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基于小RNA深度测序的烟草脉坏死病病原分子鉴定及其全基因组序列分析
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作者 莫翠萍 陈锦清 +7 位作者 韦学平 崔丽贤 罗婉笛 李金哲 谢慧婷 秦碧霞 蔡健和 李战彪 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1387-1396,共10页
【目的】明确引起广西河池市南丹县烟草呈现斑驳花叶、叶脉坏死等症状的病毒病原,为烟草病毒病的综合防治提供理论依据。【方法】2022年5月,从河池市南丹县采集5份表现叶脉坏死、花叶等症状的烟草叶片样品,采用小RNA深度测序技术、反转... 【目的】明确引起广西河池市南丹县烟草呈现斑驳花叶、叶脉坏死等症状的病毒病原,为烟草病毒病的综合防治提供理论依据。【方法】2022年5月,从河池市南丹县采集5份表现叶脉坏死、花叶等症状的烟草叶片样品,采用小RNA深度测序技术、反转录PCR(RT-PCR)、摩擦接种、分段克隆、系统进化及重组分析等方法对样品进行鉴定及遗传进化分析。【结果】小RNA深度测序获得与GenBank数据库中马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)不同分离物具有较高核苷酸相似性(99.00%~100.00%)的5条序列,将5条序列拼接后获得1条全长为9708 nt的全基因组序列;通过鉴别寄主苋色藜(Chenopodium amaranticolor)单斑分离的方法获得单一病毒,利用该分离纯化后的病毒单斑接种普通烟K326和本氏烟,其中K326的新叶产生坏死症状,而本氏烟的新叶呈不规则深绿色病斑症状;分别提取K326和本氏烟的叶片样品总RNA,通过RT-PCR检测、分段克隆的方法获得病毒分离物的全基因组序列,结果显示2个烟草品种中的病毒序列与小RNA深度测序获得的序列相似性达99.90%;将序列在GenBank中进行BLAST分析发现,研究获得的序列与已登录GenBank的PVY各分离物具有较高的核苷酸相似性,其中与我国黑龙江省马铃薯分离物PVY HLJ26(MF134425)的核苷酸相似性最高,为99.01%,表明研究获得的病毒序列为PVY分离物,命名为PVY-GXnd1(OP131591)。重组分析发现,PVY-GXnd1是由PVYO-139(U09509.1)、PVYN-Mont(AY884983.1)和PVYN-605(X97895.1)重组而来的新PVY分离物,重组主要发生在3个区域,分别是1~498、2415~5816和8555~9373 nt,覆盖PVY的P1、P3、6K1、CI、6K2、Vpg、Nib和CP蛋白编码区,包含了PVYN-Wi和PVYNTN株系的2种不同重组结构特征,表明PVYGXnd1株系更接近PVYNTN-NW株系;基于PVY编码区构建的系统发育进化树分析表明,PVY-GXnd1与我国黑龙江省分离物PVY HLJ26处于同一小分支,具有较近的亲缘关系,而该分离物归属于PVYNTN-NW(SYR-II)株系,与重组分析结果一致。【结论】侵染广西河池市南丹县烟草引起叶脉坏死症状的病毒PVY-GXnd1为一株PVYNTN-NW(SYR-II型)重组株系。 展开更多
关键词 烟草 小RNA深度测序 马铃薯Y病毒 重组 叶脉坏死 广西
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Effects on the local symptoms of subgenomic RNAs expressions and their translational products of Tobacco necrosis virus A Chinese isolate 被引量:1
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作者 LI Jiang LI Min LI Cui GAO Yang LI DaWei HAN ChengGui YU JiaLin 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2008年第11期1682-1690,共9页
Based on a full-length infectious cDNA clone, gene modifications of Tobacco necrosis virus A Chinese isolate (TNV-AC) were made by site-directed mutagenesis or nucleotide deletions for in vitro transcrip-tion of mutan... Based on a full-length infectious cDNA clone, gene modifications of Tobacco necrosis virus A Chinese isolate (TNV-AC) were made by site-directed mutagenesis or nucleotide deletions for in