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Low WT1 transcript levels at diagnosis predicted poor outcomes of acute myeloid leukemia patients with t(8;21) who received chemotherapy or allogeneic hematopoietic stem cell transplantation 被引量:7
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作者 Ya-Zhen Qin Yu Wang +12 位作者 Hong-Hu Zhu Robert Peter Gale Mei-Jie Zhang Qian Jiang Hao Jiang Lan-Ping Xu Huan Chen Xiao-Hui Zhang Yan-Rong Liu Yue-Yun Lai Bin Jiang Kai-Yan Liu Xiao-Jun Huang 《Chinese Journal of Cancer》 SCIE CAS CSCD 2016年第7期350-358,共9页
Background:Acute myeloid leukemia(AML) with t(8;21) is a heterogeneous disease.Identifying AML patients with t(8;21) who have a poor prognosis despite achieving remission is important for determining the best subseque... Background:Acute myeloid leukemia(AML) with t(8;21) is a heterogeneous disease.Identifying AML patients with t(8;21) who have a poor prognosis despite achieving remission is important for determining the best subsequent therapy.This study aimed to evaluate the impact of Wilm tumor gene-1(WT1) transcript levels and cellular homolog of the viral oncogene v-KIT receptor tyrosine kinase(C-KIT) mutations at diagnosis,and RUNXTRUNX1T1 transcript levels after the second consolidation chemotherapy cycle on outcomes.Methods:Eighty-eight AML patients with t(8;21) who received chemotherapy only or allogeneic hematopoietic stem cell transplantation(allo-HSCT) were included.Patients who achieved remission,received two or more cycles of consolidation chemotherapy,and had a positive measureable residual disease(MRD) test result(defined as <3-log reduction in RUNX1-RUNX1T1 transcript levels compared to baseline) after 2-8 cycles of consolidation chemotherapy were recommended to receive allo-HSCT.Patients who had a negative MRD test result were recommended to receive further chemotherapy up to only 8 cycles.WT1 transcript levels and C-KIT mutations at diagnosis,and RUNX1-RUNX1T1 transcript levels after the second consolidation chemotherapy cycle were tested.Results:Patients who had a C-KIT mutation had significantly lower WTl transcript levels than patients who did not have a C-KIT mutation(6.7%± 10.6%vs.19.5%± 19.9%,P < 0.001).Low WTl transcript levels(<5.0%) but not C-KIT mutation at diagnosis,a positive MRD test result after the second cycle of consolidation chemotherapy,and receiving only chemotherapy were independently associated with high cumulative incidence of relapse in all patients(hazard ratio[HR]= 3.53,2.30,and 11.49;95%confidence interval[CI]1.64-7.62,1.82-7.56,and 4.43-29.82;P = 0.002,0.034,and <0.001,respectively);these conditions were also independently associated with low leukemia-free survival(HR =3.71,2.33,and 5.85;95%CI 1.82-7.56,1.17-4.64,and 2.75-12.44;P < 0.001,0.016,and <0.001,respectively) and overall survival(HR = 3.50,2.32,and 4.34;95%CI 1.56-7.82,1.09-4.97,and 1.98-9.53;P = 0.002,0.030,and <0.001,respectively) in all patients.Conclusions:Testing for WTl transcript levels at diagnosis in patients with AML and t(8;21) may predict outcomes in those who achieve remission.A randomized study is warranted to determine whether allo-HSCT can improve prognosis in these patients. 展开更多
关键词 异基因造血干细胞移植 转录水平 白血病 WT1 患者 化疗 诊断 预后
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Transcript Level Analysis of Lignin and Flavonoid Biosynthesis Related Genes in <i>Eucalyptus globulus</i>
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作者 Tomotaka Shinya Kazunori Hayashi +1 位作者 Shinichi Onogi Akiyoshi Kawaoka 《American Journal of Plant Sciences》 2014年第18期2764-2772,共9页
