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阴道毛滴虫衰老相关基因Tv-Sir2-like克隆与序列分析 被引量:3
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作者 张可浩 傅玉才 +1 位作者 章家新 刘红 《汕头大学医学院学报》 2004年第3期132-135,共4页
目的 :克隆单细胞模式生物阴道毛滴虫 (Tv)Sir2基因 ,以便探讨其功能。方法 :构建TvcDNA表达文库 ,筛选出Tv_Sir2_like基因 ,并对该基因进行序列分析。结果 :成功克隆Tv_Sir2_like基因。测序及序列分析显示 ,Tv_Sir2_like基因开放读码框... 目的 :克隆单细胞模式生物阴道毛滴虫 (Tv)Sir2基因 ,以便探讨其功能。方法 :构建TvcDNA表达文库 ,筛选出Tv_Sir2_like基因 ,并对该基因进行序列分析。结果 :成功克隆Tv_Sir2_like基因。测序及序列分析显示 ,Tv_Sir2_like基因开放读码框长 1116bp ,编码 3 71个氨基酸残基的蛋白质。该氨基酸序列与SIR2的同源性最高 ,并具有SIR2 3个特征性的高度保守结构域。结论 :推测Tv_Sir2_like是Sir2的同源基因 ,其表达产物可能参与Tv转录沉默 。 展开更多
关键词 阴道毛滴虫 E基因 克隆 序列分析 衰老相关基因 CDNA表达文库 细胞周期 结构域 氨基酸序列 转录
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转录因子7-like 2在宫颈癌中表达水平及其与顺铂化疗敏感性关系研究
2
作者 冯敏娟 蔡东阁 李虹 《陕西医学杂志》 CAS 2024年第10期1335-1339,共5页
目的:探究转录因子7-like 2(TCF7L2)在宫颈癌患者中表达水平及其与顺铂化疗敏感性的相关性。方法:收集68例宫颈癌患者(观察组)和68例体检正常者(对照组)为研究对象。留取两组晨起静脉血样用于血清TCF7L2和β-catenin表达水平测定。分析... 目的:探究转录因子7-like 2(TCF7L2)在宫颈癌患者中表达水平及其与顺铂化疗敏感性的相关性。方法:收集68例宫颈癌患者(观察组)和68例体检正常者(对照组)为研究对象。留取两组晨起静脉血样用于血清TCF7L2和β-catenin表达水平测定。分析血清中TCF7L2和β-catenin与患者临床特征及顺铂化疗敏感性的关系。结果:观察组患者血清TCF7L2和β-catenin表达水平显著高于对照组(均P<0.05)。观察组患者FIGO分期Ⅳa期、肿瘤低分化者血清中TCF7L2、β-catenin表达水平明显高于FIGO分期Ⅱb期、Ⅲ期和肿瘤高分化者,FIGO分期Ⅲ期明显高于FIGO分期Ⅱb期,出现淋巴转移者高于无淋巴转移者(均P<0.05);同时顺铂化疗不敏感者血清TCF7L2、β-catenin表达水平明显高于敏感者(均P<0.05)。Logistic回归分析显示,血清中TCF7L2、β-catenin高表达是顺铂化疗不敏感的危险因素(均P<0.05)。结论:宫颈癌患者中TCF7L2异常高表达,且其高表达可能是导致患者顺铂化疗耐药的原因之一。 展开更多
关键词 宫颈癌 化疗 顺铂 转录因子7-like 2 预后 耐药性
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陆地棉2-酮戊二酸依赖型氧化酶GhAOP2-like基因的克隆和功能分析
3
作者 李丹 赵存鹏 +5 位作者 刘素恩 王凯辉 张晓慧 赵丽英 郭宝生 耿军义 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期49-54,共6页
为了研究棉花中AOP2-like(GhAOP2-like)与抗旱耐盐的相关性,根据河北省农林科学院棉花研究所遗传育种研究室前期获得的蛋白质组数据,利用同源克隆法得到了GhAOP2-like的基因序列,用生物信息学方法对GhAOP2-like蛋白的理化性质、结构、... 为了研究棉花中AOP2-like(GhAOP2-like)与抗旱耐盐的相关性,根据河北省农林科学院棉花研究所遗传育种研究室前期获得的蛋白质组数据,利用同源克隆法得到了GhAOP2-like的基因序列,用生物信息学方法对GhAOP2-like蛋白的理化性质、结构、亚细胞定位等进行了分析,利用qRT-PCR技术检测了GhAOP2-like的组织特异性表达以及在干旱、盐和激素处理下的表达量变化。结果显示,GhAOP2-like位于D13染色体上,CDS序列长972 bp,编码323个氨基酸。生物信息学分析发现,GhAOP2-like蛋白的分子式为C_(1654)H_(2525)N_(429)O_(478)S_(19),理论等电点为5.20,不含信号肽和跨膜结构域,定位于细胞质中。聚类分析结果显示,棉花与其他物种中的AOP序列被明显分成2组,但与木槿中AOP序列关系最近。根据qRT-PCR的结果,发现GhAOP2-like在根、茎、叶和发育中的种子中都表达,但在根中表达量最高,并且在干旱、盐、GA_(3)、MeJA和ABA处理下上调表达,但在MeJA处理下表达变化最强烈,说明GhAOP2-like可能通过参与茉莉酸信号通路调节根系的生长从而提高陆地棉的抗逆性。 展开更多
关键词 陆地棉 非生物胁迫 GhAOP2-like 茉莉酸信号通路 次生代谢产物
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MdDGK3-like as a negative regulator participates in ALA-induced PP2AC to promote stomatal opening in apple leaves 被引量:1
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作者 Zheng Chen Yingrui Lou Liangju Wang 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2023年第5期898-908,共11页
