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活血消异方治疗子宫内膜异位症网络药理学研究
被引量:
7
1
作者
刘哲
赵瑞华
《山东中医药大学学报》
2021年第3期354-361,共8页
采用网络药理学方法探析活血消异方治疗子宫内膜异位症(EMT)的相关靶点及作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)及Swiss Target Prediction网络数据库推测并获取活血消异方组方的药物活性成分及靶点。利用基因卡片(GeneCard...
采用网络药理学方法探析活血消异方治疗子宫内膜异位症(EMT)的相关靶点及作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)及Swiss Target Prediction网络数据库推测并获取活血消异方组方的药物活性成分及靶点。利用基因卡片(GeneCard)数据库筛选获取EMT的疾病相关靶点,绘制药物成分-药物靶点网络、药物-疾病靶点的网络及核心蛋白质互作(PPI)网络,并对关键靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)基因富集分析。结果:从活血消异方中筛选出主要活性成分共99个,纳入靶点166个,其中疾病与药物的共同靶点66个;GO分析得到785项结果,主要涉及细胞的增殖、代谢、凋亡及激素受体活性等过程;KEGG分析得到124条通路,活血消异方治疗EMT主要涉及细胞增殖与凋亡、P53信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶/分子蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路等。结论:活血消异方治疗EMT具有多成分、多靶点的特征,且涉及多条信号通路,此为进一步探讨该方治疗EMT机制提供了思路。
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关键词
子宫内膜异位症
活血消异方
网络药理学
中药系统药理学分析平台
细胞增殖与凋亡
P53信号通路
磷脂酰肌醇-3-激酶/分子蛋白激酶B信号通路
下载PDF
职称材料
基于网络药理学和实验验证探讨糖痹康颗粒治疗糖尿病周围神经病变的分子机制
被引量:
6
2
作者
张亚奇
秦灵灵
+7 位作者
白惠中
张程斐
张秋娥
左心玮
蒋昇源
赵毅
刘铜华
穆晓红
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期81-90,共10页
目的:基于网络药理学和体内实验验证探讨糖痹康颗粒治疗糖尿病周围神经病变的相关分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)平台查找糖痹康颗粒组方中各味中药所含的活性成分及其对应的靶点基因,TCMSP中未收录的中药...
目的:基于网络药理学和体内实验验证探讨糖痹康颗粒治疗糖尿病周围神经病变的相关分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)平台查找糖痹康颗粒组方中各味中药所含的活性成分及其对应的靶点基因,TCMSP中未收录的中药则通过文献查询有效成分后通过SwissADME类药性分析后上传SwissTargetPrediction数据库预测相关靶点基因。通过GeneCard数据库收集糖尿病周围神经病变(DPN)的相关疾病靶点基因。将药物基因与疾病基因取交集获得糖痹康颗粒治疗DPN的核心靶点基因。将核心靶点基因上传Metascape平台进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。高糖高脂饲料诱导加小剂量链脲佐菌素(STZ)腹腔注射建立糖尿病大鼠模型,成模后进行糖痹康颗粒高、中、低剂量组(2.5、1.25、0.625 g·kg^(-1))12周连续药物干预。通过功能学检测感觉神经传导速度(SNCV)电生理测定评估神经传导速度改变,坐骨神经苏木素-伊红(HE)染色光镜下观察组织形态评估神经损伤程度,实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)检测大鼠坐骨神经组织腺苷一磷酸活化蛋白激酶(AMPK)通路相关靶向分子的基因表达,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测大鼠坐骨神经组织中AMPK、磷酸化腺苷一磷酸活化蛋白激酶(p-AMPK)的蛋白表达水平。结果:筛选出槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、水蛭蝶啶A、豆甾醇、黄芩素等主要活性成分,主要作用于白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、蛋白激酶B(Akt)、JUN、HSP90AA1等关键靶点和AMPK、核转录因子-κB(NF-κB)、Janus激酶/信号转导子与转录激活因子(JAK/STAT)等信号通路。