vitro transcrip-tion of mutant viral RNAs. Mechanical inoculations of Chenopodium amaranticolor with in vitro tran-scripts, containing a single nucleic acid substitution at the presumed transcriptional start sites for the two subgenomic (sg) RNAs, showed that the sgRNA1 and sgRNA2 of TNV-AC were initiated at G2184 or G2460, respectively. Mutagenesis of the translational initiation-codons for the open-reading frame (ORF) P8 or P6 encoded by sgRNA1 indicated that each of the two genes was essential for formation of local lesions on C. amaranticolor leaves, perhaps by blocking virus cell-to-cell movement, but were not necessary for viral RNA replication in the protoplast of tobacco cell BY-2. Results of prokaryotic expression showed that the ORF coding for coat protein on TNV-AC sgRNA2 was initiatively translated by the first AUG codon at nucleotides 2612―2614. Site-directed mutation of translational start codons, and deletion of the entire coding region, showed that the intact TNV-AC coat protein was dispensable for establishment of TNV-AC infection in C. amaranticolor, otherwise the numbers of local lesions and the viral RNA accumulation level were reduced, or the time to symptom appearance significantly delayed. These results suggested that the nucleotide sequence around the translational start codon coding for TNV-AC coat protein gene may play an important role in the local symptoms. Aspects of the involve-ment of the coat protein in the TNV-AC life cycle were discussed. 展开更多
关键词 烟草坏死病毒A RNAS 染色体 基因表达
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过氧化物酶活性与烟草对马铃薯Y病毒抗性关系的研究 被引量:11
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作者 吴元华 刘永中 +4 位作者 文才艺 李浩戈 刘秋 杜春梅 赵秀香 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 2000年第3期23-26,共4页
本文测定了接种马铃薯Y病毒脉坏死株系后烟草抗病转基因品系 960 8(转PVY -NIb的NC89)和非转基因NC89叶片组织透性和过氧化物酶活性 ,并对过氧化物酶同工酶带谱进行了分析。结果表明 ,抗病转基因 960 8和感病NC89叶片的组织透性与叶片... 本文测定了接种马铃薯Y病毒脉坏死株系后烟草抗病转基因品系 960 8(转PVY -NIb的NC89)和非转基因NC89叶片组织透性和过氧化物酶活性 ,并对过氧化物酶同工酶带谱进行了分析。结果表明 ,抗病转基因 960 8和感病NC89叶片的组织透性与叶片内过氧化物酶活性的变化趋势一致 ,两者在接种后均呈增高趋势 ,但感病NC89的增高幅度明显高于抗病转基因 960 8;接种后 ,转基因 960 8和非转基因NC89的过氧化物同工酶均出现了一条新酶带 ,960 8的新酶带在接种后第 2d开始出现 ,而NC89的新酶带则在接种后第 6d开始出现 ,且明显强于 960 8。 展开更多
关键词 过氧化物酶活性 烟草 马铃薯Y病毒 抗性 叶片组织透性 同工酶
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烟草坏死病毒A大豆分离物的分子鉴定 被引量:6
