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Genetic Structure and Genetic Differentiation of Tibetan Mastiff Populations
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作者 LAN Xiao-ping GUO Xian +3 位作者 CHEN Yong-chang YANG Jun-nian YAN xun CUI Tai-bao 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2010年第2期12-14,共3页
[ Objective] To analyze the genetic structure and genetic differentiation of Tibetan Mastiff populations and provide a theoretical basis for the protection and rational development and utilization of the Tibetan Masti... [ Objective] To analyze the genetic structure and genetic differentiation of Tibetan Mastiff populations and provide a theoretical basis for the protection and rational development and utilization of the Tibetan Mastiff breed resources. [ Method] A total of 86 blood samples were collected from two populations of Hequ Tibetan Mastiff (HTM) and Qinghai Tibetan Mastiff (QTM). The genetic structure and genetic differentiation of nine blood protein loci of "If, Po, Es-1, Es-2, S(alpha)2, Hb, AIb, Pr and Amy between these two populations were examined by vertical polyacrylam- ide gel electrophoresis with discontinuous buffer system. [ Result] The effective number of alleles (Ne), Shannon genetic diversity index (I) and Nei average expected gene heterozygosity (H) of the HTM were respectively 1.690 7, 0.485 5 and 0.295 9, and these were higher than those of QTM. The Nei's standard genetic distance (D) between HTM and QTM was 0.012 3, and the degree of genetic similarity was 0.987 8. The gene flow (Nm) of these two Tibetan Mastiff populations was 14.543 7. [ Conclusion] The genetic variability of intra-population of HTM was higher than that of QTM, and the genetic differentiation of inter-population was very low ( GsT = 0.018 7). Thereby, the great gene flow ( Nm = 14.543 7) is the main factor leading to the low genetic differentiation of the inter-population in different geographical groups. 展开更多
关键词 tibetan mastiff genetic structure Gene flow genetic differentiation
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High genetic diversity of Tibetan Mastiffs revealed by mtDNA sequences 被引量:2
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作者 LI Yan ZHANG YaPing 《Chinese Science Bulletin》 SCIE CAS 2012年第13期1483-1487,共5页