We have investigated a correlation of transcript abundances of key genes that influence the quality of wood and flavonoid biosynthesis, such as the two p-hydroxycinnamoyl-CoA:quinate shikimate p-hydroxycinnamoyl trans... We have investigated a correlation of transcript abundances of key genes that influence the quality of wood and flavonoid biosynthesis, such as the two p-hydroxycinnamoyl-CoA:quinate shikimate p-hydroxycinnamoyl transferase (HCT) and the two chalcone synthases (CHS) from Eucalyptus globulus grown in a greenhouse. The EglHCT1 and EglHCT2 transcripts accumulated in stems of all ages, but to a lesser extent in leaves. On the other hand, EglCHS3 and EglCHS4 exhibited high transcript levels in leaves, roots and shoots, but low levels in the stem. A positive correlation (R2 > 0.70) was observed between the transcript levels of the EglHCT1, EglHCT2 genes and Klason lignin (KL) content. In addition, the sum of transcript levels of EglHCT1 and EglHCT2 genes were highly correlated to KL contents (R2 > 0.85). However, there is no relationship between transcript levels of two CHS genes and, KL or flavonoid contents. This may imply that lignin biosynthesis and flavonoid biosynthesis are independently regulated in E. globulus. 展开更多
关键词 HCT CHS 4CL transcript level LIGNIN Content Eucalyptus GLOBULUS
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Polypropylene crisper and 1-MCP delay the softening,lignification and transcription levels of related enzyme genes of golden needle mushrooms(Flammulina velutipes) 被引量:6
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作者 WANG Wen-jun LI Yao +2 位作者 LI Fu-hua ZENG Kai-fang MING Jian 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2022年第1期249-260,共12页
The fresh postharvest golden needle mushroom(Flammulina velutipes) sporocarp has a high moisture content and crisp texture, but it still has high physiological activity and respiration, leading to senescence and quali... The fresh postharvest golden needle mushroom(Flammulina velutipes) sporocarp has a high moisture content and crisp texture, but it still has high physiological activity and respiration, leading to senescence and quality deterioration.Treatments with 1-methylcyclopropene(1-MCP) and polypropylene(PP) crispers were used to study the changes of lignification and softening of F. velutipes during storage. The main findings were as follows: the crisper packaging could effectively prolong the storage time of F. velutipes;either the 1-MCP treatment, crisper packaging or the combination of the two treatments could significantly inhibit the accumulation of lignin and the decreases in the contents of cellulose and pectin, and had certain inhibitory effects on the activities of enzymes involved in lignification and softening including phenylalanine ammonia-lyase(PAL), cinnamyl alcohol dehydrogenase(CAD), cellulase(Cx), pectin methylesterase(PME) and polygalacturonase(PG). Among them, the inhibitory effect of the crisper packaging was higher than the 1-MCP treatment, while the combination of the two treatments was the best. The results of transmission electron microscopy(TEM) and scanning electron microscopy(SEM) showed that the crisper packaging in combination with the 1-MCP treatment could effectively maintain the integrity and stability of the F. velutipes cellular structure and inhibit the emergence of plasmolysis to prevent cell membrane rupture. The transcription levels showed that the crisper packaging and the combination of the 1-MCP treatment and crisper packing could effectively affect the expression of genes for enzymes related to lignification and softening of F. velutipes. In conclusion, 1-MCP and PP crispers could delay the lignification and softening of F. velutipes during storage. 展开更多