分子对接结果表明β-谷甾醇、豆甾醇等药物活性成分与IL-6、TNF、JUN、HSP90AA1等作用靶点分子有较好的结合性。动物实验结果显示,与正常组比较,模型组大鼠坐骨神经SNCV显著降低(P<0.01);有髓神经纤维排列紊乱、稀松,轴索断裂,甚至髓鞘脱失;坐骨神经AMPKα、AMPKβ、过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子-1α(PGC-1α)、去乙酰化酶3(SirT3)、线粒体转录因子A(TFAM)mRNA表达及坐骨神经蛋白表达水平的p-AMPK/AMPK明显降低(P<0.05,P<0.01)。与模型组比较,糖痹康颗粒治疗后各组SNCV显著升高(P<0.01);神经形态接近正常组,排列较为紧密;神经AMPKα、AMPKβ、PGC-1α、SirT3、TFAM mRNA表达明显升高(P<0.05,P<0.01);糖痹康颗粒高、中剂量组p-AMPK/AMPK显著升高(P<0.01),糖痹康颗粒低剂量组与模型组蛋白表达差异无统计学意义。结论:糖痹康颗粒治疗DPN具有多通路-多靶点的特性,其机制可能与糖痹康颗粒激活并调控AMPK/PGC-1α/SirT3信号通路发挥对DPN的治疗作用相关,为后续糖痹康颗粒干预DPN更深入的研究提供实验依据。
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关键词
糖痹康颗粒
网络药理学
糖尿病周围神经病变
动物实验
分子机制
系统药理学数据库与分析平台(
tcmsp
)
SwissTargetPrediction数据库
原文传递
阿尔茨海默病嗅觉障碍中药用药规律的网络药理学研究
被引量:
1
3
作者
李智飘
郭宵飞
+1 位作者
徐国杰
刘缨
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
2023年第6期628-632,共5页
目的利用网络药理学及数据挖掘方法初步探索中药调节阿尔茨海默病(AD)嗅觉障碍的物质基础及用药规律。方法通过OMIM、GeneCards、CTD等数据库分别获得AD和嗅觉障碍的相关靶点,取两者的交集靶点后,以在中药系统药理学数据库与分析平台(TC...
目的利用网络药理学及数据挖掘方法初步探索中药调节阿尔茨海默病(AD)嗅觉障碍的物质基础及用药规律。方法通过OMIM、GeneCards、CTD等数据库分别获得AD和嗅觉障碍的相关靶点,取两者的交集靶点后,以在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中类药性≥0.18且可匹配到相应的化合物为条件,进一步筛选获得AD嗅觉障碍的潜在作用靶点。应用TCMSP数据库收集潜在作用靶点的相关化合物、中药,在Cytoscape软件中构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络,根据度值大小获得核心潜在作用靶点、核心候选化合物及核心候选中药。将获得的核心候选化合物及核心潜在作用靶点进行分子对接,初步验证预测结果。建立中药数据库,通过数据分析获得AD嗅觉障碍的中药用药规律。结果共获得AD及嗅觉障碍的疾病相关靶点2919、2358个,两者的交集靶点共946个;其中,符合类药性≥0.18且能匹配到相关化合物的靶点共245个,候选化合物1172个,候选中药406味。候选中药的药味以苦、辛、甘为主,药性主要为温,归经以肝、肺二经为要主。结论以网络药理学及数据挖掘的方法,较为系统的探索了中药调节AD嗅觉障碍的物质基础,获得了中药治疗AD嗅觉障碍的用药规律,为该病的治疗提供了理论依据及用药指导。
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关键词
阿尔茨海默病
嗅觉障碍
网络药理学
数据挖掘
分子对接
用药规律
中药系统药理学数据库分析平台
中药
原文传递
题名
活血消异方治疗子宫内膜异位症网络药理学研究
被引量:
7
1
作者
刘哲
赵瑞华
机构
北京中医药大学
中国中医科学院广安门医院
出处
《山东中医药大学学报》
2021年第3期354-361,共8页
基金
首都卫生发展科研专项重点攻关项目(编号:首发2018-1-4151)。
文摘
采用网络药理学方法探析活血消异方治疗子宫内膜异位症(EMT)的相关靶点及作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)及Swiss Target Prediction网络数据库推测并获取活血消异方组方的药物活性成分及靶点。利用基因卡片(GeneCard)数据库筛选获取EMT的疾病相关靶点,绘制药物成分-药物靶点网络、药物-疾病靶点的网络及核心蛋白质互作(PPI)网络,并对关键靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)基因富集分析。结果:从活血消异方中筛选出主要活性成分共99个,纳入靶点166个,其中疾病与药物的共同靶点66个;GO分析得到785项结果,主要涉及细胞的增殖、代谢、凋亡及激素受体活性等过程;KEGG分析得到124条通路,活血消异方治疗EMT主要涉及细胞增殖与凋亡、P53信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶/分子蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路等。结论:活血消异方治疗EMT具有多成分、多靶点的特征,且涉及多条信号通路,此为进一步探讨该方治疗EMT机制提供了思路。
