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番茄抗病基因Tm-2^2及其等位基因氨基酸序列的比较 被引量:1
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作者 姜国勇 王林华 黄婷婷 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期493-496,共4页
从4个番茄栽培品种(Lycopersicon esculentum Miller)中获得了Tm-2^2等位基因的同源克隆,进行序列分析,结果表明:‘沙龙’、‘渝抗2号’和‘97-4’分别与‘GCR-267’(Tm-2^2)、‘GCR-236’(Tm-2)、以及‘GCR-26’(tm-2)有10... 从4个番茄栽培品种(Lycopersicon esculentum Miller)中获得了Tm-2^2等位基因的同源克隆,进行序列分析,结果表明:‘沙龙’、‘渝抗2号’和‘97-4’分别与‘GCR-267’(Tm-2^2)、‘GCR-236’(Tm-2)、以及‘GCR-26’(tm-2)有100%的同源性,而樱桃番茄(Lycopersicon peruvianum.var.cerasiforme)品种‘樱红1号’与‘GCR-26’(tm-2)仅有98%的同源性;在C-端的LRR结构域中,抗病基因Tm-2。和Tm-2编码蛋白的氨基酸序列与感病基因tm-2存在624和704两个位点的氨基酸差异,即624位点的脯氨酸(P)对应亮氨酸(L)、704位点的甲硫氨酸(M)对应异亮氨酸(I);在601—790个氨基酸的LRR结构域中,抗病基因Tm-2、Tm-2及其秘鲁种(Lycopersicon peruvianum var.dentatum)lptm-2三者均与感病基因tm-2的编码蛋白存在23个氨基酸的差异;樱桃番茄品种‘樱红1号’与含有tm-2基因的栽培种之间具有同源性关系。 展开更多
关键词 番茄 抗病基因 ^tm-2^2等位基因 氨基酸序列
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Jr(a-)稀有血型ABCG2^(*) 376T等位基因高分辨熔解曲线检测方法的建立及分布频率研究 被引量:1
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作者 王贞 贾双双 +5 位作者 廖志坚 莫春妍 魏玲 张润青 罗广平 姬艳丽 《中国输血杂志》 CAS 2022年第7期690-693,共4页
目的 建立针对Jr(a-)稀有血型ABCG2^(*)376T等位基因的高通量分子检测方法,并将其应用于中国人群该等位基因的分布频率研究。方法 设计针对ABCG2基因376位点的特异性引物,利用前期已获得的携带ABCG2^(*)376T等位基因的纯合子和杂合子标... 目的 建立针对Jr(a-)稀有血型ABCG2^(*)376T等位基因的高通量分子检测方法,并将其应用于中国人群该等位基因的分布频率研究。方法 设计针对ABCG2基因376位点的特异性引物,利用前期已获得的携带ABCG2^(*)376T等位基因的纯合子和杂合子标本作为阳性对照,不携带该突变的野生型标本作为阴性对照,建立该等位基因的高分辨熔解曲线(HRM)检测方法。应用建立的方法对广州地区献血人群的DNA标本进行筛查,对筛查出携带ABCG2^(*)376T等位基因的标本进行测序确证,以验证HRM方法的准确性。结果 成功建立可检测ABCG2^(*)376T等位基因,并可同时对纯合子及杂合子进行准确分型的HRM方法,在1 560例广州地区献血者中筛查出携带杂合型等位基因个体15例,尚未筛查出携带纯合型等位基因的个体。结论 HRM方法可用于准确筛查ABCG2^(*)376T等位基因并进行分型,该等位基因在中国人群的分布频率约为0.48%(15/3120)。 展开更多
关键词 Jr(a-)血型 ^ABCG2^(*)376T等位基因 高分辨熔解曲线 分布频率
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番茄Tm-2^2基因在烟草中的表达及其对番茄花叶病毒(TOMV)的特异抗性 被引量:3
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作者 姜国勇 杨仁崔 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期365-370,共6页
Tm-22基因在烟草上的转化和表达表明,Tm-22基因在同科不同属植物体上的功能没有改变。在两种类型的纯合转化体上,Tm-22基因编码蛋白能够抗Tobamovirus属5种不同的毒株,并能被ToMV-2a毒株感染而失去抗病性。这个结果表明:移动蛋白上的氨... Tm-22基因在烟草上的转化和表达表明,Tm-22基因在同科不同属植物体上的功能没有改变。在两种类型的纯合转化体上,Tm-22基因编码蛋白能够抗Tobamovirus属5种不同的毒株,并能被ToMV-2a毒株感染而失去抗病性。这个结果表明:移动蛋白上的氨基酸变异能够影响R蛋白对ToMV的应答反应。Tm-22基因转化体在不同启动子的调控下,对ToMV-2a毒株感染所表现的症状不同,说明启动子在Tm-22基因的抗病反应中具有非常重要的作用。 展开更多
