卵巢恶性肿瘤类器官库的初建

背景卵巢恶性肿瘤异质性导致患者个体治疗效果差异大,经典治疗方案无法实现患者个体化治疗。可靠的卵巢恶性肿瘤体外模型可作为患者“替身”进行研究和药物敏感性测定,其结果为卵巢恶性肿瘤患者的精准治疗提供新思路。目的建立卵巢恶性肿瘤类器官生物库,在基因组学层面验证类器官与对应卵巢癌组织的一致性,探索类器官模型药敏结果预测临床疗效的可行性。方法分离患者组织来源的卵巢恶性肿瘤细胞,在基质胶三维环境中培养形成类器官。利用全外显子测序技术检测并对比类器官与对应卵巢恶性肿瘤组织的基因组学特征。类器官培养2~3 d后加入化疗单药或联合方案药物,进行药物敏感性测定。结果本研究建立了卵巢恶性肿瘤类器官生物库,包含来自113例患者的122个类器官系,培养成功率达90.4%。全外显子测序分析显示卵巢恶性肿瘤类器官在基因组学层面与亲本肿瘤组织具有一致性。卵巢恶性肿瘤类器官药敏结果对临床疗效的预测准确性达70.7%,敏感度为75%,特异度为55.6%。结论本研究在体外成功建立了卵巢恶性肿瘤类器官生物库,类器官模型可反映亲本肿瘤的基因组学特征,其药敏结果可反映临床疗效。卵巢恶性肿瘤类器官库为卵巢恶性肿瘤研究、药物开发、临床治疗方案制定提供了可靠的临床前模型。

肿瘤类器官临床前转化研究及应用

越来越深入的肿瘤机制研究和临床精准治疗对肿瘤模型的建立提出了更高的要求,肿瘤类器官应用越来越广泛。该模型被认为可以再现亲代肿瘤的基因组、转录组、蛋白质组等多组学特征,具有细胞系模型所缺乏的异质性。基于这些特征,肿瘤类器官逐渐成为一个具有代表性的临床前模型,助力于新的研究成果转化以及患者的精准治疗。本文将从肿瘤类器官的研究及应用的角度总结其最新进展,重点关注当前建立肿瘤类器官方法以及应用中所面临的机遇和挑战。

犬猫肿瘤样本库的发展现状及基本建立流程

生物样本库(biobank)是指具有系统性收集、储存和分发样本的存储系统,其建立有助于对疾病进行更为准确的诊疗。建立肿瘤样本库可以为肿瘤早期诊断试剂盒的研发、新药靶点的筛选与验证及肿瘤个体化治疗指导等提供服务平台。犬猫肿瘤样本库可提供高质量的生物样本,解决样本获取的难题,在研究和诊断疾病方面起着至关重要的作用。文章阐述了国内外犬猫肿瘤样本库的现状,指出了我国建设犬猫肿瘤样本库面临的问题,并总结了建立样本库的基本流程,以期为我国犬猫肿瘤样本库的建设提供参考。

肿瘤生物样本库的发展现状及探讨

生物样本包含丰富的遗传、疾病特征和治疗效果等信息,且具有不可再生性,规范保存和使用生物样本已成为肿瘤诊治与研究领域最宝贵的资源之一,本文通过对国内外生物样本库发展现状的概述,提出建设我国肿瘤生物样本库的思考。

肝脏肿瘤标本资源库的建立、维护及管理

目的探讨建立以肝癌组织样本为主的肝脏外科生物样本库及相关数据信息化管理的方法和标准化操作规程,为临床与基础研究提供高质量的临床标本资源平台。方法收集肝脏肿瘤手术患者的血液标本(血清、血浆、白细胞)、组织标本(癌、癌旁、远端正常组织),将处理好的血液标本于-80℃冰箱保存,新鲜组织置液氮保存,定期随机抽取液氮保存的肿瘤组织样本进行RNA、DNA的提取及鉴定。结果现收集并保存有完整临床信息及随访资料的肝脏肿瘤患者血液标本22 103份,组织标本3 319例,其中肝脏肿瘤组织标本807例,包括肝脏恶性肿瘤762例,良性肿瘤23例,肝硬化组织22例。随机抽取组织RNA、DNA鉴定均符合标本质量标准,能够满足后续实验要求。结论初步建立标准化、规范化的肝脏肿瘤标本库,制定了标准化的标本库维护和管理规程,为肝脏肿瘤基础和临床研究提供了宝贵的实验材料。