5-Aminolevulinic acid(ALA)can inhibit abscisic acid(ABA)-induced stomatal closure.However,the molecular mechanism is unclear.In this study,we found that ALA upregulated the MdPP2AC expression and PP2A activity in the ... 5-Aminolevulinic acid(ALA)can inhibit abscisic acid(ABA)-induced stomatal closure.However,the molecular mechanism is unclear.In this study,we found that ALA upregulated the MdPP2AC expression and PP2A activity in the apple(Malus domestica Borkh.cv.‘Fuji’)leaves.With the promoter of MdPP2AC as bait,a diacylglycerol kinase MdDGK3-like was selected by the Yeast One Hybrid(Y1H)from the cDNA library of the epidermis of apple leaves treated by exogenous ALA.Additional to binding the promoter of MdPP2AC,MdDGK3-like was found to inhibit the transcription activity of MdPP2AC promoter,while ALA significantly eliminated the role of MdDGK3-like.In tobacco leaves,MdDGK3-like was localized in the nucleus of stomatal guard cells.Therefore,MdDGK3-like might act as a transcription factor negatively regulating MdPP2AC expression and causing stomatal closure.To further identify MdDGK3-like functions,several transiently transgenic apple leaves(including overexpression and interference)were established.The results revealed that overexpression of MdDGK3-like promoted stomatal closure by increasing Ca^(2+)and H_(2)O_(2)and decreasing flavonol levels in the guard cells.Conversely,MdDGK3-like(i)led the stomatal opening with lower levels of Ca^(2+)and H_(2)O_(2)but higher flavonols.Based on these,we proposed a new hypothesis that ALA up-regulated MdPP2AC expression via negatively regulating the expression of MdDGK3-like to up-regulate PP2A expression and the enzyme activity,which improved the stomatal aperture.Since it was the first time that MdDGK3-like was showed to act as a transcription factor,the proposed model provided a new insight onto the mechanisms of ALA-induced stomatal opening. 展开更多
关键词 ALA APPLE MdDGK3-like MdPP2AC Stomatal opening Transcription factor
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小麦G2-like转录因子家族基因鉴定与表达模式分析 被引量:1
5
作者 贾玉库 高宏欢 +5 位作者 冯健超 郝紫瑞 王晨阳 谢迎新 郭天财 马冬云 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1410-1425,共16页
Golden2-Like(G2-like)转录因子,是属于MYB类转录因子中GARP超家族的成员,在调节叶绿体发育中起重要作用。本研究利用生物信息学方法对小麦G2-like基因进行了全基因组鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、启动子顺式作用元件及对非生物胁... Golden2-Like(G2-like)转录因子,是属于MYB类转录因子中GARP超家族的成员,在调节叶绿体发育中起重要作用。本研究利用生物信息学方法对小麦G2-like基因进行了全基因组鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、启动子顺式作用元件及对非生物胁迫和激素的响应模式进行了分析。从小麦中共鉴定出87个G2-like基因,不均匀的分布在小麦21条染色体上,系统发育分析将这些基因分为14个亚族。蛋白质二级结构预测表明,小麦G2-like基因的氨基酸序列均以α螺旋和随机卷曲为主要结构。启动子顺式作用元件分析表明其上游2 kb区域含有7种(P-box、SpI、LTR、ABRE、MBS、TGA-element和AE-box)与逆境胁迫诱导相关顺式作用元件。其中Ta3AG2-like19含有顺式调控元件结合位点最多,一共有18个结合位点。qRT-PCR验证发现,Ta3AG2-like19、Ta3AG2-like20、Ta4AG2-like29和Ta6AG2-like52在PEG和盐胁迫下以及GA、IAA和ABA激素诱导下表达量显著上调,这些基因可能介导了小麦对多种非生物逆境的响应。 展开更多
关键词 小麦 G2-like转录因子 生物信息学 逆境胁迫 表达分析
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海藻糖酶基因TRE2-like和TRE2在异色瓢虫羽化过程中的表达与功能 被引量:1
6
作者 张道伟 李燕 +5 位作者 张萌 王莎莎 肖仲久 曾伯平 倪晓丽 唐斌 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期663-671,共9页
【目的】异色瓢虫Harmonia axyridis是一种重要的捕食性天敌昆虫,海藻糖在异色瓢虫的变态发育、羽化等整个生命过程都起着重要的作用。本研究以前期获得的类似膜结合型海藻糖酶(TRE2-like)与膜结合型海藻糖酶(TRE2)基因为基础,探讨在异... 【目的】异色瓢虫Harmonia axyridis是一种重要的捕食性天敌昆虫,海藻糖在异色瓢虫的变态发育、羽化等整个生命过程都起着重要的作用。本研究以前期获得的类似膜结合型海藻糖酶(TRE2-like)与膜结合型海藻糖酶(TRE2)基因为基础,探讨在异色瓢虫羽化阶段这两个海藻糖酶的潜在功能,为阐明异色瓢虫从蛹发育到成虫时海藻糖代谢机制提供参考。【方法】根据TRE2-like和TRE2基因序列设计双链RNA(dsRNA)区域片段并合成对应的dsRNA,通过RNAi将其注射到异色瓢虫2日龄蛹中。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测RNAi处理后羽化第1天的异色瓢虫成虫糖代谢相关基因的表达;同时采用蒽酮比色法、酶标法等分别测定RNAi处理后羽化第1天的异色瓢虫成虫主要糖类物质含量及TRE活性变化,并观察异色瓢虫羽化后的表型变化。