关键词 Flammulina velutipes polypropylene crisper 1-MCP softening and lignification transcription levels
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Metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1 molecular mechanisms in gastric cancer progression 被引量:1
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作者 Daniel Mateus de Oliveira Batista Jessica Manoelli Costa da Silva +3 位作者 Carolina de Oliveira Gigek Marilia de Arruda Cardoso Smith Paulo Pimentel de Assumpcao Danielle Queiroz Calcagno 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE 2023年第9期1520-1530,共11页
Gastric cancer(GC)remains among the most common cancers worldwide with a high mortality-to-incidence ratio.Accumulated evidence suggests that long noncoding RNAs(lncRNAs)are involved in gastric carcinogenesis.These tr... Gastric cancer(GC)remains among the most common cancers worldwide with a high mortality-to-incidence ratio.Accumulated evidence suggests that long noncoding RNAs(lncRNAs)are involved in gastric carcinogenesis.These transcripts are longer than 200 nucleotides and modulate gene expression at multiple molecular levels,inducing or inhibiting biological processes and diseases.Metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1(MALAT1)is one of the best-studied lncRNAs with comprehensive actions contributing to cancer progression.This lncRNA regulates gene expression at the transcriptional and posttranscriptional levels through interactions with microRNAs and proteins.In the present review,we discussed the molecular mechanism of MALAT1 and summarized the current knowledge of its expression in GC.Moreover,we highlighted the potential use of MALAT1 as a biomarker,including liquid biopsy. 展开更多
关键词 Long noncoding RNA Gastric carcinogenesis transcriptional levels Posttranscriptional levels Prognostic biomarker Liquid biopsy
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口蹄疫病毒感染后猪PD-1及其配体转录水平变化和免疫抑制机制分析
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作者 岳锋 周娟娟 +4 位作者 朱艳平 郭东光 夏黎明 祝仰钊 王选年 《河南农业科学》 北大核心 2024年第8期126-132,共7页
研究猪感染口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)后程序性死亡受体-1(Programmed death-1,PD-1)及其配体(PD-L1、PD-L2),细胞因子[IL-2(Interleukin-2)、IL-10(Interleukin-10)、IFN-γ(Interferon-γ)]mRNA转录水平和外周血... 研究猪感染口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)后程序性死亡受体-1(Programmed death-1,PD-1)及其配体(PD-L1、PD-L2),细胞因子[IL-2(Interleukin-2)、IL-10(Interleukin-10)、IFN-γ(Interferon-γ)]mRNA转录水平和外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)增殖能力,探讨PD-1/PD-Ls通路在FMDV引起免疫抑制过程中的作用机制。结果表明,猪感染FMDV后3、7、14、17 d,PD-1的mRNA转录水平显著或极显著升高,感染后7 d达到峰值,之后逐渐降低;感染FMDV后3 d和7 d,PD-L1的mRNA转录水平极显著升高;感染FMDV后3 d,PD-L2的mRNA转录水平显著升高。感染FMDV后3、7 d,IL-2的mRNA转录水平显著下降;感染FMDV后1、3 d,IFN-γ的mRNA转录水平极显著下降,IL-2和IFN-γ的mRNA转录水平与PD-1及其配体mRNA转录水平变化趋势相反;感染FMDV后3、7、14 d,IL-10的mRNA转录水平显著或极显著升高,与PD-1及其配体mRNA转录水平变化趋势相同。感染FMDV后,全血中FMDV的病毒载量随着感染后时间的推进逐渐升高,感染后7 d达到峰值,与PD-1及其配体mRNA转录水平变化趋势总体上相同。感染后7 d,PBMCs的增殖能力明显降低。综上,FMDV感染猪后,总体上上调了PD-1及其配体的mRNA转录水平,是FMDV感染引起机体免疫抑制的重要致病机制。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 程序性死亡受体-1 程序性死亡受体配体-1 转录水平 免疫抑制机制
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谷子SiNF-YB亚家族基因的单倍型与功能分析
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作者 王春芳 祁东梅 +2 位作者 张霈涵 林伟 史慎奎 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期28-37,共10页
