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西藏地区膀胱尿路上皮癌患者GATA-3和H3K27me3的表达及其临床意义
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作者 尼玛卓玛 肖雨 +6 位作者 罗含欢 多布啦 王寒 达珍 斯朗江村 郭平平 廖瑞倩 《协和医学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第4期953-959,共7页
目的探讨西藏地区膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BUC)患者膀胱组织中GATA-3和H3K27me3的表达及其临床意义。方法回顾性收集西藏自治区人民医院2016年1月—2021年12月间行膀胱癌手术的BUC患者的临床资料及其病理组织,以... 目的探讨西藏地区膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BUC)患者膀胱组织中GATA-3和H3K27me3的表达及其临床意义。方法回顾性收集西藏自治区人民医院2016年1月—2021年12月间行膀胱癌手术的BUC患者的临床资料及其病理组织,以经尿道膀胱黏膜活检术获取的正常膀胱组织作为对照,采用免疫组化染色方法检测BUC和正常膀胱组织中GATA-3和H3K27me3的表达水平,同时结合临床病理特征分析GATA-3和H3K27me3在藏族BUC患者中的表达差异。结果共入选BUC患者70例,其中男性51例,女性19例,平均年龄(60.5±12.0)岁,收集同期正常膀胱组织标本20份,均来自于藏族患者。免疫组化检测结果显示,GATA-3在BUC及正常膀胱组织中高表达率分别为70.0%(49/70)和100%(20/20),GATA-3高表达与男性、病理分级低、组织非浸润相关(P均<0.05);H3K27me3在BUC及正常膀胱组织中高表达率分别为45.7%(32/70)和20.0%(4/20),H3K27me3高表达仅与男性相关(P=0.011)。结论GATA-3在西藏地区BUC患者膀胱组织中表达下调,且随着肿瘤级别的升高表达显著下调,提示GATA-3可能参与BUC发生、发展并与其恶性程度相关,为临床诊疗及判断疾病预后提供了参考。H3K27me3在西藏地区BUC患者膀胱组织中表达上调,提示H3K27me3有望成为诊断BUC的新型免疫标志物。 展开更多
关键词 西藏地区 膀胱尿路上皮癌 临床病理特征 GatA-3 h3k27me3
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Genome-wide profiling of histone H3 lysine 27 trimethylation and its modification in response to chilling stress in grapevine leaves 被引量:2
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作者 Zhenfei Zhu Qingyun Li +11 位作者 Duncan Kiragu Gichuki Yujun Hou Yuanshuang Liu Huimin Zhou Chen Xu Linchuan Fang Linzhong Gong Beibei Zheng Wei Duan Peige Fan Qingfeng Wang Haiping Xin 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2023年第3期496-508,共13页
Histone H3 lysine 27 trimethylation(H3K27me3) is a histone modification associated with transcriptional repression. However, insights into the genome-wide pattern of H3K27me3 in grapevines are limited. Here, anti-H3K2... Histone H3 lysine 27 trimethylation(H3K27me3) is a histone modification associated with transcriptional repression. However, insights into the genome-wide pattern of H3K27me3 in grapevines are limited. Here, anti-H3K27 chromatin immunoprecipitation(ChIP), high-throughput sequencing, and transcriptome analysis were performed using leaves of Vitis amurensis. The leaves were treated at 4°C for 2 h and 24 h and used to investigate changes in H3K27me3 under chilling treatment. The results show that H3K27me3 is well-distributed both in gene regions(-50%) and in the intergenic region(-50%) in the grapevine genome(Vitis vinifera ‘Pinot Noir PN40024'). H3K27me3 was found to be localized in8 368 annotated gene regions in all detected samples(leaves at normal temperature and under chilling treatments) and mainly enriched in gene bodies with the adjacent promoter and downstream areas. The short-term chilling treatments(4°C for 2 h) induced 2 793 gains and 305losses in H3K27me3 modification. Subsequently, 97.3% of the alterations were restored to original levels after 24 h treatment. The ChIP-qPCR for five differential peaks showed similar results to the data for ChIP-seq, indicating that the chilling-induced H3K27me3 modification is reliable.Integrative analysis of transcriptome and ChIP-seq results showed that the expression of H3K27me3 target genes was significantly lower than those of non-target genes, indicating transcriptional repression of H3K27me3 in grapevine leaves. Furthermore, histone methylation alterations were detected in 82 genes and were related to either repression or activation of their expression during chilling stress. The findings provide the genome-wide H3K27me3 patterns in grapevines and shed light on uncovering its regulation in chilling stress responses. 展开更多