【结果】结果表明,与对照组(dsGFP注射组)相比,异色瓢虫2日龄蛹被注射TRE2-like或TRE2 dsRNA后,其新羽化成虫体内TRE2-like和TRE2表达量均极显著下调,且少数个体出现了蜕皮与翅形成困难等畸形表型。可溶性海藻糖酶活性在注射dsTRE2-like后显著降低,膜结合型海藻糖酶活性在注射dsTRE2后显著降低;注射dsTRE2后糖原含量显著下降,注射dsTRE2-like后糖原和海藻糖含量显著下降,注射dsTRE2-like+dsTRE2后糖原和葡萄糖含量显著下降,且海藻糖含量极显著下降。注射dsTRE2-like, dsTRE2和dsTRE2-like+dsTRE2后可溶性海藻糖酶基因TRE1-1和TRE1-2表达下降或显著下降,而TRE1-5表达上升或显著上升,海藻糖合成酶(trealose-6-phosphate synthase, TPS)、糖原磷酸化酶(glycogen phosphorylase, GP)、糖原合成酶(glycogen synthase, GS)基因的表达均显著下调。【结论】TRE2-like和TRE2基因表达被抑制后,异色瓢虫海藻糖等代谢受到影响。研究结果为探究异色瓢虫体内膜结合型海藻糖酶的潜在功能和调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 异色瓢虫 海藻糖酶 TRE2-like TRE2 基因表达 酶活性 RNA干扰
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大豆GmNAC73-like基因的克隆和表达及其对GmIFS2基因的影响 被引量:1
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作者 万群 刘晓庆 +5 位作者 张大勇 何晓兰 徐照龙 宁丽华 黄益洪 邵宏波 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期12-18,27,共8页
为研究NAC转录因子对大豆〔Glycine max(Linn.)Merr.〕异黄酮合成的影响,根据大豆基因组序列设计引物,从豆荚中克隆获得Gm NAC73-like基因,并对该基因序列进行生物信息学分析。结果显示:Gm NAC73-like基因包含1个长度981 bp的完整开放... 为研究NAC转录因子对大豆〔Glycine max(Linn.)Merr.〕异黄酮合成的影响,根据大豆基因组序列设计引物,从豆荚中克隆获得Gm NAC73-like基因,并对该基因序列进行生物信息学分析。结果显示:Gm NAC73-like基因包含1个长度981 bp的完整开放阅读框,编码326个氨基酸。Gm NAC73-like蛋白的理论相对分子质量37 000,理论等电点p I 6.4,为亲水性蛋白,无信号肽,并被定位在细胞核上,包含核定位信号"PKRRK"。同源性比对结果显示:Gm NAC73-like蛋白与野大豆(Glycine soja Sieb.et Zucc.)、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula Gaertn.)、可可(Theobroma cacao Linn.)、葡萄(Vitis vinifera Linn.)及拟南芥〔Arabidopsis thaliana(Linn.)Heynh.〕的NAC蛋白具有较高的相似性,相似度分别为93%、69%、73%、75%和58%。在NJ系统树上,Gm NAC73-like蛋白与野大豆的Gs NAC8蛋白和木豆〔Cajanus cajan(Linn.)Millsp.〕的Cc NAC8蛋白聚在一起,显示出较近的亲缘关系。半定量RT-PCR分析结果显示:在大豆的三叶期、开花期和结荚期,Gm NAC73-like基因在根中均不表达,在茎和叶中可不同程度表达且茎中表达量较高;而在开花期或结荚期,该基因在花或豆荚中也可表达,且豆荚中表达量较高。酵母单杂交实验结果显示:Gm NAC73-like可与异黄酮生物合成关键酶基因Gm IFS2启动子中的CGTG基序结合;在大豆转基因发状根系中过表达Gm NAC73-like基因后,除查尔酮异构酶基因的表达量无变化外,其他异黄酮生物合成相关基因的表达量均不同程度提高,其中,肉桂酸-4-羟化酶基因和查尔酮合酶基因的表达量明显提高。此外,在Gm NAC73-like基因过表达的大豆转基因发状根系中总异黄酮含量显著降低。综合分析结果表明:Gm NAC73-like可能通过与MYB转录因子的互作调控Gm IFS2基因的表达,并在大豆异黄酮的生物合成过程中起负调控作用。 展开更多
关键词 大豆 GmNAC73-like基因 蛋白特性 表达特性 GmIFS2基因 总异黄酮含量
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大豆胞囊线虫相关G2-like转录因子生物信息学分析 被引量:1
8
作者 韩英鹏 李一 +4 位作者 吴桐 徐爱佟 白芮瑶 卜凡珊 姜海鹏 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期1-9,共9页
G2-like转录因子在植物中广泛存在,是GARP转录因子超家族中重要成员之一,在叶绿体发育、果实生长、生物或非生物胁迫和植物衰老等方面均起重要作用。研究对大豆胞囊线虫3号生理小种胁迫下东农L-10(抗病)根部进行转录组测序,初步筛选得到... G2-like转录因子在植物中广泛存在,是GARP转录因子超家族中重要成员之一,在叶绿体发育、果实生长、生物或非生物胁迫和植物衰老等方面均起重要作用。研究对大豆胞囊线虫3号生理小种胁迫下东农L-10(抗病)根部进行转录组测序,初步筛选得到8个与大豆胞囊线虫抗性相关G2-like转录因子,并通过在线软件对其作生物信息学分析。结果表明,G2-like家族成员中8个G2-like转录因子均定位于细胞核,为亲水性蛋白;蛋白质二级结构大多以无规则卷曲为主;Gl GLK-3含有与大豆生长发育及逆境胁迫密切相关顺式作用元件。GlGLK-1、GlGLK-2、GlGLK-5和GlGLK-7与拟南芥ATGLK1和ATGLK2亲缘关系最近,预示其在功能上相似性。 展开更多
关键词 大豆 G2-like 转录因子 生物信息学分析
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落叶松APETALA2-Like转录因子基因的分离及功能分析
9
作者 李爱 李少娟 +1 位作者 吴建强 阎国荣 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1305-1311,共7页
以落叶松转录组测序数据为基础,利用RT-PCR从落叶松中分离出一个1590 bp的APETALA2-Like转录因子基因全长编码序列,命名为La AP2L1。蛋白质特性分析显示La AP2L1编码529个氨基酸,为亲水性蛋白,相对分子质量为58.327 k D,等电点为6.45。... 以落叶松转录组测序数据为基础,利用RT-PCR从落叶松中分离出一个1590 bp的APETALA2-Like转录因子基因全长编码序列,命名为La AP2L1。蛋白质特性分析显示La AP2L1编码529个氨基酸,为亲水性蛋白,相对分子质量为58.327 k D,等电点为6.45。二级结构主要由α-螺旋(alpha helix)、β-折叠(strand)和环肽链(loop)组成。多重序列比对和系统进化分析表明La AP2L1所编码的氨基酸与黑松、云杉等亲缘关系最近。同时,通过构建植物表达载体,利用浸花法转化模式植物拟南芥的功能研究发现,与转空载体对照拟南芥相比,过量表达La AP2L1的转基因拟南芥的叶片、茎、花和株高都显著增大、增高,表明落叶松La AP2L1转录因子可能参与了植物器官发育的调节。 展开更多