谷子属于短日照植物,是我国北方重要的杂粮作物,随着对谷子的深入研究,越来越多与逆境相关的转录因子被发现,其中NF-Y家族便是一类可以与启动子中CCAAT-box相结合的转录因子,包括3个亚家族NF-YA、NF-YB、NF-YC。本研究针对谷子SiNF-YB... 谷子属于短日照植物,是我国北方重要的杂粮作物,随着对谷子的深入研究,越来越多与逆境相关的转录因子被发现,其中NF-Y家族便是一类可以与启动子中CCAAT-box相结合的转录因子,包括3个亚家族NF-YA、NF-YB、NF-YC。本研究针对谷子SiNF-YB亚家族的14个基因进行研究,通过亚细胞定位分析,发现该亚家族中除了SiNF-YB8和SiNF-YB15其余成员主要定位于细胞核中。顺式作用元件分析显示,在各成员启动子区域包含大量与非生物胁迫响应以及光周期相关的顺式作用元件。单倍型分析显示,SiNF-YB4是一个与耐旱有很强相关性的基因,有3种单倍型,其中H003是优异的抗旱单倍型;SiNF-YB12是一个与抽穗有很强相关性的基因,有H001和H002两种单倍型。转录组数据分析显示,抗旱和敏旱品种干旱处理前后,SiNF-YB5在根部的表达量存在显著性差异;在长日照与短日照条件下,SiNF-YB4在春谷和夏谷中的表达量存在显著差异。本研究结果为后续进一步探究谷子SiNF-YB亚家族基因的功能提供了重要的理论依据,同时为培育抽穗期与环境相适应的谷子抗旱品种奠定基础。 展开更多
关键词 谷子 NF-YB 转录因子 单倍型分析 表达量
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青海血蜱Haemalin基因的克隆、生物信息学及转录水平分析
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作者 何永彩 李增魁 +11 位作者 陈炳华 张连生 李中余 何顺福 陈继勇 耿鹏程 胡晓宇 蒋硕 陈强 徐璐瑶 康明 李英 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期700-708,共9页
为构建青海血蜱Haemalin基因的cDNA全长序列,并分析该基因的生物信息学特征及其在青海血蜱不同发育阶段和雌蜱不同组织中的转录水平,本研究基于青海血蜱唾液腺转录组文库中检索到的一个功能注释为Haemalin的基因片段,采用cDNA末端快速... 为构建青海血蜱Haemalin基因的cDNA全长序列,并分析该基因的生物信息学特征及其在青海血蜱不同发育阶段和雌蜱不同组织中的转录水平,本研究基于青海血蜱唾液腺转录组文库中检索到的一个功能注释为Haemalin的基因片段,采用cDNA末端快速扩增技术(RACE)引物设计软件设计Haemalin基因3'RACE和5'RACE特异性引物,分别经RACE扩增青海血蜱Haemalin基因的3'端和5'端序列,测序后与其中间序列拼接获得该基因的cDNA全长序列。利用生物信息学软件分析该基因编码蛋白的信号肽、理化性质、跨膜结构域、结构域、蛋白质三级结构、B细胞抗原表位以及氨基酸序列比对,采用NCBI中的BLAST及MEGA 7.0软件分别分析Haemalin基因编码氨基酸序列的相似性及构建其系统进化树,采用qPCR检测Haemalin基因在不同发育阶段青海血蜱和雌蜱不同组织中的转录水平。结果显示,青海血蜱Haemalin基因cDNA全长583 bp,开放阅读框(ORF)423 bp,该基因编码蛋白的信号肽为N端的15个氨基酸,理论等电点4.71,属于亲水性蛋白,无跨膜结构域。该基因编码蛋白的三级结构分析结果显示,其存在两个典型的Kunitz/牛胰蛋白酶抑制剂(Kunitz/BPTI)结构域,两个结构域之间由单链连接,共包括3个α螺旋,2对反向平行的β折叠;在aa35~aa45、aa54~aa60、aa75~aa80、aa91~aa93、aa125~aa131等处可能存在潜在的B细胞抗原表位。相似性与进化树结果显示,青海血蜱Haemalin氨基酸序列与褐黄血蜱凝血酶抑制剂Haemalin氨基酸序列的相似最高达92%,并在进化树中二者处于同一进化分支。表明,青海血蜱Haemalin可能也为一种凝血酶抑制剂。qPCR结果显示,Haemalin基因在不同发育阶段青海血蜱中的转录水平为:卵>半饱血蜱>若蜱>饱血蜱>幼蜱>吸血96 h的雌成蜱>游离雌成蜱,且其在青海血蜱雌蜱中肠中的转录水平极显著高于其他组织(P<0.0001)。表明,Haemalin基因在青海血蜱成蜱吸血阶段及其在该蜱的血液消化中均发挥重要作用。本研究为进一步研究Haemalin基因的生物学功能及其在青海血蜱防控中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 青海血蜱 Haemalin基因 克隆 生物信息学 转录水平
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灰飞虱冠蛋白的基因克隆与表达分析
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作者 钟嘉怡 李莉 +1 位作者 王锡锋 刘文文 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期178-185,共8页
灰飞虱Laodelphax striatellus冠蛋白属于WD40重复超家族成员,主要通过结合肌动蛋白调控细胞骨架的动态聚合与解聚。本研究通过RT-PCR克隆并获得了灰飞虱3个冠蛋白coronin 1A、coronin 2B和coronin 7的基因CDS区。系统进化树分析显示,这... 灰飞虱Laodelphax striatellus冠蛋白属于WD40重复超家族成员,主要通过结合肌动蛋白调控细胞骨架的动态聚合与解聚。本研究通过RT-PCR克隆并获得了灰飞虱3个冠蛋白coronin 1A、coronin 2B和coronin 7的基因CDS区。系统进化树分析显示,这3个冠蛋白分别属于3个分支,且与褐飞虱Nilaparvata lugens的3个冠蛋白同源性最高,氨基酸序列相似性分别为99.2%、88.2%和82.5%。荧光定量PCR检测结果显示,coronin 1A在成虫中的转录水平显著高于2龄、4龄若虫,coronin 2B在雄虫中的转录水平显著高于2龄、4龄若虫和雌虫,coronin 7在雌虫中的转录水平显著高于2龄、4龄若虫和雄虫。而3个冠蛋白基因在唾液腺中的转录水平都显著高于肠道。灰飞虱携带水稻条纹病毒(rice stripe tenuivirus,RSV)后体内3个冠蛋白基因的转录水平显著高于对照,说明冠蛋白可能在灰飞虱传播RSV过程中发挥一定作用,研究结果为深入探究冠蛋白的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 灰飞虱 水稻条纹病毒 冠蛋白 转录水平
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小檗碱消除ESBLs大肠杆菌耐药性的研究
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作者 左丽 旷年玲 +3 位作者 王芝超 张永英 石玉祥 王风申 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第1期54-58,共5页
为了研究小檗碱消除超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠杆菌耐药性的效果,试验以3株ESBLs大肠杆菌作为研究对象,采用二倍稀释法测定小檗碱作用3株ESBLs大肠杆菌前后的MIC变化,然后采用琼脂糖凝胶电泳、ELISA法和实时荧光定量PCR方法分别检测... 为了研究小檗碱消除超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠杆菌耐药性的效果,试验以3株ESBLs大肠杆菌作为研究对象,采用二倍稀释法测定小檗碱作用3株ESBLs大肠杆菌前后的MIC变化,然后采用琼脂糖凝胶电泳、ELISA法和实时荧光定量PCR方法分别检测小檗碱作用后大肠杆菌R质粒、ESBLs活性、生物被膜形成及外排系统AcrA mRNA、AcrB mRNA转录水平的变化。结果表明:3株ESBLs大肠杆菌对小檗碱的MIC均为2.00 mg/mL;经小檗碱作用后有2株ESBLs大肠杆菌对头孢噻肟的MIC从32.00 mg/mL降至8.00 mg/mL,有1株ESBLs大肠杆菌对头孢噻肟的MIC从32.00 mg/mL降至16.00 mg/mL。经小檗碱作用后有2株ESBLs大肠杆菌质粒条带消失2条,有1株ESBLs大肠杆菌质粒条带消失1条;3株ESBLs大肠杆菌的ESBLs活性均极显著降低(P<0.01),碱性磷酸酶活性均极显著升高(P<0.01);3株ESBLs大肠杆菌外排系统AcrA mRNA转录水平极显著降低(P<0.01),2株ESBLs大肠杆菌外排系统AcrB mRNA转录水平显著降低(P<0.05)。说明小檗碱对ESBLs大肠杆菌的4种耐药消除机制均具有良好的效果。 展开更多