关键词 Vitis amurensis histone modification h3k27me3 Chilling stress
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Histone H3K27me3 methylation regulates the expression of secreted proteins distributed at fast-evolving regions through transcriptional repression of transposable elements 被引量:1
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作者 XIE Jia-hui TANG Wei +4 位作者 LU Guo-dong HONG Yong-he ZHONG Zhen-hui WANG Zong-hua ZHENG Hua-kun 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2023年第10期3059-3068,共10页
The fine-tuned expression dynamics of the effector genes are pivotal for the transition from vegetative growth to host colonization of pathogenic filamentous fungi.However,mechanisms underlying the dynamic regulation ... The fine-tuned expression dynamics of the effector genes are pivotal for the transition from vegetative growth to host colonization of pathogenic filamentous fungi.However,mechanisms underlying the dynamic regulation of these genes remain largely unknown.Here,through comparative transcriptome and chromatin immunoprecipitation sequencing(ChIP-seq)analyses of the methyltransferase PoKmt6 in rice blast fungus Pyricularia oryzae(syn.Magnaporthe oryzae),we found that PoKmt6-mediated H3K27me3 deposition was enriched mainly at fast-evolving regions and contributed to the silencing of a subset of secreted proteins(SP)and transposable element(TE)families during the vegetative growth of P.oryzae.Intriguingly,we observed that a group of SP genes,which were depleted of H3K27me3 modification,could also be silenced via the H3K27me3-mediated repression of the nearby TEs.In conclusion,our results indicate that H3K27me3 modification mediated by PoKmt6 regulates the expression of some SP genes in fast-evolving regions through the suppression of nearby TEs. 展开更多
关键词 secreted protein transposable elements fast-evolving regions h3k27me3
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Loss of LBP triggers lipid metabolic disorder through H3K27 acetylation-mediated C/EBPβ-SCD activation in non-alcoholic fatty liver disease 被引量:1
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作者 Ya-Ling Zhu Lei-Lei Meng +17 位作者 Jin-Hu Ma Xin Yuan Shu-Wen Chen Xin-Rui Yi Xin-Yu Li Yi Wang Yun-Shu Tang Min Xue Mei-Zi Zhu Jin Peng Xue-Jin Lu Jian-Zhen Huang Zi-Chen Song Chong Wu Ke-Zhong Zheng Qing-Qing Dai Fan Huang Hao-Shu Fang 《Zoological Research》 SCIE CSCD 2024年第1期79-94,共16页
