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基于rDNAITS和beta-tubulin gene部分序列分析灵芝属菌株的遗传关系 被引量:4
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作者 唐传红 苏春丽 +6 位作者 张劲松 杨焱 唐庆九 贾薇 冯娜 刘艳芳 吴迪 《食用菌学报》 北大核心 2012年第3期37-41,共5页
联合ITS序列和beta-tubulin基因部分序列的系统发育分析将分属于8个种的38株菌株分为9个聚类群,聚类结果与物种结果基本一致,只有少数几个菌株,如GL81菌株聚类结果与拉丁名不符,可能由于来源地给出的定名不够准确。根据结果联合信息分... 联合ITS序列和beta-tubulin基因部分序列的系统发育分析将分属于8个种的38株菌株分为9个聚类群,聚类结果与物种结果基本一致,只有少数几个菌株,如GL81菌株聚类结果与拉丁名不符,可能由于来源地给出的定名不够准确。根据结果联合信息分析可以对收集的不同菌株进行种类的初步分析。 展开更多
关键词 灵芝 ITS beta-tubulin基因 遗传多样性
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Genetic Variations Among Liriomyza sativae Blanchard Populations Indicated by β-tubulin Gene Sequences
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作者 ZHENG Fu-shan DU Yu-zhou +2 位作者 WANG Li-ping LU Ya-juan LU Zi-qiang 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2007年第5期580-585,共6页
To analyze the genetic differentiation of the host- and geo-populations of Liriomyza sativae Blanchard, the β-tubulin gene of 5 host-populations and 6 geo-populations of L. sativae was sequenced. Subsequently, the se... To analyze the genetic differentiation of the host- and geo-populations of Liriomyza sativae Blanchard, the β-tubulin gene of 5 host-populations and 6 geo-populations of L. sativae was sequenced. Subsequently, the sequences were analyzed by biosoftware DNAStar and MEGA, and the phylogenetic trees constructed. The results obtained by the two softwares were similar, that is, the sequences of β-tubulin gene were more than 98% homologous, among the host- and geo-populations of L. sativae, with only 8 variable sites, but no insertions and deletions were detected. It seems that differentiations in β-tubulin gene among the host- and geo-populations of L. sativae are related to the hobby to hosts and the geographical distributions, respectively. 展开更多
关键词 Liriomyza sativae Blanchard host-populations geo-populations β-tubulin gene genetic differentiation
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Molecular Analysis of the Alpha-Tubulin Gene from the Microsporidium, Endoreticulatus sp. Zhenjiang, Isolated from Bombyx mori
3
作者 Shengyan Xiao Zhongyuan Shen +5 位作者 Xudong Tang Li Xu Xuliang Fu Yajie Yue Nan Li Wei Wang 《Agricultural Sciences》 2014年第10期882-890,共9页
We isolated a microsporidium from the silkworm, Bombyx mori, and classified it as Endoreticulatus sp. Zhenjiang based on morphological characteristics and phylogenetic analyses of ribosomal sequences. This microsporid... We isolated a microsporidium from the silkworm, Bombyx mori, and classified it as Endoreticulatus sp. Zhenjiang based on morphological characteristics and phylogenetic analyses of ribosomal sequences. This microsporidium causes silkworm pebrine, although its original host and mode of transmission are unknown. To better understand its distribution and transmission mode, it is essential to have species specific molecular markers. Towards this goal, we characterized the alpha tubulin gene from Endoreticulatus sp. Zhenjiang in this study. The full-length alpha-tubulin cDNA from Endoreticulatus sp. Zhenjiang was cloned and sequenced (GenBank ID: KJ784483) using the rapid amplification of cDNA ends (RACE) protocol. The alpha-tubulin cDNA is 1382 bp long with an open reading frame spanning 1320 bp and consisting of a short 20-bp 5’-untranslated region (5’-UTR) and a 42-bp 3’-UTR with a stop codon and a poly (A) tail. This alpha-tubulin cDNA encodes a deduced polypeptide with 439 amino acids, including a complete tubulin domain and a tubulin C domain. This protein has an estimated isoelectric point of 5.1 and a predicted molecular weight of 48.6 kDa. 展开更多