关键词 落叶松 APETALA2-like 植物器官发育 拟南芥
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S_(N)2(N)-like和S_(N)2(P)-like与传统S_(N)2反应的对比分析 被引量:1
10
作者 王运滨 《沈阳化工大学学报》 CAS 2021年第3期282-288,共7页
由于包含NH_(3)—和PH_(3)—基团的络合物的类S_(N)2(S_(N)2-like)反应存在于实际的生物体内,因此,研究其作用方式非常重要.采用从头算CCSD(T)/aug-cc-pVTZ//MP2/6-311++G(3df,3pd)方法研究恒等的HF进攻的以N和P为中心的类S_(N)2(S_(N)2... 由于包含NH_(3)—和PH_(3)—基团的络合物的类S_(N)2(S_(N)2-like)反应存在于实际的生物体内,因此,研究其作用方式非常重要.采用从头算CCSD(T)/aug-cc-pVTZ//MP2/6-311++G(3df,3pd)方法研究恒等的HF进攻的以N和P为中心的类S_(N)2(S_(N)2-like)反应机理,对比分析F-进攻S_(N)2反应路径上固定点的几何构型、活化能等信息,分析探讨过渡态NPA电荷分布.研究表明:F-进攻以N和P为中心的S_(N)2反应,在气相中背面进攻具有翻转构型的反应是优选的反应路径;而HF进攻的以N和P为中心的类S_(N)2反应,则是前面进攻具有保留构型的反应路径是优选的反应路径,与传统的S_(N)2反应不同,因为包含NH_(3)—和PH_(3)—基团的络合物的S_(N)2-like前面进攻的路径是最可能有效的作用方式. 展开更多
关键词 S_(N)2(N)-like反应 S_(N)2(P)-like反应 前面和背面进攻
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转录因子7-like 2基因沉默对原发性肝癌Th1/Th2免疫漂移与微血管密度的调控作用研究 被引量:8
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作者 朱冬梅 唐翀 朱斌 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期930-938,共9页
目的探究转录因子7-like 2(transcription factor 7-like 2,TCF7L2)对原发性肝癌大鼠Th1/Th2免疫漂移及微血管密度(microvessel density,MVD)形成的影响。方法 60只Wistar大鼠根据随机数字表法分为空白对照组、模型组、si-NC组和siTCF7L... 目的探究转录因子7-like 2(transcription factor 7-like 2,TCF7L2)对原发性肝癌大鼠Th1/Th2免疫漂移及微血管密度(microvessel density,MVD)形成的影响。方法 60只Wistar大鼠根据随机数字表法分为空白对照组、模型组、si-NC组和siTCF7L2组,每组15只。除空白对照组外,其余3组大鼠通过饮用二乙基亚硝胺(DEN)制备原发性肝癌模型。14周后,si-NC组大鼠尾静脉注射阴性对照慢病毒混合液,si-TCF7L2组大鼠尾静脉注射LV-TCF7L2-siRNA慢病毒混合液,空白对照组和模型组大鼠注射等体积生理盐水,每日1次,连续7 d。6周后,大鼠腹主动脉采血,全自动血液分析仪检测血清天冬氨酸转氨酶(AST)、丙氨酸转氨酶(ALT)及总胆红素(TBIL)含量;ELISA法检测干扰素-γ(IFN-γ)、白细胞介素-2(IL-2)、IL-4和IL-10含量;HE染色观察大鼠肝组织形态学变化;免疫荧光染色检测大鼠肝组织血管内皮细胞生长因子(VEGF)表达;免疫组织化学染色检测大鼠肝组织INF-γ、IL-4表达及MVD形成情况;实时荧光定量PCR检测肝组织中转录因子T-bet和Gata-3 m RNA表达;流式细胞术检测脾脏淋巴细胞Th1、Th2比例及Th1/Th2比值。结果与空白对照组比较,模型组大鼠血清中ALT、AST、TBIL升高(P<0.01),IL-2、IFN-γ水平下降,IL-4、IL-10水平升高,IFN-γ/IL-4比例降低(P<0.01),肝组织出现肿瘤细胞,排列紊乱且核质变大、核仁突出,VEGF和IL-4表达水平变高,IFN-γ表达水平降低(P<0.01), MVD增加(P<0.01),T-bet mRNA相对表达量下调,Gata-3 mRNA相对表达量上调(P<0.01),Th1细胞比例减少,Th2细胞比例增加,Th1/Th2比值降低(P<0.01)。与模型组比较,si-TCF7L2组大鼠血清中ALT、AST、TBIL降低(P<0.01),IL-2、IFN-γ水平升高,IL-4、IL-10水平下降,IFN-γ/IL-4比例升高(P<0.01),肝组织癌变程度减小,VEGF和IL-4表达水平降低,IFN-γ表达水平升高(P<0.01), MVD减少(P<0.01),T-bet m RNA相对表达量上调,Gata-3 mRNA相对表达量下调(P<0.01);同时,Th1细胞比例增加而Th2细胞比例减少,Th1/Th2比值升高(P<0.01)。结论沉默TCF7L2表达可效抑制原发性肝癌大鼠模型瘤体中微血管密度,调节Th1/Th2比例趋于正常。 展开更多
关键词 原发性肝癌 转录因子7-like 2 微血管密度 Th1/Th2免疫漂移
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葡萄Golden2-like转录因子家族的鉴定及其表达分析 被引量:2
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作者 许晨 李青云 +5 位作者 万俊男 侯雨君 周慧敏 朱振飞 辛海平 李吉涛 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期205-215,共11页
本研究对葡萄(Vitis vinifera L.)的Golden2-like(GLK)转录因子家族进行了全基因组鉴定和表达模式分析,并利用品种‘玫瑰香’(V.vinifera cv.Muscat Hamburg)进一步验证其在低温胁迫下的响应。结果显示,葡萄Golden2-like家族共46个成员... 本研究对葡萄(Vitis vinifera L.)的Golden2-like(GLK)转录因子家族进行了全基因组鉴定和表达模式分析,并利用品种‘玫瑰香’(V.vinifera cv.Muscat Hamburg)进一步验证其在低温胁迫下的响应。结果显示,葡萄Golden2-like家族共46个成员,分为5个亚族,同一亚族的保守结构域相似。46个VvGLK分别定位于细胞核、叶绿体、细胞质和过氧化物酶体中,其启动子区域含多种逆境应答顺式作用元件。基因芯片分析结果表明,22个Golden2-like基因在果实发育过程中变化显著。同时,有15、15和9个基因分别响应盐、干旱和低温胁迫。qRT-PCR分析发现26个基因参与低温应答。VvGLK41在所有胁迫处理中均下调表达。 展开更多