Non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD)is associated with mutations in lipopolysaccharide-binding protein(LBP),but the underlying epigenetic mechanisms remain understudied.Herein,LBP^(-/-)rats with NAFLD were establi... Non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD)is associated with mutations in lipopolysaccharide-binding protein(LBP),but the underlying epigenetic mechanisms remain understudied.Herein,LBP^(-/-)rats with NAFLD were established and used to conduct integrative targetingactive enhancer histone H3 lysine 27 acetylation(H3K27ac)chromatin immunoprecipitation coupled with high-throughput and transcriptomic sequencing analysis to explore the potential epigenetic pathomechanisms of active enhancers of NAFLD exacerbation upon LBP deficiency.Notably,LBP^(-/-)reduced the inflammatory response but markedly aggravated high-fat diet(HFD)-induced NAFLD in rats,with pronounced alterations in the histone acetylome and regulatory transcriptome.In total,1128 differential enhancer-target genes significantly enriched in cholesterol and fatty acid metabolism were identified between wild-type(WT)and LBP^(-/-)NAFLD rats.Based on integrative analysis,CCAAT/enhancer-binding proteinβ(C/EBPβ)was identified as a pivotal transcription factor(TF)and contributor to dysregulated histone acetylome H3K27ac,and the lipid metabolism gene SCD was identified as a downstream effector exacerbating NAFLD.This study not only broadens our understanding of the essential role of LBP in the pathogenesis of NAFLD from an epigenetics perspective but also identifies key TF C/EBPβand functional gene SCD as potential regulators and therapeutic targets. 展开更多
关键词 Non-alcoholic fatty liver disease C/EBPΒ Lipopolysaccharide-binding protein h3K27ac Integrative analysis ENHANCER
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组蛋白H3K27me3沉默子重塑上调胃黏膜高级别上皮内瘤变磷酸甘油醛激酶1表达
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作者 秦苾珺 谭玉婷 +7 位作者 储召乐 刘碧颖 李先锋 王涛 陈东风 崔红娟 吴林育 王斌 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期597-607,共11页
目的 绘制胃黏膜高级别上皮内瘤变(High-Grade Intraepithelial Neoplasia, HGIN)组织的组蛋白H3K27me3沉默子图谱,寻找沉默子调控的重要靶基因。方法 从本院内镜中心收集HGIN与正常胃黏膜组织各24例,采用H3K27me3染色体靶向切割和标签... 目的 绘制胃黏膜高级别上皮内瘤变(High-Grade Intraepithelial Neoplasia, HGIN)组织的组蛋白H3K27me3沉默子图谱,寻找沉默子调控的重要靶基因。方法 从本院内镜中心收集HGIN与正常胃黏膜组织各24例,采用H3K27me3染色体靶向切割和标签化(Cleavage Under Target&Tagmentation, CUT&Tag)测序技术捕获基因组修饰区域。通过生物信息学分析比较两类组织的沉默子信号特征以及差异;整合RNA测序数据及高通量染色体构象捕获技术(Hi-C)公共数据,分析沉默子重塑调控的靶基因及调控的潜在生物学过程。结果 与正常胃黏膜相比,HGIN组织H3K27me3修饰数量减少,信号强度全局性降低,呈现H3K27me3信号峰重塑现象;转录组差异分析结果显示,与正常胃黏膜组织相比,HGIN共有8 887个差异表达基因,其中表达上调基因4 335个,表达下调基因4 552个,其中CTNNB1等肿瘤发生相关基因显著上调;整合分析表观组学和转录组学数据,发现沉默子丢失可能在转录水平上调氨基酸生物合成、精氨酸与脯氨酸代谢和糖酵解等关键代谢基因,如糖酵解关键酶磷酸甘油醛激酶1(phosphoglycerate kinase1,PGK1)表达,进而促进胃黏膜上皮内瘤变。结论 组蛋白H3K27me3沉默子信号丢失是HGIN表观重塑特征之一,沉默子丢失可能与PGK1等糖酵解和氨基酸代谢基因表达紊乱相关。 展开更多
关键词 胃高级别上皮内瘤变 胃癌 组蛋白修饰h3k27me3 沉默子 磷酸甘油醛激酶1
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H3K27me3在恶性外周神经鞘膜瘤中的研究进展
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作者 林香桃 谈顺 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第5期531-535,共5页
恶性外周神经鞘膜瘤(malignant peripheral nerve sheath tumor,MPNST)是一种罕见的源自周围神经的软组织肉瘤,其组织学特征复杂且缺乏特异性免疫组化标志物,是较难诊断的肿瘤之一。组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化(histone 3 trimethylat... 恶性外周神经鞘膜瘤(malignant peripheral nerve sheath tumor,MPNST)是一种罕见的源自周围神经的软组织肉瘤,其组织学特征复杂且缺乏特异性免疫组化标志物,是较难诊断的肿瘤之一。组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化(histone 3 trimethylated on lysine 27,H3K27me3)的修饰是表观遗传中重要的基因沉默标志,参与调节细胞分化与增殖之间的平衡,其异常表达与多种肿瘤密切相关。近年,随着H3K27me3作为MPNST的辅助诊断标志物应用于临床,已有进一步的研究。该文现对H3K27me3在MPNST的发生、发展、诊断与鉴别诊断以及治疗和预后的研究进展进行综述,以期为该领域的深入研究和临床应用提供有益的参考。 展开更多