关键词 小檗碱 超广谱β-内酰胺酶大肠杆菌 消除耐药性 耐药机制 基因转录水平
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CO_(2)驱动的海水酸化对菲律宾蛤仔组织、免疫和抗氧化酶活及转录水平的影响
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作者 林毅 陈强 +2 位作者 周思顺 孔鲁闽 黄张帆 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期88-100,共13页
随着CO_(2)的大量排放,海洋酸化效应不断加重,为探究未来海水酸化情况对菲律宾蛤仔产生的影响,设置对照组(pH为8.1)和酸化组(pH为7.7、7.1和6.4),研究周期为42 d,测定菲律宾蛤仔在酸化条件下组织结构、免疫和抗氧化酶活性的变化情况,以... 随着CO_(2)的大量排放,海洋酸化效应不断加重,为探究未来海水酸化情况对菲律宾蛤仔产生的影响,设置对照组(pH为8.1)和酸化组(pH为7.7、7.1和6.4),研究周期为42 d,测定菲律宾蛤仔在酸化条件下组织结构、免疫和抗氧化酶活性的变化情况,以及在分子水平上产生的影响。结果表明:菲律宾蛤仔置于酸化海水环境中,鳃丝间距随pH的降低而扩大,鳃丝纤毛黏合,水管和外套膜外表皮褶皱逐渐加深;鳃组织中酸性磷酸酶(ACP)和超氧化物歧化酶(SOD)活性变化情况为先降后升,碱性磷酸酶(AKP)活性各组变化趋势不同,总抗氧化能力(T-AOC)、过氧化氢酶(CAT)和溶菌酶(LZM)活性趋势为先升后降;鳃和内脏团谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性变化规律皆为持续上升;内脏团组织中LZM活性变化趋势各不相同,ACP活性变动趋势为先降后升,AKP、SOD和CAT活性变化规律为先升后降,T-AOC趋势为持续下降;通过转录组的分析得到,鳃组织GO功能主要富集在DNA整合、膜的组成部分和RNA定向DNA聚合酶活性等条目中,KEGG通路主要富集在吞噬体和与蛋白合成的相关通路中。海水酸化使菲律宾蛤仔组织呈现不同程度的损伤,破坏其内环境稳态,改变其代谢水平和与免疫相关基因表达,引发菲律宾蛤仔染病乃至死亡的风险上升。 展开更多
关键词 二氧化碳 菲律宾蛤仔 免疫 抗氧化 转录水平
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甘蓝型油菜苗期响应渍害胁迫的生理调控机制 被引量:1
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作者 周香玉 徐劲松 +2 位作者 谢伶俐 许本波 张学昆 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1015-1029,共15页
长江流域是中国油菜主产区,该区域常年湿润多雨,且产区实行油菜-水稻轮作制度,导致渍害频发。为明确甘蓝型油菜(Brassica napus L.)对苗期渍害的响应机制,本研究采用盆栽试验,以强耐渍品系YZ12、中等耐渍品系YZ45和不耐渍品系YZ59为试... 长江流域是中国油菜主产区,该区域常年湿润多雨,且产区实行油菜-水稻轮作制度,导致渍害频发。为明确甘蓝型油菜(Brassica napus L.)对苗期渍害的响应机制,本研究采用盆栽试验,以强耐渍品系YZ12、中等耐渍品系YZ45和不耐渍品系YZ59为试验材料,研究苗期淹水对油菜表型性状、生理特性、光合作用、相关基因相对转录水平等的影响,同时分析了外源激素抑制剂对油菜渍害胁迫的影响。结果表明,淹水胁迫严重抑制油菜生长,根系活力可作为衡量淹水胁迫对油菜生长影响的指示指标。根细胞超微结构观察发现,淹水胁迫导致油菜根系细胞发生质壁分离及细胞器破碎解体,强、中耐渍油菜的细胞器受损程度较小,能够在淹水胁迫中维持较为正常的细胞形态;淹水胁迫下根部细胞骨架相关基因Bnamicrotubule1.A3、Bnatubulin-α2.C3、Bnatubulin-β7.C6、Bnalamin-like.A2相对转录水平显著下调至对照水平(CK)的0.2~0.5倍;无氧呼吸相关基因BnaPDC.C9、BnaLDH.A1、BnaADH.A7表达量显著升高,为CK的3~6倍,且在中、强耐渍油菜中诱导表达水平更高。过氧化物酶(peroxidase,POD)、超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性随淹水时间延长呈先升后降趋势,过氧化氢酶(catalase,CAT)活性和丙二醛(malondialdehyde,MDA)含量呈升高趋势,其中强耐渍品系抗氧化酶活性相对较高,而MDA增幅较小。淹水胁迫严重影响油菜叶片光合效率及叶绿素含量,导致油菜叶绿素含量、光合速率、气孔导度和蒸腾速率显著下降,胞间CO_(2)浓度显著升高,且不耐渍品系变化幅度相对较大。淹水胁迫导致油菜乙烯(ethylene,ET)和脱落酸(abscisic acid,ABA)含量显著升高,其中强耐渍品系ET含量较高,不耐渍品系ABA含量较高;强耐渍品系的ET信号相关基因BnaACO1.C8、BnaERF73.C6相对转录水平显著上调,不耐渍品系ABA合成相关基因BnaZEP.A7相对转录水平上调。外源喷施激素抑制剂可改善淹水胁迫对油菜的伤害,但不同外源激素抑制剂效果差异明显。综上,不同耐渍性甘蓝型油菜苗期对淹水胁迫响应在表型、生理代谢、光合、激素和基因转录水平存在差异。甘蓝型油菜通过调控细胞骨架、无氧呼吸、激素代谢相关基因的相对转录水平,引起植株内抗氧化酶活性、激素水平、光合效率、根部超微结构及根系活力改变,进而响应淹水胁迫。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 淹水胁迫 根系超微结构 光合特性 抗氧化酶活性 激素水平 转录调控
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番茄SlDOGL4转录因子基因的克隆和表达分析
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作者 王祎祎 范冰丽 +4 位作者 李营 王改雪 薛东齐 李艳 高艳娜 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2024年第8期24-33,共10页
为了明确SlDOGL4基因在番茄中的耐盐作用,以栽培番茄Ailsa Craig为试验材料,克隆该基因并通过生物信息学方法分析其理化性质和表达特性。结果表明,SlDOGL4基因CDS全长660 bp,编码219个氨基酸;保守结构域分析结果表明,该基因仅含有1个DOG... 为了明确SlDOGL4基因在番茄中的耐盐作用,以栽培番茄Ailsa Craig为试验材料,克隆该基因并通过生物信息学方法分析其理化性质和表达特性。结果表明,SlDOGL4基因CDS全长660 bp,编码219个氨基酸;保守结构域分析结果表明,该基因仅含有1个DOG1结构域,属于bzip转录因子中的DOG1家族成员;系统进化关系表明,SlDOGL4与马铃薯的StDOGL4蛋白亲缘关系较近。组织表达谱结果表明,SlDOGL4基因主要在根和破色期果实中表达。亚细胞定位结果表明,SlDOGL4蛋白定位于细胞核。SlDOGL4基因启动子上有多种与非生物胁迫和激素响应相关的顺式元件。构建ProSlDOGL4::GUS融合表达载体,遗传转化番茄检测启动子活性,GUS组织化学染色结果表明,SlDOGL4在根、茎、生长点、种子等组织中都有表达,表明该基因在番茄整个生长发育过程中发挥重要作用。通过公共数据库中转录组数据分析表明,SlDOGL4基因的表达受到盐、干旱、冷和热胁迫不同程度的诱导。为了进一步验证SlDOGL4基因的功能,在盐处理后,SlDOGL4基因的转录水平呈先升高后降低的趋势,且在盐处理2 h后达到最高转录水平。研究结果为探索SlDOGL4基因在番茄耐盐中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄 SlDOGL4 非生物胁迫 亚细胞定位 转录水平
