚牛(Budorcas taxicolor)苦味受体基因的结构和功能,本研究对羚牛苦味受体3 (Tas2R3)基因进行了克隆和生物信息学分析(GenBank登录号:MG650195)。结果显示,羚牛Tas2R3基因编码区(coding sequence, CDS)序列全长951 bp,共编码316个氨基酸,以亮氨酸含量最高,谷氨酰胺含量最低。其蛋白质等电点为9.68,分子量为51.96 kD。高级结构功能预测显示,二级结构以α-螺旋为主,蛋白质为碱性、稳定的亲水性蛋白,由4个胞外区、7个跨膜区和4个胞内区组成。预测到2种类型共8个糖基化功能位点和4种类型共15个磷酸化功能位点。通过比较Tas2R3基因种间相似性发现,在偶蹄目中具有很高的同源性,羚牛与绵羊(Ovis aries)的相似性最高(0.98),与褐家鼠(Rattus norvegicus)最低(0.52)。用羚牛、绵羊等12个物种的Tas2R3基因CDS序列构建的NJ树与ME树结构一致,表明Tas2R3基因适合用于构建不同物种间的系统进化树。
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关键词
羚牛
苦味受体
tas2r3基因
克隆
生物信息学分析
原文传递
题名
羚牛苦味受体3(Tas2R3)基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
周明
余姣姣
李彪
欧阳菠
杨建东
机构
四川农业大学动物科技学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期1957-1968,共12页
基金
四川省教育局创新研究小组计划项目(No.14TD0002)资助
文摘
Tas2R3是苦味受体基因家族中一个重要的成员,为了进一步了解和研究羚牛(Budorcas taxicolor)苦味受体基因的结构和功能,本研究对羚牛苦味受体3 (Tas2R3)基因进行了克隆和生物信息学分析(GenBank登录号:MG650195)。结果显示,羚牛Tas2R3基因编码区(coding sequence, CDS)序列全长951 bp,共编码316个氨基酸,以亮氨酸含量最高,谷氨酰胺含量最低。其蛋白质等电点为9.68,分子量为51.96 kD。高级结构功能预测显示,二级结构以α-螺旋为主,蛋白质为碱性、稳定的亲水性蛋白,由4个胞外区、7个跨膜区和4个胞内区组成。预测到2种类型共8个糖基化功能位点和4种类型共15个磷酸化功能位点。通过比较Tas2R3基因种间相似性发现,在偶蹄目中具有很高的同源性,羚牛与绵羊(Ovis aries)的相似性最高(0.98),与褐家鼠(Rattus norvegicus)最低(0.52)。用羚牛、绵羊等12个物种的Tas2R3基因CDS序列构建的NJ树与ME树结构一致,表明Tas2R3基因适合用于构建不同物种间的系统进化树。
关键词
羚牛
苦味受体
tas2r3基因
克隆
生物信息学分析
Keywords
ta
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xicolo
r
)
Bitte
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ecepto
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tas
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3
gene
Cloning
Bioinfo
r
matics
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
羚牛苦味受体3(Tas2R3)基因的克隆及生物信息学分析
周明
余姣姣
李彪
欧阳菠
杨建东
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
原文传递
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