实体肿瘤生物样本采集及使用的病理学策略

人体组织样本库在转化医学研究设计及新技术("组学")的应用方面发挥着越来越重要的关键性作用,以期发现疾病的分子机制,并将新的生物标志物应用于临床试验。尽管病理学家的首要任务是进行临床病理诊断,但他们在样本库的运行中同样起到关键的、同时又容易被忽视的作用。除在整个生物样本操作周期中需要兼顾临床病理诊断及选取最佳生物样本外,病理学家还要为研究提供生物样本特征性信息、进行质量控制、协助研究资源的合理分配,以及对样本使用的研究者进行相关知识的培训等技术性服务。本文对这些关键的原则问题及一系列针对生物样本的肉眼评估及入库判断的大体病理操作规范进行探讨,这些操作规范体现了病理学家对于生物样本库建设至关重要的作用。总之,病理学家可协助样本使用者正确理解生物样本的性质(包括生物样本的形态学特征及使用局限性等),使生物样本的使用达到科学最大化。我们相信这些原则的实施将会更加便于病理学家和生物样本库管理者之间的协作,提高研究者对不可再生的生物样本资源的利用价值,同时优化临床病理程序中生物样本采集的规范化操作。

研究型医院肿瘤生物样本库的构建和应用

生物样本库的建立对于研究型医院有着重要作用。本文以协和医院垂体瘤标本库为例,系统阐述了该标本库建立的意义、标本库建立的历程及经验总结、标本库在基础研究及临床研究中发挥的重要作用。并对下一阶段更高标准建设垂体瘤标本库进行展望。

消化系统恶性肿瘤多中心标本库的建立及管理

为探讨建立及管理消化道恶性肿瘤多中心标本库的有效策略,该文设计了多中心标本库管理系统并制定标准化操作流程(SOPs)。牵头全国十家医院合作收集标本。建库半年收集消化道恶性肿瘤患者标本共695份。标本临床资料全面完整,统一编号,分类管理。以标本库为基础进行了临床及分子生物学研究,取得了一定成果,为多地区、多种类消化系统恶性肿瘤的研究提供了平台。

我国消化系统疾病样本库的应用现状

我国消化系统疾病高发,其中消化系统恶性肿瘤发病率高、早期诊断率低、远期生存效果差。近年来,我国生物样本库发展较快。各地区科研工作者根据不同的疾病特色、民族特色、人群特色,建立了适合其发展的不同类别、不同规模的生物样本库,推进了疾病的诊断治疗。目前我国消化系统疾病临床样本数量巨大,国家、科研机构以及各大医院对于样本库的建设也愈发重视。将这些样本资源应用于我国消化系统疾病研究、药物开发等方面,可带来巨大的社会价值。

