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基于生物信息学分析TGFBI基因在头颈部鳞癌中的表达及其预后意义
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作者 胡婷 卢诗丽 +4 位作者 李钰颖 刘洁兰 侯沅林 莫丽梅 唐玉莲 《右江医学》 2023年第2期102-108,共7页
目的探讨转化生长因子β诱导基因(transforming growth factorβ-induced gene,TGFBI)在头颈部鳞癌(head and neck squamous carcinoma,HNSC)中的表达及其预后意义。方法首先通过TIMER2.0数据库分析TGFBI基因在泛癌中的表达水平;并进一... 目的探讨转化生长因子β诱导基因(transforming growth factorβ-induced gene,TGFBI)在头颈部鳞癌(head and neck squamous carcinoma,HNSC)中的表达及其预后意义。方法首先通过TIMER2.0数据库分析TGFBI基因在泛癌中的表达水平;并进一步利用UALCAN数据库和GEPIA数据库检索TGFBI基因在HNSC与正常组织中的表达水平,以及TGFBI基因与患者种族、年龄、性别、肿瘤分期、淋巴结转移状况等相关临床特征的关系;通过STRING数据库分析TGFBI基因的互作蛋白,借助DAVID数据库对其与互作蛋白基因进行功能富集分析;最后通过GEPIA数据库分析TGFBI基因在HNSC中的生存意义。结果发现TGFBI在HNSC中的表达明显高于正常组织(P<0.05),TGFBI高表达的患者总生存期明显低于低表达的患者(P<0.05)。蛋白互作分析发现,FN1、MMP14、ITGA3、ITGAM、ITGAV、ITGB1、ITGB2、ITGB3、TGIF2和TGIF2LX这10个蛋白基因与TGFBI存在紧密联系,此外,TGFBI及相关基因功能富集分析显示它们主要参与了5个生物学程序、4个细胞组分、3个分子功能、4个信号通路。结论TGFBI在HNSC中的表达水平较正常组织明显升高,且与患者预后不良有关,有望成为HNSC诊断和治疗的生物学靶点。 展开更多
关键词 转化生长因子β诱导基因 头颈部鳞癌 生物信息学 预后
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海南省糖尿病视网膜病变患者TGFBI基因突变情况分析
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作者 唐平 王玲 +2 位作者 陈执 吕博琦 李蒙恩 《海南医学》 CAS 2019年第16期2117-2120,共4页
目的调查分析转化生长因子β诱导基因(TGFBI)基因突变在海南省糖尿病视网膜病变患者中的发生情况。方法选择2013年8月至2018年2月在海南医学院第一附属医院眼科就诊的海南省糖尿病视网膜病变患者78例作为观察组,同期选择本省非糖尿病视... 目的调查分析转化生长因子β诱导基因(TGFBI)基因突变在海南省糖尿病视网膜病变患者中的发生情况。方法选择2013年8月至2018年2月在海南医学院第一附属医院眼科就诊的海南省糖尿病视网膜病变患者78例作为观察组,同期选择本省非糖尿病视网膜病变患者68例作为对照组,两组患者均进行全血组织TGFBI基因突变检测,记录患者的临床特征并进行相关性分析。结果观察组患者的TGFBI基因突变率为10.25%,明显高于对照组的1.47%,差异有统计学意义(P<0.05);8例TGFBI基因突变患者中,-51G>A 3例,-26A>G 3例,310G>A 1例,895G>T 1例;Pearson相关分析结果显示,海南省糖尿病视网膜病变患者的TGFBI基因突变与最佳矫正视力、视网膜厚度、眼压均呈正相关性(P<0.05)。结论TGFBI基因突变在海南省糖尿病视网膜病变患者中比较常见,与患者的临床特征显著相关。 展开更多
关键词 海南省 转化生长因子β诱导基因 基因突变 糖尿病视网膜病变
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转化生长因子β诱导的基因抑制恶性间皮瘤细胞增殖的体外研究 被引量:3
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作者 曹艳梅 张鹤美 +5 位作者 高四海 贺金奖 童建 张增利 Tom K Hei 李冰燕 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1123-1127,共5页
目的研究转化生长因子β诱导的基因(transforming growth factor-βinduced gene,TGFBI)在体外是否能抑制恶性间皮瘤细胞NCI-H28的增殖。方法将外源性TGFBI稳定性转染到恶性间皮瘤细胞NCI-H28中,绘制生长曲线图,测定其细胞增殖、接种效... 目的研究转化生长因子β诱导的基因(transforming growth factor-βinduced gene,TGFBI)在体外是否能抑制恶性间皮瘤细胞NCI-H28的增殖。方法将外源性TGFBI稳定性转染到恶性间皮瘤细胞NCI-H28中,绘制生长曲线图,测定其细胞增殖、接种效率和软琼脂克隆形成,并进行细胞周期的分析。结果外源性TGFBI在恶性间皮瘤细胞NCI-H28中能够稳定地高表达;当外源性的TGFBI转入到肿瘤细胞NCI-H28后,TGFBI高表达的细胞倍增时间增加了4.38倍;与转染空载体的肿瘤细胞相比:NCI-H28的相对接种效率降低了69.68%,外源性TGFBI表达的T28细胞形成了较小的软琼脂克隆;TGFBI可以使肿瘤细胞阻滞在G1期,并延缓肿瘤细胞进入S期的时间。结论 TGFBI可以抑制恶性间皮瘤细胞的体外增殖。 展开更多
关键词 tgfbi 恶性间皮瘤细胞 细胞增殖
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Pathogenic mutations of TGFBI and CHST6 genes in Chinese patients with Avellino,lattice,and macular corneal dystrophies 被引量:2