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转录因子POU2F2通过激活Sestrin2对缺血性脑卒中后癫痫铁死亡的保护作用及机制
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作者 于文琪 艾长思 +1 位作者 宋博 李晓雪 《河北医药》 CAS 2024年第19期2885-2891,共7页
目的 探讨敲减POU转录因子家族2级同源框2(POU2F2)对缺血性脑卒中后癫痫(PISE)的影响及机制。方法 利用生物信息学方法预测并分析POU2F2和Sestrin2(Sesn2)启动子结合位点;雄性Wistar大鼠随机分为Sham组、PISE组、PISE+LV-shNC组和PISE+L... 目的 探讨敲减POU转录因子家族2级同源框2(POU2F2)对缺血性脑卒中后癫痫(PISE)的影响及机制。方法 利用生物信息学方法预测并分析POU2F2和Sestrin2(Sesn2)启动子结合位点;雄性Wistar大鼠随机分为Sham组、PISE组、PISE+LV-shNC组和PISE+LV-shPOU2F2组,四血管闭塞(4-VO)法建立PISE模型;健康大鼠大脑皮层中分离原代神经元,无镁处理法构建体外细胞PISE模型,随机分为对照组、PISE组、PISE+shNC组、PISE+shPOU2F2组和PISE+shPOU2F2+Sesn2组。qRT-PCR检测POU2F2和Sesn2 mRNA表达;Western blot检测POU2F2、Sesn2和GPX4蛋白表达;试剂盒检测活性氧(ROS)、脂质ROS、超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)、谷胱甘肽(GSH)和乳酸脱氢酶(LDH)水平;双荧光素酶报告基因和染色质免疫共沉淀(ChIP)检测POU2F2对Sesn2启动子转录活性的影响。结果 JASPAR转录因子预测结果显示Sesn2启动子区与转录因子POU2F2存在结合位点。qRT-PCR和Western blot结果显示,与对照组比较,PISE组大鼠和原代皮层神经元POU2F2和Sesn2 mRNA和蛋白均表达增多(P<0.05);与PISE+shNC组比较,PISE+shPOU2F2组大鼠和神经元POU2F2和Sesn2 mRNA和蛋白均表达降低(P<0.05)。与对照组比较,PISE组大鼠脑组织ROS产生、原代皮层神经元脂质ROS积累、LDH活性和MDA含量显著增加,GSH含量和GPX4蛋白表达明显降低(P<0.05);与PISE+shNC组比较,沉默POU2F2可进一步增加大鼠脑组织ROS产生和原代皮层神经元脂质ROS积累、LDH活性和MDA含量,降低GSH含量和GPX4蛋白表达(P<0.05)。双荧光素酶报告基因技术和ChIP实验证实POU2F2可调控Sesn2启动子的活性。过表达Sesn2后,PISE+shPOU2F2+Sesn2组较PISE+shPOU2F2组神经元脂质ROS积累、LDH活性和MDA含量降低,GSH活性增加(P<0.05)。结论 PISE可诱导POU2F2和Sesn2的代偿性增加,抑制POU2F2可通过降低Sesn2表达促进铁死亡而加剧PISE,这为PISE的治疗机制提供了新的视角。 展开更多
关键词 POU2F2 缺血性脑卒中后癫痫 Sestrin2 铁死亡
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Diurnal Changes in the Transcription Profiles of Genes Encoding Starch Synthesis-related Enzymes in Wheat Grains under Field Conditions
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作者 Lina WANG Qiaoxia HAN +2 位作者 Xianghong XIAO Tiancai GUO Guozhang KANG 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2017年第4期565-569,574,共6页
[Objective] During the filling stage of plant growth and development, storage starch is diurnally synthesized and accumulated in the grains from cereal crops, but the underlying molecular mechanism is unclear. [Method... [Objective] During the filling stage of plant growth and development, storage starch is diurnally synthesized and accumulated in the grains from cereal crops, but the underlying molecular mechanism is unclear. [Method] In this study, grains from the bread wheat cultivar Zhoumai 18 grown in fields were harvested at 15 d after anthesis, and quantitative real-time reverse transcription polymerase chain reaction(qPCR) was used to measure the transcriptional levels of 26 genes encoding starch synthesis-related enzymes at 2 h intervals throughout a diurnal cycle. [Result] Our findings indicated that storage starch was persistently synthesized in wheat grains throughout a 24 h period. The diurnal patterns of the transcriptional levels of 26 genes in wheat grains were classified into two groups. The 13 genes in Group 1 were temporally and highly expressed in wheat grains,and their encoded proteins could play crucial roles in starch synthesis. The other 13 genes in Group 2 were characterized by low or no transcription in wheat grains throughout a diurnal cycle, suggesting their function in the synthesis or degradation of transitory starches in wheat grains. [Conclusion] These results provide information on the molecular mechanism of storage starch synthesis in higher plants. 展开更多
关键词 Diurnal change Gene expression Starch synthesis transcriptional level Triticum aestivum L.