关键词 恶性外周神经鞘膜瘤 h3k27me3 文献综述
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Peculiarity of transcriptional and H3K27me3 dynamics during peach bud dormancy
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作者 Yalin Zhao Yong Li +6 位作者 Ke Cao Weichao Fang Changwen Chen Xinwei Wang Jinlong Wu Wenwu Guo Lirong Wang 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2024年第1期38-50,共13页
Bud dormancy facilitates the survival of meristems under harsh environmental conditions.To elucidate how molecular responses to chilling accumulation controlling dormancy in peach buds,chromatin immunoprecipitation se... Bud dormancy facilitates the survival of meristems under harsh environmental conditions.To elucidate how molecular responses to chilling accumulation controlling dormancy in peach buds,chromatin immunoprecipitation sequencing to identify the H3K27me3 modifications and RNA sequencing of two peach cultivars with pronounced differences in chilling requirement were carried out,the results showed that genes associated with abscisic acid and gibberellic acid signal pathways play key roles in dormancy regulation.The results demonstrated that peach flower bud differentiation occurred continuously in both cultivars during chilling accumulation,which was correlated with the transcript abundance of key genes involved in phytohormone metabolism and flower bud development under adverse conditions.The more increased strength in high chillingrequirement cultivar along with the chilling accumulation at the genome-wide level.The function of the dormancy-associated MADS-box gene PpDAM6 was identified,which is involved in leaf bud break in peach and flower development in transgenic Nicotiana tabacum(NC89).In addition,PpDAM6 was positively regulated by PpCBF,and the genes of putative dormancy-related and associated with metabolic pathways were proposed.Taken together,these results constituted a theoretical basis for elucidating the regulation of peach bud dormancy transition. 展开更多
关键词 Peach bud DORMANCY RNA-SEQ h3k27me3 Chilling requirement
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LncRNA TERC调控H3K27me3、DKK1在地塞米松干预间充质干细胞成骨细胞分化中的相关研究
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作者 韩锁 齐岩松 +4 位作者 贾鹏 孙官文 王剑 呼和 高锦 《生物骨科材料与临床研究》 CAS 2024年第4期67-72,77,共7页
目的 研究地塞米松干预骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stem cells, BMSCs)成骨分化后,过表达LncRNA TERC对组蛋白H3K27三甲基化(H3K27me3)及DKK1表达的影响,从而进一步验证其对成骨分化的作用。方法 (1)地塞米松干预BMSCs... 目的 研究地塞米松干预骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stem cells, BMSCs)成骨分化后,过表达LncRNA TERC对组蛋白H3K27三甲基化(H3K27me3)及DKK1表达的影响,从而进一步验证其对成骨分化的作用。方法 (1)地塞米松干预BMSCs成骨分化,实验分为对照组(单纯成骨诱导组)及干预组(地塞米松干预成骨组),第14天使用茜素红染色检测的成骨分化能力,RT-PCR检测第3、7、14、21 d各组细胞中BMP-2、SMAD-1、Dlx5、Dlx3等成骨相关基因的表达。(2)地塞米松干预BMSCs成骨分化,构建TERC过表达载体,分别设置:空白对照组(地塞米松干预成骨组)、空白载体组、TERC过表达组。RT-PCR检测第3、7、14、21 d各组细胞中BMP-2、SMAD-1、Dlx5、Dlx3等成骨相关基因的表达,Western blot实验检测各组细胞中H3K27me3、DKK1的蛋白水平。结果 (1)地塞米松干预BMSCs成骨分化后,茜素红染色显示其成骨能力下降(P均<0.05),且RT-PCR显示,随着地塞米松干预时间的延长,BMP-2、SMAD-1、Dlx5、Dlx3等成骨相关基因均下调(P均<0.05)。(2)TERC过表达转染实验中,TERC过表达组细胞中BMP-2、SMAD-1、Dlx5、Dlx3等成骨相关基因与其他两组比较均上调(P均<0.05),其他两组以上成骨基因表达水平比较,差异无统计学意义(P均>0.05);TERC过表达组细胞中H3K27me3的蛋白表达水平较其他两组显著上升(P均<0.05),DKK1的蛋白水平较其他两组显著下降(P均<0.05)。其他两组中以上基因蛋白表达水平相近,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 过表达LncRNA TERC能够显著调高地塞米松干预BMSCs向成骨细胞分化能力,并与H3K27me3及DKK1在地塞米松干预BMSCs向成骨细胞分化中存在有相关性。 展开更多
