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Theta复制A类质粒的研究进展
被引量:
1
1
作者
姚芳
代富英
+2 位作者
曹康
谢拥军
潘渠
《成都医学院学报》
CAS
2020年第2期269-272,共4页
质粒主要存在于古细菌、细菌和真核细菌等领域[1-3],其通过重组或转座来整合和传递基因,促进细菌种群的遗传交换。质粒携带的基因赋予宿主细菌新的表型,让细菌更好地适应生存环境[4]。环状质粒有theta复制、滚环复制与链替换复制3种复...
质粒主要存在于古细菌、细菌和真核细菌等领域[1-3],其通过重组或转座来整合和传递基因,促进细菌种群的遗传交换。质粒携带的基因赋予宿主细菌新的表型,让细菌更好地适应生存环境[4]。环状质粒有theta复制、滚环复制与链替换复制3种复制机制。过去观点认为,滚环复制的质粒更多出现在革兰阳性菌中,theta复制的质粒更多出现在革兰阴性菌中。随着测序和质粒提取技术的发展,在革兰阳性菌中不断发现theta复制的质粒。质粒的复制起点可决定其生物学特性[5-7]。质粒大小方面,滚环复制的质粒较小,theta复制的质粒较大;宿主范围方面,具有ColE1类质粒复制起点的质粒,其宿主范围较窄,具有RK2质粒复制起点的质粒,其宿主范围较宽;质粒的拷贝数受复制起点中串联重复序列的重复次数控制。Theta复制质粒的传统分类方法是参考Rep蛋白的氨基酸序列同源性分类[8],也可根据复制起点的共有序列,分为pUCL287[9]家族、pUCL22家族[10]等;但越来越多的theta复制质粒难以分类,如pLP60、pB21AG02等。目前最新的方法是根据复制机制进行分类[11]。本综述将依据最新分类方法,重点讨论theta复制A类质粒的研究进展,包括复制起点、Rep蛋白、复制机制、拷贝数调控及分类。
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关键词
质粒
theta复制
复制
起点
调控机制
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职称材料
新疆牛羊源金黄色葡萄球菌D353质粒pD353序列分析
2
作者
贺腾飞
刘英玉
+5 位作者
张柳青
陈旺
李泽亚
胡芸
蒋金豆
祖力胡马尔·艾力
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期1806-1812,共7页
【目的】分析金黄色葡萄球菌耐甲氧西林菌株和耐万古霉素菌株的野生型质粒序列特征,为研究超级耐药菌提供参考。【方法】多重耐药菌株D353通过16S rRNA鉴定菌种,应用BLAST、MEGA 11、Mauve和trf等软件,分析多重耐药菌株D353的质粒pD353...
【目的】分析金黄色葡萄球菌耐甲氧西林菌株和耐万古霉素菌株的野生型质粒序列特征,为研究超级耐药菌提供参考。【方法】多重耐药菌株D353通过16S rRNA鉴定菌种,应用BLAST、MEGA 11、Mauve和trf等软件,分析多重耐药菌株D353的质粒pD353进行序列特征、基因、功能及复制方式。【结果】pD353质粒大小为34063 bp,其G+C mol%含量为30.42%。pD353质粒与金黄色葡萄球菌的质粒序列pIT1-S和pIT4-R有高度同源性,其存在丰富的重金属转运蛋白和插入序列转座酶,其rep蛋白与pSK639家族质粒有高度同源性。【结论】该质粒为Theta复制,且未发现抗生素抗性基因。
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关键词
金黄色葡萄球菌
多重耐药菌株
质粒
重复序列
theta复制
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职称材料
题名
Theta复制A类质粒的研究进展
被引量:
1
1
作者
姚芳
代富英
曹康
谢拥军
潘渠
机构
成都医学院基础医学院病原生物学教研室
出处
《成都医学院学报》
CAS
2020年第2期269-272,共4页
基金
国家自然科学基金项目(No:31170007)
四川省卫生和计划生育委员会科研课题(No:17PJ494)。
文摘
质粒主要存在于古细菌、细菌和真核细菌等领域[1-3],其通过重组或转座来整合和传递基因,促进细菌种群的遗传交换。质粒携带的基因赋予宿主细菌新的表型,让细菌更好地适应生存环境[4]。环状质粒有theta复制、滚环复制与链替换复制3种复制机制。过去观点认为,滚环复制的质粒更多出现在革兰阳性菌中,theta复制的质粒更多出现在革兰阴性菌中。随着测序和质粒提取技术的发展,在革兰阳性菌中不断发现theta复制的质粒。质粒的复制起点可决定其生物学特性[5-7]。质粒大小方面,滚环复制的质粒较小,theta复制的质粒较大;宿主范围方面,具有ColE1类质粒复制起点的质粒,其宿主范围较窄,具有RK2质粒复制起点的质粒,其宿主范围较宽;质粒的拷贝数受复制起点中串联重复序列的重复次数控制。Theta复制质粒的传统分类方法是参考Rep蛋白的氨基酸序列同源性分类[8],也可根据复制起点的共有序列,分为pUCL287[9]家族、pUCL22家族[10]等;但越来越多的theta复制质粒难以分类,如pLP60、pB21AG02等。目前最新的方法是根据复制机制进行分类[11]。本综述将依据最新分类方法,重点讨论theta复制A类质粒的研究进展,包括复制起点、Rep蛋白、复制机制、拷贝数调控及分类。
关键词
质粒
theta复制
复制
起点
调控机制
分类号
Q343.37 [生物学—遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
新疆牛羊源金黄色葡萄球菌D353质粒pD353序列分析
2
作者
贺腾飞
刘英玉
张柳青
陈旺
李泽亚
胡芸
蒋金豆
祖力胡马尔·艾力
机构
新疆农业大学动物医学学院
出处
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期1806-1812,共7页
基金
新疆维吾尔自治区天山创新团队(2020D14005)。
文摘
【目的】分析金黄色葡萄球菌耐甲氧西林菌株和耐万古霉素菌株的野生型质粒序列特征,为研究超级耐药菌提供参考。【方法】多重耐药菌株D353通过16S rRNA鉴定菌种,应用BLAST、MEGA 11、Mauve和trf等软件,分析多重耐药菌株D353的质粒pD353进行序列特征、基因、功能及复制方式。【结果】pD353质粒大小为34063 bp,其G+C mol%含量为30.42%。pD353质粒与金黄色葡萄球菌的质粒序列pIT1-S和pIT4-R有高度同源性,其存在丰富的重金属转运蛋白和插入序列转座酶,其rep蛋白与pSK639家族质粒有高度同源性。【结论】该质粒为Theta复制,且未发现抗生素抗性基因。
关键词
金黄色葡萄球菌
多重耐药菌株
质粒
重复序列
theta复制
Keywords
Staphylococcus aureus
multidrug-resistant strains
plasmids
repeat sequence
theta
copy
分类号
S855.1 [农业科学—临床兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Theta复制A类质粒的研究进展
姚芳
代富英
曹康
谢拥军
潘渠
《成都医学院学报》
CAS
2020
1
下载PDF
职称材料
2
新疆牛羊源金黄色葡萄球菌D353质粒pD353序列分析
贺腾飞
刘英玉
张柳青
陈旺
李泽亚
胡芸
蒋金豆
祖力胡马尔·艾力
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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