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细粒棘球绦虫泛素结合酶基因家族的生物信息学及表达分析 被引量:1
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作者 杜小迪 侯巍 +5 位作者 苏中华 马青梅 何雪 华瑞其 阳爱国 杨光友 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期2605-2618,共14页
本研究对细粒棘球绦虫泛素结合酶(EgE2s)基因家族进行鉴定、生物信息学分析以及检测其在不同发育阶段的转录水平,为其功能研究和构建优势抗原表位疫苗奠定基础。本研究基于数据库中细粒棘球绦虫基因组学信息,对EgE2s基因家族进行T-A克... 本研究对细粒棘球绦虫泛素结合酶(EgE2s)基因家族进行鉴定、生物信息学分析以及检测其在不同发育阶段的转录水平,为其功能研究和构建优势抗原表位疫苗奠定基础。本研究基于数据库中细粒棘球绦虫基因组学信息,对EgE2s基因家族进行T-A克隆、生物信息学分析以及采用qRT-PCR法检测了这些基因在原头蚴(Protoscolex, PSCs)和28日龄童虫中的转录水平。结果成功克隆并测序19个EgE2s基因,更正了两个原序列有误的EgE2s,分别为EgE2L3(登录号:MZ277618);EgE2J1(登录号:MZ277619)。三级结构和保守基序预测结果表明EgE2s高度保守。qRT-PCR结果显示,EgE2s的转录水平在PSCs和28日龄童虫中存在差异,其中EgE2A(P<0.001)、EgE2J1(P<0.01)在PSCs阶段高表达。B细胞抗原表位预测表明EgE2N的139-157区域位于EgE2s保守基序外。同时,T细胞抗原表位预测表明EgE2N与人和犬MHCⅠ类分子各有两个强结合位点,且有一个共同的抗原表位位点104-113。综上,EgE2A和EgE2J1可能在PSCs的生长发育中起重要作用。EgE2N的139-157和104-113区域可能是药物研究和疫苗开发的靶序列。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 泛素结合酶基因家族 生物信息学 转录水平分析
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GPR50在小鼠卵母细胞体外成熟进程中的表达及亚细胞定位
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作者 王甜 黄显朋 +4 位作者 朱洪阳 吉文汇 付伟 殷实 兰道亮 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2023年第3期245-254,共10页
旨在探究GPR50在小鼠卵母细胞体外成熟进程中的表达规律及亚细胞定位.通过卵母细胞体外培养技术、qPCR技术及免疫荧光技术测定GPR50在小鼠不同时期卵母细胞的转录水平及亚细胞定位.结果表明,所建立的qPCR方法敏感性高、特异性强、重复... 旨在探究GPR50在小鼠卵母细胞体外成熟进程中的表达规律及亚细胞定位.通过卵母细胞体外培养技术、qPCR技术及免疫荧光技术测定GPR50在小鼠不同时期卵母细胞的转录水平及亚细胞定位.结果表明,所建立的qPCR方法敏感性高、特异性强、重复性好且检测效率高,可用于测定GPR50在小鼠卵母细胞中转录水平的表达;GPR50在不同阶段小鼠卵母细胞中均有表达,生发泡破裂(GVBD)后,GPR50的表达量显著高于GV期(P<0.05);随着卵母细胞的发育,其表达量不断增高,到MII期达到顶峰,极显著高于GV、GVBD及MI期(P<0.01).随着卵母细胞的发育,GPR50大量表达于细胞质和细胞膜,但在成熟卵母细胞中,GPR50主要集中分布于细胞膜.以上结果说明,GPR50在小鼠卵母细胞体外成熟中发挥重要的作用,为解析GPR50在哺乳动物卵母细胞体外成熟进程的分子机制奠定了基础. 展开更多
关键词 GPR50 小鼠卵母细胞 体外成熟 转录水平表达 亚细胞定位
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白三叶类黄酮合成基因TrCHI的克隆及转录分析
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作者 张婷婷 刘洋 +1 位作者 张鹤山 许本波 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期2547-2555,共9页
为研究白三叶类黄酮合成途径的关键基因TrCHI在白三叶(Trifolium repens)花色形成中的作用,以白三叶野生型和红花突变体为材料,通过同源克隆得到TrCHI基因并进行转录分析和CHI酶活性测定。结果表明,白三叶野生型TrCHI基因开放阅读框长66... 为研究白三叶类黄酮合成途径的关键基因TrCHI在白三叶(Trifolium repens)花色形成中的作用,以白三叶野生型和红花突变体为材料,通过同源克隆得到TrCHI基因并进行转录分析和CHI酶活性测定。结果表明,白三叶野生型TrCHI基因开放阅读框长660 bp,编码219个氨基酸,其红花突变体TrCHI开放阅读框长度为669 bp,编码222个氨基酸。7处氨基酸突变包括:第13号位的谷氨酸突变成天冬氨酸,第75号位的谷氨酸突变成谷氨酰胺,第154号位的丝氨酸突变成苏氨酸,第218号位的赖氨酸突变成精氨酸,并在末尾增加了甘氨酸、蛋氨酸和赖氨酸。进化分析发现,CHI基因进化具有物种保守性,Tr CHI属于Ⅱ型CHI。花瓣、根和叶柄中,红花突变体TrCHI转录水平显著高于野生型;但在茎、叶和花梗中,红花突变体TrCHI基因转录水平低于野生型。突变体花瓣中CHI酶活性极显著高于野生型(P<0.001)。推测白三叶突变体的红花表型与TrCHI基因突变并对白三叶中的类黄酮化合物的合成调控有关。本研究为进一步研究TrCHI在白三叶上的潜在功能提供了一定的价值。 展开更多
关键词 基因克隆 同义突变 错义突变 开放阅读框 进化分析 转录水平 CHI酶活性分析
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Hhcy对急性心肌梗死患者IL-6/STAT3信号通路与炎症因子水平的影响 被引量:3