关键词 Microsporidium RACE tubulin gene SILKWORM PEBRINE
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棉花β-tubulin基因家族的鉴定及其在纤维发育中的表达 被引量:1
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作者 党媛玥 马建江 +5 位作者 杨书贤 宋吉坤 贾冰 冯盼 陈全家 于霁雯 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第23期4585-4601,共17页
【目的】β-微管蛋白是棉纤维细胞形态建成的基本结构单位,在纤维发育过程中具有重要作用。通过鉴定棉花β-tubulin基因家族成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为深入探究β-tubulin基因在棉花纤维发育中的作用提供理论依据。【方法... 【目的】β-微管蛋白是棉纤维细胞形态建成的基本结构单位,在纤维发育过程中具有重要作用。通过鉴定棉花β-tubulin基因家族成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为深入探究β-tubulin基因在棉花纤维发育中的作用提供理论依据。【方法】利用BLAST方法,在4个棉种基因组中鉴定β-tubulin基因家族成员,并结合ProtParam tool分析理化性质、MEGA7.0构建系统进化树、Mapchart2.2绘制染色体定位图、MEME分析保守基序、PlantCARE分析启动子顺式作用元件;根据39个材料发育纤维转录组数据分析陆地棉β-tubulin基因家族的表达水平,并利用Spearman相关性分析鉴定影响纤维品质性状形成的β-tubulin基因。【结果】在陆地棉(Gossypiumhirsutum,AD1)、海岛棉(Gossypiumbarbadense,AD2)、亚洲棉(Gossypiumarboretum,A2)和雷蒙德氏棉(Gossypiumraimondii,D5)基因组中分别鉴定到36、37、19和18个β-tubulin基因,且在四倍体棉种中的数目约是二倍体棉种数目的二倍,系统进化将其分为ClusterⅠ—ClusterⅤ共5个亚组。系统进化与共线性分析发现,与陆地棉β-tubulin基因家族相比,海岛棉与二倍体亚洲棉和雷蒙德氏棉亲缘关系更近。保守结构域均具有典型的Tubulin和Tubulin-C。理化性质分析表明,该家族基因编码的氨基酸数目为421—508,等电点为4.68—5.09。启动子顺式作用元件分析获得生长发育响应相关元件、激素响应相关元件和胁迫响应相关元件等,表明β-tubulin基因参与细胞的生长调节。利用TM-1转录组数据对36个陆地棉β-tubulin基因表达模式进行聚类分析,发现有42%基因在纤维中优势表达;此外,利用海陆群体动态纤维转录组数据筛选到1、6和11个β-tubulin基因分别与纤维马克隆值、比强度和纤维长度显著相关,其中4个基因同时影响纤维长度和比强度性状。【结论】4个棉种中共鉴定出110个β-tubulin基因家族成员,氨基酸理化性质和序列高度保守而启动子序列调控元件多样;筛选出陆地棉纤维优势表达的β-tubulin基因家族成员,并发掘潜在调控纤维发育的候选基因。 展开更多
关键词 棉花 β-tubulin基因家族 生物信息学 表达分析 纤维发育
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Expression pattern of a β_2 tubulin gene in zebrafish embryos identified by whole mount in situ hybridization 被引量:3
5
作者 LI Shuhong, GUO Shaodong and SUN Fangzhen Institute of Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100080, China 《Chinese Science Bulletin》 SCIE CAS 1998年第22期1894-1898,共5页
Zebrafish is a good vertebrate model for development studies. Research on gene expression and regulation during zebrafish embryonic development plays an important role in revealing the molecular mechanism of morphogen... Zebrafish is a good vertebrate model for development studies. Research on gene expression and regulation during zebrafish embryonic development plays an important role in revealing the molecular mechanism of morphogenesis in vertebrate. Tubulin locates the cytoplasmic determinants in eggs, organizes the formation of basic cytoskeleton and controls various cell movements. There are several types of tubulin, each of which has specific expression regions and functions. In this study, the full_length cDNA of a Xenopus β 2 tubulin was used as template to generate Dig_labeled antisense RNA which was used as a probe to carry out in situ hybridization on whole mount zebrafish embryos. Under the experimental conditions, the tubulin transcript was first detected in a group of cells in embryos at the midblastula stage. With the development of the embryo, this transcript was gradually restricted to the nervous system. These results demonstrate that the expression of this β 2 tubulin gene in zebrafish embryos is neural specific. 展开更多
关键词 tubulin gene whole mount in SITU HYBRIDIZATION zebrafish.