Many studies have been reported the origin and evolution of domesticated animals, particularly dogs, however, few have system-atically examined the Tibetan Mastiff (TM), a dog that lives primarily in the Qing-Tibet Pl... Many studies have been reported the origin and evolution of domesticated animals, particularly dogs, however, few have system-atically examined the Tibetan Mastiff (TM), a dog that lives primarily in the Qing-Tibet Plateau. Here, we study the origin and evolution of TM based on the population comparison of mtDNA D-loop sequences from TM and other dogs across the world. Intriguingly, non-simultaneous arrivals of Tibetan Mastiffs ancestors to Tibet occurred, which may result from continuous Tibetans' settlement on Qing-Tibet Plateau supported by archaeological and genetic evidence. High genetic and haplotype diversity and robust haplotypes sharing with other dogs unique to East Asia are observed in Tibetan Mastiff, supporting that it is a very archaic breed derived probably from East Asia. 展开更多
关键词 遗传多样性 DNA序列 线粒体 藏獒 D-LOOP区 青藏高原 家养动物 TM
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闽楠天然种群遗传多样性的RAPD分析 被引量:52
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作者 江香梅 温强 +2 位作者 叶金山 肖复明 江梅 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期438-444,共7页
利用RAPD分子标记分析了闽楠主要分布区江西和福建两省的8个天然种群的遗传多样性和种群遗传分化。应用12条引物从160个植株中共检测到135个位点,其中多态位点134个。RAPD数据经Lynch-Milligan矫正后利用POPGENE软件计算出种群间遗传分... 利用RAPD分子标记分析了闽楠主要分布区江西和福建两省的8个天然种群的遗传多样性和种群遗传分化。应用12条引物从160个植株中共检测到135个位点,其中多态位点134个。RAPD数据经Lynch-Milligan矫正后利用POPGENE软件计算出种群间遗传分化系数GST为0.373;利用Shannon多样性表型指数估算出46.4%的变异存在于种群间;分子方差分析(AMOVA)亦显示种群间变异占43.3%(P<0.001)。尽管遗传变异主要存在于种群内,但闽楠种群间亦存在强烈的遗传分化,这可能与闽楠种群生境片断化、地理隔离等有关。根据闽楠的遗传变异特点,建议尽可能多地保护闽楠天然种群,对遗传多样性较高的福建西芹、浦城、明溪等种群应予以重点保护,同时收集各地闽楠遗传资源进行迁地保护,并通过种群扩繁以及合理回归自然等方式扩大种群规模、增强种群间的基因流,以维持其遗传多样性水平。 展开更多
关键词 闽楠 rapd 种群遗传分化 遗传多样性 保护对策
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RAPD标记研究马褂木地理种群的遗传分化 被引量:35
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作者 李建民 周志春 +1 位作者 吴开云 金国庆 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第4期61-66,共6页