关键词 葡萄 Golden2-like 低温胁迫 果实发育 表达分析
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尼罗罗非鱼CD2-like基因克隆及其胞外区表达研究
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作者 陈福暖 高晓琳 +6 位作者 曾晓怜 谢彩霞 汪志文 鲁义善 吴灶和 王忠良 王蓓 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期700-709,共10页
依据数据库中预测的尼罗罗非鱼白细胞分化抗原2(CD2)基因(GenBank登录号:XM_005460661.4)序列,采用PCR扩增体质量(150±50)g尼罗罗非鱼CD2分子同源类似物(CD2-like)基因编码区片段,然后以其胞外区构建原核表达质粒pGEX-6P1-CD2L,并... 依据数据库中预测的尼罗罗非鱼白细胞分化抗原2(CD2)基因(GenBank登录号:XM_005460661.4)序列,采用PCR扩增体质量(150±50)g尼罗罗非鱼CD2分子同源类似物(CD2-like)基因编码区片段,然后以其胞外区构建原核表达质粒pGEX-6P1-CD2L,并进行原核表达及条件优化,最后进行复性纯化,为进一步研究该CD2-like分子在罗非鱼中的免疫功能奠定基础。研究结果表明,罗非鱼CD2-like(OnCD2-like)基因(GenBank登录号:MN296489)编码区全长1110bp,其中胞外区长558 bp。构建OnCD2-like胞外区的原核表达质粒pGEX-6P1-CD2L,将该重组质粒导入大肠杆菌BL21后,成功表达OnCD2-like胞外段重组蛋白。原核表达结果显示,目的蛋白分子质量为20ku,主要以包涵体形式存在,而该包涵体蛋白复性纯化最佳条件为:37℃下,0.2mmol/L异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导6h,经梯度稀释复性并纯化后可成功获得目的重组蛋白。 展开更多
关键词 尼罗罗非鱼 CD2-like基因 基因克隆 原核表达
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G1-like与F/98-like进化谱系的P B2、M基因在H5N6亚型禽流感病毒重配中的竞争优势研究
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作者 刘娇 郝小利 +7 位作者 李秀丽 刘东 石磊 陈凯彪 刘开拓 王晓泉 顾敏 刘秀梵 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1087-1093,共7页
为评价不同H9N2亚型病毒供体在H5N6亚型禽流感病毒(AIV)重配中的作用,本研究选取全套内部基因与S基因型H9N2 AIV高度同源的3株H5N6 AIV流行株MZ34、YB0597和JT131,利用反向遗传学技术在MZ34的8基因重组质粒基础上另外添加F/98-like来源... 为评价不同H9N2亚型病毒供体在H5N6亚型禽流感病毒(AIV)重配中的作用,本研究选取全套内部基因与S基因型H9N2 AIV高度同源的3株H5N6 AIV流行株MZ34、YB0597和JT131,利用反向遗传学技术在MZ34的8基因重组质粒基础上另外添加F/98-like来源的PB2和M质粒,即以MZ34(8)+F/98(PB2+M)的10质粒组合(Group 1)共转染细胞进行重组H5N6病毒的竞争性拯救;PCR扩增经3轮空斑纯化后PCR扩增拯救病毒的PB2和M基因并测序鉴定。同时,为排除来源于同一母本病毒的8质粒易于自我组合包装的可能干扰,又将MZ34的PB2和M质粒替换为YB0597或JT131来源的质粒,构成另外的2种10质粒组合Group 2:MZ34(6)+YB0597(PB2+M)+F/98(PB2+M)和Group 3:MZ34(6)+YB0597(PB2)+JT131(M)+F/98(PB2+M),经共染获得拯救病毒,对其PB2和M基因PCR扩增后测序鉴定。结果显示,从Group1、Group 2和Group 3中拯救获得的重组H5N6病毒中PB2基因的构成情况S∶H分别为41∶23、48∶15以及37∶19,M基因的构成情况S∶H分别为40∶24、31∶32以及25∶31,而PB2和M基因的组合情况SS∶SH∶HS∶HH分别为27∶14∶13∶10、26∶22∶5∶10以及17∶20∶8∶11。表明相较于H型的F/98-like PB2与M基因,S型的G1-like PB2基因在各10质粒转染组的拯救的H5N6病毒重配中具有更显著的竞争优势,而G1-like M基因仅在Group 1组拯救的重组病毒中表现出优势,但G1-like PB2与M基因间的竞争优势叠加效应不明显。本研究为解析S基因型H9N2 AIV作为H7N9、H10N8等新型重组流感病毒内部基因供体的相关机制提供重要参考。 展开更多
关键词 H5N6亚型禽流感 H9N2内部基因 竞争优势 G1-like PB2和M
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Short hairpin RNA-mediated knockdown of nuclear factor erythroid 2-like 3 exhibits tumor-suppressing effects in hepatocellular carcinoma cells 被引量:3
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作者 Miao-Mei Yu Yue-Hua Feng +2 位作者 Lu Zheng Jun Zhang Guang-Hua Luo 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2019年第10期1210-1222,共13页
