SARS病毒再测序DNA微阵列的探针设计

探针设计是SARS病毒再测序DNA微阵列制作的关键步骤 ,为了保证探针的杂交条件尽可能一致 ,采用了作者提出的两种等长变覆盖的探针设计方法 ,即基于Tm距离的算法和遗传算法。针对SARS病毒基因组中的两段特异序列设计了一组探针 ,并与等长移位法和变长变覆盖法的设计结果进行了比较。等长变覆盖法得到的探针集在探针长度一致的情况下 ,探针的Tm值有较小的标准差和变化范围。结果表明 ,等长变覆盖法得到的探针具有更好的杂交条件一致性。