利用RAPD标记对马褂木全分布区 15个种群的遗传多样性进行了分析。研究发现 ,马褂木具有丰富的遗传多样性 ,但东部种群因现有种群小 ,其遗传多样性明显地低于西部种群。种群遗传学研究揭示 ,由于小种群效应 ,以及缺乏有效的基因流和特... 利用RAPD标记对马褂木全分布区 15个种群的遗传多样性进行了分析。研究发现 ,马褂木具有丰富的遗传多样性 ,但东部种群因现有种群小 ,其遗传多样性明显地低于西部种群。种群遗传学研究揭示 ,由于小种群效应 ,以及缺乏有效的基因流和特有的致濒机制 ,马褂木种群间的遗传分化巨大 ,30 %以上的遗传变异存在于种群间。但在不同的地理区域 ,种群间的遗传分化程度不同。在西部分布区 ,地域上相距不远的种群其遗传距离较小 ,而在东部即使两个相邻的种群 ,其遗传距离也非常大。使用Nei’s遗传距离进行算术平均数的非加权成组配对法分析 (UPGMA) ,其聚类结果可以很好地将马褂木划分为西部和东部两个种源区 。 展开更多
关键词 马褂木 rapd 地理种群 遗传多样性 遗传分化
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岛屿植物舟山新木姜子居群遗传多样性的RAPD分析 被引量:25
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作者 王中生 安树青 +3 位作者 冷欣 丁方明 郑建伟 陈琳 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期414-422,共9页
基于随机扩增多态 DNA(RAPD)方法分析了舟山群岛濒危植物舟山新木姜子 (N eolitsea sericea) 6个居群的遗传多样性及分化程度。 10条随机引物扩增出 84个可分析位点 ,多态位点百分比 (PPL)为 3 8.10 %。经 POPOGENE分析发现 ,舟山新木... 基于随机扩增多态 DNA(RAPD)方法分析了舟山群岛濒危植物舟山新木姜子 (N eolitsea sericea) 6个居群的遗传多样性及分化程度。 10条随机引物扩增出 84个可分析位点 ,多态位点百分比 (PPL)为 3 8.10 %。经 POPOGENE分析发现 ,舟山新木姜子居群平均水平的多态位点百分比 (PPL )为 2 3 .18% ,Nei' s基因多样度 (HE)为 0 .0 793 ,Shannon信息指数 (H )为 0 .12 0 1,与其它岛屿植物比较具有中等偏低水平的遗传多样性 ;岛屿各居群间遗传分化程度较高 (Gst=0 .3 646) ;地理距离与遗传距离之间具有显著相关性 (r=0 .7697,P=96.62 % ) ,岛屿隔离效应是导致居群间遗传分化的重要因素。结合居群遗传多样性及UPGMA聚类分析 ,推测普陀山岛舟山新木姜子部分个体可能为大猫岛迁入的后裔 ,而朱家尖岛舟山新木姜子则由人为移植自普陀山岛。基于舟山新木姜子的物种保护及资源利用 ,建议加强现有自然居群的就地保护 ,促进居群自然更新 ;建立种质资源库 ,收集不同岛屿的种源进行混合繁殖 ,促进基因交流 ; 展开更多
关键词 舟山新木姜子 rapd 遗传多样性 居群分化 地理隔离 岛屿 海岛植被 遗传距离
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多叶重楼遗传多样性的RAPD分析 被引量:25
6
作者 张金渝 虞泓 +1 位作者 张时刚 丁长春 《生物多样性》 CAS CSCD 2004年第5期517-522,共6页
应用RAPD技术检测了多叶重楼 (Parispolyphylla) 2个变种 4个居群的遗传多样性 ,并与 1个凌云重楼 (P .cronquistii)居群进行了比较。选择的 16个随机引物在 5个居群中共检测到 2 4 6个多态位点。在居群水平上 ,滇重楼 2个居群的多态位... 应用RAPD技术检测了多叶重楼 (Parispolyphylla) 2个变种 4个居群的遗传多样性 ,并与 1个凌云重楼 (P .cronquistii)居群进行了比较。选择的 16个随机引物在 5个居群中共检测到 2 4 6个多态位点。在居群水平上 ,滇重楼 2个居群的多态位点百分比 (PPB)分别为 5 7.4 3%和 5 4 .6 7% ,Shannon指数分别为 0 .30 80和 0 .2 830 ;七叶一枝花2个居群的PPB分别为 5 6 .33%和 5 7.75 % ,Shannon指数分别为 0 .30 80和 0 .32 93。在变种水平上 ,滇重楼的PPB为75 .14 % ,Shannon指数为 0 .392 2 ,遗传分化系数 (Gst)为 0 .30 85 ;七叶一枝花的PPB为 80 .31% ,Shannon指数为 0 .3992 ,遗传分化系数 (Gst)为 0 .372 6 ;在种的水平PPB达 92 .0 5 % ,遗传分化系数Gst达 0 .5 15 1。聚类分析显示滇重楼和七叶一枝花有较近的亲缘关系 ,而与凌云重楼遗传距离较远。此结果从分子水平上支持了过去将滇重楼和七叶一枝花划分为 1个种下 展开更多
关键词 PARIS polyphylla rapd 遗传多样性 居群遗传分化
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天然蒙古栎群体遗传多样性的RAPD分析 被引量:34
7
作者 夏铭 周晓峰 赵士洞 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第5期126-133,共8页