BACKGROUND Hepatocellular carcinoma(HCC) is one of the most common malignant tumors with high mortality-to-incidence ratios. Nuclear factor erythroid 2-like 3(NFE2 L3), also known as NRF3, is a member of the cap ‘n&#... BACKGROUND Hepatocellular carcinoma(HCC) is one of the most common malignant tumors with high mortality-to-incidence ratios. Nuclear factor erythroid 2-like 3(NFE2 L3), also known as NRF3, is a member of the cap ‘n' collar basic-region leucine zipper family of transcription factors. NFE2 L3 is involved in the regulation of various biological processes, whereas its role in HCC has not been elucidated.AIM To explore the expression and biological function of NFE2 L3 in HCC.METHODS We analyzed the expression of NFE2 L3 in HCC tissues and its correlation with clinicopathological parameters based on The Cancer Genome Atlas(TCGA) data portal. Short hairpin RNA(shRNA) interference technology was utilized to knock down NFE2 L3 in vitro. Cell apoptosis, clone formation, proliferation, migration,and invasion assays were used to identify the biological effects of NFE2 L3 in BEL-7404 and SMMC-7721 cells. The expression of epithelial-mesenchymal transition(EMT) markers was examined by Western blot analysis.RESULTS TCGA analysis showed that NFE2 L3 expression was significantly positively correlated with tumor grade, T stage, and pathologic stage. The qPCR and Western blot results showed that both the mRNA and protein levels of NFE2 L3 were significantly decreased after shRNA-mediated knockdown in BEL-7404 and SMMC-7721 cells. The shRNA-mediated knockdown of NFE2 L3 could induce apoptosis and inhibit the clone formation and cell proliferation of SMMC-7721 and BEL-7404 cells. NFE2 L3 knockdown also significantly suppressed the migration, invasion, and EMT of the two cell lines.CONCLUSION Our study showed that shRNA-mediated knockdown of NFE2 L3 exhibited tumor-suppressing effects in HCC cells. 展开更多
关键词 Nuclear factor ERYTHROID 2-like 3 Hepatocellular carcinoma The Cancer Genome Atlas Short HAIRPIN RNA Epithelial-mesenchymal transition
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Role of nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 2 in metabolic homeostasis and insulin action: A novel opportunity for diabetes treatment? 被引量:5
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作者 Zhi-Wen Yu Dan Li +1 位作者 Wen-Hua Ling Tian-Ru Jin 《World Journal of Diabetes》 SCIE 2012年第1期19-28,共10页
Redox balance is fundamentally important for physiological homeostasis. Pathological factors that disturb this dedicated balance may result in oxidative stress, leading to the development or aggravation of a variety o... Redox balance is fundamentally important for physiological homeostasis. Pathological factors that disturb this dedicated balance may result in oxidative stress, leading to the development or aggravation of a variety of diseases, including diabetes mellitus, cardiovascular diseases, metabolic syndrome as well as inflammation, aging and cancer. Thus, the capacity of endogenous free radical clearance can be of patho-physiological importance; in this regard, the major reactive oxygen species defense machinery, the nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 2 (Nrf2) system needs to be precisely modulated in response to pathological alterations. While oxidative stress is among the early events that lead to the development of insulin resistance, the activation of Nrf2 scavenging capacity leads to insulin sensitization. Furthermore, Nrf2 is evidently involved in regulating lipid metabolism. Here we summarize recent findings that link the Nrf2 system to metabolic homeostasis and insulin action and present our view that Nrf2 may serve as a novel drug target for diabetes and its complications. 展开更多