关键词 ^tm-2^2基因 番茄 基因烟草 番茄花叶病毒 启动子
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番茄花叶病毒移动蛋白和番茄抗病基因Tm-2^2的互作诱导烟草转化体程序性细胞死亡 被引量:3
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作者 姜国勇 杨仁崔 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期301-304,共4页
番茄的抗病基因Tm -2 2 与番茄花叶病毒 (ToMV)的移动蛋白MP基因是一对互作的基因 ,Tm- 2 2 基因和ToMV MP基因同时在烟草中表达 ,并分别获得单一基因整合的纯合转化体植株。病毒接种试验表明 ,Tm -2 2 基因转化体与Tm- 2 2 番茄对Tobam... 番茄的抗病基因Tm -2 2 与番茄花叶病毒 (ToMV)的移动蛋白MP基因是一对互作的基因 ,Tm- 2 2 基因和ToMV MP基因同时在烟草中表达 ,并分别获得单一基因整合的纯合转化体植株。病毒接种试验表明 ,Tm -2 2 基因转化体与Tm- 2 2 番茄对Tobamavirus病毒的特异抗性结果一致 ;Tm -2 2 转基因植株和ToMV MP转基因植株杂交试验及其农杆菌注射试验均证明 :(1)Tm -2 2 基因与ToMV- MP在转基因烟草上保持“基因对基因”的互作关系 ;(2 )在外源乙烯的参与下 ,ToMV的移动蛋白与Tm -2 2 基因编码蛋白的互作能够诱导转化体程序性细胞死亡。这一结果为今后研究Tm -2 2 与MP互作的分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄花叶病毒(ToMV) 移动蛋白 ^tm-2^2基因烟草
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转番茄Tm-2^2基因烟草T2代植株的生物学性状变异
5
作者 姜国勇 杨仁崔 +1 位作者 HILLE Jacques LANFERMEIJER Frank 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2003年第3期336-340,共5页
Tm-22基因转化烟草并获得表达,表明Tm-22基因的功能在同科不同属的植物体上没有改变.但是转基因烟草的T2代出现了许多生物学性状的变异,例如,无花粉花药、花瓣呈浅色、植株体矮化、种苗黄化等,这种变异性状的产生不仅有外源基因重组的因... Tm-22基因转化烟草并获得表达,表明Tm-22基因的功能在同科不同属的植物体上没有改变.但是转基因烟草的T2代出现了许多生物学性状的变异,例如,无花粉花药、花瓣呈浅色、植株体矮化、种苗黄化等,这种变异性状的产生不仅有外源基因重组的因素,也是该基因与其它基因相互作用的结果.这些变异的个体为研究该基因的功能及其遗传变异规律提供了丰富的材料. 展开更多
关键词 烟草 ^番茄tm-2^2基因 基因植株 生物学性状 基因变异 抗病基因 黄化苗 花色 植株个体矮化
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由基因序列开发番茄枯萎病抗性基因I-2的共显性分子标记 被引量:8
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作者 于拴仓 邹艳敏 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期926-932,共7页
根据I-2的基因序列设计特异扩增引物对I-2/5F和I-2/5R,扩增I-2基因3132~3765bp之间片段,基因型为I-2/I-2的材料03F-7可扩增出633bp的条带,而基因型为i-2/i-2的材料Moneymaker可扩增出693bp的条带,杂合型材料可扩增出以上2个条带。通过... 根据I-2的基因序列设计特异扩增引物对I-2/5F和I-2/5R,扩增I-2基因3132~3765bp之间片段,基因型为I-2/I-2的材料03F-7可扩增出633bp的条带,而基因型为i-2/i-2的材料Moneymaker可扩增出693bp的条带,杂合型材料可扩增出以上2个条带。通过这两个特异扩增片段的克隆和测序证明,抗病材料扩增的633bp片段为I-2基因的3132~3765bp之间的序列,而感病等位基因中出现大量的碱基突变和60bp片段插入。利用引物对I-2/5F和I-2/5R,可区分纯合抗病材料、杂合抗病材料和纯合感病材料,从而建立了I-2基因的共显性分子标记。在此基础上,利用该标记对16个主要番茄品种进行基因型鉴定,8个品种含有I-2基因,其中1个品种基因型为I-2/I-2,其他品种为I-2/i-2。通过一次PCR和一次HindⅢ酶切建立了I-2和Tm-22双基因检测体系,为多基因鉴定及标记辅助选择提供了有力工具。 展开更多