关键词 骨髓间充质干细胞 成骨分化 地塞米松 LncRNA TERC h3k27me3 DKK1
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H3K27乙酰化修饰促进lncRNA OIP5-AS1转录并通过上调TLR4诱导过敏性鼻炎鼻黏膜上皮细胞凋亡
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作者 谢勇 佘志强 +3 位作者 李容华 吴荣华 王瑢 刘继远 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期419-427,共9页
目的本研究旨在探讨组蛋白3的27位赖氨酸(H3K27)乙酰化修饰对长链非编码RNA OPA相互作用蛋白5-反义RNA1(lncRNA OIP5-AS1)转录的促进作用,探讨其通过调控Toll样受体4(TLR4)对过敏性鼻炎(AR)中鼻黏膜上皮细胞(NEC)凋亡的影响。方法白细... 目的本研究旨在探讨组蛋白3的27位赖氨酸(H3K27)乙酰化修饰对长链非编码RNA OPA相互作用蛋白5-反义RNA1(lncRNA OIP5-AS1)转录的促进作用,探讨其通过调控Toll样受体4(TLR4)对过敏性鼻炎(AR)中鼻黏膜上皮细胞(NEC)凋亡的影响。方法白细胞介素13(IL-13)处理NEC以建立AR细胞模型。采用实时定量PCR检测OIP5-AS1和TLR4在AR患者鼻黏膜组织和体外细胞模型中的表达。ELISA检测粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)、嗜酸性粒细胞趋化因子1(eotaxin-1)和黏蛋白5AC(MUC5AC)的浓度。原位末端转移酶标记技术(TUNEL)染色法用于检测NEC的凋亡。双荧光素酶报告实验用于验证OIP5-AS1和TLR4的关系。染色质免疫沉淀(ChIP)实验分析用于验证OIP5-AS1启动子区组蛋白的H3K27乙酰化修饰。结果与健康对照和未处理的NEC相比,OIP5-AS1和TLR4在AR患者鼻黏膜组织和IL-13刺激的NEC中均表达升高。敲减OIP5-AS1可降低IL-13诱导的NEC的TLR4水平,而过表达OIP5-AS1可增加IL-13处理的NEC的TLR4水平。敲减OIP5-AS1可降低IL-13处理的NEC凋亡率及GM-CSF、eotaxin-1和MUC5AC的分泌,而过表达TLR4可部分逆转敲减OIP5-AS1对NEC凋亡及GM-CSF、eotaxin-1和MUC5AC表达的影响。此外,H3K27ac在OIP5-AS1的启动子区域显著富集,H3K27乙酰化可促进OIP5-AS1在IL-13诱导的NEC中的表达。结论H3K27乙酰化修饰促进OIP5-AS1转录并通过上调TLR4诱导AR中NEC凋亡。 展开更多
关键词 h3K27 OIP5-AS1 TLR4 鼻黏膜上皮细胞(NEC)
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鸡卵泡颗粒层组蛋白H3K4me3和H3K27me3的表达研究
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作者 李春苗 贾雪波 +3 位作者 王钱保 黄正洋 黄华云 赵振华 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第4期621-626,共6页
卵母细胞成熟过程受组蛋白H3K4me3(trimethylation of lysine 4 on histone 3)和H3K27me3(trimethylation of lysine 27 on histone 3)及其相关的甲基化和去甲基化酶的调控,因此考虑对鸡的卵泡发育也存在一定的影响。选取“苏禽3号”配... 卵母细胞成熟过程受组蛋白H3K4me3(trimethylation of lysine 4 on histone 3)和H3K27me3(trimethylation of lysine 27 on histone 3)及其相关的甲基化和去甲基化酶的调控,因此考虑对鸡的卵泡发育也存在一定的影响。选取“苏禽3号”配套系第一母本为研究对象,采用Western blot法探究组蛋白H3K4me3和H3K27me3在鸡卵泡不同发育阶段颗粒层中蛋白的表达模式。结果表明:在苏禽3号卵泡颗粒层中,组蛋白H3K4me3在卵泡发育不同阶段表达模式呈降低→升高→降低→升高的波浪形趋势,波浪变化较为平缓,在F5、F2和F13个表达高点的表达量与SWF(small white follicle)、LWF(large white follicle)、SYF(small yellow follicle)和F34个表达低点的表达差异显著(P<0.05)。组蛋白H3K27me3在不同发育阶段表达模式亦呈波浪形表达趋势,波浪变化起伏较明显,在SWF、SYF和F33个表达高点的表达量与F5、F4、F1和F24个表达低点的表达差异显著(P<0.05)。相关性分析显示,组蛋白H3K4me3与H3K27me3在不同发育阶段卵泡颗粒细胞中的表达呈较强的负线性相关(R=-0.808,P=0.000)。结果提示:组蛋白H3K4me3和H3K27me3在不同发育阶段卵泡颗粒层中的表达具有组织差异性,呈负相关的动态修饰性,可能共同协调卵泡生长过程中各基因的表达与功能,研究结果为鸡繁殖性状调控机理提供了理论依据。 展开更多
关键词 卵泡 颗粒细胞 组蛋白 h3K4me3 h3k27me3
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儿童弥漫性中线胶质瘤伴H3K27变异型102例临床病理特征 被引量:1
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作者 李金华 王立峰 王佳 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第7期696-700,共5页