4
作者 席德慧 李江 +4 位作者 曹淳 韩成贵 李大伟 于嘉林 周雪平 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期595-603,共9页
对曹琦和濮祖芹早期分离到的烟草坏死病毒大豆分离物的生物学、血清学和外壳蛋白的序列进行了进一步研究。该分离物能侵染8科29种植物,除系统侵染大豆和本生烟外,其余寄主均为局部侵染。电镜下病毒粒子呈球状,直径约28nm。基因组为单组... 对曹琦和濮祖芹早期分离到的烟草坏死病毒大豆分离物的生物学、血清学和外壳蛋白的序列进行了进一步研究。该分离物能侵染8科29种植物,除系统侵染大豆和本生烟外,其余寄主均为局部侵染。电镜下病毒粒子呈球状,直径约28nm。基因组为单组分RNA,大小约为3.7 kb,具有2条亚基因组,分别约为1.6 kb和1.3 kb。外壳蛋白亚基的分子量约为30 kDa。血清学试验表明,该分离物与TNV柳树分离物的抗血清呈特异反应,与同属坏死病毒属(Necrovirus)的烟草坏死病毒D(TNV-D)和甜菜黑色焦枯病毒(BBSV)无血清学关系。利用简并引物通过RT-PCR克隆了该分离物的外壳蛋白基因。序列分析表明,该分离物与烟草坏死病毒A(TNV-A)、TNV-D和TNV-DH的外壳蛋白分别具有88.77%、45.13%和45.49%的氨基酸序列一致性。因此,该大豆分离物属于TNV-A的一个新株系,命名为TNV-AC。 展开更多
关键词 烟草坏死病毒A 大豆分离物 生物学性质 血清学 外壳蛋白基因序列
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辽宁烟区新分离到烟草坏死病毒及其生物学性状的初步研究 被引量:6
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作者 吴元华 贝纳新 +3 位作者 韦石泉 孙淑英 郑云泽 马长乃 《中国烟草》 CSCD 1992年第3期1-5,共5页
从辽宁省主栽烟区凤城、开原、西丰、岫岩、宽甸调查和采集样本多份,新分离到田间自然发病的烟草坏死病毒(TNV),将病毒纯化作汁液接种寄主范围试验,侵染6科29种植物,如茄科、豆科、葫芦科、藜科等多种植物上均表现侵染。接种烟草2~3天... 从辽宁省主栽烟区凤城、开原、西丰、岫岩、宽甸调查和采集样本多份,新分离到田间自然发病的烟草坏死病毒(TNV),将病毒纯化作汁液接种寄主范围试验,侵染6科29种植物,如茄科、豆科、葫芦科、藜科等多种植物上均表现侵染。接种烟草2~3天即出现坏死枯斑;接种大豆叶约4~5天出现褐色坏死斑。病毒常规测定得知其钝化温度(TIP)约85~95℃;稀释限点(DEP)为10^(-6)~10^(-7);体外存活期(LIV)较长,(做到30~35天)。提纯病毒的紫外吸收光谱,呈典型核蛋白吸收峰,其最高值在264nm 处,其最低值在245nm 处,A260/A280约1.51。电镜测视病毒粒子球形,直径27~28nm,与抗 TNV 标准抗血清产生清晰的沉淀线。初步证实辽宁新发生的这种病毒,应是烟草坏死病毒,这对田间防治和抗病选育工作提供了很好的依据。 展开更多
关键词 烟草 环死病毒 生物学性瘃
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烟草感染PVY^N后叶脉坏死与总酚、类黄酮及PPO关系研究 被引量:15
6
作者 吴元华 钟丽娟 赵秀香 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期398-402,共5页
本文采用常规摩擦接种和比色法研究了烟草感染PVYN后叶脉坏死与总酚、类黄酮及PPO的关系。试验结果表明:感病品种K326接种PVYN后总酚和类黄酮含量升高,且接种处理与未接种对照间总酚和类黄酮含量的差别随症状表现的加重有递增趋势;就部... 本文采用常规摩擦接种和比色法研究了烟草感染PVYN后叶脉坏死与总酚、类黄酮及PPO的关系。试验结果表明:感病品种K326接种PVYN后总酚和类黄酮含量升高,且接种处理与未接种对照间总酚和类黄酮含量的差别随症状表现的加重有递增趋势;就部位而言,与根部及叶部相比,坏死严重的叶脉中总酚和类黄酮含量增加幅度最大,其含量分别增加了149.23%和152.97%;其PPO活性在接种PVYN后3d时出现第一个高峰,比对照高213.61%,随后降至最低,但仍比对照高130.77%,在接种PVYN后15d,坏死症状表现严重时,又迅速升高。抗病品种VAM接种PVYN后无异常症状,其总酚和类黄酮含量也升高,但升高幅度不大,不同部位总酚及类黄酮含量增加的幅度也均小于25%,其PPO活性在接种PVYN后稍有升高,但基本保持一个水平。 展开更多
关键词 烟草 马铃薯Y病毒脉坏死株系 总酚 类黄酮 多酚氧化酶
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铜元素诱导烟草抗PVY^N相关生理生化及信号物质的研究 被引量:6
7
作者 李鑫 吴元华 +1 位作者 顾晶晶 赵秀香 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期536-540,共5页