Genetic diversity and differentiation of four natural populations of \%Quercus mongolica \%in Northeast China were studied with the method of RAPD.Through the amplification with 48 random primers,344 repeatable loci w... Genetic diversity and differentiation of four natural populations of \%Quercus mongolica \%in Northeast China were studied with the method of RAPD.Through the amplification with 48 random primers,344 repeatable loci were detected and 245 loci were polymorphic.Percentage of polymorphic loci was 71.22%.According to the measurement of Shannon index,genetic diversity of \%Quercus mongolica\% was on relative high level and genetic variation mainly distributed within population (64.50%).In the studied populations of \%Quercus mongolica,\%the level of genetic diversity of OLJ was the highest,that of OHH was the lowest, and that of OSZ and OHL were the middle.The average genetic distance within populations was 0.0962 ,that among populations was 0.1290.Abundant genetic diversity of Quercus mongolica assured the steady existence and development of its populations. 展开更多
关键词 蒙古栎 群体 rapd 遗传多样性 遗传分化 栎树
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濒危植物长叶榧群体遗传多样性的RAPD分析 被引量:25
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作者 李建辉 金则新 李钧敏 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第12期2661-2667,共7页
借助随机扩增多态DNA方法,分析了中国特有的濒危植物长叶榧的遗传多样性和遗传分化.结果表明:12个随机引物在9个长叶榧自然群体180个样品中可检测到180个可重复位点,其中多态位点119个.长叶榧物种水平的遗传多样性较高,多态位点百分率(P... 借助随机扩增多态DNA方法,分析了中国特有的濒危植物长叶榧的遗传多样性和遗传分化.结果表明:12个随机引物在9个长叶榧自然群体180个样品中可检测到180个可重复位点,其中多态位点119个.长叶榧物种水平的遗传多样性较高,多态位点百分率(P)为66.11%,Shannon信息指数(I)为0.3087,Nei指数(h)为0.2015;而群体水平的遗传多样性较低,P、I和h分别平均为23.76%、0.1221和0.0813.AMOVA分子变异显示,42.57%变异来源于群体内,57.43%变异来源于群体间,群体间的遗传分化系数(Gst)为0.5965,群体间的遗传分化程度高.长叶榧群体间的基因流很低,为0.3382.瓶颈效应、群体隔离和群体间基因流低等因素都加剧了长叶榧群体间的遗传分化.9个长叶榧群体间的平均遗传距离为0.1630.通过UPGMA进行聚类,可将9个长叶榧群体分为浙江和福建两大类群.建议在迁地保护时应尽量避免在群体之间实施种质迁移. 展开更多
关键词 rapd 长叶榧 遗传多样性 遗传分化 遗传结构 种质保育
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羊草种群遗传分化的RAPD分析Ⅱ.RAPD数据的统计分析 被引量:14
9
作者 崔继哲 祖元刚 聂江城 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第7期982-989,共8页