目的 探讨儿童弥漫性中线胶质瘤(diffuse midline gliomas, DMG)伴H3K27变异型的临床病理特点和分子学特征。方法 收集102例DMG伴H3K27变异型患者临床资料,采用HE、免疫组化EnVision两步法染色,应用Sanger测序法行分子检测,分析其临床... 目的 探讨儿童弥漫性中线胶质瘤(diffuse midline gliomas, DMG)伴H3K27变异型的临床病理特点和分子学特征。方法 收集102例DMG伴H3K27变异型患者临床资料,采用HE、免疫组化EnVision两步法染色,应用Sanger测序法行分子检测,分析其临床病理特征并复习相关文献。结果 患者发病年龄1~14岁,中位年龄7岁。发病部位:脑干83例(81.4%),非脑干如丘脑、基底节和松果体等19例(18.6%)。临床表现主要为头晕、头痛和步态不稳等。MRI示T1低信号或等信号,T2高信号。组织学示高级别64例(62.7%),低级别38例(37.3%)。免疫表型:H3K27me3表达降低或缺失(100%,81/81),表达H3K27M(98%,100/102)、EZHIP(2%,2/102)、BRAF V600E(2.2%,2/89);p53突变型占53.6%(52/97);ATRX失表达(19.1%,18/94);IDH1不表达(100%,89/89)。分子检测示BRAF突变占1.7%(1/59);EGFR突变占9.1%(1/11)。结论 儿童DMG伴H3K27变异型好发于脑干,组织学以高级别为主,H3K27me3染色呈不同程度表达缺失,分子变异包括H3K27M突变、EZHIP过表达和EGFR突变。 展开更多
关键词 弥漫性中线胶质瘤伴h3K27变异型 儿童 临床病理 免疫组织化学
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成人H3K27M-变异型弥漫性中线胶质瘤4例临床病理分析
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作者 滕霞丽 孙宇晨 +2 位作者 宫惠琳 张冠军 王春宝 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第10期1095-1098,共4页
目的探讨成人H3K27M-变异型弥漫性中线胶质瘤(diffuse midline gliomas,DMG)的临床病理学特征。方法收集4例H3K27M-变异型DMG患者的临床病理资料,采用免疫组化EnVision两步法检测相关蛋白表达,应用荧光定量PCR法检测基因突变情况,并复... 目的探讨成人H3K27M-变异型弥漫性中线胶质瘤(diffuse midline gliomas,DMG)的临床病理学特征。方法收集4例H3K27M-变异型DMG患者的临床病理资料,采用免疫组化EnVision两步法检测相关蛋白表达,应用荧光定量PCR法检测基因突变情况,并复习相关文献。结果4例患者中,男性2例,女性2例;3例为中青年人,1例为老年人;发生部位分别为延髓、脑干、丘脑以及由丘脑蔓延至颞叶;组织学从低级别到高级别胶质瘤形态均可见,组织学分级为2~4级;免疫表型:4例患者H3K27M均呈弥漫性强表达而H3K27me3表达丢失或者下调,3例患者p53呈强表达,Ki67增殖指数为5%~60%;2例患者行分子检测均为IDH野生型,TERT未检测到变异。结论成人H3K27M-变异型DMG好发于丘脑和脊髓,H3K27M和H3K27me3免疫组化联合使用是诊断该病的重要辅助手段。 展开更多
关键词 弥漫性中线胶质瘤 h3K27M变异 成人 临床病理
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基于临床影像特征和多参数MRI影像组学特征评估儿童弥漫中线胶质瘤H3K27M突变
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作者 蒋会 苏晓然 +3 位作者 吴玲 张银霞 王红阳 时胜利 《放射学实践》 CSCD 北大核心 2024年第5期663-670,共8页
目的:探讨基于临床影像特征和多参数MRI影像组学特征评估儿童弥漫中线胶质瘤(DMG)H3K27M突变状态的应用价值。方法:回顾性纳入经病理诊断为DMG的98例患儿,包括74例H3K27M突变型和24例H3K27M野生型。按照大约7:3的比例分为训练集(n=68)... 目的:探讨基于临床影像特征和多参数MRI影像组学特征评估儿童弥漫中线胶质瘤(DMG)H3K27M突变状态的应用价值。方法:回顾性纳入经病理诊断为DMG的98例患儿,包括74例H3K27M突变型和24例H3K27M野生型。按照大约7:3的比例分为训练集(n=68)和测试集(n=30)。基于T_(2)WI和增强T_(1)WI(cT_(1)WI)序列提取影像组学特征。应用最大相关最小冗余(mRMR)和最小绝对收缩算子(LASSO)在训练集中筛选最优影像组学特征并计算影像组学评分(Rad-Score)。将临床影像特征和Rad-Score纳入多因素logistics回归筛选独立风险因素。联合筛选出的临床影像特征和Rad-Score构建联合模型以预测DMG的H3K27M状态,应用列线图对联合模型进行可视化。通过受试者工作特征(ROC)曲线评估模型的诊断效能,使用决策曲线(DCA)评估模型的临床应用价值。结果:基于T_(2)WI和cT_(1)WI序列共提取1648个影像组学特征,最终选取5个影像组学特征用于构建影像组学模型,该模型在训练集和测试集中均表现出良好的预测能力,曲线下面积(AUC)分别为0.844和0.758。多因素logistics回归显示环形强化和最小表观扩散系数(ADC_(min))是H3K27M状态相关的临床影像特征风险因素(P均<0.05),两者构建的临床影像模型具备一定的预测H3K27M状态的能力,训练集和测试集的AUC分别为0.802和0.720。由环形强化、ADC_(min)和Rad-Score构建的联合模型评估H3K27M状态表现出最佳的预测效能,训练集和测试集的AUC分别为0.863和0.851。结论:基于临床影像特征和多参数MRI影像组学特征构建的联合模型可用于无创性评估儿童DMG的H3K27M突变状态,具有较好的临床应用价值。 展开更多
关键词 影像组学 磁共振成像 弥漫中线胶质瘤 h3K27M
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胃黏膜肠化的H3K27me3沉默子重塑特征及转录调控机制
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作者 吴林育 刘文康 +6 位作者 喻博 储召乐 刘碧颖 李先锋 陈东风 王涛 王斌 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期510-518,共9页
目的绘制胃黏膜肠上皮化生(intestinal metaplasia,IM)(简称肠化)组织中沉默子(组蛋白H3K27me3修饰为标记)的全基因组分布图谱,揭示肠化发生的表观调控新机制。方法在陆军特色医学中心消化内科收集22例人正常胃窦黏膜及39例人胃窦肠化黏... 目的绘制胃黏膜肠上皮化生(intestinal metaplasia,IM)(简称肠化)组织中沉默子(组蛋白H3K27me3修饰为标记)的全基因组分布图谱,揭示肠化发生的表观调控新机制。方法在陆军特色医学中心消化内科收集22例人正常胃窦黏膜及39例人胃窦肠化黏膜,采用低起始量细胞的染色质靶向捕获(Cleavage Under Targets and Tagmentation,CUT&Tag)测序技术检测基因组H3K27me3修饰情况,RNA测序检测转录组特征。利用Ngsplot、ChIPseeker、MAnorm2、ggbiplot、edgeR、Homer等工具分析沉默子信号及其对肠化组织基因表达调控作用。结果H3K27me3的CUT&Tag测序数据质量较好,正常胃黏膜和肠化组织H3K27me3修饰的全基因组分布特征无明显差异。肠化组织沉默子信号强度显著降低(P<0.05)。主成分分析发现,肠化组织的全局性沉默子特征与正常组织差异明显,表现为沉默子重塑。整合分析转录组数据发现,沉默子重塑可能是CDX1等肠化标志性基因表达增加、肠化相关信号通路激活的重要原因之一。沉默子信号丢失可能招募ATOH1(P<0.01)和ONECUT2(P<0.01)等转录因子形成网络,它们在肠化组织高表达,调控CDX1等肠化关键基因表达,影响营养物质代谢等细胞生物学过程。结论表观组、转录组学测序数据整合分析表明沉默子重塑是胃黏膜肠化的一种显著表观遗传特征,沉默子丢失区域可能招募ATOH1及ONECUT2等转录因子形成网络,调控肠化关键基因表达与肠化细胞的多种物质代谢过程。 展开更多