通过气相色谱(GC)、高效液相色谱(HPLC)及生理生化指标的测定,研究了铜(Cu)元素诱导感染PVYN的烟株信号物质的积累及对系统抗性的影响。结果表明:喷施Cu元素能延迟烟株显症和叶脉出现褐色坏死时间,降低发病程度,病毒增殖受到抑制,烟株... 通过气相色谱(GC)、高效液相色谱(HPLC)及生理生化指标的测定,研究了铜(Cu)元素诱导感染PVYN的烟株信号物质的积累及对系统抗性的影响。结果表明:喷施Cu元素能延迟烟株显症和叶脉出现褐色坏死时间,降低发病程度,病毒增殖受到抑制,烟株体内的与抗性相关物质如脯氨酸及可溶性糖含量升高,电解质的外渗减少。此外,Cu元素处理能诱导信号物质水杨酸和乙烯的积累,水杨酸含量在接种后15d达到最大量3.93μg·g-1,为接种对照的1.3倍;而乙烯释放量在3~9d内均高于接种对照,在12d时乙烯释放量显著低于接种对照,分析认为前期Cu元素处理后诱导了乙烯释放的增强,进行抗性信号的传递。因此,喷施Cu元素后可以诱导烟草植株产生抗病性,增强烟草对PVYN侵染的抵抗力,并且诱导了相关抗性信号的传递。 展开更多
关键词 烟草 马铃薯Y病毒脉坏死株系(PVYN) 诱导抗性 信号物质
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烟草感染马铃薯Y病毒脉坏死株系后六种酶活性变化的研究 被引量:25
8
作者 吴元华 文才艺 +3 位作者 李浩戈 陈华民 赵秀香 韦石泉 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 1999年第2期33-37,共5页
本文定期测定了感病品种NC89接种PVYN后叶片内6种酶活性的动态变化,结果表明,接种后14天内SOD活性均较对照增高,其中第8天达高峰值,但接种后第16天SOD活性低于对照约28%;AAO活性在接种后2~6天明显高... 本文定期测定了感病品种NC89接种PVYN后叶片内6种酶活性的动态变化,结果表明,接种后14天内SOD活性均较对照增高,其中第8天达高峰值,但接种后第16天SOD活性低于对照约28%;AAO活性在接种后2~6天明显高于对照,6~12天,AAO活性变化不定,但12天后,AAO活性又升高;POD活性在接种后2~4天比对照降低,4天后显著升高,至接种后第14天达高峰值,接种后16天又有下降趋势;CAT活性仅在接种后第2天比对照略有升高,随后均低于对照,其中第6天和第10天CAT活性降低幅度较大;PAL活性在接种后2~6天均比对照高,随后开始下降,第8~10天PAL活性低于对照,10天后又升高,第12天又达高峰值;PPO活性在接种后2~16天明显高于对照。本文还详细讨论了上述6种酶与烟草脉坏死病病程的相关性。 展开更多
关键词 烟草 马铃薯Y病毒 超氧化物岐化酶 抗坏血酸氧化酶 过氧化物酶 过氧化氢酶 苯丙氨酸解氨酶 多酚氧化酶
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硫酸镁对烟草感染PVY^N后病情及防御酶系活性的影响 被引量:1
9
作者 顾晶晶 李鑫 +1 位作者 赵秀香 吴元华 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期286-290,共5页
对叶面喷施240mg·L-1硫酸镁溶液后,烟草幼苗感染烟草马铃薯Y病毒脉坏死株系(Potato Virus Y-vein necrosis,PVYN)的发病情况、病毒含量及防御酶系活性进行研究。结果表明:烟草幼苗经240 mg·L-1 MgSO4处理,再接种PVYN后其发病... 对叶面喷施240mg·L-1硫酸镁溶液后,烟草幼苗感染烟草马铃薯Y病毒脉坏死株系(Potato Virus Y-vein necrosis,PVYN)的发病情况、病毒含量及防御酶系活性进行研究。结果表明:烟草幼苗经240 mg·L-1 MgSO4处理,再接种PVYN后其发病程度减轻,病情指数及幼苗叶片中病毒含量均低于未喷施MgSO4的对照。叶面单独喷施MgSO4处理和喷施后接种PVYN处理,对苯丙氨酸解氨酶(PAL)、过氧化物酶(POD)、多酚氧化酶(PPO)的活性均有较强的促进作用,烟草幼苗接种PVYN后,PAL在处理第6天时达到酶活高峰(2.63U·g-1FW),POD、PPO的活性在接种PVYN后第15天时产生高于对照处理的酶活高峰,峰值分别为55.76U·g-1FW和10.62U·g-1FW;但喷施MgSO4对过氧化氢酶(CAT)活性影响较小。本研究证实,MgSO4具有较强的诱导植物产生抗病毒的能力,可明显提高植株的抗病性。 展开更多
关键词 烟草 马铃薯Y病毒脉坏死株系(PVYN) 苯丙氨酸解氨酶 过氧化物酶 多酚氧化酶 过氧化氢酶 MgSO4
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马铃薯Y病毒脉坏株系(PVY^N)的侵染对烟草光合作用和呼吸作用的影响 被引量:2
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作者 文才艺 吴元华 张艳红 《襄樊学院学报》 1999年第2期34-36,共3页
感染马铃薯Y病毒脉坏死株系后,烟草叶片的叶绿素含量和Hill反应活性均明显降低,光合速率在接种后2天出现增高现象,随后逐渐降低,呼吸速在接种的后2~6天明显降低,显症初期呼吸速率增高,随后大幅度降低.