关键词 番茄 枯萎病 I-2基因 ^tm-2^2基因 分子标记
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番茄枯萎病抗性基因I-2的显性分子标记及其应用 被引量:10
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作者 于拴仓 邹艳敏 《分子植物育种》 CAS CSCD 2007年第6期806-810,共5页
番茄是世界上最主要的蔬菜作物之一,番茄枯萎病(Fusarium oxysporumf.sp.lycopersici)的发生和蔓延使番茄生产受到严重影响,培育抗枯萎病的番茄品种是控制该病害最经济有效的方法。本研究根据I-2的基因序列设计特异扩增引物,以... 番茄是世界上最主要的蔬菜作物之一,番茄枯萎病(Fusarium oxysporumf.sp.lycopersici)的发生和蔓延使番茄生产受到严重影响,培育抗枯萎病的番茄品种是控制该病害最经济有效的方法。本研究根据I-2的基因序列设计特异扩增引物,以不同抗病基因型的番茄为材料,扩增I-2基因3132~3640bp之间的单拷贝片段,基因型为,I-2/-的材料均特异地扩增出一条509bp的条带,而基因型为i-2/i-2的材料均无扩增条带。从而可建立了I-2基因的显性标记,对I-2基因进行分子识别。在此基础上,利用该标记对16个主要番茄品种进行了I-2基因鉴定,其中8个品种含有I-2基因。另外,本研究通过一次PCR和一次HindⅢ酶切建立了,-2和Tm-2^2双基因检测体系,为多基因鉴定及标记辅助选择提供了有力工具。 展开更多
关键词 番茄 枯萎病 I-2基因 ^tm-2^2基因 分子标记
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番茄抗病毒基因Tm-2^2及其等位基因tm-2氨基酸差异分析
8
作者 刘丹 陈天元 刘玉乐 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期767-774,共8页
番茄抗病蛋白Tm-2^2与其等位感病蛋白tm-2在序列上相对保守但也有一定的差异性,研究这些差异对于了解Tm-2^2抗病蛋白的结构和功能起着重要作用。本研究构建了不同的Tm-2^2/tm-2置换突变体,在本生烟草上利用农杆菌注射法共表达突变体... 番茄抗病蛋白Tm-2^2与其等位感病蛋白tm-2在序列上相对保守但也有一定的差异性,研究这些差异对于了解Tm-2^2抗病蛋白的结构和功能起着重要作用。本研究构建了不同的Tm-2^2/tm-2置换突变体,在本生烟草上利用农杆菌注射法共表达突变体及其效应因子MP或TMV—GFP载体。通过对植物坏死表型以及病毒量变化的观察。发现Tm-2^2ARC结构域中RNBS—D保守基序中的第413位甘氨酸突变成tm-2中的丝氨酸后,Tm-2^2介导的对烟草花叶病毒属病毒的抗性减弱。这说明RNBS-D保守基序对于Tm-2^2行使其抗病功能是至关重要的。 展开更多
关键词 ^抗病蛋白tm-2^2 感病蛋白tm-2 烟草花叶病毒属 RNBS—D保守基序
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小麦高分子量谷蛋白亚基1Ax2`的AS-PCR鉴定 被引量:5
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作者 孙宪印 吴科 +3 位作者 钱兆国 卫宪云 米勇 李斯深 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期75-77,共3页
为了从DNA水平上快速鉴定Glu-A1位点编码的1Ax2*优质亚基,建立了稳定的检测1Ax2*优质亚基基因的PCR扩增体系。通过该体系,1Ax2*优质亚基基因扩增出2652bp特异片段,而其他亚基基因则不能扩增出该片段。验证材料的PCR鉴定结果与SDS-PAGE... 为了从DNA水平上快速鉴定Glu-A1位点编码的1Ax2*优质亚基,建立了稳定的检测1Ax2*优质亚基基因的PCR扩增体系。通过该体系,1Ax2*优质亚基基因扩增出2652bp特异片段,而其他亚基基因则不能扩增出该片段。验证材料的PCR鉴定结果与SDS-PAGE电泳结果一致,表明利用该体系鉴定1Ax2*亚基是可行的。利用此体系鉴定了44份外引小麦品种(系)的谷蛋白Glu-A1位点,有24个品种(系)含有1Ax2*亚基,1Ax2*亚基出现频率为54.5%。 展开更多
关键词 小麦 ^1Ax2^* 等位基因特异性PCR
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家族性热性惊厥与CAPS基因的相关分析
10
作者 孙允霄 许忠 +7 位作者 马祎楠 陈志越 钮淑兰 裴佩 张英 许玉凤 卜定方 戚豫 《中国优生与遗传杂志》 2005年第7期18-19,35,共3页
