刚地弓形虫棒状体蛋白10的生物信息学分析

目的对刚地弓形虫棒状体蛋白10(TgROP10)进行生物信息学预测,分析其免疫原性。方法运用生物信息学在线分析程序ProtParam、SOSUI、ProtScale、TMHMM、SignalP-4.1、TargetP1.1Server、SOPMA、MotifScan、SWISS-MODEL、SYFPEITHI和Bcepred等并结合生物信息学软件DNASTAR和DNAMAN分析预测TgROP10的理化性质、可溶性、亲疏水性、跨膜结构域、信号肽、胞内定位、二级结构、蛋白翻译后修饰位点、三级结构、柔韧性、表面可及性和B细胞、T细胞抗原表位等。结果 TgROP10蛋白由586个氨基酸组成,分子式为C2562H4045N739O964S9,分子质量单位(Mr)为60.912 21×103,理论等电点为4.19,吸光度值为0.476,半衰期为30h,不稳定系数为55.56,脂溶性指数为56.25,总平均亲水性系数为-0.699,属于亲水性蛋白;该蛋白无跨膜结构区域,信号肽切割位点在22-23位氨基酸之间,亚细胞定位预测可能是分泌蛋白;二级结构中α螺旋和β折叠分别占26.79%和13.31%,β转角和无规则卷曲分别占6.48%和53.41%,有6种翻译后修饰位点,15个B细胞抗原表位,3个CTL细胞抗原表位,12个Th细胞抗原表位,28个亲水性参数得分1.9的区域,15个柔韧性参数得分2.0的区域,27个表面可及性参数得分1.9的区域,3个暴露表面参数得分2.3的区域。结论生物信息学预测TgROP10含多个抗原表位,具有免疫原性,可作为弓形虫疫苗备选蛋白。