关键词 烟草 马铃薯Y病毒脉坏死株系 光合作用 呼吸作用 生理特性 叶绿素 Hill反应活性 光合速率
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转基因烟草感染马铃薯Y病毒脉坏死株系后某些酶活性变化的比较研究 被引量:2
11
作者 文才艺 吴元华 张艳红 《襄樊学院学报》 1999年第5期56-59,共4页
烟草感染马铃薯Y病毒脉坏死株系后,过氧化物酶活性升高,但非转基因敏感烟草升高的幅度大于转基因抗病烟草;同时,非转基固敏感烟草的苯丙氨酸解氨酶和多酚氧化酶活性均增高,并且都出现两个活性高峰,但转基因抗病烟草的苯丙氨酸解... 烟草感染马铃薯Y病毒脉坏死株系后,过氧化物酶活性升高,但非转基因敏感烟草升高的幅度大于转基因抗病烟草;同时,非转基固敏感烟草的苯丙氨酸解氨酶和多酚氧化酶活性均增高,并且都出现两个活性高峰,但转基因抗病烟草的苯丙氨酸解氨酶活性仅出现第一个活性高峰,随后其活性值降低并逐渐恢复至未接种时的水平,而多酚氧化酶活性则降低;在未感染PVYN的情况下,转基因抗病烟草的过氧化物酶、苯丙氨酸解氨酶和多酚氧化酶活性均比非转基因敏感烟草高. 展开更多
关键词 烟草 马铃薯Y病毒脉坏死株系 过氧化物酶 苯丙氨酸解氨酶 多酚氧化酶
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烟草坏死病毒A诱导的基因沉默及其条件优化 被引量:3
12
作者 高阳 张永亮 +3 位作者 张晓峰 韩成贵 于嘉林 李大伟 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第10期919-928,共10页
以烟草坏死病毒A中国分离物(Tobacco necrosis virus A Chinese isolate,TNV-AC)侵染性cDNA克隆为基础,通过基因替换、基因插入策略构建获得多种重组TNV-AC,比较了外源基因片段插入位置、插入形式及接种植物培养温度对TNV-AC诱导的基因... 以烟草坏死病毒A中国分离物(Tobacco necrosis virus A Chinese isolate,TNV-AC)侵染性cDNA克隆为基础,通过基因替换、基因插入策略构建获得多种重组TNV-AC,比较了外源基因片段插入位置、插入形式及接种植物培养温度对TNV-AC诱导的基因沉默的影响.外源基因片段替换CP基因19~828 nt的重组TNV-AC丧失了在本生烟中的系统移动能力,也不能有效诱导相应基因发生明显的沉默,说明替换策略不适合于TNV-AC.向CP基因终止密码子UAG附近插入外源基因片段后,TNV-AC仍可进行复制,但最适的插入位点位于UAG之后,且容纳外源片段的长度约为120 nt.当外源片段以反向重复的形式插入UAG之后,诱导基因沉默的效率较高.接种植物的培养温度也会显著影响基因沉默的效率以及插入片段的稳定性,低温(18℃)条件下诱导NbPDS基因沉默的效率明显高于高温(24℃)条件,且沉默表型可持续110天以上.除了本生烟PDS基因,TNV-AC沉默载体还可诱导本生烟sulfur基因Su和镁离子螯合酶H亚基基因ChlH发生沉默,以上结果说明,TNV-AC具有开发为本生烟基因功能鉴定的新VIGS载体的潜力. 展开更多
关键词 烟草坏死病毒A 病毒诱导的基因沉默 条件优化
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茶山海棠叶提取物对烟草花叶病毒活性的抑制效果 被引量:2
13
作者 王莹 陈建鹏 《贵州农业科学》 CAS 2017年第2期59-62,共4页
为烟草花叶病毒植物源农药的研发提供参考,采用半叶枯斑法测定茶山海棠叶提取物对烟草花叶病毒活性的影响。结果表明:茶山海棠叶的乙醇提取物,石油醚、乙酸乙酯、氯仿、正丁醇和水相的液-液萃取物对烟草花叶病毒(TMV)活性均具有显著体... 为烟草花叶病毒植物源农药的研发提供参考,采用半叶枯斑法测定茶山海棠叶提取物对烟草花叶病毒活性的影响。结果表明:茶山海棠叶的乙醇提取物,石油醚、乙酸乙酯、氯仿、正丁醇和水相的液-液萃取物对烟草花叶病毒(TMV)活性均具有显著体外钝化效果;当各提取物浓度为10mg/mL时,其对TMV的抑制率为100.00%~64.13%;茶山海棠叶各提取物对TMV的初侵染抑制率为47.57%~18.62%,增殖抑制率为25.56%。 展开更多
关键词 茶山海棠叶 烟草花叶病毒(TMV) 抗TMV活性 半叶枯斑法
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烟草坏死病毒完整基因组的统计特征与聚类 被引量:12
14
作者 杨硕 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第13期6803-6804,共2页
[目的]提取烟草坏死病毒完整基因组的统计特征。并且对其进行聚类分析。[方法]在烟草坏死病毒完整基因组的碱基序列上,用每个碱基及其随后2个碱基所构成的三碱基组排列成一个新的序列S;计算所有64种不同三碱基组在S上出现的概率,得到一... [目的]提取烟草坏死病毒完整基因组的统计特征。并且对其进行聚类分析。[方法]在烟草坏死病毒完整基因组的碱基序列上,用每个碱基及其随后2个碱基所构成的三碱基组排列成一个新的序列S;计算所有64种不同三碱基组在S上出现的概率,得到一个64维向量L;比较各个基因组的L向量,得到8个三碱基组,它们的概率存在明显差异。[结果]8个三碱基组(CGT;CAA;TAC;TAA;AGG;ATG;ATA;AAG)的出现概率与烟草坏死病毒基因组的遗传变异有着重要关联;4个不同来源的烟草坏死病毒完整基因组,按其遗传变异结果形成2个大类。[结论]该研究方法普遍适用于各种烟草病毒基因序列的分析,为烟草坏死病毒病的防治提供理论依据。 展开更多