对松嫩草原上分布的灰绿型和黄绿型羊草 9个种群进行了 1 5个引物的 RAPD分析。统计结果表明 ,两类种群的扩增片段数和多态位点比率明显不同 ,黄绿型种群低于灰绿型 ,其值分别 <90与 >1 0 0 ,<5 0 %与 >70 %。比较了 7种不... 对松嫩草原上分布的灰绿型和黄绿型羊草 9个种群进行了 1 5个引物的 RAPD分析。统计结果表明 ,两类种群的扩增片段数和多态位点比率明显不同 ,黄绿型种群低于灰绿型 ,其值分别 <90与 >1 0 0 ,<5 0 %与 >70 %。比较了 7种不同统计方法据 RAPD表型或基因型频率估算的种群遗传多样性 ,几种统计结果都揭示 ,黄绿型种群低于灰绿型种群。用 FIS值矫正种群对 Hardy-Weinberg平衡的偏离后 ,估算等位基因频率 ,通过 Shannon指数和 Nei指数估计羊草种群间分化分别为 37.6 %和 35 .7% ,高于等位酶的分析。讨论比较了等位酶和 展开更多
关键词 羊草种群 遗传分化 rapd分析 数据 统计分析 遗传多样性 草原
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天然红松群体遗传多样性的RAPD分析 被引量:21
10
作者 夏铭 周晓峰 赵士洞 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期730-737,共8页
用 RAPD技术分析了分布于中国东北的 3个红松 ( Pinuskoraiensis Seib. et Zucc.)天然群体的遗传多样性及群体间的遗传分化。 38个随机引物共检测到 2 4 1个可重复的位点 ,其中多态位点 1 39个 ,占总位点的 57.68%。 Shannon信息指数和 ... 用 RAPD技术分析了分布于中国东北的 3个红松 ( Pinuskoraiensis Seib. et Zucc.)天然群体的遗传多样性及群体间的遗传分化。 38个随机引物共检测到 2 4 1个可重复的位点 ,其中多态位点 1 39个 ,占总位点的 57.68%。 Shannon信息指数和 Nei指数的统计结果都表明 ,红松种内的遗传变异主要存在于群体内 ,凉水群体的遗传多样性水平高于黑河、虎林群体。群体内平均遗传相似度为 0 .92 7,群体间为 0 .84 5。 展开更多
关键词 红松 群本遗传多样性 遗传分化 rapd分析
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红皮云杉地理种源遗传多样性的RAPD分析 被引量:18
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作者 王秋玉 任旭琴 姜静 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期1-3,共3页
以来自东北地区红皮云杉种源试验林 8个种源的 80个样本为材料 ,采用RAPD分子标记技术 ,对种源的遗传多样性进行研究的结果表明 :红皮云杉在DNA水平上具有较高的遗传变异 ,多态位点比率达到 73.6 8% ,各种源多态位点比率的变化范围为 35... 以来自东北地区红皮云杉种源试验林 8个种源的 80个样本为材料 ,采用RAPD分子标记技术 ,对种源的遗传多样性进行研究的结果表明 :红皮云杉在DNA水平上具有较高的遗传变异 ,多态位点比率达到 73.6 8% ,各种源多态位点比率的变化范围为 35 .0 9%~ 4 5 .0 3%。采用Nei基因多样性指数和Shannon信息指数估算种源的遗传多样性 ,证明各种源的遗传变异程度由桦楠、乌伊岭、柴河、穆棱、天桥岭、爱辉、高峰、大丰依次递增 ;种源间和种源内遗传分化分别为 4 2 .2 6 %和 5 7.74 %。各种源间具有较高水平的遗传一致度 ,其平均值为 0 .86 2 2。遗传距离聚类分析表明 ,8个种源可聚为 3大类 :天桥岭、穆棱种源为第 1类 ;柴河、桦楠种源为第 2类 ;大丰、乌伊岭、爱辉和高峰种源为第 3类。红皮云杉种源间遗传距离和地理距离之间存在着一定程度的正相关。 展开更多
关键词 红皮云杉 种源 rapd标记 遗传多样性 遗传分化
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濒危植物长叶榧群体不同年龄级遗传多样性的RAPD和ISSR分析 被引量:15
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作者 李建辉 金则新 李钧敏 《浙江大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期104-111,共8页
按胸径将浙江省桐庐县白云源森林公园长叶榧群体划分为成体、小树、幼苗3个年龄级,利用RAPD和ISSR分子标记对不同年龄级的遗传多样性及遗传分化进行分析.12个RAPD引物和12个ISSR引物分别扩增出199和180个条带,总多态位点百分率分别为44.... 按胸径将浙江省桐庐县白云源森林公园长叶榧群体划分为成体、小树、幼苗3个年龄级,利用RAPD和ISSR分子标记对不同年龄级的遗传多样性及遗传分化进行分析.12个RAPD引物和12个ISSR引物分别扩增出199和180个条带,总多态位点百分率分别为44.72%和56.11%.RAPD和ISSR分析均显示3个年龄级的多态位点百分率、Shannon信息指数、Nei指数以成体最高,小树次之,幼苗最低,表明长叶榧群体遗传变异呈衰退趋势.分子方差分析(AMOVA)表明长叶榧群体不同年龄级内、年龄级间均存在遗传变异,但遗传变异主要存在于年龄级内.RAPD和ISSR分析显示,长叶榧群体不同年龄级间的遗传分化系数(Gst)分别为0.2869、0.3077,基因流(Nm)分别为1.2412、1.1231.长叶榧群体不同年龄级间的遗传相似度以幼苗与小树最高,遗传距离以幼苗与小树间最小.在长叶榧群体不同年龄级中,ISSR能检测到比RAPD更多的遗传变异,经Mantel检验,两种分子标记的分析结果相关性极显著. 展开更多