目的研究CAPS(calcyphsine)基因单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)位点与家族性热性惊厥(febrileseizures,FS)的关系。方法通过NCBI的dbSNP数据库选择CAPS基因的2个单核苷酸多态性位点,应用聚合酶链式反应—限制性内... 目的研究CAPS(calcyphsine)基因单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)位点与家族性热性惊厥(febrileseizures,FS)的关系。方法通过NCBI的dbSNP数据库选择CAPS基因的2个单核苷酸多态性位点,应用聚合酶链式反应—限制性内切酶长度多态性技术,检测54例家族性热性惊厥患儿和90名健康对照者的CAPS基因2个SNPs位点的基因型,用SPSS软件判定个单核苷酸多态性基因型频率分布是否符合Hardy-Weinberg平衡,SNPs基因型频率和基因频率在正常人和患儿中的分布比较用R×C和2×2表χ2检验并经连续性校正。结果位点rs7249419的基因型频率符合Hardy-Weinberg平衡,但是它的最小等位基因频率不足1%,其基因型频率和等位基因频率在正常人和患儿间的分布无显著性差异(P>0·05)。位点rs11437855只有1种基因型,均为无插入的纯合子。结论CAPS基因SNPrs7249419、rs11437855可能与家族性热性惊厥无关。 展开更多
关键词 家族性热性惊厥 PS基因 CA 相关分析 单核苷酸多态性 等位基因频率 基因型频率 聚合酶链式反应 限制性内切酶 SPSS软件 SNPs 多态性位点 多态性技术 连续性校正 ^Χ^2检验 显著性差异 NCBI 惊厥患儿 频率分布 分布比较 数据库
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Evaluation of Tomato Hybrids for Resistance against Tomato Mosaic Virus(ToMV)
11
作者 Sahar Nadeem Najeeb Ullah +2 位作者 Khalid Pervaiz Akhtar Amjad Hameed Muhammad Yussouf Saleem 《Journal of Botanical Research》 2022年第2期1-11,共11页
Tomato mosaic virus(ToMV)drastically affects the tomato production worldwide.To deal with this problem,breeding of ToMV-resistant hybrids/varieties is the ultimate need and most successful approach.In wild tomato spec... Tomato mosaic virus(ToMV)drastically affects the tomato production worldwide.To deal with this problem,breeding of ToMV-resistant hybrids/varieties is the ultimate need and most successful approach.In wild tomato species,three dominant ToMV-resistant genes(Tm-1,Tm-2 and Tm-2^(2))were identified and the World Vegetable Center developed few fresh market tomato lines resistant to ToMV by the introgression of these genes.Recently at Nuclear Institute for Agriculture and Biology,Faisalabad,Pakistan a breeding programme was initiated to develop high yielding and ToMV tolerant hybrids using these lines.Current study was performed to screen elite F1 hybrids carrying Tm gene along with their parents against ToMV using mechanical inoculation,confirmation of the virus using DAS-ELISA and marker assisted selection of hybrids.Out of 28 hybrids and 17 parent accessions/genotypes,eight hybrids and five accessions