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番茄PLC基因家族鉴定及抗番茄褐色皱果病毒(ToBRFV)防御反应分析 被引量:3
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作者 方远鹏 韦建明 李云洲 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期230-240,共11页
番茄褐色皱果病毒(ToBRFV)被我国列为检疫性病毒,严重威胁番茄的安全生产。为了明确番茄磷脂酶C(PLC)的种类,探究番茄PCL在植株抗ToBRFV防御反应过程中的潜在作用。本研究首先基于生物信息学鉴定了10个番茄PLC家族成员,其中特异性磷脂酶... 番茄褐色皱果病毒(ToBRFV)被我国列为检疫性病毒,严重威胁番茄的安全生产。为了明确番茄磷脂酶C(PLC)的种类,探究番茄PCL在植株抗ToBRFV防御反应过程中的潜在作用。本研究首先基于生物信息学鉴定了10个番茄PLC家族成员,其中特异性磷脂酶C(PI-PLC)7个,非特异性磷脂酶C(NPC)3个,7个PI-PLC蛋白均具备3个核心结构域(PLC_X c、PLC_Y c、C2)和1个EF_hand-like结构域,3个NPC蛋白均只具有Phosphoesterase结构域。10个番茄PLC蛋白按照结构相似度可以划分为7个分支,分别为NPC1、NPC2、NPC6、PI-PLC2、PI-PLC3、PI-PLC4、PI-PLC6。另外,10个番茄PLC蛋白的二级结构占比类似,但三级结构存在明显差异。共线性分析结果显示,番茄PLC基因与水稻、拟南芥、雷蒙德式棉PLC基因间分别存在3、12、16对共线性关系。最后,通过转录组测序方法,检测了PLC基因家族在接种ToBRFV后的相对表达水平,结果显示,SlNPC1、SlNPC6、SlPLC4在ToBRFV接种的样本中表达水平较高,其他PLC基因则在ToBRFV接种后表达水平降低。本研究为番茄抗ToBRFV研究和育种奠定了技术与理论基础。 展开更多
关键词 番茄 PLC基因家族 生物信息学 抗病毒 tobrfv
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番茄褐色皱果病毒田间综合防控方法
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作者 王永亮 《西北园艺》 2024年第1期25-26,共2页
番茄褐色皱果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)自2014年在以色列发现后迅速向全球扩散。我国也在多个地区检测到ToBRFV,对国内番茄产业造成巨大威胁。分析ToBRFV为害症状、传播途径,提出综合防控措施。
关键词 番茄褐色皱果病毒 tobrfv 综合防治
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番茄褐色皱纹果病毒分子检测与鉴定 被引量:2
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作者 王少骅 陈利达 +5 位作者 石延霞 谢学文 李磊 范腾飞 李宝聚 柴阿丽 《中国蔬菜》 北大核心 2023年第6期34-40,共7页
利用3对番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)特异性引物对云南红河、宁夏银川、北京顺义疑似病毒病样本进行RT-PCR检测,分别扩增出大小为812、842、1053 bp的特异性条带。对扩增产物进行测序及系统进化分析,发... 利用3对番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)特异性引物对云南红河、宁夏银川、北京顺义疑似病毒病样本进行RT-PCR检测,分别扩增出大小为812、842、1053 bp的特异性条带。对扩增产物进行测序及系统进化分析,发现云南、宁夏、北京的ToBRFV分离物与约旦、意大利、荷兰的ToBRFV分离物聚在同一分支上,亲缘关系较近。致病性结果显示,接种后的番茄植株表现出与田间相同的症状,且在发病组织中检测到病毒ToBRFV。表明来自云南红河、宁夏银川、北京顺义的番茄植株均被ToBRFV侵染。 展开更多
关键词 番茄褐色皱纹果病毒 分子检测 tobrfv RT-PCR
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番茄褐色皱果病毒Taq Man荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用 被引量:1
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作者 李献锋 于璇 +7 位作者 冯黎霞 于翠 丁钿 徐强 赵菊鹏 马骏 武目涛 魏霜 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期185-193,共9页
为建立番茄褐色皱果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)Taq Man荧光定量RT-PCR方法,本研究针对ToBRFV RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRP)基因序列设计了4组特异性引物和Taq Man探针,构建了标准曲线,并... 为建立番茄褐色皱果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)Taq Man荧光定量RT-PCR方法,本研究针对ToBRFV RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRP)基因序列设计了4组特异性引物和Taq Man探针,构建了标准曲线,并对该方法的特异性、灵敏度和实际样品的检测效率进行评估。结果显示,该方法特异性强,与番茄花叶病毒、番茄斑驳花叶病毒、烟草花叶病毒、黄瓜绿斑驳花叶病毒、番茄环斑病毒、番茄黑环病毒、辣椒轻斑驳病毒、烟草环斑病毒和凤果花叶病毒等9种病毒均无交叉反应。建立的标准曲线的R^(2)为0.999,扩增效率为102.096%,检测灵敏度为10 fg/μL,与EPPO PM 7/146(1)推荐的CaTa28、CSP1325方法相当,是常规RT-PCR的100倍;采用该方法成功从60份番茄和辣椒叶片、种子样品中检出10份阳性样品。建立的Taq Man荧光定量RT-PCR方法特异性强、灵敏度高,适用于实际样品中ToBRFV的快速精准检测。 展开更多
关键词 番茄褐色皱果病毒 RNA依赖的RNA聚合酶 Taq Man探针 荧光定量RT-PCR 检测
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Robust molecular detection of the new Tomato brown rugose fruit virus in infected tomato and pepper plants from Turkey 被引量:4
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作者 Hakan FIDAN Pelin SARIKAYA +3 位作者 Kubra YILDIZ Bengi TOPKAYA Gozde ERKIS Ozer CALIS 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2021年第8期2170-2179,共10页