关键词 烟草坏死病毒 三碱基组 概率 K-M聚类
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烟草坏死病毒完整基因组的统计特征与聚类(摘要)(英文) 被引量:1
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作者 杨硕 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2010年第3期160-161,188,共3页
[目的]提取烟草坏死病毒完整基因组的统计特征,并对其进行聚类分析。[方法]在烟草坏死病毒完整基因组的碱基序列上,用每个碱基及其随后2个碱基所构成的三碱基组排列成一个新的序列S;计算所有64种不同三碱基组在S上出现的概率,得到一个6... [目的]提取烟草坏死病毒完整基因组的统计特征,并对其进行聚类分析。[方法]在烟草坏死病毒完整基因组的碱基序列上,用每个碱基及其随后2个碱基所构成的三碱基组排列成一个新的序列S;计算所有64种不同三碱基组在S上出现的概率,得到一个64维向量L;比较各个基因组的L向量,得到8个三碱基组,它们的概率存在明显差异;依照一定的规律,给三碱基组赋予数字代码;最后,对不同来源的烟草坏死病毒完整基因组按照L向量进行K-M聚类分析。[结果]8个三碱基组(CGT;CAA;TAC;TAA;AGG;ATG;ATA;AAG)的出现概率与烟草坏死病毒基因组的遗传变异有着重要关联;4个不同来源的烟草坏死病毒完整基因组,按其遗传变异结果形成2个大类。[结论]该研究方法普遍适用于各种烟草病毒基因序列的分析,为烟草坏死病毒病的防治提供了理论依据。 展开更多
关键词 烟草坏死病毒 三碱基组 概率 K-M聚类
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侵染马铃薯的烟草坏死病毒的鉴定、提纯及抗血清制备
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作者 王人元 贺俊杰 孙桂华 《东北农学院学报》 CSCD 1990年第1期15-21,共7页
自马铃著植株上分离得到了烟草坏死病毒(TNV)。在测试的13科53种植物中,能侵染8科34种,但人工接种仅在接种叶上引起局部侵染,未发现其系统侵染寄主。该病毒的钝化温度为78~80℃,稀释限点10^(-5)~10^(-6),体外保毒期27~28天。提纯病... 自马铃著植株上分离得到了烟草坏死病毒(TNV)。在测试的13科53种植物中,能侵染8科34种,但人工接种仅在接种叶上引起局部侵染,未发现其系统侵染寄主。该病毒的钝化温度为78~80℃,稀释限点10^(-5)~10^(-6),体外保毒期27~28天。提纯病毒经紫外吸收测定,最高吸收峰为260 nm,最低吸收峰为245 nm,提纯得毒率为7.8 mg/kg接种叶。病毒粒体球状,直径约28 nm。经免疫琼脂双扩散测定,该病毒与TNV标准抗血清产生明显的反应沉淀线。人工接种该病毒不能侵染马铃薯植株的地上部分。块茎病斑为ABC病的C型症状。感病植株所结块茎仅部分带毒。受侵染块茎下一年可产生病苗。 展开更多
关键词 马铃薯 烟草坏死病毒 侵染 抗血清
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Three-dimensional reconstruction and comparison of vacuolar membranes in response to viral infection 被引量:2
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作者 Xueting Wang Juncai Ma +7 位作者 Xuejiao Jin Ning Yue Peng Gao Keith Ka Ki Mai Xian-Bing Wang Dawei Li Byung-Ho Kang Yongliang Zhang 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2021年第2期353-364,共12页
