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TIPIN分子与肝细胞癌预后的关系及其生物学作用机制 被引量:2
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作者 鲁睿 卫宣均 +1 位作者 胡龙泉 张乐 《中国癌症防治杂志》 CAS 2022年第6期600-606,共7页
目的分析节律分子Timeless(TIM)相互作用蛋白(TIM interacting protein,TIPIN)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织中的表达及其与患者预后的关系,并探究TIPIN对肝癌细胞增殖的影响及可能的生物学作用机制。方法通过UALCAN数... 目的分析节律分子Timeless(TIM)相互作用蛋白(TIM interacting protein,TIPIN)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织中的表达及其与患者预后的关系,并探究TIPIN对肝癌细胞增殖的影响及可能的生物学作用机制。方法通过UALCAN数据库分析TIPIN在HCC组织中的表达情况及其与HCC患者预后的关系。将siTIPIN及其阴性对照序列分别转染至肝癌MHCC-97H细胞,采用qRT-PCR和Western blot检测TIPIN的表达情况,采用MTS实验和平板细胞克隆形成实验检测TIPIN表达对细胞增殖的影响。利用UALCAN数据库对TIPIN进行GO和KEGG富集分析,以及TIPIN与TIM、TP53的关联分析。结果UALCAN数据库分析结果显示,TIPIN在HCC组织中的表达明显高于正常肝组织(P<0.01);TIPIN高表达患者的总生存期和无病生存期均明显短于TIPIN低表达患者(P=0.037,0.021)。与正常肝细胞HL7702相比,肝癌细胞MHCC-97H、MHCC-97L、HepG2、BEL-7402中TIPIN的mRNA和蛋白表达水平均明显升高(均P<0.01)。MTS和克隆形成实验结果显示,沉默TIPIN表达后肝癌MHCC-97H细胞的增殖和平板细胞克隆形成能力明显受到抑制(均P<0.05)。GO和KEGG富集分析结果显示,TIPIN可能通过调控细胞分裂、DNA复制、细胞周期的相互作用通路促进肝癌的恶性进程。Pearson相关性分析结果显示,TIPIN分子与TIM表达呈明显正相关(r=0.67,P<0.01)。TIPIN在TP53突变HCC患者中的表达显著高于TP53野生型HCC患者(P<0.01)。结论TIPIN在肝癌中表达上调,且与患者不良预后密切相关,沉默TIPIN可抑制肝癌细胞增殖。TIPIN在肝癌中可能通过与TIM形成复合体或调控TP53信号通路发挥其生物学作用。 展开更多
关键词 肝癌 tipin 生物节律 增殖 预后
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TIPIN :肝癌预后生物标志物 被引量:2
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作者 李姝婧 刘怀峰 +5 位作者 王香港 王清晴 陈玉欣 石兵兵 谭静文 王媛媛 《安徽科技学院学报》 2022年第3期52-59,共8页
目的:通过生物信息学方法分析TIPIN基因在肝癌中的表达及其作用。方法:通过癌症与肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中下载肝癌的mRNA表达数据,分析TIPIN表达与临床病理参数的关系。利用Rstudio软件中limma、survival、ROC等R包进行数据整理... 目的:通过生物信息学方法分析TIPIN基因在肝癌中的表达及其作用。方法:通过癌症与肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中下载肝癌的mRNA表达数据,分析TIPIN表达与临床病理参数的关系。利用Rstudio软件中limma、survival、ROC等R包进行数据整理、基因表达量分析、生存分析、COX分析以及ROC分析,并通过基因集富集分析(GSEA)鉴定与TIPIN表达相关的信号通路。利用cBioportal数据库进行数据挖掘,筛选与TIPIN相互作用的基因。结果:与正常肝组织相比较,TIPIN基因在肝癌组织中的表达量显著升高,且TIPIN低表达的患者生存率较高,而高表达患者生存率显著降低。TIPIN的表达量与临床分期显著相关,与总生存期独立相关。TIPIN高表达样本中,膀胱癌、非小细胞性肺癌、DNA复制信号通路、NOTCH信号通路、P53信号通路和WNT信号通路等肿瘤相关信号通路显著富集。基因共表达分析显示FANCI与TIPIN显著正相关,且和TIPIN一致,FANCI在肝癌组织中高表达且FANCI高表达患者生存率显著降低。结论:TIPIN的表达促进了肝癌的发生与发展,可以作为肝癌诊断和预后的生物标志物。 展开更多
关键词 tipin 肝癌 生物信息学分析 预后标志物
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Instrumentation of Infiltrometers with Arduino to Determine Soil Water Infiltration Rate
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作者 Afranio Almir Righes Felipe Henrique Moraes Galileo Adeli Buriol 《Agricultural Sciences》 2020年第11期1109-1115,共7页
The intense mobilization of the soil inappropriately causes a reduction in the percentage of macropores and in the rate of soil water infiltration with reduction of crop yield. Due to the difficulty of using the Muntz... The intense mobilization of the soil inappropriately causes a reduction in the percentage of macropores and in the rate of soil water infiltration with reduction of crop yield. Due to the difficulty of using the Muntz concentric ring method, researchers have used mathematical models to estimate infiltration based on soil physical parameters such as, soil texture that does not reflect physical reality in relation to infiltration rate, leading to errors. To automate the use of the infiltrometer ring method, there are no hydrometers that record small flows in non-pressurized hydraulic systems, making it difficult to automate the method for field determination. For this purpose, six Muntz double rings were instrumented with an electromechanical system coupled to the “Tipin Buked” (weighbridge) with the ability to record flows from 8 cm<sup>3</sup><span style="white-space:nowrap;">&#8729;</span>minute<sup><span style="white-space:nowrap;">&#8722;</span>1</sup> on a memory card. The results indicate that the models of the regression equations describe 93% to 99% of the real values, showing the accuracy of the equipment. This work aimed to modify the Muntz method to reduce field work and automate the determination of water infiltration rate in the soil. 展开更多
关键词 tipin Buked ARDUINO Automation Method of Double Rings
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