关键词 Nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 2 Oxidative stress INSULIN resistance Metabolism Dia- betic drug
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巨桉GOLDEN2-LIKE基因家族全基因组鉴定与进化分析 被引量:3
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作者 李丁宁 吴进樟 +1 位作者 李白杨 曹世江 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2020年第6期816-824,共9页
利用生物信息学方法,基于全基因组水平筛选鉴定出40个巨桉GLK基因(EgG1~EgG40),对其分子质量、等电点和亲水性进行了预测.结果表明,这些基因非均匀地分布在11条染色体上,亚细胞定位主要在细胞质和细胞核上.GLK蛋白二级结构主要以α-螺... 利用生物信息学方法,基于全基因组水平筛选鉴定出40个巨桉GLK基因(EgG1~EgG40),对其分子质量、等电点和亲水性进行了预测.结果表明,这些基因非均匀地分布在11条染色体上,亚细胞定位主要在细胞质和细胞核上.GLK蛋白二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主.系统进化分析将巨桉GLK基因分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ等5个亚家族.该家族基因含有1~11个外显子,基因结构相对保守.结果表明巨桉GLK基因在成熟叶、茎尖和幼叶中表达较高,而在木质部中表达相对较低. 展开更多
关键词 巨桉 GOLDEN2-like基因 全基因组鉴定 进化分析
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AmphiSox1/2/3-like基因的系统进化学分析和在文昌鱼胚胎发育中的表达
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作者 张伟 李忻怡 +4 位作者 黄向炜 林浴霜 安云鹤 张培军 张红卫 《自然科学进展》 北大核心 2005年第8期930-936,共7页
为了研究文昌鱼胚胎发育中神经管发育的分子机制和脊椎动物中枢神经系统的起源,我们筛选和分析了与佛罗里达文昌鱼AmphiSox1/2/3基因同源的青岛文昌鱼AmphiSox1/2/3-like 基因,对其推测的氨基酸序列与17个脊椎动物和无脊椎动物的同源基... 为了研究文昌鱼胚胎发育中神经管发育的分子机制和脊椎动物中枢神经系统的起源,我们筛选和分析了与佛罗里达文昌鱼AmphiSox1/2/3基因同源的青岛文昌鱼AmphiSox1/2/3-like 基因,对其推测的氨基酸序列与17个脊椎动物和无脊椎动物的同源基因进行了系统的进化学分析,并利用胚胎整体原位杂交技术结合系列组织学切片技术,对该基因在青岛文昌鱼胚胎发育中的时空表达模式进行了系统的研究.AmphiSox1/2/3-like在原肠胚早中期开始在背部上胚层和预定神经外胚层中明显表达.在神经胚早期其表达定位于神经板.此后,表达区域位于形成中的神经管和胚胎中、后部分化中的神经管的两侧,其表达的水平从前向后逐渐下调和终止.此外,该基因在神经胚晚期和幼虫期的消化道壁中也有明显表达.研究结果显示,该基因与文昌鱼的神经分化和消化道分化密切相关. 展开更多
关键词 AmphiSox1/2/3-like 文昌鱼 胚胎发育 进化 中枢神经系统 青岛文昌鱼 表达定位 化学分析 E基因 无脊椎动物
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虾夷马粪海胆LRCH2-Like基因的克隆与表达特征分析
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作者 邹惠冬 白莉 +4 位作者 刘圣美 陈亚东 周淑红 仇雪梅 刘洋 《海洋科学前沿》 2018年第2期18-28,共11页
本实验采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得了一条虾夷马粪海胆(Strongylocentrotus inter-medius)LRCH2-like基因的全长cDNA序列。SiLRCH2-like基因全长为2446 bp,其中编码区为1644 bp,3’-UTR为609 bp,5’-UTR为193 bp,编码548个... 本实验采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得了一条虾夷马粪海胆(Strongylocentrotus inter-medius)LRCH2-like基因的全长cDNA序列。SiLRCH2-like基因全长为2446 bp,其中编码区为1644 bp,3’-UTR为609 bp,5’-UTR为193 bp,编码548个氨基酸,预测的蛋白分子量为59.9 KDa,理论等电点为4.07,为酸性蛋白,有1个Na-Ca-ex-superfamily结构域和7个LRR结构域。我们采用实时定量PCR技术分析了SiLRCH2-like基因在各组织中的表达情况。他在所有检测的组织中均有表达,在雌性性腺中表达量最高,其次是肠道、管足,体腔细胞和围口膜中表达量较少,在雄性性腺中几乎检测不到表达。我们也检测了该基因在强壮弧菌(Vibrio fortis)、脂多糖(LPS)、肽聚糖(PGN)、葡聚糖(WGP)、聚肌胞苷酸(polyI:C)五种病原刺激后的体腔细胞中的表达情况。SiLRCH2-like基因在PGN处理后在12 h出现了表达高峰,在WGP处理后出现了表达下调,而其他病原处理后表达上调不明显。研究结果表明,SiLRCH2-like基因参与了虾夷马粪海胆的NLR信号通路,它在海胆的天然免疫系统中发挥了重要的作用。 展开更多
关键词 虾夷马粪海胆 LRCH2-like RACE 实时定量PCR
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Evaluation of trabecular meshwork-specific promoters in vitro and in vivo using scAAV2 vectors expressing C3 transferase 被引量:2
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作者 Jun-Kai Tan Ying Xiao +9 位作者 Guo Liu Long-Xiang Huang Wen-Hao Ma Yan Xia Xi-Zhen Wang Xian-Jun Zhu Su-Ping Cai Xiao-Bing Wu Yun Wang Xu-Yang Liu 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2023年第8期1196-1209,共14页