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马氏珠母贝α-Tubulin基因结构、SNP筛选及耐低温相关性分析
6
作者 刘雅 李松谕 +3 位作者 赖卓欣 钟如卓 王庆恒 邓岳文 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期406-413,共8页
为了探究马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)α-Tubulin基因在低温适应性中的作用,通过RACE克隆技术获得马氏珠母贝α-Tubulin基因,分析了α-Tubulin基因在低温胁迫下的表达趋势,并筛选和比较了马氏珠母贝耐低温选育系(R)F3和北部... 为了探究马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)α-Tubulin基因在低温适应性中的作用,通过RACE克隆技术获得马氏珠母贝α-Tubulin基因,分析了α-Tubulin基因在低温胁迫下的表达趋势,并筛选和比较了马氏珠母贝耐低温选育系(R)F3和北部湾野生群体(W)的α-Tubulin编码区SNP位点。结果表明:马氏珠母贝α-Tubulin基因总长为2107 bp,可编码454个氨基酸,具有典型的Tubulin和Tubulin-C结构域;全组织定量显示,α-Tubulin基因在所有组织中均有表达,在足部中表达量最高(P<0.05);低温胁迫时,鳃组织中α-Tubulin基因在低温组(12、17℃)的表达量均在72 h时达到最高,且显著高于对照组(22℃)(P<0.05);α-Tubulin外显子区域共有34个SNP,其中3个SNP位点的基因型频率在R和W群体间有显著性差异(P<0.05);连锁不平衡分析显示,R群体单倍型CCTCAGCGCC的频率明显高于W群体。研究表明,α-Tubulin为参与调节马氏珠母贝低温适应过程中的候选基因,筛选出的与抗低温性状相关的SNP位点g.111071125及优异单倍型CCTCAGCGCC,可作为选择育种的候选标记。 展开更多
关键词 马氏珠母贝 α-tubulin基因 SNP 低温耐受
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Expression of α Tubulin Gene in Motoneurons of Spinal Cord During Nerve Regeneration
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作者 何彬 范明 +1 位作者 刘淑红 甘思德 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 1993年第12期1038-1042,共5页
We have previously reported that the injury of sciatic nerve causes not only the change of axonal ultrastructures, but also the increase of β tubulin gene expression in the neural soma. And the microtubule, as a carr... We have previously reported that the injury of sciatic nerve causes not only the change of axonal ultrastructures, but also the increase of β tubulin gene expression in the neural soma. And the microtubule, as a carrier of transported materials, of axonal architecture plays an important role. It has also been found that the content and transported velocity of tubulin in the regeneration nerve increase significantly owing to the requirements of axonal reconstruction. As the NOR-Ag staining technique is specific 展开更多
关键词 MOTONEURON NOR-Ag tubulin gene in SITU hybridization.
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TUBB8基因c.154-156del杂合变异致卵母细胞成熟阻滞一例
8
作者 闻星星 柴梦晗 +4 位作者 杨倪 邹慧娟 章志国 李琳 陈蓓丽 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2024年第1期17-19,23,共4页