结直肠肿瘤生物样本库质量控制体系建立的经验与体会

目的通过创建结直肠肿瘤组织样本库质量控制体系,充分保护和合理利用结直肠肿瘤标本资源,为临床和科学研究者提供质量合格的结直肠肿瘤标本,促进结直肠肿瘤的研究。方法建立严格的结直肠肿瘤组织生物样本库质量控制体系,规范收集手术切除后的肿瘤组织,包括肿瘤、瘤旁和切缘远端正常组织以及术前、术后的外周血血清/血浆标本。建立一套完整的结直肠肿瘤组织提取、储存操作流程,制定质量控制方案,建立符合国际规范的结直肠肿瘤组织生物样本库及信息管理系统,提供临床样本资源。结果标本库现保存有完整临床资料及随访资料的结直肠肿瘤组织标本1600例。其中恶性肿瘤1225例,良性肿瘤275例。包括肿瘤组织、癌旁组织、远端正常组织标本以及术前、术后血液标本。完成了标本库信息数据管理软件的开发工作,对所收集标本的流行病学及临床资料信息录入计算机归档管理。结论初步建立了具有一定规模的肿瘤标本资源库,完善了结直肠肿瘤生物样本库质量控制体系,形成了一整套肿瘤组织标本库的建设及管理方法,为相关的结直肠肿瘤研究提供了服务平台。

妇科肿瘤标准化生物样本库的建立与管理中国专家共识(2023年版)

1背景及意义生物样本库的定义是“标准化地筛选、采集、处理、保藏和分发生物样本及样本捐献者信息和临床数据的专门机构”[1]。近十年逐渐发展为大科学基础工程,为基因组、转录组、蛋白质组等多种组学研究、分子诊断标志物及药物靶点大样本验证提供高质量生物样本,是发展精准医疗、转化研究的重要桥梁与主要资源[2-5]。

-80℃低温保藏对结直肠癌血浆miRNA标志物的影响

目的探讨在非溶血和溶血状态下,低温保藏时间对结直肠癌患者血浆miRNA标志物质量的影响。方法随机抽取中山大学附属第三医院生物样本资源库2014年至2021年间在-80℃低温环境下保藏不同时间的结直肠癌血浆标本,采用分光光度计检测评估血浆溶血程度,并分为溶血组和非溶血组。miRNA提取后采用实时荧光定量PCR对潜在的结直肠癌miRNA标志物miR-92a-3p和miR-378a-5p进行丰度分析和比较。结果在-80℃低温储存环境下,非溶血组保藏8年以及溶血组保藏3年的血浆中miR-92a-3p和miR-378a-5p丰度无明显变化,溶血组保藏1、3年的血浆中miR-92a-3p的丰度显著高于同期非溶血组(均P<0.01),而两组同期保藏1、3年miR-378a-5p的丰度差异无统计学意义(P=0.931、0.339)。结论血浆初始溶血状态会影响循环miRNA的丰度,但低温保藏时间不影响血浆中miRNA的丰度,能较好地保持血浆样本中miRNA的稳定,用于后续研究。

肿瘤样本库建设与单病种MDT科研模式应用探讨

[目的]分享湖北省肿瘤医院院级肿瘤样本库标准化建设和规范化管理的经验与体会。[方法]针对样本库筹建样本收集和管理科研合作等环节,结合湖北省肿瘤医院学科发展的创新理念.分析医院样本库建设管理中的重点.难点及特色。[结果]建库5年来,湖北省肿瘤医院样本库支持科研项目10余项,涉及临床样本170例,参与国家级项目3项,省级项目1项,助力医院成功申报国家级“疑难病症诊治能力提升工程”建设项目、“湖北省结直肠癌临床医学研究中心”等。[结论]湖北省肿瘤医院样本库已摸索出一.套具有自身特色的单病种样本管理,以及MDT科研合作模式,在--定程度上推动了医院科研的快速发展,成为学科发展的重要引擎。

湖北省肿瘤医院3.0版肿瘤生物样本库的建立与管理

湖北省肿瘤医院生物样本库于2014年6月成立,是湖北省第一个院级肿瘤生物样本库,其职责是采集、储存人类常见肿瘤病种的组织、血液样本及其临床信息,并对其进行规范化管理和质量控制,以充分利用现有的肿瘤样本资源,助力医院科研及学科建设发展。过去3年间样本库先后参与了中国结直肠癌专病队列研究项目,城市癌症早诊早治项目,和武汉国家生物样本库合作开展的关于结直肠癌、乳腺癌和肺癌的科研专项研究项目等多个科研项目,并承担了这些项目的样本采集和保藏工作。样本采集模式由建库之初的综合性采集为主逐渐发展成了根据研究项目的需求针对性地采集样本为主,发展模式转向了3.0版生物样本库。