Tomato brown rugose fruit virus(ToBRFV)causes severe fruit loss in tomato(Solanum lycopersicum)and pepper(Capsicum annuum)plants.It is an emerging Tobamovirus that is spreading globally.The major challenge is to devel... Tomato brown rugose fruit virus(ToBRFV)causes severe fruit loss in tomato(Solanum lycopersicum)and pepper(Capsicum annuum)plants.It is an emerging Tobamovirus that is spreading globally.The major challenge is to develop a reliable method for the detection of the virus,and to better characterize the symptoms it causes.The aims of this study,therefore,were to characterize the symptom development on tomato and pepper plants,and to establish a reliable detection method for the virus.Following infection of the tomato and pepper plants with ToBRFV,the leaves turned chlorotic,mosaic or mottled,while the fruit became rugose,necrotic and marbled,and showed discoloration with yellow or brown spots.Transmission electron microscopy(TEM)revealed single rod-like virus particles characteristic of the Tobamoviruses.Classical reverse transcription PCR(RT-PCR)and quantitative PCR(qPCR)with specific primers and probes confirmed that the virus is ToBRFV.We found that the resistance genes from tomato,Tm-2^(2),and pepper,L1,L2,L3 and L4,did not confer resistance to ToBRFV.Here,we present a PCR-based method as a diagnostic test for detecting ToBRFV in infected seeds.This method will help to prevent further spread of the virus in commercial seeds. 展开更多
关键词 TOMATO PEPPER TOBAMOVIRUS tobrfv resistance
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番茄褐色皱纹果病毒对中国番茄产业的潜在威胁及预防措施 被引量:8
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作者 向伟勇 《湖北农业科学》 2021年第S02期247-251,共5页
番茄褐色皱纹果病毒(ToBRFV)2014年在以色列第一次被发现,2019年传入中国山东。该病毒具有危害性大,传播性强的特点,对番茄种植业的威胁极大。为避免番茄褐色皱纹果病毒在中国大暴发,需要做好防控措施,将潜在风险降到最低。针对番茄褐... 番茄褐色皱纹果病毒(ToBRFV)2014年在以色列第一次被发现,2019年传入中国山东。该病毒具有危害性大,传播性强的特点,对番茄种植业的威胁极大。为避免番茄褐色皱纹果病毒在中国大暴发,需要做好防控措施,将潜在风险降到最低。针对番茄褐色皱纹果病毒的相关问题进行探究,分析对中国番茄产业的潜在为害,给出了相应的防控措施与建议。 展开更多
关键词 番茄褐色皱纹果病毒(tobrfv) 潜在威胁 番茄产业 预防措施
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番茄褐色皱纹果病毒的发生分布及防控对策 被引量:11
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作者 张宇 张松柏 +4 位作者 张德咏 刘慧 张战泓 张友军 刘勇 《中国蔬菜》 北大核心 2020年第5期12-17,共6页
番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)是烟草花叶病毒属(Tobamovirus)的新成员,主要危害番茄、辣椒等茄科作物。2014年在以色列番茄上首次发现该病毒,随后快速扩展至欧洲、美洲的茄科作物主产区。2019年我国山... 番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)是烟草花叶病毒属(Tobamovirus)的新成员,主要危害番茄、辣椒等茄科作物。2014年在以色列番茄上首次发现该病毒,随后快速扩展至欧洲、美洲的茄科作物主产区。2019年我国山东发现ToBRFV侵染番茄,要警惕该病毒在我国暴发危害。本文综述了国内外ToBRFV的分布、为害症状、传播途径、鉴定方法以及致病性等方面的研究进展,并结合烟草花叶病毒属病毒的侵染循环特征,提出防控对策;此外,对未来的研究重点、防控技术研发等进行了展望。 展开更多
关键词 番茄褐色皱纹果病毒 烟草花叶病毒属 茄科作物 发生分布 防控对策 综述
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番茄褐色皱果病毒RT⁃PCR检测方法的建立与评价 被引量:4
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作者 李献锋 刘明航 +3 位作者 魏霜 丁钿 武目涛 冯黎霞 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期905-914,共10页
本研究旨在建立番茄和辣椒种子携带番茄褐色皱果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)快速、精准的核酸检测技术。选用ToBRFV的MP蛋白基因和CP蛋白基因保守序列作为靶标区域设计了1对特异性引物ToBRFV⁃F⁃5506/ToBRFV⁃R⁃6186,... 本研究旨在建立番茄和辣椒种子携带番茄褐色皱果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)快速、精准的核酸检测技术。选用ToBRFV的MP蛋白基因和CP蛋白基因保守序列作为靶标区域设计了1对特异性引物ToBRFV⁃F⁃5506/ToBRFV⁃R⁃6186,建立了ToBRFV的RT⁃PCR检测方法。用ToBRFV阳性样品对该方法的灵敏度和特异性进行了系统分析,最后以疑似ToBRFV感染的实际种子样品进行验证,并与已报道的9对ToBRFV特异性引物对实际种子样品的检测效率进行比较分析。结果表明,采用本研究建立的RT⁃PCR检测方法检测限值至2.5ng/μL,且与番茄和辣椒的其他主要病毒无交叉反应,特异性良好,对50份疑似ToBRFV感染的番茄和辣椒种子样品的阳性检出率高达40%,要优于已报道的9对ToBRFV特异性引物。本研究建立的番茄褐色皱果病毒RT⁃PCR检测方法具有较高的灵敏度和良好的特异性,适用于ToBRFV感染的番茄和辣椒种子样品检测。 展开更多
关键词 番茄褐色皱果病毒(tobrfv) RT⁃PCR 种子 检测
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