紫花凤梨叶绿体基因组微卫星特征分析

紫花凤梨(Tillandsia cyanea)是一种空气凤梨,具有很高的观赏价值。由于其基因组信息缺乏,其分子生物学相关研究鲜有报道。为研究紫花凤梨叶绿体微卫星(cpSSR)特征,本研究分析了紫花凤梨叶绿体全基因组序列(157602 bp),使用MISA软件共识别出204个SSR位点,位点间平均分布距离为772.6 bp。其中cpSSR主要集中于大单拷贝区(LSC),占SSR位点总数的64.22%。重复序列中主要以单碱基重复序列为主,占SSR位点总数的62.75%,主要由A/T碱基组成。cpSSR长度集中在8~20 bp,占95.10%,有10个cpSSR长度大于20 bp,这些cpSSR位点具有多态性的潜能。本研究结果为紫花凤梨的cpSSR引物筛选和遗传多样性等研究提供信息。