关键词 长叶榧 年龄级 遗传多样性 遗传分化 rapd ISSR
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内蒙古地区天然臭柏种群遗传多样性的RAPD分析 被引量:8
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作者 张国盛 张小红 +3 位作者 王林和 梁小荣 温国胜 红雨 《干旱区资源与环境》 CSSCI CSCD 北大核心 2005年第z1期193-198,共6页
应用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记法研究了内蒙古地区臭柏种群的遗传分化,所用的18条引物对4个臭柏种群的55个样本扩增出124个位点,其中多态位点100个,多态率达80.7%。种内的平均Nei's多样性指数和Shannon's多样性指数分别为0.... 应用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记法研究了内蒙古地区臭柏种群的遗传分化,所用的18条引物对4个臭柏种群的55个样本扩增出124个位点,其中多态位点100个,多态率达80.7%。种内的平均Nei's多样性指数和Shannon's多样性指数分别为0.286和0.428,种群内分别为0.232和0.347,基因多样性变化趋势为毛乌素沙地(0.258,0.386)>阴山山脉西部(0.258,0.376)>浑善达克沙地(0.231,0.345)>内蒙古贺兰山(0.184,0.281)。臭柏种群总的基因多样性(Ht=0.288),大于种群间的基因多样性(Hs=0.233)。种群间的遗传分化系数(Gst)为0.183,种群内的遗传变异占总遗传变异的81.7%。臭柏种群间的平均遗传距离为0.086,平均相似性系数为0.918,4个种群之间有比较相似的遗传多样性,由于地理隔离,种群间也存在分化。 展开更多
关键词 臭柏 rapd 遗传多样性 遗传分化
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黄藤遗传多样性的RAPD分析 被引量:6
14
作者 杨华 尹光天 +4 位作者 甘四明 白嘉雨 李荣生 杨锦昌 陈和明 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2005年第5期505-509,共5页
利用RAPD标记从DNA水平对收集的4个天然黄藤种群进行遗传多样性分析。15条引物扩增得到154条片段,整个种的多态性位点比率为75.97%,Ne i’s指数为0.258 4,Shannon信息指数为0.388 8。黄藤种的遗传多样性为0.257 8,种群间的Ne i遗传分化... 利用RAPD标记从DNA水平对收集的4个天然黄藤种群进行遗传多样性分析。15条引物扩增得到154条片段,整个种的多态性位点比率为75.97%,Ne i’s指数为0.258 4,Shannon信息指数为0.388 8。黄藤种的遗传多样性为0.257 8,种群间的Ne i遗传分化系数为0.141 2,各种群间的遗传变异非常小。4个种群间的遗传相似性分析结果显示:毛感乡和尖峰岭种群间的遗传相似度最高,吊罗山和坝王岭种群间的遗传相似度最低。AMOVA分析结果表明:种群间基因分化系数为0.026 2,大部分遗传变异(97.38%)来源于群体内。研究结果揭示:收集的天然黄藤种群具有较高的遗传多样性,有良好的保存和利用价值,尖峰岭种群可以作为重点保护。 展开更多
关键词 黄藤 rapd 遗传多样性 遗传分化
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缙云山川鄂连蕊茶在不同群落类型中的RAPD分析 被引量:8
15
作者 操国兴 钟章成 +2 位作者 谢德体 刘芸 龙云 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第8期1583-1589,共7页
采用随机扩增多态性 DNA( RAPD)对常绿阔叶林灌木层广布种川鄂连蕊茶 ( Camellia rosthorniana)在缙云山 3个群落类型 (毛竹林、针阔混交林和常绿阔叶林 )中的遗传结构和 DNA多样性进行了研究。 1 0个引物共扩增出 1 38个产物 ,其中 1 ... 采用随机扩增多态性 DNA( RAPD)对常绿阔叶林灌木层广布种川鄂连蕊茶 ( Camellia rosthorniana)在缙云山 3个群落类型 (毛竹林、针阔混交林和常绿阔叶林 )中的遗传结构和 DNA多样性进行了研究。 1 0个引物共扩增出 1 38个产物 ,其中 1 1 5个是多态性的 ,多态位点比率为 83.33%。Shannon指数估算的 3个种群的遗传多样性为常绿阔叶林 0 .3345 ,毛竹林 0 .31 48,针阔混交林 0 .30 85 ,遗传分化为 8.1 2 % ;Nei指数计算的 3个种群的基因多样性为常绿阔叶林 0 .2 0 95 ,毛竹林 0 .1 981 ,针阔混交林 0 .1 934,遗传分化为7.5 1 %。种群间遗传距离在 0 .0 1 77~ 0 .0 393之间。川鄂连蕊茶在 3个群落中的种群大小和生长状况不同 ,各种群遗传多样性的高低可能是对所处群落生境的适应。 展开更多