对1例卵母细胞成熟阻滞患者进行全外显子组测序,通过生物信息学筛查可疑致病变异,对患者及其家系成员进行Sanger测序验证。测序提示患者TUBB8基因存在c.154-156del(p.52del)杂合缺失变异,患者的父母、哥哥、姐姐和侄女均未检出该变异,... 对1例卵母细胞成熟阻滞患者进行全外显子组测序,通过生物信息学筛查可疑致病变异,对患者及其家系成员进行Sanger测序验证。测序提示患者TUBB8基因存在c.154-156del(p.52del)杂合缺失变异,患者的父母、哥哥、姐姐和侄女均未检出该变异,患者的哥哥、姐姐均已生育,该变异与家系表型共分离,提示TUBB8基因c.154-156del(p.52del)杂合缺失变异可能是该卵母细胞成熟阻滞患者的遗传学病因。TUBB8基因变异在卵母细胞成熟阻滞患者中约占30%,对于这类患者的遗传咨询可常规行TUBB8基因检查,而TUBB8基因变异引起的卵母细胞成熟阻滞患者只能通过卵母细胞捐赠助孕。 展开更多
关键词 微管蛋白 基因 突变 卵母细胞 不育 女(雌)性 TUBB8基因
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抗苯并咪唑的小麦赤霉病菌β-tubulin基因序列分析与特性研究 被引量:28
9
作者 陆悦健 周明国 +2 位作者 叶钟音 D.W.Hollomon J.A.Butters 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期30-34,共5页
本研究用真菌 β-微管蛋白基因的通用寡聚核苷酸引物 B1和 B3,扩增并克隆了一段 82 1bp的小麦赤霉病菌 Fusarium graminearum的 β-微管蛋白基因片段 ,并进行了序列测定。根据该序列设计了 F.graminearumβ-微管蛋白基因的特异性测序引... 本研究用真菌 β-微管蛋白基因的通用寡聚核苷酸引物 B1和 B3,扩增并克隆了一段 82 1bp的小麦赤霉病菌 Fusarium graminearum的 β-微管蛋白基因片段 ,并进行了序列测定。根据该序列设计了 F.graminearumβ-微管蛋白基因的特异性测序引物 ,测定了赤霉病菌对多菌灵不同抗感菌株的β-微管蛋白基因核苷酸序列 ,结果表明不同 F.graminearum菌株的 β-微管蛋白的 16 5,198,2 0 0和 2 57位氨基酸未发生突变 ,在克隆的片段内也未发现核苷酸突变引起的氨基酸改变。表明该菌对多菌灵产生抗性的分子机制与目前已知的其它真菌有所不同 ,有待进一步研究。 展开更多
关键词 小麦赤霉病菌 β-微管蛋白基因 多菌灵 抗药性
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龙眼成花逆转花芽α-tubulin基因的克隆与原核表达 被引量:3
10
作者 游向荣 黄榕辉 +3 位作者 王喜军 黄春梅 梁文裕 陈伟 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期63-68,共6页
运用蛋白质组学方法比较龙眼(Dimocarpus longanLour.)正常成花和成花逆转花芽的差异蛋白质组,并应用RACE方法克隆其中上调表达的α-微管蛋白基因α-tubulin,获得一段长度为1641 bp的cDNA,其中包括1个1350 bp的开放阅读框[GenBank登录号... 运用蛋白质组学方法比较龙眼(Dimocarpus longanLour.)正常成花和成花逆转花芽的差异蛋白质组,并应用RACE方法克隆其中上调表达的α-微管蛋白基因α-tubulin,获得一段长度为1641 bp的cDNA,其中包括1个1350 bp的开放阅读框[GenBank登录号:FJ479617(GI:218202929)]。将α-tubulin全长cDNA在大肠杆菌中表达,获得1个约49.6 kD的外源蛋白,经Western blotting验证为α-微管蛋白。RT-PCR和Western blotting分别检测了α-tubulin在转录和翻译水平上的表达,结果表明,α-微管蛋白在成花逆转的龙眼花芽中上调表达,可能是逆转花芽形态差异表现的原因之一。 展开更多
关键词 龙眼 花芽 α-tubulin基因 克隆 原核表达
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美洲斑潜蝇不同寄主种群及地理种群间的β-tubulin基因序列分析 被引量:2
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作者 杜予州 王莉萍 +2 位作者 陆亚娟 郑福山 陆自强 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期1542-1547,共6页
【目的】通过对美洲斑潜蝇β-tubulin基因序列的比较,分析不同寄主种群和地理种群的遗传分化情况。【方法】对中国美洲斑潜蝇Liriomyza sativae Blanchard 5个寄主种群以及6个地理种群的β-微管蛋白基因(β-tubulingene)进行测序,运用软... 【目的】通过对美洲斑潜蝇β-tubulin基因序列的比较,分析不同寄主种群和地理种群的遗传分化情况。【方法】对中国美洲斑潜蝇Liriomyza sativae Blanchard 5个寄主种群以及6个地理种群的β-微管蛋白基因(β-tubulingene)进行测序,运用软件DNAStar和MEGA对美洲斑潜蝇不同地理种群及寄主种群的β-tubulin基因序列的遗传分歧及相似性进行分析,并建立系统发生树。【结果】DNAStar和MEGA两种软件对美洲斑潜蝇不同寄主种群以及地理种群间的遗传关系的分析可得到相似的结果。在美洲斑潜蝇寄主种群和地理种群序列变异分析中,共发现8个变异位点,序列长度比较保守,均没有碱基的插入或缺失。美洲斑潜蝇不同寄主种群之间以及地理种群之间的β-tubulin基因序列相似性极高,都在98%以上。【结论】虽然基于β-tubulin基因序列所显示的美洲斑潜蝇各寄主种群之间以及地理种群之间的遗传分化很小,但是其分化趋势分别与对寄主的嗜好程度以及地理分布基本吻合。 展开更多