were found to be highly resistant and the virus was not detected in DAS-ELISA.Five hybrids were resistant,nine hybrids and four genotypes were tolerant,while the remaining six hybrids and eight genotypes were susceptible.For the confirmation of Tm-2^(2) gene,the tomato hybrids and their parents were subjected to molecular analysis using cleaved amplified polymorphic sequence(CAPS)primers.The result of CAPS markers for the confirmation of Tm-2^(2) gene was found consistent with phenotypic data of the inoculated tomato genotypes/hybrids.Higher phenolic content,total soluble proteins,better CAT and SOD activities were positively correlated with resistance.Screening results based on phenotype,biochemical and molecular marker data indicate that hybrids carrying Tm-2^(2) gene are good sources of resistance against ToMV. 展开更多
关键词 HYBRIDS SCREENING TOMATO TOMV ^tm-2^(2)gene Biochemical parameters
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番茄5个抗病基因KASP分型技术体系的建立与应用 被引量:10
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作者 王鹏 田哲娟 +7 位作者 康忱 李亚栋 王洪乐 杨超沙 邙光伟 康亮 范庆杰 吴志明 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期2211-2226,共16页
竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive allele specific PCR,KASP)是一种基于单核酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)的新型基因分型技术,建立高效、经济的番茄抗病基因的KASP分型技术对促进抗病品种的选育具有重要意义。本... 竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive allele specific PCR,KASP)是一种基于单核酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)的新型基因分型技术,建立高效、经济的番茄抗病基因的KASP分型技术对促进抗病品种的选育具有重要意义。本研究中设计了抗番茄黄花曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)病基因Ty-1和抗根结线虫(root-knot nematode,RKN)基因Mi-1的KASP引物,结合已报道的抗番茄花叶病毒(tomato mosaic virus,ToMV)病基因Tm-2^(2)、抗番茄斑萎病毒(tomato spotted wilt virus,TSWV)病基因Sw-5和抗镰刀菌颈腐根腐(fusarium crown and root rot,FCRR)病基因Frl的KASP引物,进行了番茄抗病基因KASP分型检测技术研究。利用不同基因型的番茄抗病种质,对影响KASP的反应体积、DNA模板浓度、引物浓度及反应循环数等进行了优化,建立了最优番茄抗病基因的KASP分型检测技术体系。研究结果显示,优化的KASP体系与Ty-1、Mi-1、Tm-2^(2)、Sw-5和Frl基因的PCR分子标记检测结果相一致。所用的KASP反应体系不但能节省试剂,且具有高准确性和强稳定性的优点,因此其可以广泛应用于番茄抗病基因的鉴定、遗传多样性和基因定位等研究,为番茄种质资源分子标记辅助的抗病性鉴定、抗原的快速筛选及利用提供技术支持和理论依据。 展开更多
关键词 番茄 种质资源 KASP技术 基因分型 Ty-1 Mi-1 ^tm-2^(2) Sw-5 Frl
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