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作者 姜延昌 韩涛 +2 位作者 杨宏臻 李永光 崔磊 《临床和实验医学杂志》 2023年第2期116-119,共4页
目的探讨高同型半胱氨酸血症(Hhcy)对急性心肌梗死患者白细胞介素-6/信号转导与转录激活因子3(IL-6/STAT3)信号通路与炎症因子水平的影响。方法回顾性分析2020年1月至2022年3月在烟台业达医院住院治疗的80例急性心肌梗死患者临床资料,... 目的探讨高同型半胱氨酸血症(Hhcy)对急性心肌梗死患者白细胞介素-6/信号转导与转录激活因子3(IL-6/STAT3)信号通路与炎症因子水平的影响。方法回顾性分析2020年1月至2022年3月在烟台业达医院住院治疗的80例急性心肌梗死患者临床资料,根据患者是否并发Hhcy,将其分为Hhcy组(n=35)和非Hhcy组(n=45)。比较两组患者基线资料差异,检测并比较两组患者炎症因子包括C反应蛋白(CRP)、肿瘤坏死因子-α(TFN-α)水平,观察IL-6/STAT3信号通路表达差异,采用Pearson相关性检验分析IL-6/STAT3、CRP、IL-6、TFN-α与急性心肌梗死并发Hhcy的关系,受试者工作特征(ROC)曲线评估其对急性心肌梗死患者并发Hhcy的预测价值。结果Hhcy组患者有高血压史、糖尿病史、高血脂史及吸烟史占比均高于非Hhcy组,差异均有统计学意义(P<0.05)。Hhcy组患者血清CRP、TFN-α、IL-6水平及STAT3表达为(18.67±3.69)mg/L、(45.69±8.64)pg/mL、(22.64±5.61)pg/mL、1.69±0.32,均明显高于非Hhcy组[(12.57±2.51)mg/L、(35.97±8.67)pg/mL、(16.52±4.72)pg/mL、1.21±0.28],差异均有统计学意义(P<0.05)。经过ROC分析证实,血清CRP、TFN-α、IL-6及STAT3可用于急性心肌梗死合并Hhcy的预测,曲线下面积分别为0.883、0.802、0.866、0.831,预测价值好(P<0.05)。血清CRP、TFN-α、IL-6水平及STAT3表达与急性心肌梗死患者Hcy水平呈正相关(r=0.531、0.529、0.527、0.632,P<0.05)。结论Hhcy与急性心肌梗死患者体内的IL-6/STAT3信号通路表达与炎症因子水平变化关系密切,当急性心肌梗死患者合并Hhcy时,会导致IL-6/STAT3信号通路表达上调,体内炎症因子水平升高。 展开更多
关键词 高同型半胱氨酸血症 急性心肌梗死 白细胞介素-6/信号转导与转录激活因子3 炎症因子
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过量表达CHO细胞内源性糖基化酶对抗体五聚甘露糖修饰的影响
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作者 徐静 余垚 Tan Kee Wee 《中国医药生物技术》 2023年第4期319-327,共9页
目的研究CHO K1细胞内源性糖基化酶对细胞的生长代谢以及抗体中五聚甘露糖(Man5)水平的影响。方法构建含有抗体基因、糖基化酶基因共转染的CHO K1稳定细胞株以及空载细胞株,检测细胞群和克隆阶段的抗体滴度、Man5水平,使用RT-qPCR的方... 目的研究CHO K1细胞内源性糖基化酶对细胞的生长代谢以及抗体中五聚甘露糖(Man5)水平的影响。方法构建含有抗体基因、糖基化酶基因共转染的CHO K1稳定细胞株以及空载细胞株,检测细胞群和克隆阶段的抗体滴度、Man5水平,使用RT-qPCR的方法检测过表达基因的转录水平,并分析单克隆细胞基因转录水平与Man5含量的相关性。结果研究显示,过表达糖基化酶基因后对细胞生长代谢的影响相对较小,糖基化酶基因单独过表达对降低蛋白中的Man5含量没有效果。将基因Man2a2和Mgat2组合过表达之后,可以将Man5的水平降低70%~80%,两个基因的转录水平都较高的情况下对降低Man5含量可以起到更加显著的作用。结论糖基化酶基因Man2a2和Mgat2组合过表达可以显著降低抗体蛋白中的Man5水平。 展开更多
关键词 CHO K1细胞 基因过表达 五聚甘露糖 转录水平
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PKM2和ALDOA在胃癌中的表达与病理特征的相关性
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作者 周淑萍 盛晓曼 《安徽理工大学学报(自然科学版)》 CAS 2023年第4期103-108,共6页
目的 检测M2型丙酮酸激酶(PKM2)和醛缩酶A(ALDOA)在胃癌组织中的表达,分析胃癌组织中PKM2和ALDOA的表达水平与其病理特征之间的关系。方法 应用免疫组织化学法检测30例胃癌组织中的PKM2和ALDOA的表达水平,并与临床病理特征的关系进行相... 目的 检测M2型丙酮酸激酶(PKM2)和醛缩酶A(ALDOA)在胃癌组织中的表达,分析胃癌组织中PKM2和ALDOA的表达水平与其病理特征之间的关系。方法 应用免疫组织化学法检测30例胃癌组织中的PKM2和ALDOA的表达水平,并与临床病理特征的关系进行相关性分析。结果 免疫组化显示,PKM2在胃癌组织中的高表达率为57%,ALDOA的高表达率为60%;在浸润深度T_(1)~T_(2)胃癌组织中的PKM2高表达率低于T_(3)~T_(4)组,在Ⅰ~Ⅱ期中的高表达率低于Ⅲ~Ⅳ期胃癌,低分化组低于高分化组(P<0.05);ALDOA的高表达率在浸润深度为T_(1)~T_(2)的胃癌组织中低于T_(3)~T_(4)组,在低分化组中低于高分化组(P<0.05);但胃癌组织中PKM2和ALDOA的表达与患者的性别、年龄、肿瘤大小、有无淋巴转移和有无神经、血管侵犯等因素无明显关联(P>0.05)。结论 PKM2和ALDOA在胃癌组织中的高表达与胃癌的发生发展相关,或许会成为胃癌新的治疗靶点和诊断指标。 展开更多
关键词 胃癌 丙酮酸激酶M2 醛缩酶A 免疫组织化学
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