关键词 美洲斑潜蝇 寄主种群 地理种群 β-tubulin基因 遗传分化
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γ-tubulin、HER-2和k-ras在乳腺癌组织中的表达及临床意义 被引量:2
12
作者 张建立 马金海 +1 位作者 崔伟 杨永滨 《解放军医药杂志》 CAS 2016年第7期47-50,共4页
目的观察γ-tubulin、HER-2、k-ras在乳腺癌组织中的表达情况,探讨其临床意义。方法选择2010年1月—2014年12月手术切除的乳腺原位导管癌(DCIS)、浸润导管癌(IDC)及正常乳腺组织各60例,观察各组织中γ-tubulin、HER-2和k-ras的表达情况... 目的观察γ-tubulin、HER-2、k-ras在乳腺癌组织中的表达情况,探讨其临床意义。方法选择2010年1月—2014年12月手术切除的乳腺原位导管癌(DCIS)、浸润导管癌(IDC)及正常乳腺组织各60例,观察各组织中γ-tubulin、HER-2和k-ras的表达情况。结果光镜下可见γ-tubulin阳性表达于上皮细胞质中,HER-2和k-ras阳性位于细胞膜。乳腺癌组织中γ-tubulin、HER-2和k-ras阳性表达率均高于正常乳腺组织,且IDC组织中HER-2和k-ras阳性表达率高于DCIS组织(P<0.05)。结论γ-tubulin、HER-2和k-ras在乳腺组织中高表达,提示其共同参与了乳腺癌的发生发展过程。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 微管蛋白 基因 HER-2 基因 ras
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弓形虫不同分离株α-Tubulin和β-Tubulin基因PCR-RFLP分析及其探针制备 被引量:1
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作者 李华文 陈观今 +5 位作者 郑焕钦 王海 吕芳丽 甘慧泉 黄燕 邵筱 《热带医学杂志》 CAS 2004年第2期122-125,共4页
目的不同分离株弓形虫α-Tubulin和β-Tubulin基因的PCR-RFLP分析及其杂交探针制备。方法PCR体外扩增α-Tubulin和β-Tubulin基因片段并进行RFLP分析;采用随机引物法用地高辛(DIG-11-dUTP)标记探针并同基因组DNA进行Southern杂交分析。... 目的不同分离株弓形虫α-Tubulin和β-Tubulin基因的PCR-RFLP分析及其杂交探针制备。方法PCR体外扩增α-Tubulin和β-Tubulin基因片段并进行RFLP分析;采用随机引物法用地高辛(DIG-11-dUTP)标记探针并同基因组DNA进行Southern杂交分析。结果从5株弓形虫分离株的基因组DNA中均扩增出α-Tubulin基因的818bp片段和β-Tubulin基因的959bp片段,RFLP分析弓形虫各分离株间酶切图谱未见差异。探针的特异性和敏感性较好。结论α-Tubulin和β-Tubulin基因在弓形虫中高度保守;α-Tubulin和β-Tubulin基因杂交探针可用于Southern杂交。 展开更多
关键词 弓形虫 α-tubulin和β-tubulin基因 RFLP分析 探针制备
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茶树α-tubulin基因实时荧光定量RT-PCR方法的建立 被引量:1
14
作者 曾威 赵昕梅 +3 位作者 薛佩 陈春妍 师彗云 袁红雨 《生物技术通讯》 CAS 2012年第2期245-247,共3页
目的:建立茶树仅-tubulin基因实时荧光定量RT-PCR方法。方法:根据GenBank中茶树d-tubulin基因保守区域设计-对特异性引物,将PCR扩增得到的a-tubulin基因克隆到pTGl9-T载体上,构建的重组质粒标准品经1/10梯度稀释后,用SYBRGreenI... 目的:建立茶树仅-tubulin基因实时荧光定量RT-PCR方法。方法:根据GenBank中茶树d-tubulin基因保守区域设计-对特异性引物,将PCR扩增得到的a-tubulin基因克隆到pTGl9-T载体上,构建的重组质粒标准品经1/10梯度稀释后,用SYBRGreenI染料法绘制标准曲线,并进行融解曲线分析。结果:标准曲线Ct值检测范围为14.56-27.09,相关系数为0.991,溶解曲线分析显示产物为特异的单峰,其Tm值为81±0.3C。结论:建立了茶树d-tu.bulin基因实时荧光定量RT-PCR法,为以oL-tubulin作为茶树内参基因进行功能基因表达差异研究奠定了基础。 展开更多
关键词 茶树 α-tubulin基因 实时荧光定量PCR
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慈竹β-tubulin基因片段的克隆及序列分析 被引量:2
15
作者 黄胜雄 胡尚连 +1 位作者 孙霞 蒋瑶 《福建林业科技》 2009年第1期7-10,42,共5页