The vacuole is a unique plant organelle that plays an important role in maintaining cellular homeostasis under various environmental stress conditions. However, the effects of biotic stress on vacuole structure has no... The vacuole is a unique plant organelle that plays an important role in maintaining cellular homeostasis under various environmental stress conditions. However, the effects of biotic stress on vacuole structure has not been examined using three-dimensional(3D) visualization. Here, we performed 3D electron tomography to compare the ultrastructural changes in the vacuole during infection with different viruses. The 3D models revealed that vacuoles are remodeled in cells infected with cucumber mosaic virus(CMV) or tobacco necrosis virus A Chinese isolate(TNV-AC), resulting in the formation of spherules at the periphery of the vacuole. These spherules contain neck-like channels that connect their interior with the cytosol. Confocal microscopy of CMV replication proteins 1 a and 2 a and TNV-AC auxiliary replication protein p23 showed that all of these proteins localize to the tonoplast.Electron microscopy revealed that the expression of these replication proteins alone is sufficient to induce spherule formation on the tonoplast, suggesting that these proteins play prominent roles in inducing vacuolar membrane remodeling. This is the first report of the 3D structures of viral replication factories built on the tonoplasts. These findings contribute to our understanding of vacuole biogenesis under normal conditions and during assembly of plant(+) RNA virus replication complexes. 展开更多
关键词 COMPARISON cucumber mosaic virus electron tomography SPHERULES tobacco necrosis virus A VACUOLE viral replication
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TMV病毒载体表达重组rPA致受体本氏烟叶片坏死的初步分析
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作者 徐丽 吴乐乐 +2 位作者 丁向真 李志英 王盛 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期3584-3592,共9页
重组rPA是临床上治疗血栓性疾病的主要溶栓药物。利用烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)表达载体在本氏烟(Nicotiana benthamiana)中表达重组rPA会致使接种叶片严重坏死,受体细胞坏死会影响重组产物的积累、定量和下游纯化,剖析... 重组rPA是临床上治疗血栓性疾病的主要溶栓药物。利用烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)表达载体在本氏烟(Nicotiana benthamiana)中表达重组rPA会致使接种叶片严重坏死,受体细胞坏死会影响重组产物的积累、定量和下游纯化,剖析坏死症状产生原因可为提高外源基因在植物中表达提供指导。分别从替换TMV病毒载体携带的外源基因和更换TMV病毒表达载体两个方面入手,通过比较叶片接种部位的表型变化和重组产物在叶片中的积累情况,初步解析致接种叶片坏死的主要因素。结果表明,农杆菌菌株和RNA沉默抑制子与本氏烟叶片坏死症状的产生无关联;TMV病毒载体自身不是坏死症状产生的直接原因;外源重组rPA对受体本氏烟细胞无细胞毒性。推测TMV病毒载体与重组rPA相互作用是引起本氏烟接种叶片细胞坏死的主要原因。 展开更多
关键词 重组rPA 烟草花叶病毒 豇豆花叶病毒 病毒表达载体 本氏烟 叶片坏死
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