肿瘤生物样本库与转化医学

随着对肿瘤研究的日益深入,肿瘤生物样本库的重要性逐渐显现,日益受到各国科研工作者的重视,世界各地也相继建立了肿瘤生物样本库。高质量肿瘤生物样本库的建立将为研究肿瘤发病机制及个体差异,发展"个体化"治疗提供基础数据,也是决定转化医学研究的重要限速性因素。本文就国内外肿瘤生物样本库建立的现状、趋势及存在的问题做一论述。

精准医疗时代下结直肠肿瘤组织样本库的标准化建设与质量管理

目的建立一个标准的具有完整临床信息的结直肠肿瘤组织样本库,为结直肠肿瘤的基颮与临床研究提供高质量的样本。方法以浙江大学医学院附属金华医院为依托,对结直肠肿瘤组织、正常组织及其相关信息进行结构化设计,从组织样本的采集、储存等环节建立标准操作流程,规范化录人样本患者的基本信息.病史和病理等相关临床信息,定期从病理形态、分子水平等方面进行随机质检。结果成功构建了结直肠肿瘤组织样本库,在样本库建立和完善的过程中,从样本采集、人库、保存到出库等众多环节实现了对样本库的标准化质量控制,随机抽样质检结果显示RNA保存效果良好,癌组织中肿瘤比例>80%,且样本临床资料完整。结论初步构建的结直肠肿瘤组织样本库不仅提高了组织样本的利用价值,而且为实现基础研究和临床应用的双向转化提供了保障。

恶性肿瘤生物样本信息数据库的构建及应用

目的生物样本库对临床转化性研究具有重要的推动作用,随着生物样品数量的日益增加和研究需求的多样性,传统的电子表格管理模式已不能满足庞大样品量及其临床信息高效、集中管理的需求。因此迫切需要对生物样本实行信息化管理,构建恶性肿瘤生物样本及临床信息的信息化管理体系,以实现生物样本信息的系统化、规范化、高效化管理。方法以恶性肿瘤生物样本信息数据库为依托,对恶性肿瘤样品源及样品信息进行结构化设计,通过恶性肿瘤样品组、样品源组、虚拟医用冰箱的构建,整合恶性肿瘤患者基本信息、临床信息等相关信息,并实现查询统计功能。结果成功构建了恶性肿瘤生物样本数据库,包含样品组、样品源组、虚拟医用冰箱组,实现了生物样本的查询统计应用,包括各癌种的样品量统计、各科室血液样品和组织样品的采集量统计,以及对样品管出库管理的应用。结论构建的恶性肿瘤生物样本信息数据库,数据信息完整、结构设计合理,样品组信息具有可扩展性。该数据库满足了我院当前生物样本数据信息化管理的需求,实现了多项查询统计应用和出库应用,为相关恶性肿瘤疾病的研究提供了可靠保障。

肿瘤生物样本库的运营与应用

一个集样本收集、处理、储存和分发等活动为主的肿瘤生物样本库,正在为生物样本库事业、肿瘤的基础与临床研究发挥重要作用。肿瘤生物样本库除收集、处理、储存和分发肿瘤相关的生物样本,同时收集相关的生物样本信息与样本本身同等重要,缺一不可。肿瘤生物样本库样本与一般疾病样本库区别最大之处,是其样本的病理学形态至关重要,应提供明确的肿瘤形态学分析信息供研究者使用。与其他任何生物样本库一样,肿瘤生物样本库的可持续性发展,是决定其是否能够生存,并在医药卫生事业和攻克癌症中充分发挥作用的关键。以肿瘤生物样本库联盟的形式扩大肿瘤样本数量,能够快速为课题组织高质量的肿瘤样本,满足研究的需求,是肿瘤生物样本库长期而持续发展的任务。