关键词 rapd 川鄂连蕊茶 群落类型 DNA多样性 遗传分化
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西藏牦牛的RAPD遗传多样性及其分类研究 被引量:17
16
作者 柴志欣 赵上娟 +3 位作者 姬秋梅 张成福 信金伟 钟金城 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1380-1386,共7页
为了解西藏地区牦牛品种或类群的遗传多样性和亲缘关系,本研究从33个RAPD多态性引物中筛选出8个条带清晰且多态性丰富的引物对西藏地区的巴青牦牛、类乌齐牦牛、丁青牦牛、桑日牦牛、工布江达牦牛、江达牦牛、康布牦牛、桑桑牦牛、嘉黎... 为了解西藏地区牦牛品种或类群的遗传多样性和亲缘关系,本研究从33个RAPD多态性引物中筛选出8个条带清晰且多态性丰富的引物对西藏地区的巴青牦牛、类乌齐牦牛、丁青牦牛、桑日牦牛、工布江达牦牛、江达牦牛、康布牦牛、桑桑牦牛、嘉黎牦牛、帕里牦牛、斯布牦牛等11个类群的核基因组DNA进行了RAPD分析,并用Nei氏标准距离和UPGMA聚类法分析了类群间的亲缘关系。结果表明:(1)西藏牦牛类群的遗传多样性指数变异范围在0.185 7~0.405 3之间,其中帕里牦牛最小(0.185 7),说明相对较纯,群体较整齐;而工布江达牦牛最大(0.405 3),显示该群体内部具有较多的遗传变异。(2)在11个类群中,其遗传多样性指数大小分别为:工布江达牦牛(0.405 3)>江达牦牛(0.353 6)>斯布牦牛(0.344 8)>康布牦牛(0.342 8)>嘉黎牦牛(0.332 3)>桑日牦牛(0.282 3)>巴青牦牛(0.279 3)>桑桑牦牛(0.269 8)>丁青牦牛(0.259 7)>类乌齐牦牛(0.224 1)>帕里牦牛(0.185 7),具有西藏东部牦牛类群遗传多样性相对较高,而西部牦牛类群遗传多样性相对较低的趋势,预示着西藏东部可能是牦牛的起源地之一。(3)遗传距离构建的分子聚类关系图表明:西藏11个牦牛类群可分为2大类,帕里牦牛(PL)为一类,其余10个牦牛类群为另一类。综上所述,西藏牦牛具有较丰富的遗传多样性,品种或种群内的遗传分化显著,这是西藏牦牛业持续发展和牦牛适应外界环境的遗传基础,是将来培养牦牛新品种或品系的重要基因资源;西藏牦牛品种可分为2大类群。 展开更多
关键词 西藏牦牛 rapd 遗传多样性
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巨龙竹种下不同变异类型的RAPD分析 被引量:18
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作者 李鹏 杜凡 +1 位作者 普晓兰 杨宇明 《云南植物研究》 CSCD 北大核心 2004年第3期290-296,共7页
巨龙竹 (Dendrocalamussinicus)其种下具有 2个明显不同的变异类型 ,即“通直型”和“歪脚型”。本文利用 2 0个随机引物对 5 6份巨龙竹材料进行RAPD标记。首先用RAPDis tance软件计算各个体间的相似性系数 ,再用NTSYS软件对巨龙竹 5 6... 巨龙竹 (Dendrocalamussinicus)其种下具有 2个明显不同的变异类型 ,即“通直型”和“歪脚型”。本文利用 2 0个随机引物对 5 6份巨龙竹材料进行RAPD标记。首先用RAPDis tance软件计算各个体间的相似性系数 ,再用NTSYS软件对巨龙竹 5 6个样品以UPGMA方法进行聚类 ,聚类图中有 2个明显的分枝 ,一为“通直型” ,一为“歪脚型” ,结果表明巨龙竹表型的差异与遗传因素密切相关。同时用POPGENE软件和AMOVA软件分析表明 :巨龙竹种下不同变异类型的遗传变异较大 ,具有丰富的遗传多样性 ;歪脚类型的遗传多样性高于通直类型 ;巨龙竹变异类型群体之间及群体之内均出现显著的分化。 展开更多
关键词 巨龙竹 变异 rapd 群体分化 遗传多样性
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濒危植物香果树自然居群遗传多样性的RAPD分析 被引量:9
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作者 张文标 金则新 李钧敏 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期61-67,共7页