关键词
子宫内膜异位症
活血消异方
网络药理学
中药系统药理学分析平台
细胞增殖与凋亡
P53信号通路
磷脂酰肌醇-3-激酶/分子蛋白激酶B信号通路
Keywords
endometriosis
Huoxue Xiaoyi Formula
network
pharmacology
traditional
chinese
medicine
system
pharmacology
analysis
platform
cell proliferation
and
apoptosis
P53 signaling pathway
phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signaling pathway
分类号
R271.113 [医药卫生—中医妇科学]
R243 [医药卫生—中医临床基础]
下载PDF
职称材料
题名
基于网络药理学和实验验证探讨糖痹康颗粒治疗糖尿病周围神经病变的分子机制
被引量:
6
2
作者
张亚奇
秦灵灵
白惠中
张程斐
张秋娥
左心玮
蒋昇源
赵毅
刘铜华
穆晓红
机构
北京中医药大学东直门医院
北京中医药大学科技处
教育部高等学校学科创新引智基地
北京中医药大学生命科学学院
北京中医药大学中医学院
北京中医药大学中医养生学北京市重点实验室
科技部中医药防治糖尿病国际联合研究中心
出处
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期81-90,共10页
基金
国家自然科学基金项目(81874467)
北京市自然科学基金项目(L192059)。
文摘
目的:基于网络药理学和体内实验验证探讨糖痹康颗粒治疗糖尿病周围神经病变的相关分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)平台查找糖痹康颗粒组方中各味中药所含的活性成分及其对应的靶点基因,TCMSP中未收录的中药则通过文献查询有效成分后通过SwissADME类药性分析后上传SwissTargetPrediction数据库预测相关靶点基因。通过GeneCard数据库收集糖尿病周围神经病变(DPN)的相关疾病靶点基因。将药物基因与疾病基因取交集获得糖痹康颗粒治疗DPN的核心靶点基因。将核心靶点基因上传Metascape平台进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。高糖高脂饲料诱导加小剂量链脲佐菌素(STZ)腹腔注射建立糖尿病大鼠模型,成模后进行糖痹康颗粒高、中、低剂量组(2.5、1.25、0.625 g·kg^(-1))12周连续药物干预。通过功能学检测感觉神经传导速度(SNCV)电生理测定评估神经传导速度改变,坐骨神经苏木素-伊红(HE)染色光镜下观察组织形态评估神经损伤程度,实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)检测大鼠坐骨神经组织腺苷一磷酸活化蛋白激酶(AMPK)通路相关靶向分子的基因表达,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测大鼠坐骨神经组织中AMPK、磷酸化腺苷一磷酸活化蛋白激酶(p-AMPK)的蛋白表达水平。结果:筛选出槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、水蛭蝶啶A、豆甾醇、黄芩素等主要活性成分,主要作用于白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、蛋白激酶B(Akt)、JUN、HSP90AA1等关键靶点和AMPK、核转录因子-κB(NF-κB)、Janus激酶/信号转导子与转录激活因子(JAK/STAT)等信号通路。分子对接结果表明β-谷甾醇、豆甾醇等药物活性成分与IL-6、TNF、JUN、HSP90AA1等作用靶点分子有较好的结合性。动物实验结果显示,与正常组比较,模型组大鼠坐骨神经SNCV显著降低(P<0.01);有髓神经纤维排列紊乱、稀松,轴索断裂,甚至髓鞘脱失;坐骨神经AMPKα、AMPKβ、过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子-1α(PGC-1α)、去乙酰化酶3(SirT3)、线粒体转录因子A(TFAM)mRNA表达及坐骨神经蛋白表达水平的p-AMPK/AMPK明显降低(P<0.05,P<0.01)。与模型组比较,糖痹康颗粒治疗后各组SNCV显著升高(P<0.01);神经形态接近正常组,排列较为紧密;神经AMPKα、AMPKβ、PGC-1α、SirT3、TFAM mRNA表达明显升高(P<0.05,P<0.01);糖痹康颗粒高、中剂量组p-AMPK/AMPK显著升高(P<0.01),糖痹康颗粒低剂量组与模型组蛋白表达差异无统计学意义。结论:糖痹康颗粒治疗DPN具有多通路-多靶点的特性,其机制可能与糖痹康颗粒激活并调控AMPK/PGC-1α/SirT3信号通路发挥对DPN的治疗作用相关,为后续糖痹康颗粒干预DPN更深入的研究提供实验依据。
