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Tc1/Mariner转座子超家族的研究进展
被引量:
2
1
作者
沈丹
陈才
+3 位作者
王赛赛
陈伟
高波
宋成义
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期1-13,共13页
随着高通量测序技术的迅猛发展,越来越多的生物基因组注释结果表明:转座子几乎存在于所有生物的基因组中,是大多数生物基因组的重要组分。其中,Tc1/Mariner转座子是自然界中分布最广泛的一类DNA转座子超家族,在自然界已经发现14个有活性...
随着高通量测序技术的迅猛发展,越来越多的生物基因组注释结果表明:转座子几乎存在于所有生物的基因组中,是大多数生物基因组的重要组分。其中,Tc1/Mariner转座子是自然界中分布最广泛的一类DNA转座子超家族,在自然界已经发现14个有活性的Tc1/Mariner转座子(如Minos,Mos1等),另外通过分子重构也获得高活性的人工转座子,如睡美人转座子(Sleeping Beauty,SB)。SB和Mos1等转座子作为基因转移载体已被广泛应用于转基因、基因捕获和基因治疗等领域的研究中,并取得了很好的应用效果。本文将重点综述Tc1/Mariner转座子的结构、分类、分布、转座机制、活性转座子的挖掘,及其在转基因、基因捕获和基因治疗等研究领域的应用。
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关键词
tc
1
/mariner
转座子
转基因
基因治疗
基因捕获
下载PDF
职称材料
Tc1/Mariner转座子超家族在褶皱臂尾轮虫中的进化和表达分析
2
作者
范正杰
王玉珏
张全启
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期62-74,共13页
为了探究Tc1/Mariner转座子超家族对褶皱臂尾轮虫(Brachionus plicatilis)基因组结构和基因表达调控的影响,本研究基于褶皱臂尾轮虫的基因组和转录组数据,对褶皱臂尾轮虫的重复序列进行了注释,并对褶皱臂尾轮虫的转座子的表达和其临近...
为了探究Tc1/Mariner转座子超家族对褶皱臂尾轮虫(Brachionus plicatilis)基因组结构和基因表达调控的影响,本研究基于褶皱臂尾轮虫的基因组和转录组数据,对褶皱臂尾轮虫的重复序列进行了注释,并对褶皱臂尾轮虫的转座子的表达和其临近基因的表达进行了统计和富集,在基因上下游及内部区域富集到了10个转座子家族(其中3个家族属于Tc1/Mariner超家族)。在针对褶皱臂尾轮虫的Tc1/Mariner超家族分析中,共发现其7个亚家族:Tc1(DD34E)、Tc2(DD35D)、Mariner(DD34D)、Pogo(DDxD)、Sagan(DD30D)、Tigger(DD32/36D)和Fot1(DD30D),并主要分布在基因间区,对转座酶催化区域的结构和系统发育分析显示拥有完整转座酶的3个亚家族(Tc1、Tc2和Pogo)保守性强且聚类情况良好。基于转录组数据发现各个家族的表达模式较为相似,在雄性阶段表达较高。Tc1/Mariner超家族临近基因的功能大量涉及到环境信息处理和生物发育调节,反映了褶皱臂尾轮虫基因组对环境的适应。本研究通过对褶皱臂尾轮虫Tc1/Mariner转座子超家族在基因组中的进化和表达进行系统分析,为从功能角度认知Tc1/Mariner转座子并理解Tc1/Mariner对基因组进化的作用提供了新的线索。
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关键词
褶皱臂尾轮虫
tc
1
/mariner
转座子
系统发育
表达分析
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职称材料
题名
Tc1/Mariner转座子超家族的研究进展
被引量:
2
1
作者
沈丹
陈才
王赛赛
陈伟
高波
宋成义
机构
扬州大学农业与农产品安全国际合作联合实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期1-13,共13页
基金
国家自然科学基金项目(编号:31671313,31572364)
扬州现代农业项目(编号:YZ2016040)资助~~
文摘
随着高通量测序技术的迅猛发展,越来越多的生物基因组注释结果表明:转座子几乎存在于所有生物的基因组中,是大多数生物基因组的重要组分。其中,Tc1/Mariner转座子是自然界中分布最广泛的一类DNA转座子超家族,在自然界已经发现14个有活性的Tc1/Mariner转座子(如Minos,Mos1等),另外通过分子重构也获得高活性的人工转座子,如睡美人转座子(Sleeping Beauty,SB)。SB和Mos1等转座子作为基因转移载体已被广泛应用于转基因、基因捕获和基因治疗等领域的研究中,并取得了很好的应用效果。本文将重点综述Tc1/Mariner转座子的结构、分类、分布、转座机制、活性转座子的挖掘,及其在转基因、基因捕获和基因治疗等研究领域的应用。
关键词
tc
1
/mariner
转座子
转基因
基因治疗
基因捕获
Keywords
tc1/mariner transposon
transgenesis
gene trapping
gene therapy
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
Tc1/Mariner转座子超家族在褶皱臂尾轮虫中的进化和表达分析
2
作者
范正杰
王玉珏
张全启
机构
中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室
青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
中国海洋大学三亚海洋研究院海南省热带水产种质重点实验室
出处
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期62-74,共13页
基金
国家重点研究发展计划项目(2020YFD0901002)资助。
文摘
为了探究Tc1/Mariner转座子超家族对褶皱臂尾轮虫(Brachionus plicatilis)基因组结构和基因表达调控的影响,本研究基于褶皱臂尾轮虫的基因组和转录组数据,对褶皱臂尾轮虫的重复序列进行了注释,并对褶皱臂尾轮虫的转座子的表达和其临近基因的表达进行了统计和富集,在基因上下游及内部区域富集到了10个转座子家族(其中3个家族属于Tc1/Mariner超家族)。在针对褶皱臂尾轮虫的Tc1/Mariner超家族分析中,共发现其7个亚家族:Tc1(DD34E)、Tc2(DD35D)、Mariner(DD34D)、Pogo(DDxD)、Sagan(DD30D)、Tigger(DD32/36D)和Fot1(DD30D),并主要分布在基因间区,对转座酶催化区域的结构和系统发育分析显示拥有完整转座酶的3个亚家族(Tc1、Tc2和Pogo)保守性强且聚类情况良好。基于转录组数据发现各个家族的表达模式较为相似,在雄性阶段表达较高。Tc1/Mariner超家族临近基因的功能大量涉及到环境信息处理和生物发育调节,反映了褶皱臂尾轮虫基因组对环境的适应。本研究通过对褶皱臂尾轮虫Tc1/Mariner转座子超家族在基因组中的进化和表达进行系统分析,为从功能角度认知Tc1/Mariner转座子并理解Tc1/Mariner对基因组进化的作用提供了新的线索。
关键词
褶皱臂尾轮虫
tc
1
/mariner
转座子
系统发育
表达分析
Keywords
Brachionus plicatilis
tc
1
/mariner
transposon
phylogeny
expression pattern
分类号
Q173 [生物学—水生生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Tc1/Mariner转座子超家族的研究进展
沈丹
陈才
王赛赛
陈伟
高波
宋成义
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
下载PDF
职称材料
2
Tc1/Mariner转座子超家族在褶皱臂尾轮虫中的进化和表达分析
范正杰
王玉珏
张全启
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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参考文献
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