关键词 肠上皮化生 表观遗传 组蛋白h3k27me3修饰 沉默子 转录因子
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H3K27me3与高级别胶质瘤生存预后的关系
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作者 陈智超 薛奥诺 时金昭 《中国临床神经外科杂志》 2023年第10期635-638,共4页
目的探讨组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化(H3K27me3)与高级别胶质瘤生存预后的关系。方法选取2015年6月至2017年9月手术切除的64例高级别胶质瘤标本,另选取颅脑损伤内减压术中切除的非肿瘤脑组织10例为对照,免疫组织化学染色法检测组织H3K... 目的探讨组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化(H3K27me3)与高级别胶质瘤生存预后的关系。方法选取2015年6月至2017年9月手术切除的64例高级别胶质瘤标本,另选取颅脑损伤内减压术中切除的非肿瘤脑组织10例为对照,免疫组织化学染色法检测组织H3K27me3表达,根据染色评分分为高表达和低表达。随机选取3例非肿瘤脑组织、3例WHO分级Ⅲ级胶质瘤组织、3例WHO分级Ⅳ级胶质瘤组织,应用免疫印迹法检测H3K27me3的蛋白表达。胶质瘤病人随访截止2022年10月,记录总体生存期。结果免疫组化染色检测结果显示,高级别胶质瘤组织H3K27me3高表达率(59.37%)明显高于非肿瘤脑组织(20.00%;P<0.05)。免疫印迹法检测结果显示,WHO分级Ⅳ级胶质瘤组织H3K27me3蛋白表达水平明显高于WHO分级Ⅲ级胶质瘤组织和非肿瘤脑组织(P<0.05)。64例胶质瘤中位随访时间为62.23个月,5年生存率为37.5%。多因素Cox回归分析显示,H3K27me3高表达是高级别胶质瘤不良生存预后的独立影响因素(P<0.05)。生存曲线分析显示,H3K27me3高表达高级别胶质瘤病人中位生存期(18个月)明显低于低表达病人(33个月;P<0.05)。结论H3K27me3在高级别胶质瘤组织中高表达,与病人不良生存预后有关。 展开更多
关键词 高级别胶质瘤 组蛋白h327位赖氨酸三甲基化(h3k27me3) 基因表达 生存预后
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组蛋白H3K27me3介导JAK_(2)/STAT_(3)信号通路对足细胞损伤的调控机制 被引量:3
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作者 袁树珍 隋晓露 +6 位作者 顾凤娟 张艾莎 许云鹏 谢婷妃 曾启城 邹杰锋 陈继红 《医学理论与实践》 2021年第17期2929-2933,2945,共6页
目的:探讨组蛋白H3K27me3介导JAK_(2)/STAT_(3)信号通路对足细胞损伤的调控机制。方法:体外培养小鼠肾足细胞MPC5,随机分为对照组及EZH_(2)-组。EZH_(2)-组小鼠肾足细胞给予EZH_(2)酶抑制剂(EPZ-6438)干预,对照组给予等量PBS培养。应用W... 目的:探讨组蛋白H3K27me3介导JAK_(2)/STAT_(3)信号通路对足细胞损伤的调控机制。方法:体外培养小鼠肾足细胞MPC5,随机分为对照组及EZH_(2)-组。EZH_(2)-组小鼠肾足细胞给予EZH_(2)酶抑制剂(EPZ-6438)干预,对照组给予等量PBS培养。应用Western Blot法检测足细胞组蛋白H3K27me3、p-JAK_(2)、JAK_(2)、p-STAT_(3)、STAT_(3)蛋白水平;实时定量PCR法检测足细胞JAK_(2)、STAT_(3)mRNA水平;ChIP-chip确定组蛋白H3K27me3调控靶基因群,利用MACS2软件得出组间差异富集峰,进行基于GO、KEGG数据库的功能注释分类和通路富集分析。结果:与对照组相比,EZH_(2)-组足细胞H3K27me3蛋白表达显著下降(P<0.05),JAK_(2)/STAT_(3)信号通路相关基因及蛋白表达显著增加(P<0.05);GO富集分析发现靶基因Pigu基因呈现显著性富集,其参与JAK/STAT信号通路调控;KEGG富集分析发现靶基因参与调控信号通路主要集中在细胞溶质DNA感应途径、Rap1信号通路、Toll样受体信号通路、HIF-1信号通路和JAK/STAT信号通路,其中靶基因IL12rb1、IL5ra呈现显著性富集,其参与JAK/STAT信号通路调控。结论:组蛋白H3K27me3可能通过调控靶基因Pigu、IL12rb1、IL5ra参与JAK_(2)/STAT_(3)信号通路活化,导致足细胞损伤。 展开更多
关键词 组蛋白h3k27me3 JAK_(2)/STat_(3)信号通路 足细胞 肾小球肾病
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β-榄香烯通过调控RBBP4/H3K27通路抑制结肠癌肝转移 被引量:1
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作者 章波 林恒军 +2 位作者 邱学科 张继超 王丽红 《中国现代医生》 2023年第16期86-90,共5页
目的探究β-榄香烯(β-elemene,β-E)抑制结肠癌进展的潜在机制。方法使用移植肿瘤模型验证β-E在体内抑制结肠癌的生长作用。将不同浓度(0~400μmol/L)的β-E作用于结肠癌细胞,利用CCK-8、细胞克隆、Transwell实验和蛋白质印迹法等评... 目的探究β-榄香烯(β-elemene,β-E)抑制结肠癌进展的潜在机制。方法使用移植肿瘤模型验证β-E在体内抑制结肠癌的生长作用。将不同浓度(0~400μmol/L)的β-E作用于结肠癌细胞,利用CCK-8、细胞克隆、Transwell实验和蛋白质印迹法等评估细胞活力、迁移和侵袭能力。结果5-Fu组和β-E组小鼠的结肠肿瘤重量均显著低于模型组(P<0.05),5-Fu组小鼠的结肠肿瘤抑制率显著高于β-E组[(59.22±0.11)%vs.(36.63±0.09)%,P<0.05]。5-Fu组和β-E组小鼠的肝转移灶数量显著少于模型组(P<0.05)。β-E可抑制结肠癌细胞增殖、克隆和侵袭。β-E显著抑制结肠癌组织中RBBP4和H3K27me3表达(P<0.05)。结论β-E可抑制结肠癌细胞增殖和侵袭,可能与其调控RBBP4功能重塑H3K27甲基化有关。 展开更多
关键词 结肠癌 Β-榄香烯 RBBP4 h3k27me3