利用Trizol一步法提取慈竹幼笋总RNA,运用RT-PCR方法首次在慈竹中克隆到3条β-tubulin基因部分序列,命名为Na-βtub1、Naβ-tub2、Naβ-tub3,长度分别为958bp、958bp和959bp,分别编码318、318和319个氨基酸。核酸和氨基酸的序列比对分... 利用Trizol一步法提取慈竹幼笋总RNA,运用RT-PCR方法首次在慈竹中克隆到3条β-tubulin基因部分序列,命名为Na-βtub1、Naβ-tub2、Naβ-tub3,长度分别为958bp、958bp和959bp,分别编码318、318和319个氨基酸。核酸和氨基酸的序列比对分析结果表明,慈竹中3条β-tubulin基因核酸和推测的氨基酸序列之间相似性分别为92.46%和98.22%,与禾本科植物水稻、玉米、小麦的β-tubulin基因核酸和氨基酸序列相似性分别在89%和95%以上。 展开更多
关键词 慈竹 β-tubulin基因 克隆 序列分析
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晚期非小细胞肺癌中β-tubulin Ⅲ表达水平对化学治疗敏感性的影响
16
作者 陈佳 何松 +11 位作者 王淼舟 郭燕 张晓东 吉志固 朱亚芳 陆俊国 陶玉 朱兴华 王建红 杨书云 尹海兵 谭清和 《国际病理科学与临床杂志》 CAS 2013年第1期37-41,共5页
目的:分析非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者β-tubulin Ⅲ的表达水平与化学治疗(化疗)敏感性的关系。方法:经病理确诊的晚期NSCLC患者以1:2随机分配至对照组和基因型组:对照组使用吉西他滨联合顺铂化疗;基因型组根据... 目的:分析非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者β-tubulin Ⅲ的表达水平与化学治疗(化疗)敏感性的关系。方法:经病理确诊的晚期NSCLC患者以1:2随机分配至对照组和基因型组:对照组使用吉西他滨联合顺铂化疗;基因型组根据ERCC1及RRM1的表达情况进行个体化治疗。检测病理标本中β-tubulin Ⅲ的表达水平,比较β-tubulin Ⅲ蛋白表达水平与临床疗效之间的关系。结果:基因型组最终有118例NSCLC病例可评价,均可成功检测β-tubulin Ⅲ的表达情况。对照组有效率(37.5%)与基因型组有效率(47.5%)比较,差异无统计学意义(P>0.05)。基因型组中各组间有效率比较,差异无统计学意义(P>0.05);但β-tubulinⅢ低表达组有效率(55.1%)显著高于β-tubulin Ⅲ高表达组(36.7%,P<0.05)。结论:在晚期NSCLC腺癌亚型中,β-tubulin Ⅲ低表达患者疗效较好,β-tubulin Ⅲ高表达可能意味着对多西他赛耐药。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 Β-tubulin III ERCC1基因 RRM1基因
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条斑紫菜Tubulin和Kinesin基因家族鉴定及失水胁迫表达模式分析 被引量:3
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作者 崔正彩 孔凡娜 +3 位作者 茅云翔 孙斌 王俊皓 董道英 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期673-684,共12页
微管是细胞骨架的主要成分,其结构及动力学机制对提高生物体耐受性具有重要作用。微管网络如何通过结构的动态变化调控适应环境变化已成为胁迫生物学领域的研究热点之一。条斑紫菜(Pyropia yezoensis)能够适应潮间带复杂多变的环境,是... 微管是细胞骨架的主要成分,其结构及动力学机制对提高生物体耐受性具有重要作用。微管网络如何通过结构的动态变化调控适应环境变化已成为胁迫生物学领域的研究热点之一。条斑紫菜(Pyropia yezoensis)能够适应潮间带复杂多变的环境,是研究潮间带大型海藻抗逆机制的良好材料。目前对紫菜微管相关基因家族构成及其生物学功能的研究较少。本研究利用生物信息学方法,在条斑紫菜基因组中共鉴定出4个Tubulin基因(Pyα-tubulin 1、Pyα-tubulin 2、Pyβ-tubulin和Pyγ-tubulin)和11个Kinesin基因(PyKinesin 1—PyKinesin 11),并对其理化性质、基因结构、蛋白特征、染色体定位、系统进化和失水胁迫下的表达模式进行了系统分析。结果显示:条斑紫菜中有3种微管蛋白(Tubulin)亚型;该家族成员散布于1号和2号染色体上,Pyα-tubulin 1和Pyα-tubulin 2为串联重复基因;PyTubulin家族成员在基因结构和蛋白特征方面均较为保守,且在转录水平对失水胁迫不敏感。条斑紫菜中有5种驱动蛋白(Kinesin)亚型,亚家族种类和基因数量均少于高等植物;该家族基因散布于1号、2号和3号染色体上,无串联重复基因;PyKinesin家族成员在基因结构和蛋白特征方面存在一定差异,PyKinesin 1在中高度失水胁迫下表达量显著上调。本研究为进一步理解Tubulin和Kinesin基因家族的进化和功能、解析微管在条斑紫菜响应失水胁迫中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 条斑紫菜 tubulin KINESIN 基因家族 失水胁迫
