Theta复制A类质粒的研究进展

质粒主要存在于古细菌、细菌和真核细菌等领域[1-3],其通过重组或转座来整合和传递基因,促进细菌种群的遗传交换。质粒携带的基因赋予宿主细菌新的表型,让细菌更好地适应生存环境[4]。环状质粒有theta复制、滚环复制与链替换复制3种复制机制。过去观点认为,滚环复制的质粒更多出现在革兰阳性菌中,theta复制的质粒更多出现在革兰阴性菌中。随着测序和质粒提取技术的发展,在革兰阳性菌中不断发现theta复制的质粒。质粒的复制起点可决定其生物学特性[5-7]。质粒大小方面,滚环复制的质粒较小,theta复制的质粒较大;宿主范围方面,具有ColE1类质粒复制起点的质粒,其宿主范围较窄,具有RK2质粒复制起点的质粒,其宿主范围较宽;质粒的拷贝数受复制起点中串联重复序列的重复次数控制。Theta复制质粒的传统分类方法是参考Rep蛋白的氨基酸序列同源性分类[8],也可根据复制起点的共有序列,分为pUCL287[9]家族、pUCL22家族[10]等;但越来越多的theta复制质粒难以分类,如pLP60、pB21AG02等。目前最新的方法是根据复制机制进行分类[11]。本综述将依据最新分类方法,重点讨论theta复制A类质粒的研究进展,包括复制起点、Rep蛋白、复制机制、拷贝数调控及分类。

新疆牛羊源金黄色葡萄球菌D353质粒pD353序列分析

【目的】分析金黄色葡萄球菌耐甲氧西林菌株和耐万古霉素菌株的野生型质粒序列特征,为研究超级耐药菌提供参考。【方法】多重耐药菌株D353通过16S rRNA鉴定菌种,应用BLAST、MEGA 11、Mauve和trf等软件,分析多重耐药菌株D353的质粒pD353进行序列特征、基因、功能及复制方式。【结果】pD353质粒大小为34063 bp,其G+C mol%含量为30.42%。pD353质粒与金黄色葡萄球菌的质粒序列pIT1-S和pIT4-R有高度同源性,其存在丰富的重金属转运蛋白和插入序列转座酶,其rep蛋白与pSK639家族质粒有高度同源性。【结论】该质粒为Theta复制,且未发现抗生素抗性基因。