利用随机扩增多态DNA(RAPD)标记,对国家二级重点保护植物香果树(Emmenopterys henryi)的遗传多样性和遗传分化进行了分析.12个随机引物对9个香果树居群173个个体的DNA样品进行扩增,共检测到182个扩增条带,其中100条为多态条带,多态位点... 利用随机扩增多态DNA(RAPD)标记,对国家二级重点保护植物香果树(Emmenopterys henryi)的遗传多样性和遗传分化进行了分析.12个随机引物对9个香果树居群173个个体的DNA样品进行扩增,共检测到182个扩增条带,其中100条为多态条带,多态位点百分率(PPB)为54.95%;香果树总的Shannon多样性指数(I)为0.2838,Nei指数(h)为0.1900,表明种水平的遗传多样性较高.而居群水平的遗传多样性较低,PPB平均为16.48%,I平均为0.0914,h平均为0.0622.AMOVA分子差异分析表明香果树居群间遗传分化程度高,74.76%的变异存在于居群间,25.24%的变异存在于居群内.香果树居群间的基因流很低,为0.2434.9个居群间的平均遗传距离为0.1653,遗传距离与居群间的地理距离存在显著的相关性.利用算术加权平均数法(UPGMA)对香果树居群进行聚类,结果9个居群可分成浙江省内和省外两大类群. 展开更多
关键词 香果树 rapd 遗传多样性 遗传分化
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九孔鲍养殖群体遗传变异的RAPD分析 被引量:4
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作者 杜博 童馨 +2 位作者 黄桂菊 龚世园 喻达辉 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期52-57,共6页
为了解我国养殖九孔鲍Haliotis diversicolor supertexta的遗传多样性和遗传结构,用RAPD技术对我国福建、广东和海南的九孔鲍5个养殖群体进行了遗传变异分析。12条引物共扩增出141条清晰稳定的条带,大小范围为0.2—2.4kb,其中多态性条... 为了解我国养殖九孔鲍Haliotis diversicolor supertexta的遗传多样性和遗传结构,用RAPD技术对我国福建、广东和海南的九孔鲍5个养殖群体进行了遗传变异分析。12条引物共扩增出141条清晰稳定的条带,大小范围为0.2—2.4kb,其中多态性条带97条,多态位点比例为68.8%。基因多样性介于0.210±0.193与0.247±0.187之间,平均为0.224,各群体间没有显著差异。聚类分析表明,福建东山群体和广东惠来群体亲缘关系最近,聚为一支;深圳、湛江和三亚群体亲缘关系较近,聚为另一支。群体间遗传距离介于0.062与0.135之间,福建东山群体与广东惠来群体间遗传距离最小,惠来群体与深圳群体间遗传距离最大。群体间FST值介于0.176与0.326之间,随机组合检验表明,群体间遗传分化已经达到显著水平,但东山和惠来与深圳、湛江和三亚2组之间遗传分化不显著。较高的遗传多样性水平表明近年来九孔鲍大规模死亡事件可能与遗传多样性并无直接相关,而较高的遗传多样性有利于遗传选育。不同地方群体间的显著分化表明,各地方群体应分别作为单独的"管理单元(management unit)"进行遗传资源管理,群体之间的移植应严格监管。 展开更多
关键词 九孔鲍Haliotis diversicolor supertexta 遗传多样性 rapd 遗传分化 养殖种群
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附子野生资源群体遗传多样性的RAPD分析 被引量:15
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作者 侯大斌 任正隆 舒光明 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期1833-1841,共9页
应用RAPD标记分析了分布在附子主栽区四川、重庆、陕西及湖北16个野生乌头种群的遗传变异。24个引物共检测到643个RAPD位点,多态位点602个,总的多态位点百分率达93.5%。Shannon多样性和Nei遗传分化结果一致显示重庆酉阳种群和重庆城口... 应用RAPD标记分析了分布在附子主栽区四川、重庆、陕西及湖北16个野生乌头种群的遗传变异。24个引物共检测到643个RAPD位点,多态位点602个,总的多态位点百分率达93.5%。Shannon多样性和Nei遗传分化结果一致显示重庆酉阳种群和重庆城口种群遗传多样性最高,四川盐源种群和陕西勉县种群的遗传多样性最低。Shannon指数测出的种群内的遗传变异(57.6%)略占优势,群体间的遗传分化达到42.4%;Nei基因分化系数(GST)达40.0%;分子方差分析(AMOVA)发现群体间遗传变异仅为25.37%;种群每代迁移数Nm为0.756。Nei相似性系数的UPGMA分析结果显示该地区的野生乌头分布上有一定的地域性,特别是同为附子道地产地江油供种的北川、安县和青川种群间遗传关系密切,说明种质资源在道地药材形成中具有重要作用。研究结果表明,附子主要栽培地区的乌头野生种群之间存在较大的遗传分化,遗传多样性较高,遗传种质资源较丰富,存在一定的特异性资源,为进一步开发利用乌头(川乌、附子)提供了丰富的种质资源。 展开更多
关键词 附子(乌头) 遗传多样性 rapd标记 种群分化 野生种群
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