AIM:To evaluate the potential of two trabecular meshwork(TM)-specific promoters,Chitinase 3-like 1(Ch3L1)and matrix gla protein(MGP),for improving specificity and safety in glaucoma gene therapy based on self-compleme... AIM:To evaluate the potential of two trabecular meshwork(TM)-specific promoters,Chitinase 3-like 1(Ch3L1)and matrix gla protein(MGP),for improving specificity and safety in glaucoma gene therapy based on self-complementary AAV2(scAAV2)vector technologies.METHODS:An scAAV2 vector with C3 transferase(C3)as the reporter gene(scAAV2-C3)was selected.The scAAV2-C3 vectors were driven by Ch3L1(scAAV2-Ch3L1-C3),MGP(scAAV2-MGP-C3),enhanced MGP(scAAV2-eMGP-C3)and cytomegalovirus(scAAV2-CMV-C3),respectively.The cultured primary human TM cells were treated with each vector at different multiplicities of infections.Changes in cell morphology were observed by phase contrast microscopy.Actin stress fibers and Rho GTPases/Rho-associated protein kinase pathway-related molecules were assessed by immunofluorescence staining,real-time quantitative polymerase chain reaction and Western blot.Each vector was injected intracamerally into the one eye of each rat at low and high doses respectively.In vivo green fluorescence was visualized by a Micron III Retinal Imaging Microscope.Intraocular pressure(IOP)was monitored using a rebound tonometer.Ocular responses were evaluated by slit-lamp microscopy.Ocular histopathology analysis was examined by hematoxylin and eosin staining.RESULTS:In TM cell culture studies,the vectormediated C3 expression induced morphologic changes,disruption of actin cytoskeleton and reduction of fibronectin expression in TM cells by inhibiting the Rho GTPases/Rhoassociated protein kinase signaling pathway.At the same dose,these changes were significant in TM cells treated with scAAV2-CMV-C3 or scAAV2-Ch3L1-C3,but not in cells treated with scAAV2-eMGP-C3 or scAAV2-MGP-C3.At lowinjected dose,the IOP was significantly decreased in the scAAV2-Ch3L1-C3-injected eyes but not in scAAV2-MGPC3-injected and scAAV2-eMGP-C3-injected eyes.At highinjected dose,significant IOP reduction was observed in the scAAV2-eMGP-C3-injected eyes but not in scAAV2-MGP-C3-injected eyes.Similar to scAAV2-CMV-C3,scAAV2-Ch3L1-C3 vector showed efficient transduction both in the TM and corneal endothelium.In anterior segment tissues of scAAV2-eMGP-C3-injected eyes,no obvious morphological changes were found except for the TM.Inflammation was absent.CONCLUSION:In scAAV2-transduced TM cells,the promoter-driven efficiency of Ch3L1 is close to that of cytomegalovirus,but obviously higher than that of MGP.In the anterior chamber of rat eye,the transgene expression pattern of scAAV2 vector is presumably affected by MGP promoter,but not by Ch3L1 promoter.These findings would provide a useful reference for improvement of specificity and safety in glaucoma gene therapy using scAAV2 vector. 展开更多
关键词 self-complementary AAV2 chitinase 3-like 1 matrix gla protein trabecular meshwork C3 transferase
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