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α-tubulin基因的克隆、生物信息学分析及其在仿刺参肠道再生过程中的表达模式 被引量:1
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作者 王怡 高银雪 +3 位作者 湛垚垚 张向向 杨立猛 常亚青 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期547-557,共11页
为了明确仿刺参α-微管蛋白(α-tubulin)基因的序列及结构信息,初步研究该基因在仿刺参肠道再生过程中的生物学功能,本研究利用转录组数据挖掘和c DNA末端快速扩增技术(RACE)首次克隆得到仿刺参α-tubulin基因的全长c DNA序列。结果表明... 为了明确仿刺参α-微管蛋白(α-tubulin)基因的序列及结构信息,初步研究该基因在仿刺参肠道再生过程中的生物学功能,本研究利用转录组数据挖掘和c DNA末端快速扩增技术(RACE)首次克隆得到仿刺参α-tubulin基因的全长c DNA序列。结果表明,仿刺参α-tubulin基因c DNA全长为1641 bp,共编码453个氨基酸,经生物信息学分析发现,该基因的5'端非编码区为153 bp,3'端非编码区为126 bp,推算该基因所编码的蛋白质分子量为50.33 ku,等电点为4.89,属于亲水性非跨膜蛋白质,且氨基酸序列中含有微管蛋白特有的信号序列GGGTGSG。通过与13种已公布物种的α-tubulin氨基酸序列进行多重序列比对及系统进化分析,发现仿刺参α-tubulin蛋白的氨基酸序列与其他真核生物的α-tubulin蛋白序列具有非常高的保守性,与南极岩斑鳕α-tubulin相似性高达90%。采用实时定量PCR技术对α-tubulin基因在仿刺参肠组织再生不同时期的表达情况进行检测,结果显示α-tubulin基因在仿刺参肠组织再生不同时期均有表达,其相对表达量在肠组织再生17 d时最高,5 d时最低。本研究在获得仿刺参α-tubulin基因结构信息的同时,进一步印证了真核生物α-tubulin基因的高度保守性,同时表明α-tubulin基因参与仿刺参肠道再生过程。 展开更多
关键词 仿刺参 Α-微管蛋白 克隆 生物信息学分析 基因表达
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微管蛋白β-Tubulin在二、三倍体虹鳟(Oncorhynchus mykiss)表达与定位分析
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作者 黄天晴 史秀兰 +8 位作者 王炳谦 邹作宇 谷伟 刘恩慧 程琳 刘洋 董福霖 潘赞宇 徐革锋 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1244-1254,共11页
微管构成纺锤体主要架构,在染色体配对与分离过程起重要作用。通过β-tubulin基因克隆,实时荧光定量,Western blot及免疫组织化学技术对三倍体虹鳟卵巢败育根本原因进行探究。结果表明β-tubulin基因开放阅读框1533 bp,编码424个氨基酸... 微管构成纺锤体主要架构,在染色体配对与分离过程起重要作用。通过β-tubulin基因克隆,实时荧光定量,Western blot及免疫组织化学技术对三倍体虹鳟卵巢败育根本原因进行探究。结果表明β-tubulin基因开放阅读框1533 bp,编码424个氨基酸。β-Tubulin蛋白质的相对分子量为47.5 kDa。虹鳟(Oncorhynchus mykiss)与银大马哈鱼(O.kisutch)同源性高达99.59%。系统发育进化树显示,虹鳟与大鳞大马哈鱼(O.tshawytscha)和红点鲑(Salvelinus alpinus)聚为一支。实时定量检测发现β-tubulin基因在二倍体雌性虹鳟卵巢表达量极显著高于其他组织。在240-330 dpf同一发育阶段中,β-tubulin基因在二倍体雌性虹鳟卵巢中的表达量较三倍体雌性虹鳟相对较高,且均存在极显著差异。免疫组化结果显示,240-330 dpf,β-Tubulin蛋白主要在二倍体虹鳟卵母细胞核内表达,在三倍体虹鳟卵原细胞核内表达量较少。推测三倍体虹鳟性腺败育可能与β-tubulin基因的低表达与组织异常定位有关,结果为进一步揭示三倍体虹鳟卵母细胞减数分裂受阻提供基础理论。 展开更多
关键词 虹鳟 Β-tubulin 基因克隆 组织表达分布
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Beta-nerve growth factor gene therapy alleviates pyridoxine-induced neuropathic damage by increasing doublecortin and tyrosine kinase A in the dorsal root ganglion 被引量:2
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作者 Hyun-Kee Cho Woosuk Kim +4 位作者 Kwon-Young Lee Jin-Ok Ahn Jung Hoon Choi In Koo Hwang Jin-Young Chung 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2020年第1期162-168,共7页