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作者 Ya-nan HUO Yu-feng YAO Ping YU 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2011年第9期687-693,共7页
Objective:To investigate gene mutations associated with three different types of corneal dystrophies(CDs),and to establish a phenotype-genotype correlation.Methods:Two patients with Avellino corneal dystrophy(ACD),fou... Objective:To investigate gene mutations associated with three different types of corneal dystrophies(CDs),and to establish a phenotype-genotype correlation.Methods:Two patients with Avellino corneal dystrophy(ACD),four patients with lattice corneal dystrophy type I(LCD I) from one family,and three patients with macular corneal dystrophy type I(MCD I) were subjected to both clinical and genetic examinations.Slit lamp examination was performed for all the subjects to assess their corneal phenotypes.Genomic DNA was extracted from peripheral blood leukocytes.The coding regions of the human transforming growth factor β-induced(TGFBI) gene and carbohydrate sulfotransferase 6(CHST6) gene were amplified by polymerase chain reaction(PCR) and subjected to direct sequencing.DNA samples from 50 healthy volunteers were used as controls.Results:Clinical examination showed three different phenotypes of CDs.Genetic examination identified that two ACD subjects were associated with homozygous R124H mutation of TGFBI,and four LCD I subjects were all associated with R124C heterozygous mutation.One MCD I subject was associated with a novel S51X homozygous mutation in CHST6,while the other two MCD I subjects harbored a previously reported W232X homozygous mutation.Conclusions:Our study highlights the prevalence of codon 124 mutations in the TGFBI gene among the Chinese ACD and LCD I patients.Moreover,we found a novel mutation among MCD I patients. 展开更多
关键词 transforming growth factor-β-induced(tgfbi gene Carbohydrate sulfotransferase 6(CHST6) gene Corneal dystrophy Mutation
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TGFBI启动子高甲基化在肿瘤中的研究进展 被引量:2
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作者 邓伟 芦永福 王学红 《中国肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期514-520,共7页
转化生长因子β诱导基因(transforming growth factor β induced gene,TGFBI)在不同肿瘤中有着启动或者抑制肿瘤的作用。抑癌基因启动子高甲基化导致基因沉默,这是许多肿瘤发生发展的早期事件并影响着肿瘤的治疗及预后。该文主要从TG... 转化生长因子β诱导基因(transforming growth factor β induced gene,TGFBI)在不同肿瘤中有着启动或者抑制肿瘤的作用。抑癌基因启动子高甲基化导致基因沉默,这是许多肿瘤发生发展的早期事件并影响着肿瘤的治疗及预后。该文主要从TGFBI作为抑癌基因角度,阐述其启动子高甲基化在相关肿瘤中的研究进展,以期为肿瘤早期诊断、治疗及预后提供思路。 展开更多
关键词 转化生长因子β诱导基因(tgfbi) 启动子 抑癌基因 DNA甲基化 肿瘤
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