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H3K27me3和EZH2在弥漫大B细胞淋巴瘤疗效预测中的意义 被引量:5
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作者 邓玉洁 陈刚 +5 位作者 朱伟峰 陈晓辉 洪华兰 黄理明 施烯 陈君敏 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期159-165,共7页
目的:探讨H3K27me3及其甲基转移酶EZH2在对弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)近期疗效和远期预后的预测意义。方法:收集福建省肿瘤医院102例初治DLBCL石蜡标本,利用TMA技术已制成的组织芯片,应用免疫组织化学方法检测H3K27me3、EZH2、BCL-2等蛋... 目的:探讨H3K27me3及其甲基转移酶EZH2在对弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)近期疗效和远期预后的预测意义。方法:收集福建省肿瘤医院102例初治DLBCL石蜡标本,利用TMA技术已制成的组织芯片,应用免疫组织化学方法检测H3K27me3、EZH2、BCL-2等蛋白表达,收集临床治疗后评价情况和随访信息,并结合组织芯片检测H3K27me3、EZH2、BCL-2表达情况,生存分析应用Kaplan-Meier法,Pearson相关性分析EZH2与H3K27me3表达及BCL-2的相关性,spearman相关分析上述指标与不同疗效间的相关性,比较EZH2、H3K27me3表达及两者共表达与患者疗效及预后关系。结果:EZH2高表达者占61.8%,与H3K27me3及BCL-2蛋白高表达均正相关。H3K27me3高表达及H3K27me3/EZH2共表达组完全缓解(CR)和总有效(OR)率均低于低表达组(P<0.001),OS、PFS均差于低表达组(P<0.001);在RCHOP组中,EZH2低表达者CR和OR率均高于高表达者(P=0.003,P=0.019),OS和PFS均优于高表达者。结论:在部分DLBCL存在EZH2高表达及H3K27me3/EZH2共表达,该类型治疗反应差,生存期短。EZH2低表达患者群体使用RCHOP方案的近期疗效及远期生存率较高表达者有改善。 展开更多
关键词 弥漫大B细胞淋巴瘤 EZH2 h3k27me3 疗效预测
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EZH2和H3K27me3在食管鳞状细胞癌中的表达及意义 被引量:4
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作者 张凤娟 刘飞 +1 位作者 谷丽娜 桑梅香 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期216-220,共5页
目的分析EZH2和H3K27me3在食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)组织中的表达及与食管鳞状细胞癌临床病理指标之间的关系,并评价其表达对食管鳞状细胞癌患者预后的意义。方法利用免疫组织化学法检测65例ESCC患者癌... 目的分析EZH2和H3K27me3在食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)组织中的表达及与食管鳞状细胞癌临床病理指标之间的关系,并评价其表达对食管鳞状细胞癌患者预后的意义。方法利用免疫组织化学法检测65例ESCC患者癌组织及相应的癌旁组织中EZH2及H3K27me3的蛋白表达,分析两者表达与ESCC患者临床病理学指标之间的相关性,并分析两者之间表达的相关性。利用Kaplan-Meier方法及Log rank检验分析两者表达与食管癌生存率之间的关系。结果癌旁组织中EZH2和H3K27me3蛋白阳性表达率分别为44.6%和26.2%,ESCC组织中分别为70.8%和47.7%,EZH2和H3K27me3蛋白表达均与ESCC患者的组织学分级及淋巴结转移状态呈正相关关系,且EZH2和H3K27me3蛋白表达之间存在正相关关系。EZH2和H3K27me3表达阳性的ESCC患者五年总生存率均明显低于EZH2和H3K27me3表达阴性的患者;EZH2和H3K27me3双阳性的ESCC患者五年总生存率明显低于EZH2和H3K27me3单阳性和双阴性的ESCC患者。Cox回归结果显示,淋巴结转移、组织学分级、EZH2和H3K27me3表达是ESCC患者的独立预后因素。结论 EZH2和H3K27me3在ESCC中均高表达,并与ESCC患者的组织学分级和淋巴结转移状态相关,可能是ESCC患者的不良预后因子。 展开更多
关键词 食管鳞状细胞癌 EZH2 h3k27me3 预后
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启动子区H3K27me3修饰异常促使系统性红斑狼疮患者CD4^+T细胞CREMα过表达 被引量:3
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作者 张庆 丁澍 张慧琳 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1597-1602,共6页
目的探讨SLE中CREMα表达升高的原因。方法分离5名正常对照和5名SLE患者的CD4^+T细胞,用染色质免疫沉淀(ChIP)微阵列法对各种基因启动子区组蛋白H3赖氨酸27三甲基化(H3K27me3)的水平进行分析。随后分离30名正常对照和30名SLE患者的CD4^+... 目的探讨SLE中CREMα表达升高的原因。方法分离5名正常对照和5名SLE患者的CD4^+T细胞,用染色质免疫沉淀(ChIP)微阵列法对各种基因启动子区组蛋白H3赖氨酸27三甲基化(H3K27me3)的水平进行分析。随后分离30名正常对照和30名SLE患者的CD4^+T细胞,用ChIP结合实时定量PCR检测CREMα启动子区H3K27me3、H3K27去甲基化酶JMJD3和UTX、H3K27甲基转移酶EZH2的水平,采用实时定量RT-PCR检测CREMαmRNA水平。结果 SLE CD4^+T细胞的CREMα启动子区H3K27me3水平是正常对照的0.23倍。随后通过ChIP结合实时定量PCR,我们证实了SLE患者CD4^+T细胞CREMα启动子区H3K27me3水平显著降低(P<0.001),且与CREMαmRNA水平呈显著负相关(P<0.001)。该区的JMJD3水平显著升高(P<0.001),且与H3K27me3水平呈负相关(P<0.001),与CREMαmRNA水平呈正相关(P<0.001)。而UTX(P=0.172)及EZH2(P=0.281)水平则与对照组无明显差异。结论 SLE CD4^+T细胞CREMα启动子区JMJD3增多,导致该区H3K27me3水平降低,结果促使CREMα过表达,最终引起SLE的发病。 展开更多
关键词 系统性红斑狼疮 c AMP反应元件调控因子α CD4+T细胞 h3k27me3 JMJD3
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