Beta-nerve growth factor(β-NGF)is known to be a major leading cause of neuronal plasticity.To identify the possible action mechanisms ofβ-NGF gene therapy for sciatic nerve recovery,experimental dogs were randomly d... Beta-nerve growth factor(β-NGF)is known to be a major leading cause of neuronal plasticity.To identify the possible action mechanisms ofβ-NGF gene therapy for sciatic nerve recovery,experimental dogs were randomly divided into control,pyridoxine,and pyridoxine+β-NGF groups.We observed chronological changes of morphology in the dorsal root ganglia in response to pyridoxine toxicity based on cresyl violet staining.The number of large neurons positive for cresyl violet was dramatically decreased after pyridoxine intoxication for 7 days in the dorsal root ganglia and the neuron number was gradually increased after pyridoxine withdrawal.In addition,we also investigated the effects ofβ-NGF gene therapy on neuronal plasticity in pyridoxine-induced neuropathic dogs.To accomplish this,tyrosine kinase receptor A(TrkA),βIII-tubulin and doublecortin(DCX)immunohistochemical staining was performed at 3 days after the last pyridoxine treatment.TrkA-immunoreactive neurons were dramatically decreased in the pyridoxine group compared to the control group,but strong TrkA immunoreactivity was observed in the small-sized dorsal root ganglia in this group.TrkA immunoreactivity in the dorsal root ganglia was similar betweenβ-NGF and control groups.The numbers ofβⅢ-tubulin-and DCX-immunoreactive cells decreased significantly in the pyridoxine group compared to the control group.However,the reduction ofβⅢ-tubulin-and DCX-immunoreactive cells in the dorsal root ganglia in theβ-NGF group was significantly ameliorated than that in the pyridoxine group.These results indicate thatβ-NGF gene therapy is a powerful treatment of pyridoxine-induced neuropathic damage by increasing the TrkA and DCX levels in the dorsal root ganglia.The experimental protocol was approved by the Institutional Animal Care and Use Committee(IACUC)of Seoul National University,South Korea(approval No.SNU-060623-1,SNU-091009-1)on June 23,2006 and October 9,2009,respectively. 展开更多
关键词 β-nerve growth factor βⅢ-tubulin DOUBLECORTIN gene therapy neuron-glial antigen 2 neuropathy PYRIDOXINE
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