关键词
糖痹康颗粒
网络药理学
糖尿病周围神经病变
动物实验
分子机制
系统药理学数据库与分析平台(
tcmsp
)
SwissTargetPrediction数据库
Keywords
Tangbikang granules
network
pharmacology
diabetic peripheral neuropathy
animal experiments
molecular mechanism
traditional
chinese
medicine
systems
pharmacology
database
and
analysis
platform
(
tcmsp
)
SwissTargetPrediction
分类号
R2-0 [医药卫生—中医学]
R22 [医药卫生—中医基础理论]
R242 [医药卫生—中医临床基础]
R2-031 [医药卫生—中西医结合]
R285.5 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
阿尔茨海默病嗅觉障碍中药用药规律的网络药理学研究
被引量:
1
3
作者
李智飘
郭宵飞
徐国杰
刘缨
机构
北京中医药大学生命科学学院
中国中医科学院望京医院
出处
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
2023年第6期628-632,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(批准号:81903738)
北京中医药大学新教师启动基金项目(2022-JYB-XJSJJ-031)。
文摘
目的利用网络药理学及数据挖掘方法初步探索中药调节阿尔茨海默病(AD)嗅觉障碍的物质基础及用药规律。方法通过OMIM、GeneCards、CTD等数据库分别获得AD和嗅觉障碍的相关靶点,取两者的交集靶点后,以在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中类药性≥0.18且可匹配到相应的化合物为条件,进一步筛选获得AD嗅觉障碍的潜在作用靶点。应用TCMSP数据库收集潜在作用靶点的相关化合物、中药,在Cytoscape软件中构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络,根据度值大小获得核心潜在作用靶点、核心候选化合物及核心候选中药。将获得的核心候选化合物及核心潜在作用靶点进行分子对接,初步验证预测结果。建立中药数据库,通过数据分析获得AD嗅觉障碍的中药用药规律。结果共获得AD及嗅觉障碍的疾病相关靶点2919、2358个,两者的交集靶点共946个;其中,符合类药性≥0.18且能匹配到相关化合物的靶点共245个,候选化合物1172个,候选中药406味。候选中药的药味以苦、辛、甘为主,药性主要为温,归经以肝、肺二经为要主。结论以网络药理学及数据挖掘的方法,较为系统的探索了中药调节AD嗅觉障碍的物质基础,获得了中药治疗AD嗅觉障碍的用药规律,为该病的治疗提供了理论依据及用药指导。
关键词
阿尔茨海默病
嗅觉障碍
网络药理学
数据挖掘
分子对接
用药规律
中药系统药理学数据库分析平台
中药
Keywords
Alzheimer's disease
Olfactory disorders
Network
pharmacology
Data mining
Molecular docking
Drug use rule
TCM system
pharmacology
database
analysis
platform
traditional
chinese
medicine
分类号
R96 [医药卫生—药理学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
活血消异方治疗子宫内膜异位症网络药理学研究
刘哲
赵瑞华
《山东中医药大学学报》
2021
7
下载PDF
职称材料
2
基于网络药理学和实验验证探讨糖痹康颗粒治疗糖尿病周围神经病变的分子机制
张亚奇
秦灵灵
白惠中
张程斐
张秋娥
左心玮
蒋昇源
赵毅
刘铜华
穆晓红
《中国实验方剂学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
6
原文传递
3
阿尔茨海默病嗅觉障碍中药用药规律的网络药理学研究
李智飘
郭宵飞
徐国杰
刘缨
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
2023
1
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