天祝白牦牛GDF-10基因CDS区的多态性及生物信息学分析

采用DNA混合池测序法检测天祝白牦牛生长分化因子-10(Growth differentiation factor 10,GDF-10)基因编码区的多态性,应用生物信息学方法分析天祝白牦牛生长分化因子-10编码蛋白质特性。结果表明,天祝白牦牛生长分化因子-10基因编码区序列存在8个突变位点,其中90C→G、124C→G、1005G→A和1232G→C为错义突变,导致了编码氨基酸的改变,132T→C、822A→G、873G→T和888T→C为同义突变;天祝白牦牛生长分化因子-10编码蛋白质的氨基酸序列没有明显的疏水性区域和跨膜螺旋区;其存在信号肽,说明可能在细胞质中发挥生物学作用;天祝白牦牛生长分化因子-10编码产物二级结构是以α-螺旋和β-折叠为主;氨基酸序列与普通牛的同源性为99.4%,与人、小鼠、大鼠4个物种间同源性较高。