Titin蛋白基因3′UTR单核苷酸多态性分析和RACE扩增

本文以6头纯种长白猪、6头蓝塘猪和243头F2代杂交猪个体为对象,采用RACE方法扩增3′非翻译区序列,运用单核苷酸多态性(SNPs)技术分析Titin基因3′非翻译区的多态性。结果显示:3′非翻译区延展出236个碱基新序列;SNPs检测到F2代群体有三种基因型,两种纯合子(AA型和BB型)和一种杂合子(AB型);测序结果显示Titin蛋白基因3′UTR+317位为A→G单碱基变化。

Titin蛋白PEVK片段中PVAP基序的构象研究

目的通过构象搜索,得到Titin蛋白PEVK片段中PVAP基序的低能构象。方法利用分子力学随机构象搜索法和混合Monte Carlo方法,对Titin蛋白PEVK片段中的PVAP基序进行构象搜索。结果随机构象搜索得到的低能构象集中,PVAP的构象骨架分为折叠式和伸展式,其中以折叠式为优势构象;利用混合Monte Carlo方法得到的低能构象与随机构象搜索结果基本一致。结论在拉力作用下,PVAP的构象由折叠式转变成伸展式,使分子在宏观上表现为弹性,为解释其对Titin蛋白弹性的贡献提供了一定的理论依据。

单分子装置：传感器、连接器、致动器

生物大分子之所以可以实现生物学功能是与其独特的力学性质息息相关的。作为纳米科技领域一个重要工具,原子力显微镜(AFM)可以对纳米尺度的生物大分子进行操纵并检测其力学性质。本文介绍了利用原子力显微镜对几类特殊蛋白以及DNA的力学性质的研究结果,发现这些生物分子具有很好的力学传感、连接和致动能力,将来有望作为单分子装置在纳米世界发挥更多功用。

肌联蛋白Titin突变与宫颈癌免疫和预后相关性研究

目的分析宫颈癌(CC)中肌联蛋白Titin(TTN)突变与免疫应答之间的关联以及临床预后。方法宫颈癌的RNA-Seq、基因突变和临床生存数据从人类基因组图谱(TCGA)网站获取;GSE9750数据从基因表达综合数据库(GEO)获取。临床病例选择确诊为宫颈癌的患者共55人,RT-qPCR和Western blot检测癌组织和正常组织中TNN的表达,生存曲线分析总体存活(OS),基因集富集分析法(GSEA)分析TTN与免疫反应的相关程度。结果TTN在宫颈癌中的突变率为32%,数据库样本和宫颈癌样本中TTN均显著高表达(P<0.05)。在TCGA数据库样本中,TTN在突变型与野生型之间没有显著的表达差异(P=0.603)。在TTN突变的宫颈癌患者中,TTN高表达与总生存率相关性具有统计学差异(HR=0.156,P=0.040),但在TTN野生型的宫颈癌患者中,TTN高表达与总生存率相关性无统计学差异(HR=0.702,P=0.212)。在TTN突变的宫颈鳞状细胞癌患者中,TTN高表达与良好的总生存率相关性具有统计学差异(HR=0,P=0.025),但在TTN野生型的宫颈鳞状细胞癌患者中,TTN高表达与总生存率相关性无统计学差异(HR=1.39,P=0.248)。在TTN野生型宫颈癌中,TTN高表达后T细胞和B细胞过程呈显著负富集。然而,在TTN突变型宫颈癌中,TTN过表达T细胞和B细胞活性过程没有显著负富集。结论TTN与宫颈癌发生及预后密切相关,TTN突变参与T细胞和B细胞相关免疫反应,TTN有望成为宫颈癌诊断和治疗的作用靶点。